水貂阿留申病毒VP2基因的克隆及原核表达.docx
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水貂阿留申病毒VP2基因的克隆及原核表达
本科生毕业论文(设计)
题目:
水貂阿留申病毒VP2基因的克隆及原核表达
姓名:
韩蓉
学院:
动物医学院
专业:
动物医学
班级:
动医54班
学号:
1715428
指导教师:
雷治海职称:
教授
姜焱职称:
高级兽医师
2010年5月18日
南京农业大学教务处制
目录
摘要…………………………………………………………………………………………1
关键词…………………………………………………………………………………………1
Abstract………………………………………………………………………………………1
Keywords……………………………………………………………………………………1
引言(或绪论)………………………………………………………………………………1
1 材料与方法………………………………………………………………………………1
1.1 材料……………………………………………………………………………………1
1.2 方法……………………………………………………………………………………2
1.2.1 ADV的VP2基因的PCR扩增…………………………………………………………2
1.2.2 VP2基因与T载体的连接……………………………………………………………2
1.2.3 pET-VP2重组表达载体的构建………………………………………………………3
1.2.4 BL21VP2诱导表达比较……………………………………………………………4
2 结果与分析………………………………………………………………………………5
2.1 vp2基因的PCR结果……………………………………………………………………5
2.2 PT-VP2重组质粒的酶切鉴定…………………………………………………………5
2.3 pET-VP2重组质粒的构建………………………………………………………………62.4 BL21VP2E.coli重组蛋白表达…………………………………………………………63 讨论………………………………………………………………………………………63.1 本实验的研究意义……………………………………………………………………63.2 本实验的优化条件……………………………………………………………………73.2.1 PCR条件的优化………………………………………………………………………73.2.2 目的基因片段与表达载体pET-32a(+)连接的优化………………………………73.2.3 诱导表达条件的优化………………………………………………………………7致谢…………………………………………………………………………………………7
参考文献……………………………………………………………………………………7
水貂阿留申病毒VP2基因的克隆及原核表达
动物医学专业学生韩蓉
指导教师雷治海
摘要:
水貂阿留申病(AD)又称浆细胞增多症,是由水貂阿留申病细小病毒(ADV)持续感染引起的一种水貂自身免疫系统紊乱,同时并发自身免疫慢性病毒血症。
根据Genebank上的水貂阿留申病病毒的VP2基因序列,设计了一对引物,通过PCR方法扩增了完整的VP2基因,将PCR产物插入pET-32a(+)载体中,构建成重组原核表达载体pET-VP2。
阳性重组质粒转化宿主菌BL21(DE3)中感受态细胞,用IPTG进行诱导表达,对表达产物进行SDS-PAGE检测,结果表明表达产物的分子质量约为21kD。
成功表达了VP2蛋白,为VP2蛋白的作用研究以及相关疫苗的制备奠定了基础。
关键词:
水貂阿留申病病毒;VP2基因;原核表达
CloningandProkaryoticExpressionOfMainAntigenicRegionOfVP2GeneofAleutianMinkDiseaseParvovirus
studentmajoringinveterinarymedicineHanRong
tutorLeiZhihai
Abstract:
Aleutianminkdisease(AD),alsoknownasminkplasmacytosis.Itiscausedbyapersistent
infectionwithAleutianminkdiseasevirus(ADV),anondefectiveparvovirus.ADiskindofmainlyenc-
roachestheimmunocyteofmink,resultsinimmunesystemdisordersandsimultaneouswithautoimmuneviremiadisease.AccordingtothesequenceoffullgenomeofVP2publishedonGenebank,wedesignedapairofprimerstoamplifyfullVP2genebyPCR.ThisPCRproductisinsertedintopET-32a(+)toconstructpET-VP2.ThepositiverecombinantvectorsweretransformedintorecipientgermsBL21(DE3)forexpress-
ionbyIPTGinducing.TheexpressedproteinsweremeasuredbySDS-PAGE.Theresultsshowedthatthemolecularweightoftheexpressedproteinswereseparately21KD.VP2proteinWassuccessfulexpressed.ItlaidafoundationofstudyonroleofVP2inpathopoiesisofvirusesanddevelopmentofrelevantvaccine.
