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外泌体分离提纯草案

By朱旭峰

一、以超高速离心的方法来分离外泌体(细胞上清)

1.1细胞培养液(CM)是来自无菌的80%-90%的培植细胞,并用浓度比1:

1.000的蛋白酶抑制剂混合。

(sigma)

1.2快速地将CM用0.22μm的过滤筛(Millipore)过滤,来分离完整地细胞和残渣。

超速离心于120,000_g(SorvallWXULTRASERIES,rotorA-641)4℃.2小时

1.3用1mL冷的PBS重悬和清洗小囊泡,再次超速离心120,000_g(SorvallWXULTRASERIES,rotorA-641)4℃.2小时

1.4再用100μL冷的PBS重悬后转移到低粘附的管中

1.5快速地使用或置于-80℃中待用为检测外泌体的蛋白浓度,取2μL的样品置于卡上,用DirectDetect™(Millipore)

1

2材料

a)细胞培养液

b)蛋白酶抑制(Sigma)

c)过滤筛(Millipore)

d)冷的PBS

e)低粘附的管

f)DirectDetect™(Millipore)

二、以超高速离心的方法来分离外泌体(人血浆)

1.1在提取外泌体之前应该向血浆里添加1;500浓度比的蛋白酶抑制剂(Sigma)

1.2将上清液移至一个新的管中离心200*g20分钟4℃

1.3小心地再将上清液移至新的管中离心10000*g30分钟于4℃来去除较大的囊泡、

1.4此阶段的样品可以

1.5将样品用0.22μm的注射器滤筛(Millipore)过滤并且离心110000g(SorvallWXULTRASERIES,rotorF65L)2小时4℃

1.6用冷的PBS重悬后再次超速离心(110,000g,1h,4℃).,

1.7将外泌体小心干燥并且用冷的PBS重悬

1.8外泌体应该立即使用或-80摄氏度冷藏

2.材料

a)蛋白酶抑制(Sigma)

b)过滤筛(Millipore)

c)冷的PBS

d)低粘附的管

e)DirectDetect™(Millipore)

三、ExoQuickTM化学沉淀法

1.1ExoQuickTM的使用要按照厂家提供的说明书来实行

1.2该试剂盒可以简单地提取CM,人血浆,和血清里的外泌体,只需用倒相管按照所指示的量来加入ExoQuickTM试剂盒里的溶液

1.3溶液孵化过夜,在4℃温和的摇晃

1.4在流式细胞仪缓冲液中洗涤

1.5试剂盒里的带荧光的免疫磁珠已经被绑定,用流式细胞仪鉴定即可(BDBiosciences)配合使用CellQuest的软件。

2材料

a)ExoQuickTM试剂盒

b)流式细胞仪

四、用METM分离外泌体

1.1样品(CM或人血清)要按照商品说明书(NewEnglandPeptide–NEP)稀释

1.2样品要事先处理好,17,000g7分钟来去除微粒物质

1.3然后用METM试剂来孵化样品(NEPpeptide)并且用旋转震荡在室温混合15分钟

1.4孵化完的样品要室温离心10000g7分钟

1.5所有的样品要用PBS洗三次

1.6最后小囊泡要用合适的KIT缓冲液重悬

五、抗体

以下的外泌体有关的一抗和二抗是用作:

WestenBlot,ELISA和FACS(流式细胞术)

1.1mAbaCD9,mAbaCD63,mAbaCD81,mAbaCD63-FITC,aCD81-PE,来自于BecktonDickinson,

1.2mAbaCD63-biotin(BioLegend),

1.3mAbaAlix(SantaCruz),

1.4mAbaTsg101(Abcam),

1.5pAbaRab5(SantaCruz),

1.6mrAbaRab5(Epitomics),

1.7mAbaCalnexin(Abcam),

1.8二抗是anti-Mouse和anti-RabbitHRP-conjugated(Dako).专门的肿瘤外泌体(HBM1andHBM2)结合抗体由HansaBioMedR&Dteam.提供

