生物文献检索与论文写作 郑兴峰.docx
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生物文献检索与论文写作郑兴峰
文献信息检索和科技论文写作
文献的定义
文献的定义或涵义随时代变化而有不同：
在古代，“文，典籍也，献，贤也”，即文献包括历史上的图书档案和贤人的学识。
《现代汉语词典》（1978年版）：
有历史价值或参考价值的图书资料；《辞海》（1979年版）：
有价值的图书文物资料，……亦指与某一学科有关的重要图书资料，这些将历史遗留下来的在文化发展上有价值的碑刻、工具、武器和各种艺术品等都纳入文献范畴。
现代一般指：
以文字、图形、符号、声频和视频等手段记录和传播知识和信息的载体。
甲骨、竹、木、树叶、丝帛和石等和现代电磁等物化材料都可作为文献性载体。
文献的构成和属性
三要素：
同时具有信息，记录方式和载体。
主要属性：
可用信息性，客观物质性，人工记录性，可查阅或传播的共享性。
根据以上文献定义和属性，如雨花石上的天然纹饰，不能称为文献；载体上人工记录方式的信息不能被辨认或记录方式消失，也就失去作为文献的性质。
另外，人们口头上的传说或口头文学，自然风景人文景观遗址遗物也不算文献。
信息
信息是被人或具有一定人智的生物或机器感知或记录、能用于处理和交换，所反映的事物表征属性。
基本属性：
客观性、可传递性、共享性、中介性。
信息的中介性：
信息处在物质和精神或意识之间，是人们认识事物的媒介或途径；依赖物质并通过感知，但不是物质和意识（认识）本身。
意义：
信息是认识必要的前提和基础。
信息可进一步转化为知识和情报，指导人们的更有效行动，因而信息也是资源、商品或财富。
通常信息愈全面、准确、充分，愈有价值。
*信息干扰.信息污染.信息爆炸
知识
是人的主观对于客观世界（自然界、人类社会、思维方式）概括性本质性和规律性的认识，是在人类社会实践基础上如实地，获得信息，通过人大脑思维处理或提炼形成的系统化或有序化的信息集合。
知识也是升华的或高级的信息。
基本属性：
意识性、信息性、实践性、继承性、渗透性。
情报
是特殊的信息或知识，在一定时间内，对特定人或人群利益或目的有重要影响的知识或信息。
基本属性：
知识信息性、传递性、效用性和时效性。
*信号
信息、知识和情报的区别
信息是知识和情报的基础或原料，知识和情报是高级的信息，情报是有特定效用的知识和信息。
信息、知识和情报共有的特征
是客观事物的具体属性在人的意识中的反映,是客观事物与人意识之间的中介，是意识的基础。
信息、知识和情报，与文献
信息、知识和情报是文献内容或一特征，，是文献一要素，但还不是文献，知识、信息和情报被记录于能传播的载体才称为文献。
文献离不开信息、知识和情报。
文献信息检索的概念、要求
概念：
从文献信息集合中，查找所需文献或文献所包含信息内容的过程，是将信息有序化过程。
通常是查找某一课题、著者、地域、机构和某一事物等的有关文献的出处、收藏单位和内容等。
广义上的文献检索过程是检索信息的储存（文献信息分析、著录和标引）和检索。
文献对象检索包括数据检索、事实检索和文献检索。
要求：
全面而准确，省时简便。
文献信息检索的目的
获得必要的和新的文献信息。
现代科技迅速发展，是信息或知识爆炸时代，文献或信息检索收集越来越重要。
在现在和未来的信息时代，要具备掌握或处理或应对信息，特别是科技人员，必须克服或掌握自然语言、专业语言和信息检索语言。
【文献检索课程，主要在于学习掌握文献（信息）检索的方法和技能】
文献信息检索的意义
1.科研不仅具有继承性，还在于创造或创新，避免重复工作的不必要浪费，科研的不同阶段都需要文献（检索）。
2.有利于把握科技前沿和知识更新。