Keywords:
Aleutianminkdiseasevirus;VP2genes;Prokaryoticexpression
水貂阿留申病(AleutianDiseaseofMink,AD)是由水貂阿留申病毒(AleutianMinkDiseaseVirus,ADV)引发的一种水貂慢性进行性疾病。
梁士哲等1982年报道了该病在我国的发生[1],目前在全国范围内仍广泛流行,是当今阻碍养貂业发展的主要传染病,以繁殖能力下降、貂体消瘦、自身免疫病、高免疫球蛋白血症、细菌感染的易感性增加、肾衰竭死亡为基本特征[2]。
临床上病理综合征表现为母貂流产、新生仔貂急性肺炎、成年水貂慢性免疫复合物介导的肾小球肾炎[3],ADV属细小病毒科(Parvovirdae)细小病毒属(Parvovirus)[4]。
ADV的基因组为线性单链DNA,ADV病毒粒子中的蛋白分为结构和非结构蛋白2类。
基因组全长为4801bp,主要编码VP1和VP2两种结构蛋白。
VP1和VP2共同构成病毒粒子的衣壳粒,而VP2在病毒衣壳中占有绝大部分的比重,病毒粒子蛋白的结构功能也主要集中在VP2蛋白上[5-7]。
由于VP2基因的可变性和相对保守性及其与致病性的相关性,该基因成为研究ADV毒力和致病机理等的首选基因[8]。
本研究就ADV国内分离株的VP2基因主要抗原区进行了克隆与表达,为VP2蛋白功能与作用的深入研究积累资料,同时为进一步揭示ADV抗原表位的分子特征奠定基础。
1材料和方法
1.1材料
1.1.1水貂阿留申病毒
由江苏出入境检验检疫局动植物检测中心实验室姜焱博士保存。
1.1.2质粒及菌株
T载体,pET-32a表达载体[及其宿主菌BL21(DE3)],都由江苏出入境检验检疫局动植物检测中心实验室姜焱博士保存。
1.1.3各种试剂
质粒抽提试剂盒、rTaq和各种限制性核酸内切酶均购自于Takara公司;pGemT-Easy试剂盒,购自Promega公司;LB培养基、酵母浸出物、水解酪蛋白为Oxoid产品。
每1000mLLB液体培养基含有10g胰化蛋白胨、5g酵母浸出物和10gNacl抗性培养基的氨苄青霉素终浓度为100μg/μL。
固体培养平板为LB液体培养基加入1.6%琼脂,分装平皿后灭菌。
TAE电泳缓冲液参照《分子克隆实验指南》(第二版)配制[9]。
1.1.4引物
参考已发表的ADVVP2基因核苷酸序列,利用Primer5.0软件分别设计合成两对引物,用于扩增VP2上主要抗原表位区的两个核酸片段;
P1:
(5’-TACggATCCTgCAAACCAAAgACAgAT-3’)
P2:
(5’-gCggAATTCggTTTTTATTCTgTCTgg-3’)
1.1.5聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)试剂
丙烯酰胺、NN'-亚甲基双丙烯酰胺,按照如下比例配制:
总体积100mL中含有29g丙烯酰胺和1gNN'-亚甲基双丙烯酰胺。
用纯水配制,并置于棕色瓶中,4℃保存。
TEMED(四甲基乙烯二胺),购自Promega公司。
10%SDS(十二烷基苯磺酸钠)、10%过硫酸铵溶液、2×上样缓冲液、考马斯亮蓝R-250染色液和脱色液等,均参照《分子克隆实验指南》(第二版)[9]自行配制。
1.1.6主要仪器
PCR仪:
AmpGene公司生产,DNAThermolCycler4800型;V-16夹心垂直电泳槽:
上海精益有机玻璃制品仪器厂生产;THZ-C空气恒温震荡器:
江苏太仓光明实验分析仪器厂产品;TY-80S型脱色摇床:
南京大学南达生物技术开发公司;SCR-6型稳定电泳仪,江苏丹阳无线电一厂;ZDX-35BI型座式自动电热压力蒸汽高压锅:
上海申安医疗器械厂。
1.2方法
1.2.1ADV的VP2基因的PCR扩增
ADV的VP2基因的PCR扩增,优化体系为:
