质粒提取实验方案.docx
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质粒提取实验方案
下面是实验流程和结果:
感受态细胞的制备(CaCl2法)
T-载体连接全过程及转化
挑单克隆
裂碱法提质粒
一.感受态细胞的制备(CaCl2法)
实验前的准备工作:
检查准备无菌的试剂:
0.1MCaCl(应提前预冷)、含10%甘油的0.1MCaCl、无抗生素的LB.1.5ml离心管50ml离心管(6-12个)、200ul与1ml枪尖(各1盒)。
1、挑DH5a单克隆菌落至3ml无抗生素的LB中,37℃摇床培养过夜(在15ml离心管中进行)。
2、1:
20-50扩大培养至250ml培养体系至OD600为0.6-0.8(约3小时)
3、将菌液移入冰水物后开超净台紫外,打开离心机使其预冷,30分钟后分装至50ml离心管中,然后于4℃下5000rpm离心5分钟;
4、弃去上清(轻轻倾倒掉上清液,不能倒掉沉淀);加入10ml预冷的0.1mol/L的CaCl2溶液,轻轻用枪尖吹动沉淀使细胞完全悬浮,冰上放置15分钟后,4℃下5000rpm离心5分钟(将两管合并至1管)
5、弃去上清(轻轻倾倒掉上清液);加入10ml预冷的0.1mol/L的CaCl2溶液,轻轻用枪尖吹动管底使细胞完全悬浮,4℃下5000rpm离心5分钟;
6、弃去上清,加入15ml预冷含10%甘油的0.1MCaCl,轻轻悬浮细胞,将感受态细胞悬液分装成若干份,每份50μl。
7、用液氮速冻,将感受态细胞置于-80℃保存。
注:
CaCl2处理后的细胞比较脆弱,尽量温柔操作!
全过程要再冰上操作,及无菌操作!
二.T-载体连接全过程及转化
第一步:
PCR扩增目的基因及纯化
PCR扩增:
1.PCR反应体系:
在PCR板中进行
无菌水1060ul
Buffer130ul
dNTP20ul
酶25ul
引物120ul
引物220ul
2.PCR反应条件:
PCR反应条件为温度、时间和循环次数。
95℃5min
95℃45s
40~60℃50s循环35次
72℃55s
72℃10min
3.PCR期间配置琼脂糖凝胶:
PCR结束以后跑胶验证,并照相,标记保存。
以下为PCR结束以后的跑胶图:
引物10
引物11A
引物11B
引物12A
引物12B
4.PCR产物回收——PCR的纯化
(1)单一PCR产物用氯仿法
●把PCR产物转移至1.5ml的离心管,加500ul无菌水,500ul氯仿异戊醇(24:
1),混匀后10000rpm离心5-10分钟
●转移上清(约400ul)至灭菌的新1.5mL的Eppendorf管,加入2倍体积(800µL体积即可)的无水乙醇与NaAc的混合液。
置冰上或-80℃冰箱30分钟以上。
●10000rpm离心10min。
弃上清,沉淀用适量的70%的乙醇洗一次,离心3min,于纸上扣干。
小心不要将沉淀洗掉。
●置于恒温器上干燥(55℃)至无色透明或无乙醇气味。
●加入40µL无菌水溶解沉淀备用,在-20摄氏度保存。
第二步:
T-载体连接和转化
1.在微量离心管(PCR管)中配制以下体系:
注:
T-载体试剂盒开封前要向pMD18-TVector管中加入25ul无菌水,同时再管上面做标记。
pMD18-TVector1.0ul
外源DNA1.5ul
SolutionI2.5ul
用封口膜密封PCR管,用低速离心机离心
2.16℃或4℃低温连接1h-2h(最好过夜);
3.连接产物半量(2.5ul)加入50ul的DH5α感受态细胞中,轻轻摇匀后冰上放置30min;DH5α感受态细胞加5ul0.1M的无菌氯化钙做阴性对照;
4.热击:
42℃水浴中热击90秒(注:
精确计算时间,过长将对细胞造成伤害),热击后立即置于冰上冷2-5分钟(禁止摇动)。
5.复苏:
向每管中加入预冷的400μlLB培养基(注:
不含Amp),混匀后37℃轻摇培养1~1.5小时,使细菌恢复正常生长状态,并表达质粒编码的抗生素抗性基因(Ampr)。
6.涂布平板筛选转化质粒:
将上述各管培养液摇匀后取100μl分别涂布于含Amp的筛选LB平板上。
(注:
1.将培养液摇匀后涂布,并要把平板涂干。
)正面向上放置15分钟,待菌液完全被培养基吸收后倒置培养皿,37℃培养过夜。
7.次日(12-14小时后)观察和从平板上挑取单克隆于甘油LB中(10-20%甘油),每个平板挑3个单克隆,-20℃保存。
三.挑单克隆
选取平板中的单克隆菌落用枪尖挑取两个分别带枪尖打入15ml的离心管中(含3ml带Amp的LB)摇床培养过夜以备提取质粒用。
四.裂碱法提质粒
1.将15ml离心管中的菌液分两组于1.5ml离心管,一组加1.5ml的菌液离心提质粒,另一组加300ul的80%的甘油+1ml的菌液-20摄氏度保存。
2.次日将培养的菌液10000rpm离心3min,弃上清。
3、加入1150µL溶液Ⅰ振荡使菌体沉淀充分悬浮(用枪尖吹起),务必悬浮充分。
4、加入200µL溶液Ⅱ(现用现配),立即轻轻翻转几下,使菌体裂解。
可观察到原浑浊的菌悬浮液变清变粘,放置时间不能超过3min。
5、加入150µL预冷的溶液Ⅲ,立即上下颠倒充分混匀7-10次,不宜太剧烈。
可观察到白色片状沉淀出现。
6、置冰浴10min,也可置于-20℃中5min。
7、10000rpm离心8-10min。
8、在离心过程中可取未灭菌的新1.5mL的Eppendorf管,加入等体积(400µL即可)酚-氯仿-异戊醇(25:
24:
1)备用,取灭菌的新1.5mL的Eppendorf管,加入2倍体积(800µL体积即可)的无水乙醇与40ul3MNaAc备用。
9、离心完将上清迅速倒入已加的酚-氯仿-异戊醇中,充分混匀。
小心不要将白色沉淀物倒入酚-氯仿-异戊醇中。
10、10000rpm离心10min。
11、吸水相,加入已加好的无水乙醇中,颠倒混匀几次(小心不要吸入酚相,没把握时宁可放弃一些水相)。
置冰上或-80℃冰箱30分钟以上。
12、10000rpm离心10min。
13、迅速弃上清,沉淀用适量的70%的乙醇洗一次,于纸上扣干。
小心不要将沉淀洗掉。
14、置于恒温器上干燥(55℃)至无色透明或无乙醇气味。
15、加入40µLTE溶解沉淀,琼脂糖电泳检测。
琼脂糖电泳检测结果为:
引物10A组质粒
引物10B组质粒
引物11A组质粒
引物11B组质粒
引物12A组质粒
引物12B组质粒