3.掌握信息，把握时机，找准立足点、位置和方向，提高包括科研、管理的决策水平和管理能力。
（信息是资源）
文献信息检索的原理
二个过程，即检索文献信息存储和文献信息检索。
文献信息存储即是检索中介途径，是对原始文献信息整序化（有序化）或检索语言化后，形成的中介性文献信息纲要，或此基础上进行标识性地汇编、集合，进行（在载体上）存储。
具体包括文献信息的著录、标引和辅助索引等过程和内容，通常是由专门的人员或文献信息处理人员进行。
用户将预需要的文献信息或提问标识，与文献信息存储对照、识别或相互作用，即进行文献信息检索，最后获得所需要的检索结果。
检索语言：
是保证文献信息存储和检索一致的一种共同性语言，它使文献信息存储和检索交流或联系起来，实现文献信息检索。
检索语言还有标引语言和索引语言等的不同形式，但都分为描述文献外部特征的和内部特征的二类检索语言。
检索工具
具有或能进行文献信息存储和检索的载体。
通过检索工具，可用较（不标识途径）少的时间，有效方便地查找需要的文献信息，因而文献信息检索也成为了一门技术。
好的检索工具，符合省时简便，全面而准确的检索要求。
检索工具一般有5个部分组成：
使用说明，目次表或目录，正文，辅助索引和附录。
文献信息检索的步骤
分析研究课题
选择检索方法（确定检索工具、确定检索途径）
查找有关文献信息，包括来源，获取原始文献。
文献信息检索的方法
追溯法（滚雪球法）
工具法（常用法）
循环法（分段法或交替法）
手工检索是相对于计算机检索而言，指不通过计算机而完成文献检索的过程。
国内外检索刊物概况
国内重要的手工检索工具有《全国报刊索引》和各专业类的文摘期刊。
国外重要的有美国的《科学文摘》、《科学引文索引》、《生物学文摘》。
1.分类法途径
利用以学科代码为检索语言而编制的各种分类目录或索引来检索文献信息。
分类语言是用分类号（代码）来表达文献的主题概念，将各种概念按学科性质进行系统排列，成为分类表的文献加工和组织方法。
分类法语言有体系分类语言，组配分类语言。
《中图法》
A 马克思主义、列宁主义、毛泽东思想
1 马克思、恩格斯著作
8 马克思主义、列宁主义、毛泽东思想的学习和研究
B 哲学
0 哲学理论
1 世界哲学
9 无神论、宗教
Q生物科学
1 普通生物学
2 细胞学
3 遗传学
4 生理学
5 生物化学
6 生物物理学
7 分子生物学
81 生物工程学
91 古生物学
93 微生物学
94 植物学
95 动物学
96 昆虫学
98 人类学
2.主题途径
是利用以代表文献主要内容的实质性词汇，作为标识的检索语言所编制的工具，进行文献信息检索的一种途径。
主要有标题词、叙词（关键词）二种主题语言。
比较适合于具体、专深和新兴边缘学科的检索，能较好地满足特性检索的要求。
主题语言
（1）标题词语言：
从标题词作为文献信息内容的标引标识和检索标识。
有时标题词一般分为主标题和副标题，词表中按级列举各级标题，把主标题和副标题加以组配，作为标引和检索使用中的依据。
3.著者途径
利用以已知文献的著者姓名作为检索语言编制的工具，来查找文献的途径，著者包括个人和团体。
著者途径使用方便，在一定程度上可以满足族性检索的需要，也隐含着内容途径（主要指分类和主题途径）的特点。
著者途径不能满足全面检索某课题文献的需要。
4.引文途径
以已掌握的文献，一般是早期的相关文献为检索起点，利用引文索引工具检索文献信息的途径。
引文索引工具通常以文献标题和作者为标识语言编制。
其原理是根据文献之间的引证和被引证的关系，显示的文献之间的内在联系。
国内的有《中国引文索引》和国外美国的《科学引文索引》。
第三章计算机检索
一、计算机检索历史
计算机检索是利用计算机进行文献信息检索的过程。
包括联机检索、光盘数据库检索、镜像数据库检索和互联网检索。