超纯水33μL、10×PCRBuffer5μL、dNTPsMix4μL、1.5mMMgCl24μL、上游引物1μL、下游引物1μL、Taq酶1μL、
反应程序为:
95℃3min,94℃1min,55℃1min,72℃1min,30个循环,然后72℃延伸10min,最后置于4℃。
反应结束后,取8μLPCR产物在10g/L琼脂糖凝胶上进行电泳。
1.2.2VP2基因与T载体的连接
1.2.2.1coliDH5感受态细胞的制备
用接种环蘸取冻存于-20℃的DH5α甘油菌少许,并划线接种于琼脂LB平板上,倒置于温箱中,37℃培养24h;待平板上长出单个菌落,挑取形态均一的单个菌落,接种于含3mLLB的试管中,37℃振荡培养,待其细菌浓度达到约0.5~0.6时,参照《分子克隆实验指南》(第二版),制备感受态细胞,其具体过程如下:
取约1.5mL细菌于1.5mLEppendorf管中,3800rmp离心4min,收集细菌,用400μL0.1MCaCL2轻轻吹打开细菌,并置于冰水混合物中水浴5min,取出,将离心管于3800rmp离心4min收集细菌,小心吹打开细菌并用200μL0.1MCaCL2小心吹打开细菌,再置于冰水混合物中水浴1h,即得感受态细胞。
该细胞可以立即使用,也可以加入甘油于-20℃冻存备用。
1.2.2.2PCR产物的小量胶回收试剂盒法回收
反应产物于1.2%琼脂电泳,切下目的条带,按小量胶回收试剂盒说明书进行回收目的片段,其过程为:
称量所切下胶块的重量,按照100mg胶块:
300μL溶胶液的比例加入溶胶液。
如胶块重量不足100mg,可以加入纯水补足;将混合物在75℃水浴10min,中间每隔2min取出EP管颠倒一次以使胶块充分溶解。
将溶解后的混合物吸入收集管,12000rmp离心1min,用洗涤液先后洗涤两次,每次用500μL,并于12000rmp离心1min,最后在收集管膜中央部位加入25μL洗脱液,放置2min,12000rmp离心1min,收集离心所得液体。
该洗脱液中即含有所有的DNA片段。
1.2.2.3外源片段和T载体的连接、转化
在RNA/DNACalculator上测定该溶液中DNA含量,与T载体连接(操作步骤见pGemT-Easy试剂盒)。
外源片段和T载体连接的优化体系为:
外源DNA8.5μL、T载体0.5μL、2×连接Buffer10μL、T4DNA连接酶1μL、
使外源DNA和T载体的摩尔比例大约为3:
1,将上述连接体系于掌式离心机上稍作混合,置于16℃连接过夜。
取出,转化方法参考文献[9]。
其过程如下:
将连接产物吸入至感受态细胞中,轻摇混匀,置于冰水混合物中水浴30min,42℃热冲击90sec,再冰水浴2min。
加入LB液体培养基800μL,37℃振摇45min。
12000rmp离心1min收集细菌,均匀涂布于氨苄平板上。
37℃温箱中培养24h。
1.2.2.4小量试剂盒提取质粒
用购自Takara公司的质粒小量抽提试剂盒提取50μL的质粒。
1.2.2.5酶切鉴定重组质粒
将所提的质粒,取出10μL用EcoRⅠ和BamHⅠ作酶切鉴定。
酶切体系为:
超纯水6μL、质粒10μL、10×KBuffer2μL、EcoRⅠ1μL、BamHⅠ1μL、
混匀上述反应体系,并置于37℃水浴3h。
将酶切产物于1.2%琼脂凝胶上电泳,在紫外投影仪上检测电泳结果。
将阳性质粒命名为pT-VP2。
1.2.3pET-VP2重组表达载体的构建
1.2.3.1含pET-32a(+)质粒DH5αE.coli的增殖和pET-32a(+)的提取
用接种环蘸取冻存于-20℃的含pET-32a(+)质粒DH5αE.coli甘油菌少许,并划线接种于含氨苄的琼脂LB平板上,倒置于温箱中,37℃培养24h;待平板上长出单个菌落,挑取形态均一的单个菌落,接种于含20mLLB的试管中,37℃振荡过夜培养。
用试剂盒小量提取质粒;并于1.2%琼脂凝胶上电泳以鉴定质粒大小和浓度。
1.2.3.2回收表达载体pET-32a(+)的双酶切产物
