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腺病毒提取与纯化腺病毒提取与纯化一、物品准备:

一、物品准备:

1、离心管:

BackmanCat:

#331372(36000rpm离心用13.2ml);BackmanCat:

#342412(65000rpm离心用5.1ml);消毒,多备用一套;2、离心管帽:

离心管BackmanCat:

#331372盖,消毒;离心管BackmanCat:

#342412外盖;离心管BackmanCat:

#342412中盖,BackmanCat:

#342883;3、热封盖:

离心管BackmanCat:

#342412热封盖,消毒;4、其他物品:

MiniQ:

2L,消毒;大烧杯(1L):

2个,消毒;中号镊子,小号镊子:

1把中号和3把小号,消毒;无菌注射器:

1ml、5ml、10ml,若干;移液枪:

1把;移液管:

2ml、10ml,若干;废液缸:

1个;无菌手套:

若干;酒精、棉球;Marker笔;二、配液:

1、CsCl:

1.25g/ml:

9.04gCsCl+25mlPBS;1.35g/ml:

12.8gCsCl+25mlPBS;1.40g/ml:

15.5gCsCl+25mlPBS;配好后过滤。

2、Viruslysisbuffer(pH7.4,50ml):

0.1%SDS0.05g10mMTrisbase0.0606g1mMEDTA0.0186g3、Dialysisbuffer(pH7.6,1.5L):

10mMTrisbase1.82g135mMNaCl11.83g1mMMgCl20.143g50%Glycerol750ml三、裂解扩增了腺病毒的293细胞:

1、从-80冰箱中取出以前扩增好的感染病毒的293细胞沉淀,解冻后用4mlPBS重悬,并转移到置于冰上的50ml离心管中;2、用绳子拴好50ml离心管,置于液氮中30分钟;3、取出后置于37水浴,摇至溶解,最大速度vortex一分钟,离心,5000rpm,10分钟;4、转移上清到一个15ml的离心管中;5、向下层沉淀中加入3ml的PBS,vortex混匀,再放于液氮中,再反复冻融两次,收集到的裂解液不超过9ml为宜;6、把收集到的上清再离心5000rpm,10分钟(上清可暂时不取出,节省步骤),放于冰上。

四、正式实验:

预冷转头至4(BackmanSW41Ti及其离心管套,BackmanVTi90),热封仪充电。

1、UV消毒超净台,检查离心机配件:

转头SW41Ti及离心管套、离心管(Cat:

#331372)、离心管盖、离心管盖固定器、离心管架;2、取出消毒好的离心管放在专用的离心管架上,用移液枪分别加2ml1.25g/mlCsCl,再在液体的底部缓慢加入1ml1.40g/mlCsCl;注:

加入时将移液管伸入到离心管底部,将移液枪调到最低档缓慢加入,拔出移液枪时也要慢,加好后可以看到不同浓度的CsCl之间有明显的分层。

4、用移液枪将293裂解液缓慢加满,配平,按1-4,2-5,3-6的顺序;注:

管子要注意做好标记。

5、用酒精擦离心管套,把装好样本的离心管轻轻放入,放上消毒好的盖子,用离心管盖固定器拧紧;注:

离心时6个离心管套都要挂上,空的离心管套也需盖上盖子并拧紧,并挂在相应的挂钩上,注意平衡。

6、离心36000rpm,65min,4;设置参数:

36000rpmenter65minenter4enterenter+star;当真空750时,开始加速,约3min可达36000rpm。

7、离心时,检查下一步离心所需配件:

转头BackmanVTi90、离心管(Cat:

#342412)、离心管架、离心管外盖、离心管中盖(Cat:

#342883)、专用螺丝、专用扳手、专用离心管加夹;8、离心完成后,小心取下离心管套,拧开盖子,用镊子取出离心管,找到要抽取的完整病毒带;9、穿刺病毒带:

用5ml注射器从病毒带下方约1ml处缓慢向斜上放刺入,抽取病毒带,抽完后用手堵住离心管上口,再将枕头抽出;注:

穿刺处先用酒精消毒,刺入时旋转,不要太用力,针头平面向上,注意不要回打,抽到病毒约1ml。

FromAdEasyVectorSystem,Qbiogene,Inc.10、将抽出来的病毒转移到5.1ml离心管(Cat:

#342412)中,用1.35g/mlCsCl填满;注:

加CsCl时要轻轻弹一弹管壁以清除气泡,加CsCl时针头应在液面以下,以减少气泡的产生,若残留气泡容易导致离心时不平衡,离心管变形。

11、热封:

用消毒好的热封盖盖好离心管口,用热封仪(cat358314)加热,垂直轻轻下压到离心管颈部与管身交界处(约30sec),用冷却管套住热封管盖冷却;12、将热封好的离心管放入到转头BackmanVTi90的对称位置,依次加入内盖、外盖,先用专用螺丝拧,再用专用扳手拧紧(用力到扳手指针达120即可);13、离心:

转头BackmanVTi90,72300rpm,3h,4;14、离心时,用75酒精消毒透析袋(剪成约5cm一个,不要太短)、夹子(要配套,一个带磁铁和一个不带磁铁),30min以上;15、离心完后,用专用的离心管夹取出离心管后置于架子上;16、第二次穿刺:

用10ml注射器针头导气,用1ml针管配5ml的针头穿刺病毒带(从病毒带下方约0.5cm处斜向上刺入),方法同前;17、病毒带抽完后,抽出注射器,用针头套套住针头,标记好至于冰上;18、透析:

取出浸泡于酒精中的透析袋,用牙签撑开透析袋,用消毒的milli-Q水冲净其上的酒精,再末端折叠一下,用夹子夹好。

将注射器中的液体注射入袋中,折叠上端,用夹子夹住,放于透析液中,隔1小时换液一次,反复3次。

最后一次的透析缓冲液保存至下次使用;注:

小心针头不要刺穿透析袋,夹子要做好标记。

19、收集病毒:

取出透析袋,用消毒milli-Q冲洗透析袋,用酒精棉球擦夹子内缘,在夹子内缘剪开透析袋,用200ul枪吸出液体转移到标记好的1.5mlEP管中-20保存;20、测浓度:

1)、要用复温好的Viruslysisbuffe裂解腺病毒:

取6ul病毒加入54ulViruslysisbuffe,第三次透析液为空白对照,做好标记;2)、水浴裂解:

56,10min;3)、测dsDNA,OD260:

首先用空白对照调零,然后放入样本读数,若在0.1-1.0之间,则可以准确反映病毒浓度,否则需要稀释或加浓。

21、计算腺病毒浓度:

公式:

VP/ml=(OD260)稀释倍数1.11012

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