二、计算机与手工检索
计算机检索是“人机对话”，优点速度快、查阅文献范围广、内容新颖、检索途径多、内容的专指性强和服务方式多；缺点检索费用高，效果受数据库质量影响大等。
手工检索是“人书对话”，优点时间不受限制，费用低等；缺点耗时多，效率低和检索入口少等。
三、计算机检索的基本原理
相同于手工检索的基本原理，都有检索语言组织的文献信息的存储和检索二过程。
四、计算机数据库的基本概念
数据库至少由一种文档组成，并能满足某一特定目的，或某一特定数据处理系统需要的一种数据集合。
即在计算机存储设备上按一定方式存储的相互关联的数据集合。
数据库的质量直接影响到检索系统的功能和效率。
五、计算机检索策略构建和调整
检索策略是实现检索目标而制定检索过程的方案。
就是在分析文献提问的基础上，确定检索主题词，各词之间的逻辑关系和检索途径、明确查找步骤，并用正确的指令输入到所选的相应数据库中的全过程。
检索策略涉及文献信息检索的效率。
优先处理算符（）
在（）中的词或字段，优先运算或处理。
截词符
主要对英文的相同词干而不同词头、词尾的主题词进行检索。
可减少输入次数，简化检索过程，扩大检索范围，节省时间降低费用，提高查全率。
不同检索系统有不同的截词符。
DIALOG系统用“？
”。
*词干不要太短，至少3个字符长；英美不同拼音的词。
选择数据库
不同数据库或搜索引擎所覆盖的专业学科内容、收录时间范围和检索方法不同，有的检索系统还提供帮助了解数据库收录内容的总索引；因而事先应了解数据库的标引特征或搜索引擎的检索方法等检索特点，然后比较选择数据库。
选择数据库原则：
按检索目的和要求，选择相应专业和年代跨度所对口的数据库；要查找最新文献信息，选择数据库更新周期短的数据库；要获取原文时，选择原文获取容易和收录有全文的数据库。
检索结果分析
输出文献篇数过多：
通常是主题词多义，检索词截词过短。
调整：
用逻辑“与、AND、*”，“非、NOT、-”；使用合适的字段限制；使用适当的位置算符。
输出篇数过少甚至无：
通常是选用了不规范的主题词或某些产品的俗称，同义词没有充分利用，上位或下位概念没有用全，还有位置算符用得过严，概念不规范或新概念，布尔算符“与、AND、*”用得过多，专指度太高或字段后缀使用过多等。
调整：
用“或、OR、+”增加同义词检索，减少截字符“？
”，除去已有的字段限制和位置符限制。
第四章网络数据库
1.网络数据库：
存储在网络服务器上的文献信息数据库。
有光盘网络数据库，直接访问的网络数据库，镜像站数据库。
2.国内外与生物类有关的一些数据库：
DIALOG数据库；OCLCFirstSearch数据库；《中国学术期刊》网络数据库；CSA数据库；PQPP数据库（学位论文）；《中文科技期刊数据库》数据库；万方数据资源系统数据库。
《中文科技期刊数据库》
国内一大型的综合性文献数据库，由重庆维普资讯有限公司制作发行，包括全文版和文摘版。
收录1989－1999年的7000余种和2000年－现在的12000余种国内科技期刊的文献。
包括自然科学、工程技术、农业科学、医药卫生、经济管理、教育科学和图书情报7大类文献。
使用时需安装专门的维普浏览器。
有简单检索、复合检索和二次检索。
网址：
第五章Internet信息的检索与利用
Internet的一些基本知识
Internet又称因特网、互联网和网际网，是计算机与计算机之间连接的总称。
Internet信息指Internet网提供的各类信息，就科技领域，主要是网上的出版物、电子文献信息、专业网站资源以及专业动态等。
在远距离甚至全球范围内收发电子邮件、召开实时电话会议、查找电子文献、电子购物等活动。
最具优势的是有效地查找巨量的文献信息资源和进行即时信息交流。