将表达载体pET-32a(+)进行EcoRⅠ、BamHⅠ双酶切,其酶切反应体系为:
超纯水6μL、质粒10μL、10×KBuffer2μL、EcoRⅠ1μL、BamHⅠ1μL
混匀上述反应体系,并置于37℃反应2~3h,酶切产物行1.2%琼脂糖凝胶电泳将
目的片段切下,按DNA小量凝胶回收试剂盒回收说明书回收目的片段。
1.2.3.3克隆载体pT-VP2的双酶切及目的片段的回收
将克隆载体pT-VP2经EcoRⅠ、BamHⅠ双酶切,其酶切反应体系为:
超纯水6μL、pT-VP210μL、10×KBuffer2μL、EcoRⅠ1μL、BamHⅠ1μL
混匀上述反应体系,37℃反应2~3h,酶切产物行1.2%琼脂糖凝胶电泳,将目的片段切下,按DNA小量凝胶回收试剂盒回收说明书回收目的片段。
1.2.3.4目的基因片段与表达载体pET-32a(+)的连接
将阳性的克隆pT-VP2经双酶切及目的片段回收,与经相应双酶切及回收的pET32a表达载体进行连接反应,将阳性克隆命名为pET-VP2见图1。
VP2
+
Vp2vp2vp2vp2
VP2
目的
基因
载体
图1VP2基因插入pET-32a(+)载体中,构建成重组原核表达载体pET-VP2
Fig.1VP2genesisinsertedintopET-32a
toconstructpET-VP2
pET-VP2
连接反应优化体系为:
pET-32a(+)5μL、10×Ligasebuffer2μL、T4DNANLigase1μL、目的基因片段12μL、
混匀上述反应体系,在冰水混合物环境下连接过夜。
1.2.3.5BL21(DE3)感受态细胞的制备
用接种环蘸取冻存于-20℃的BL21(DE3)甘油菌少许,并划线接种于琼脂LB平板上,倒置于温箱中,37℃培养24h;待平板上长出单个菌落,挑取平板上单个菌落,扩大培养至OD℃值为0.5~0.6,用0.1MCaCL2制备感受态细胞。
1.2.3.6转化
吸出过夜连接产物8μL,转移至BL21(DE3)感受态细胞中,轻摇混匀,置于冰水混合物中水浴30min,42℃热冲击90set,再冰水浴2min。
加入LB液体培养基800μL,37℃振摇45min,12000rmp离心1min收集细菌,均匀涂布于氨苄平板上,37℃温箱中培养24h。
1.2.3.7鉴定阳性菌落
挑取多个单菌落,接种到3mL氨苄LB液体培养基的试管中,振摇培养过夜。
小量提取质粒,先于1.2%琼脂糖上电泳鉴定质粒的大小和浓度。
然后每个样品取出5μL用EcoRⅠ、BamHⅠ双酶切消化鉴定,双酶切体系为:
超纯水6μL、pET-VP210μL、10×KBuffer2μL、EcoRⅠ1μL、BamHⅠ1μL
混匀上述反应体系,37℃反应2~3h,酶切产物行1.2%琼脂糖凝胶电泳,观察结果。
阳性克隆命名为pET-VP2。
1.2.4BL21VP2诱导表达比较
1.2.4.1含阳性质粒的E.coli的诱导表达和样品处理
挑取含pET-VP2的BL21VP2平板上的单个菌落,过夜培养于37℃培养至OD6000.5~0.6之间,加入1mM终浓度的IPTG37℃诱导6h。
取样品菌液1mL,室温离心12000rmp1min,收集菌体。
加入2×上样缓冲液50μL和纯水50μL,吹打使混合均匀。
于沸水中水浴5min,每个样品均取20μL上样,于12%分离胶上进行SDS-PAGE。
1.2.4.2SDS-PAGE
参照《分子克隆实验指南》(第二版)[9],在垂直板式聚丙烯酰胺凝胶电泳槽中进行SDS-PAGE。
配制12%分离胶:
在一洗净的50mL小烧杯中,依次加入纯水3.4mL、30%丙烯酰胺贮存液4.0mL、Ph8.81.5MTris-HCL缓冲液2.5mL、10%SDS0.1mL、10%过硫酸铵0.55mL和TEMED0.01mL,混匀。