六、用WestenBlot探测外泌体的蛋白

1.1将样品用合适容积的蛋白loadingBuffer(Lonza)重悬在合适的浓度下

1.2用SDS-page分离外泌体的蛋白质

1.3把蛋白转到硝酸纤维素膜上(GEHealthcare)

1.4一二抗体孵化

1.5信号要在暗室里用ECL附加

七、外泌体免疫捕捉和蛋白定量ELISA

1.1从已经加了不同抗体的96孔板(Nunc)里的细胞上清或者人血浆为免疫捕捉而筛选外泌体结合抗体(96孔板的抗体用碳酸氢盐缓冲液PH=9.6稀释,用0.5%BSA固定和1%的蔗糖稳定)

1.2PBS加入0.05%Tween-20(PBST)作为洗涤缓冲液,但如果有提示说明,应该用PBS稀释样品

1.3将外泌体样本,CM,人血浆样本加入96板孔内(最终容积为100μl),孵化4℃过夜或者室温2小时(可以使用商业化的exosomes捕捉平板(HansaBioMed))

1.4传统上的protocol包含使用主要的抗体(aCD9或aCD63)在样品缓冲液(0.5%BSAPBS)中稀释2小时于4℃。

1.5在大量的冲洗后,用辣根过氧化物酶二抗(BioRad),在需要的地方用样品缓冲液1小时于4℃。

基于BMBluePODSubstrate辣根过氧化物酶的底物(Roche)反应的光密度反应,在450nm的酶标仪下记录Infinite_M1000(TECAN)

a)QuantaBluFluorogenicPeroxidaseSubstrate(ThermoScientific)要用连续的激发光束在325/425nm

b)SuperSignalWestFemtoChemiluminescentSubstrate(ThermoScientific)要先孵化1分钟然后在酶标仪化学发光模式读数

2.材料

a)96孔板

b)碳酸氢盐缓冲液PH=9.6

c)BSAPBSTween-20蔗糖

d)辣根过氧化物酶二抗

e)辣根过氧化物酶的底物

f)酶标仪

八、磁珠捕获外泌体

1.商业化的预包裹的乳胶微球

1.1根据商品说明书(HansaBioMed)来分离外泌体

1.2每个样品先用1ml的PBS来稀释

1.3选用合适的珠子去孵化4℃过夜,旋转震荡。

1.4之后可以用离心的方法来分离(5000个,10分钟),再用PBST洗涤3次。

2.磁珠分离法

2.1比较了“1μm大小的链霉亲和素磁珠”(ThermoScientific,88816)和“亚显微大小的超磁力珠”(内部订购)

2.2先用PBST洗涤磁珠然后加入1.2μg的抗体(外泌体结合的同种抗体,CD9抗体(BecktonDickinson))

2.3生物素化的抗体用于链霉亲和素磁珠,然后用PBST洗三次,再用合适的固定剂固定(干酪素,BSA或人血清)室温1小时

2.4重悬于PBS,然后加入样品(CM或人血浆)

2.5为了最终可以富集磁珠到近108/ml,将其孵化过夜4摄氏度旋转rotation

2.6用电磁分离磁珠,在量化外泌体蛋白或提取外泌体RNA之前用PBST洗三次

2.7磁珠也会溶解于Laemmlibuffer,所以在做为westenbolt先将其煮沸

或者可以选择做bead-basedELISA

3.免疫珠分离法

3.1用主要的抗体孵化免疫磁珠2小时于室温,用ELISA缓冲液冲洗

3.2再加入二抗(辣根过氧化物酶)孵化1小时,然后大量的冲洗之

3.3为了可以被侦测到,需加入底物BMBluePODSubstrate(Roche),孵化10分钟为了终止反应,加入硫酸,并在450nm波长下读数

4.材料

a)商品化的磁珠

b)辣根过氧化物酶二抗

c)辣根过氧化物酶的底物

d)酶标仪

e)PBST

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