Internet是电话和电视后的第三大公共系统。
TCP/IP协议：
Internet各网络之间相互遵守的通讯协议，泛指所有与Internet有关的协议簇。
www：
worldwideweb的缩写，即全球信息网，通过超文本和超媒体技术来实现的。
采用客户机和服务器工作模式。
域名由两个或两个以上的词构成,中间由点号分隔开，类似于互联网上的门牌号码，是用于识别和定位互联网上计算机的层次结构式字符标识，与该计算机的互联网协议（IP）地址相对应。
但相对于IP地址而言，更便于使用者理解和记忆。
域名属于互联网上的基础服务，基于域名可以提供WWW、EMAIL、FTP等应用服务。
第二类是地理顶级域名
共有243个国家和地区的代码，例如.CN代表中国，.UK代表英国。
也叫做“国内域名”。
在.cn顶级域名下也分设有二级域，主要包括类别域和行政区域，即二级域名：
可以在或等二级域下三级注册域名，三级域名可分为两类。
类别域名：
AC科研机构;COM工、商、金融等企业;EDU教育机构;GOV政府部门;NET互联网络、接入网络的信息中心（NIC）和运行中心（NOC）;ORG各种非盈利性的组织。
行政区划域名：
如北京的机构可以选择如的域名。
中国34个顶级域名之行政区域名,如BJ-北京市；SH-上海市；TJ-天津市；TW-台湾；HK-香港；MO-澳门。
此外，从2002年12月份开始，CNNIC开放了国内.cn域名下的二级域名注册，可以在.CN下直接注册域名，如时代营销所注册的国内域名为：
。
第三类顶级域名也就是“新顶级域名”，是ICANN根据互联网发展需要，在2000年11月做出决议，从2001年开始使用的国际顶级域名，也包含7类：
biz,info，name，pro，aero,coop,museum。
其中前4个是非限制性域，后3个是限制性域。
核心期刊和SCI期刊
核心期刊
作为文献计量学的一个概念，“核心期刊”是20世纪30年代由英国文献学家布拉德福（B.C.Bradford）提出的。
他按照载文密度，将专业期刊划分为对该专业最有贡献的核心区域和论文数量与之相等的几个相继区域，将密度最大的核心区域的期刊称为“核心期刊”。
60年代，美国文献计量学家加菲尔德（E.Garfield）用类似方法从引文角度证实了核心期刊的存在。
后来，众多学者对以上经验定律提出各种修正方案。
核心期刊是某学科（或某领域）的最重要期刊，是发表该学科（或该领域）论文较多、使用率（含被引率、摘转率和流通率）较高、学术影响较大的期刊。
SCI、SCI期刊、SCI论文
SCI（ScientificCitationIndex）是美国科学信息研究所（ISI）编辑出版的引文索引类刊物，创刊于1964年。
SCI期刊是SCI收录的刊物，也可理解为国际上的核心期刊。
SCI从全球数万种期刊中选出3300种科技期刊，涉及基础科学的100余个领域。
每年报道60余万篇最新文献，涉及引文900万条。
SCI选录刊物的依据是文献分析法，即美国情报学家加费尔德提出的科学引文分析法。
该分析法以期刊论文被引用的频次作为评价指标，被引频次越高，则该期刊影响越大。
SCI论文是进入SCI期刊的论文。
第九讲
文献信息的利用
一、文献信息的收集、整理和分析
1.文献信息的收集
常规方法和非常规方法
常规方法：
非正式渠道：
就是实地调查、同行单位调查、参加会议、实物解剖，分析实物等。
正式渠道：
通过手工和计算机检索，或二者结合，查找原始文献。
非常规方法：
通过带技术攻关性质课题（科技报告、专利、会议文献和期刊论文），仿制性质课题（同类产品说明书、专利说明书和标准资料）获得资料文献。
通过综述性质课题（包括综述、述评性的进展报告、现状动态和专题论文等）获得资料文献。
通过成果水平鉴定性质课题（科技成果公报类期刊和会议文献等）获得资料文献。