加入TEMED后迅速将混合物沿玻璃板倒入槽内,使槽内液体的上液面距离短玻璃上缘约2~3cm,胶液表面小心加入纯水,用纯水慢慢冲洗2~3次,洗去未聚合的分离胶,然后用吸水纸吸去残余水,开始配制浓缩胶。
配制5%浓缩胶:
在另一洗净的50mL小烧杯中,依次加入纯水2.85mL、30%丙烯酰胺贮存液0.85mL,Ph6.80.5MTris-HCL缓冲液1.25mL、10%SDS0.05mL,10%过硫酸铵0.025mL和TEMED0.01mL。
轻旋烧杯以充分混匀,但勿摇起泡沫。
加入TEMED后迅速将混合物沿玻璃板倒入槽内,加满,插入预先洗净、烘干的梳子。
室温下放置一段时间,使凝胶充分形成。
加入Tris-甘氨酸缓冲液(1000mL中含Tris3.03g,甘氨酸14.1g,10%电泳级SDS10mL)约1000mL,倒入电泳槽中。
拔出梳子。
用加样器长针头整理各加样孔边缘。
每孔上样15~20μL,将电源负极接至矮板一侧电极,电源正极接至高板一侧电极,电压调至100V开始电泳,直到电泳结束。
当电泳进行至样品中恶溴酚蓝指示剂距凝胶下缘约1cm时,停止电泳,卸下玻璃板,取出凝胶,在考马斯亮蓝R-250染色液中染色5h,在脱色液中充分脱色。
2结果与分析
2.1VP2基因的PCR结果
取出PCR产物10μL于1.2%琼脂糖凝胶上进行电泳,并与MarkerDL2000对照,可见在约860bp处见到一特异、明显条带,即为VP2基因见图2。
211
图2水貂阿留申病毒VP2基因PCR产物电泳分析
1.VP2基因PCR的产物;
2.DL2000DNA分子量标准;
Fig.2theagarosegelanalysisofvp2gene
1.vp2genePCRProduct;
2.DL2000DNAMarker;
2,DL2000DNAMarker;
860bp
1000bp
750bp
2.2PT-VP2重组质粒的酶切鉴定
pGem-TEasy载体的大小为3Kb,插入的完整VP2基因为860bp。
在插入的外源基因的两侧有EcoRⅠ和BamHⅠ酶切位点,因此,用EcoRⅠ和BamHⅠ可切出外源片段。
酶切鉴定结果见图3。
112
T载体
860bp
1000bp
750bp
图3重组质粒PT-VP2酶切鉴定结果
1.阳性质粒;EcoRⅠ和BamHⅠ双酶切鉴定;
2.DL2000DNA分子量标准;
Fig.3IdentificationofrecombinantplasmidPT-VP2byrestrictionendonucleasedigestion
1.positiveplasmiddigestedbyEcoRIandBamHI;
2.DL2000DNAMarker;
2.3pET-VP2重组质粒的构建
pET-32a(+)空载体的大小为5900bp,插入的编码阿留申病毒VP2基因蛋白的基因为860bp。
按照设计,用EcoRⅠ和BamHⅠ双酶切即可切出外源片段见图4。
21
图4重组质粒pET-VP2酶切鉴定结果
1.阳性质粒;EcoRⅠ和BamHⅠ双酶切鉴定;
2.DL2000DNA分子量标准;
Fig.4IdentificationofrecombinantplasmidpET-VP2byrestrictionendonucleasedigestion
1.positiveplasmiddigestedbyEcoRIandBamHI;
2.DL2000DNAMarker;
pET-32a
860bp
1000bp
750bp
2.4BL21VP2E.coli重组蛋白表达
经IPTG诱导表达,确定IPTG浓度为lmmol/L、诱导温度为37℃,从0h开始诱导,诱导5h,每1h取一次菌液,一次1mL。
SDS-PAGE分析表明,pET-VP2经诱导表达后,在2lkD处有明显的蛋白带,与预期的目的产物蛋白带大小一致,而未诱导菌没有出现相同的条带。
其大小与推测的一致见图5。
97.2KD
66.4KD
44.3KD
29.0KD
20.1KD
14.3KD
M12