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生物信息学网址全电子教案文档格式.docx

1、7. 生物网络服务器索引,USCS http:/info.er.usgs.gov/network/science/biology/index.html8. 分子生物学数据库列表(LiMB) gopher:/gopher.nih.gov/11/molbio/other9. 病毒学的WWW服务器,UW-Madison http:/www.bocklabs.wisc.edu/Welcome.html10. UK MRC 人类基组图谱计划研究中心 http:/www.hgmp.mrc.ac.uk/11. 生物学家和生物化学家的WWW资源 http:/www.yk.rim.pr.jp/aisoai/in

2、dex.html12. 其他生物网络服务器的链接 http:/www.gdb.org/biolinks.html13. 分子模型服务器与数据库 http:/www.rsc.org/lap/rsccom/dab/ind006links.html14. EMBO实际结构数据库 http:/xray.bmc.uu.se/embo/structdb/links.html15. 蛋白质科学家的网络资源 http:/www.faseb.org/protein/ProSciDocs/WWWResources.html16. ExPASy分子生物学服务器 http:/expasy.hcuge.ch/cgi-b

3、in/listdoc17. 抗体研究网页 18. 生物信息网址 http:/biochem.kaist.ac.kr/bioinformatics.html19. 乔治.梅森大学(George Mason University)的生物信息学与计算分子生物学专业 http:/www.science.gmu.edu/michaels/Bioinformatics/20. INFOBIOGEN数据库目录 http:/www.infobiogen.fr/services/dbcat/21. 国家生物技术信息研究室 http:/www.nbif.org/data/data.html22. 人类基因组计划情

4、报 http:/www.ornl.gov/TechResources/Human_Genome23. 生物学软件及数据库档案 http:/www.gdb.org/Dan/software/biol-links.html24. 蛋白质组研究:功能基因组学的新前沿(著作目录) http:/expasy.hcuge.ch/ch2d/LivreTOC.html序列与结构数据库一 主要的公共序列数据库1. EMBL WWW服务器 http:/www.EMBL-heidelberg.ed/Services/index.html2. Genbank 数据库查询形式(得到Genbank的一个记录) http:

5、/ncbi.nlm.nih.gov/genbank/query_form.html3. 蛋白质结构数据库WWW服务器(得到一PDB结构) http:/www.rcsb.org4. 欧洲生物信息学研究中心(EBI) http:/www.ebi.ac.uk/5. EBI产业支持 http:/industry.ebi.ac.uk/6. SWISS-PROT(蛋白质序列库) http:/www.expasy.ch/sprot/sprot-top.html7. 大分子结构数据库 http:/BioMedN8. Molecules R Us(搜索及观察一蛋白质分子) http:/cmm.info.nih.

6、gov/modeling/net_services.html9. PIR国际蛋白质序列数据库 http:/www.gdb.org/Dan/proteins/pir.html10. SCOP(蛋白质的结构分类),MRC http:/scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/data/scop.l.html11. 洛斯阿拉莫斯的HIV分子免疫数据库 http:/hiv-web.lanl.gov/immuno/index.html12. TIGR数据库 http:/www.tigr.org/tdb/tdb.html13. NCBI WWW Entrez浏览器 http:/www.ncb

7、i.nlm.nih.gov/Entrez/index.html14. 剑桥结构数据库(小分子有机的及有机金属的结晶结构) http:/www.ccdc.cam.ac.uk15. 基因本体论坛 http:/genome-www.stanford.edu/GO/二. 专业数据库1. ANU生物信息学超媒体服务(病毒数据库、分类及病毒的命名法) http:/life.anu.edu.au/2. O-GLYCBASE(O联糖基化蛋白质的修订数据库) http:/www.cbs.dtu.dk/OGLYCBASE/cbsoglycbase.html3. 基因组序列数据序(GSDB)(已注释的DNA序列的关

8、系数据序) http:/www.ncgr.org4. EBI蛋白质拓扑图 http:/www3.ebi.ac.uk/tops/Serverintermed.html5. 酶及新陈代谢途径数据库(EMP) 6. 大肠杆菌数据库收集(ECDC)(大肠杆菌K12的DNA序列汇编) http:/susi.bio.uni-giessen.de/ecdc.html7. EcoCyc(大肠杆菌基因及其新陈代谢的百科全书) 8. Eddy实验室的snoRNA数据库 http:/rna.wustl.edu/snoRNAdb/9. GenproEc(大肠杆菌基因及蛋白质) http:/www.mbl.edu/ht

9、ml/ecoli.html10. NRSub(枯草芽胞杆菌的非冗余数据库) http:/pbil.univ-lyonl.fr/nrsub/nrsub.html11. YPD(酿酒酵母蛋白质) 12. 酵母基因组数据库 http:/genome-www.stanford.edu/Saccharomyces/13. LISTA、LISTA-HOP及LISTA-HON(酵母同源数据库汇编) http:/www.ch.embnet.org/14. MPDB(分子探针数据库) http:/www.biotech.est.unige.it/interlab/mpdb.html15. tRNA序列及tRNA

10、基因序列汇编 http:/www.uni-bayreuth.de/departments/biochemie/trna/index/html16. 贝勒医学院(Baylor College of Medicine)的小RNA数据库 http:/mbcr.bcm.tmc.edu/dbs/SRPDB/SRPDB.html17. SRPDB(信号识别粒子数据库) http:/psyche.uthct.edu/dbs/SRPDB/SRPDB.html18. RDP(核糖体数据库计划) http:/rdpwww.life.uiuc.edu/19. 小核糖体亚蛋白RNA结构 http:/rrna.uia.

11、ac.be/ssu/index.html20. 大核糖体亚蛋白RNA结构 http:/rrna.uia.ac.be/lsu/index.html21. RNA修饰数据库 http:/medlib.med.utah.edu/RNAmods/22. 16SMDB及23SMDB(16S和23S核糖体RNA突变数据库) http:/www.fandm.edu/Departments/Biology/Databases/RNA.html23. SWISS-2DPAGE(二维凝胶电泳数据库) http:/expasy.hcuge.ch/ch2d/ch2d-top.html24. PRINTS http:/

12、www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/dbbrowser/PRINTS/PRINTS.html25. KabatMan(抗体结构及序列信息数据库) http:/www.bioinf.org.uk/abs26. ALIGN(蛋白质序列比对一览) http:/www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/dbbrowser/ALIGN/ALIGN.html27. CATH(蛋白质结构分类系统) http:/www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/cath28. ProDom(蛋白质域数据库) http:/protein.toulouse.inra.fr/29. Bl

13、ocks数据库(蛋白质分类系统) http:/blocks.fhcrc.org/30. HSSP(按同源性导出的蛋白质二级结构数据库) http:/www.sander.embl-heidelberg.de/hssp/31. FSSP(基于结构比对的蛋白质折叠分类) http:/www2.ebi.ac.uk/dali/fssp/fssp.html32. SBASE蛋白质域(已注释的蛋白质序列片断) http:/www.icgeb.trieste.it/sbasessrv/33. TransTerm(翻译控制信号数据库) http:/uther.otago.ac.nz/Transterm.html34. GRBase(参与基因调控的蛋白质的相关信息数据库) 35. REBASE(限制性内切酶和甲基化酶数据库) 36. RNaseP数据库 http:/jwbrown.mbio.ncsu.edu/RNaseP/home.html37. REGULONDB(大肠杆菌转录调控数据库) http:/www.cifn.unam.mx/Computational_Biology/regulondb/38. TRANSFAC

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