2.文献信息的整理
信息的阅读和消化
信息可靠性的甄别（来源、著者、事实和数据信息）
信息的摘录（题录式、文摘式、提纲式、原文语句卡片式，全文复制或抄录）
信息组织编排
3.文献信息的分析
文献信息分析指从繁杂的原始相关文献信息中提取共性的、方向性或特征性的信息内容，为进一步的研究和决策提供佐证和依据。
是由粗而精，由低级而高级的信息提炼过程。
步骤：
鉴别筛选可靠性、先进性和适应性的文献信息，进行分类整序。
方法：
定性法是运逻辑学手段的分析方法，重要的有比较法、相关法和综合法。
定量法指运用数学手段的描述和分析方法，主要通过数学模型（主要是公式）和概率统计法（拟合模型法）。
二、文献信息收集、整理和分析后成果的表达
文献信息的收集、整理和分析后成果的表达，是根据课题要求，在选用一次文献的内容，合理利用二次文献的基础上，编写的综述、述评、评论和专题报告等形式的三次文献。
文献信息的收集、整理和分析后成果的表达是科研必要的环节，是再创造过程，还可能获得新认识或新成果。
于开题报告、学位论文的序言或前言所必须。
文献信息的收集、整理和分析的成果表达
综述、述评和评论
一、综述
概念：
综述是对某一课题的大量有关资料，进行整理、分析、归纳综合而成的一种研究报告。
有评述性和文摘性之分。
一、综述
特点：
仅对有关资料、情况和数据做客观综述归纳叙述，不加编写者的见解，不提具体建议，但可有选择性或倾向性的评议或评论。
一、综述
写作要求：
破题：
要开门见山接触问题。
发展概况：
通常以简要介绍课题的历史背景为主（有选择，不能写成编年史），讲清研究的主要方面，历史沿革，已解决的问题，主要困难和存在问题。
当前水平：
是综述的重点部分。
如果写的是产品或方法等要概括出当前的代表性的型号或方法，以及其原理特色和待解决的问题；如果是关于理论的，则要列出各流派的主要观点和成就。
写作过程通常有下列组织方法：
循序渐进法，分路递进法，以及纵深逼近法。
附录文献：
格式要规范。
二、述评
概念：
针对某种科研成果、专业中的某种倾向和问题，结合国家政策和学科理论，有时结合自己的研究成果进行的评议性综述。
作用：
述评对专业人员和社会管理者都有较强的指导性。
特点：
又述又评，比综述全面深入而有针对性，往往还有鲜明的倾向性。
二、述评
写作要求：
格式与综述相近，由前言（引言）、正文（综述）、结语（评议）和附录（文献等）组成。
内容结构分为破题、综述、评论和建议，可先述后评，也可边述边评议。
述评文章中的综述比综述文章应简略一些。
评议部分要因读者不同而有所不同。
建议部分提出方向和改进措施，但一定要结合本国本地区本领域。
述评时不应将评述内容与自己的工作混为一体。
三、（学术）评论
概念：
对某个课题评议性的文献信息研究文章，有较强的针对性、理论性和权威性，可反应进展情况和发展趋势。
作用：
评论对该学科的研究者有重要参考价值。
特点：
关注重要的、当前的问题或事件。
评论重在评议，而不同于综述和述评，综述是述而不评，述评是有述有评。
三、（学术）评论
写作要求：
形式不拘一格，一般按议论文的绪论、本论和结论进行；要求作者有较强的敏感性和洞察力，能掌握问题的关键，有较高的学术造诣、水平。
第四章搜索引擎、SCI和核心期刊
搜索引擎定义：
是一些在web中主动搜索信息，并将搜索结果通过自动标引成索引或目录组成，能被检索的数据库的web网站；搜索引擎既是用于检索的软件又是提供查询检索的网站，所以，搜索引擎也可称为因特网上具有检索功能的网站。
搜索引擎一般具有web数据采集、索引、检索和检索界面等一些功能，由网页搜索引擎、索引搜索引擎和查询搜索引擎组成。
搜索引擎的工作过程：
