生物信息学网址全电子教案文档格式.docx

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7.生物网络服务器索引，USCShttp:

//info.er.usgs.gov/network/science/biology/index.html

8.分子生物学数据库列表（LiMB）gopher:

//gopher.nih.gov/11/molbio/other

9.病毒学的WWW服务器，UW-Madisonhttp:

//www.bocklabs.wisc.edu/Welcome.html

10.UKMRC人类基组图谱计划研究中心http:

//www.hgmp.mrc.ac.uk/

11.生物学家和生物化学家的WWW资源http:

//www.yk.rim.pr.jp/~aisoai/index.html

12.其他生物网络服务器的链接http:

//www.gdb.org/biolinks.html

13.分子模型服务器与数据库http:

//www.rsc.org/lap/rsccom/dab/ind006links.html

14.EMBO实际结构数据库http:

//xray.bmc.uu.se/embo/structdb/links.html

15.蛋白质科学家的网络资源http:

//www.faseb.org/protein/ProSciDocs/WWWResources.html

16.ExPASy分子生物学服务器http:

//expasy.hcuge.ch/cgi-bin/listdoc

17.抗体研究网页

18.生物信息网址http:

//biochem.kaist.ac.kr/bioinformatics.html

19.乔治.梅森大学（GeorgeMasonUniversity）的生物信息学与计算分子生物学专业http:

//www.science.gmu.edu/~michaels/Bioinformatics/

20.INFOBIOGEN数据库目录http:

//www.infobiogen.fr/services/dbcat/

21.国家生物技术信息研究室http:

//www.nbif.org/data/data.html

22.人类基因组计划情报http:

//www.ornl.gov/TechResources/Human_Genome

23.生物学软件及数据库档案http:

//www.gdb.org/Dan/software/biol-links.html

24.蛋白质组研究：

功能基因组学的新前沿（著作目录）http:

//expasy.hcuge.ch/ch2d/LivreTOC.html

序列与结构数据库

一．主要的公共序列数据库

1.EMBLWWW服务器http:

//www.EMBL-heidelberg.ed/Services/index.html

2.Genbank数据库查询形式（得到Genbank的一个记录）http:

//ncbi.nlm.nih.gov/genbank/query_form.html

3.蛋白质结构数据库WWW服务器（得到一PDB结构）http:

//www.rcsb.org

4.欧洲生物信息学研究中心（EBI）http:

//www.ebi.ac.uk/

5.EBI产业支持http:

//industry.ebi.ac.uk/

6.SWISS-PROT（蛋白质序列库）http:

//www.expasy.ch/sprot/sprot-top.html

7.大分子结构数据库http:

//BioMedN

8.MoleculesRUs（搜索及观察一蛋白质分子）http:

//cmm.info.nih.gov/modeling/net_services.html

9.PIR国际蛋白质序列数据库http:

//www.gdb.org/Dan/proteins/pir.html

10.SCOP（蛋白质的结构分类），MRChttp:

//scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/data/scop.l.html

11.洛斯阿拉莫斯的HIV分子免疫数据库http:

//hiv-web.lanl.gov/immuno/index.html

12.TIGR数据库http:

//www.tigr.org/tdb/tdb.html

13.NCBIWWWEntrez浏览器http:

//www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/index.html

14.剑桥结构数据库（小分子有机的及有机金属的结晶结构）http:

//www.ccdc.cam.ac.uk

15.基因本体论坛http:

//genome-www.stanford.edu/GO/

二.专业数据库

1.ANU生物信息学超媒体服务（病毒数据库、分类及病毒的命名法）http:

//life.anu.edu.au/

2.O-GLYCBASE（O联糖基化蛋白质的修订数据库）http:

//www.cbs.dtu.dk/OGLYCBASE/cbsoglycbase.html

3.基因组序列数据序（GSDB）（已注释的DNA序列的关系数据序）http:

//www.ncgr.org

4.EBI蛋白质拓扑图http:

//www3.ebi.ac.uk/tops/Serverintermed.html

5.酶及新陈代谢途径数据库（EMP）

6.大肠杆菌数据库收集（ECDC）（大肠杆菌K12的DNA序列汇编）http:

//susi.bio.uni-giessen.de/ecdc.html

7.EcoCyc（大肠杆菌基因及其新陈代谢的百科全书）

8.Eddy实验室的snoRNA数据库http:

//rna.wustl.edu/snoRNAdb/

9.GenproEc（大肠杆菌基因及蛋白质）http:

//www.mbl.edu/html/ecoli.html

10.NRSub（枯草芽胞杆菌的非冗余数据库）http:

//pbil.univ-lyonl.fr/nrsub/nrsub.html

11.YPD（酿酒酵母蛋白质）

12.酵母基因组数据库http:

//genome-www.stanford.edu/Saccharomyces/

13.LISTA、LISTA-HOP及LISTA-HON（酵母同源数据库汇编）http:

//www.ch.embnet.org/

14.MPDB（分子探针数据库）http:

//www.biotech.est.unige.it/interlab/mpdb.html

15.tRNA序列及tRNA基因序列汇编http:

//www.uni-bayreuth.de/departments/biochemie/trna/index/html

16.贝勒医学院（BaylorCollegeofMedicine）的小RNA数据库http:

//mbcr.bcm.tmc.edu/dbs/SRPDB/SRPDB.html

17.SRPDB（信号识别粒子数据库）http:

//psyche.uthct.edu/dbs/SRPDB/SRPDB.html

18.RDP（核糖体数据库计划）http:

//rdpwww.life.uiuc.edu/

19.小核糖体亚蛋白RNA结构http:

//rrna.uia.ac.be/ssu/index.html

20.大核糖体亚蛋白RNA结构http:

//rrna.uia.ac.be/lsu/index.html

21.RNA修饰数据库http:

//medlib.med.utah.edu/RNAmods/

22.16SMDB及23SMDB（16S和23S核糖体RNA突变数据库）http:

//www.fandm.edu/Departments/Biology/Databases/RNA.html

23.SWISS-2DPAGE（二维凝胶电泳数据库）http:

//expasy.hcuge.ch/ch2d/ch2d-top.html

24.PRINTShttp:

//www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/dbbrowser/PRINTS/PRINTS.html

25.KabatMan（抗体结构及序列信息数据库）http:

//www.bioinf.org.uk/abs

26.ALIGN（蛋白质序列比对一览）http:

//www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/dbbrowser/ALIGN/ALIGN.html

27.CATH（蛋白质结构分类系统）http:

//www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/cath

28.ProDom（蛋白质域数据库）http:

//protein.toulouse.inra.fr/

29.Blocks数据库（蛋白质分类系统）http:

//blocks.fhcrc.org/

30.HSSP（按同源性导出的蛋白质二级结构数据库）http:

//www.sander.embl-heidelberg.de/hssp/

31.FSSP（基于结构比对的蛋白质折叠分类）http:

//www2.ebi.ac.uk/dali/fssp/fssp.html

32.SBASE蛋白质域（已注释的蛋白质序列片断）http:

//www.icgeb.trieste.it/~sbasessrv/

33.TransTerm（翻译控制信号数据库）http:

//uther.otago.ac.nz/Transterm.html

34.GRBase（参与基因调控的蛋白质的相关信息数据库）

35.REBASE（限制性内切酶和甲基化酶数据库）

36.RNaseP数据库http:

//jwbrown.mbio.ncsu.edu/RNaseP/home.html

37.REGULONDB（大肠杆菌转录调控数据库）http:

//www.cifn.unam.mx/Computational_Biology/regulondb/

38.TRANSFAC