11.搜索引擎派出名为蜘蛛或机器人的网页搜索软件（一种自动从网上一个文档的链接跳到另一文档链接的软件）在各网上自动搜寻所需要的信息，访问网络中公开区域的每一站点并沿着被引用网页中的所有URL爬到其它网页获取需要信息，将搜索来的信息带回搜索引擎站点用于用户可检索的数据库。
22.由分析索引系统程序对收集回来的网页信息进行分析，提取相关网页信息（包括网页所在URL、编码类型、页面内容包括的关键词、关键词位置、生成时间、大小和与其它网页的链接关系等），并根据一定的相关度算法等处理，对信息进行分类整理建立网页索引数据库，最后建立搜索引擎数据库。
搜索引擎数据库不断地更新。
3.搜索引擎通过其web服务器端软件，提供一个良好界面的信息查询界面。
搜索引擎的种类：
目前互联网上有数以千计的搜索引擎
1.按检索语种：
中文和西文。
中文：
搜狐（）
网易（）
新浪（）
每日新闻（）
XX（）等，
还有港台和国外的雅虎中文（）
2.按检索内容：
信息服务，软件下载，找人
3.按检索方法：
分类检索，概念检索，关键词检索，综合检索。
4.按检索功能：
单搜索引擎（如），
元搜索引擎（如），
智能搜索引擎（如国内的XX）。
SCI和核心期刊
什么是SCI论文
SCI（ScientificCitationIndex）是美国科学信息研究所（ISI）编辑出版的引文索引类刊物，创刊于1964年。
从全球数万种期刊中选出3300种科技期刊，涉及基础科学的100余个领域。
每年报道60余万篇最新文献，涉及引文900万条。
SCI选录刊物的依据是文献分析法，即美国情报学家加费尔德提出的科学引文分析法。
该分析法以期刊论文被引用的频次作为评价指标，被引频次越高，则该期刊影响越大。
进入SCI这一刊物的论文即为SCI论文。
什么是核心期刊
作为文献计量学的一个概念，“核心期刊”是20世纪30年代由英国文献学家布拉德福（B.C.Bradford）提出的。
他按照臷文密度将专业期刊划分为对该专业最有贡献的核心区域和论文数量与之相等的几个相继区域，将密度最大的核心区域的期刊称为“核心期刊”。
60年代，美国文献计量学家加菲尔德（E.Garfield）用类似方法从引文角度证实了核心期刊的存在。
后来，众多学者对以上经验定律提出各种修正方案。
可以说核心期刊是某学科（或某领域）的核心期刊，是指那些发表该学科（或该领域）论文较多、使用率（含被引率、摘转率和流通率）较高、学术影响较大的期刊。
科技论文的写作（三）
科技论文的撰写格式及其要求
科技论文一般包括以下8个部分：
题名、论文作者、摘要、关键词、引言、正文、结论和参考文献。
如有必要，可加封面、题名页、目次页以及附录等。
一、题名
题名又叫题目、文题、标题，是科技论文的中心和总纲。
要求：
准确恰当、简明扼要、醒目规范、便于检索。
避免：
空大笼统、盲目拔高、词语重复、语序错乱。
1.准确恰当
要求论文题目能准确表达论文内容，恰当反映所研究的范围和深度。
常见毛病是：
过于笼统，题不扣文。
如：
“金属疲劳强度”，可改为“铁镍合金材料疲劳强度”。
关键问题在于题目要紧扣论文内容，或论文内容与论文题目要互相匹配、紧扣。
2简明扼要
力求题目的字数要少，用词需要精选。
至于多少字算是合乎要求，并无统一的“硬性”规定，一般希望一篇论文题目不要超出20个字，不过，不能由于一味追求字数少而影响题目对内容的恰当反映，在遇到两者确有矛盾时，宁可多用几个字也要力求表达明确。
常见的繁琐题名如：
“关于钢水中所含化学成分的快速分析方法的研究”。
可精炼为：
“钢水化学成分的快速分析法”。
若简短题名不足以显示论文内容或反映出属于系列研究的性质，则可利用正、副标题的方法解决。
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