分子生物学名词解释.docx
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分子生物学名词解释
1.MolecularBiology:
分子生物学。
在分子水平上研究生命现象的科学。
通过研究生物大分子(核酸、蛋白质)的结构、功能和生物合成等方面来阐明各种生命现象的本质。
2.DenaturationofProteinandDNA:
蛋白质和DNA变性。
蛋白质变性(proteindenaturation)是指蛋白质在某些物理和化学因素作用下其特定的空间构象被改变,从而导致其理化性质的改变和生物活性的丧失的现象;DNA变性是指DNA分子由稳定的双螺旋结构松解为无规则线性结构的现象。
3.SouthernBlotting:
Southern印迹杂交。
利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反应显色,从而检测特定DNA分子的含量。
4.GeneCloning:
基因克隆。
从基因组或DNA中分离单个基因,并在细胞中复制拷贝的过程。
5.Nicktranslation:
缺刻翻译。
是实验室最常用了一种脱氧核糖核酸探针标记法,利用大肠杆菌DNA多聚酶I的多种酶促活性将标记的dNTP掺入到新合成的DNA链中,从而形成高比活性的均匀标记DNA探针。
6.YACVector:
酵母人工染色体载体。
是将酵母人工染色体中为复制与分离所需序列同片段目的DNA连接构成的,可克隆的外源片段长度可大于1Mb。
YACVector含有两个端粒序列、一个着丝粒、一个自主复制序列以及能在酵母中用作筛选标记的基因。
7.cDNALibrary:
cDNA文库。
以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。
8.MultiplecistronmRNA:
多顺反子mRNA。
在原核细胞中,通常是几种不同的mRNA连在一起,相互之间由一段短的不编码蛋白质的间隔序列所隔开,这种mRNA叫做多顺反子mRNA。
9.UbiquitinandUbiquitination:
泛素和泛素化。
泛素是一种存在于大多数真核细胞中的由76个氨基酸残基组成小蛋白。
泛素化是指对特异的靶蛋白进行泛素修饰的过程。
10.DNAladder:
DNA梯子。
细胞调亡时DNA在核小体间断裂形成一些DNA片断,提取后由一些特殊质粒被特定内切酶消化,在凝胶电泳上产生很多条带的核酸片段,由于成梯状,故称之为DNALadder。
11.Co-translationalTranslocation:
共翻译转移。
多肽自转移类型之一,蛋白质的共翻译转移首先是在游离核糖体上合成一段信号肽,指导核糖体结合到糙面内质网膜上,然后肽链边合成边进入内质网腔,经过初步加工和修饰后,部分多肽以囊泡形式被运送至高尔基体,进一步加工和修饰后被运送至质膜活被分泌到胞外。
12.GroupITransmembraneProtein:
I类跨膜蛋白。
能够选择性的使非自由扩散的小分子物质透过质膜的膜蛋白。
13.NLSandNES:
核定位信号,核输出信号。
核定位信号是另一种形式的信号肽,可位于多肽序列的任何部分。
一般含有4~8个氨基酸,且没有专一性,作用是帮助亲核蛋白进入细胞核;核输出信号是细胞核内形成的大分子复合物上的氨基酸序列,起分拣信号作用,可被核孔复合体上的输出受体所识别,引导大分子从细胞核经核孔复合体输出到细胞质。
14.RNPs:
核糖核蛋白。
由RNA和蛋白质形成的复合物。
15.RNASplicing:
RNA剪接。
从DNA模板链转录出的最初转录产物中除去内含子,并将外显子连接起来形成一个连续的RNA分子的过程。
16.RibozymeI:
核酶I。
一种可以催化特定生化反应的RNA分子。
17.TBPandTAFs:
TATA结合蛋白和TBP相关因子。
18.AlternativeProcessingofRNA:
19.RNAEditing:
RNA编辑。
在初级转录物上增加、删除或取代某些核苷酸而改变遗传信息。
20.ZincFingerDomain:
锌指结构。
一种常出现在DNA结合蛋白中的一种结构基元,是由一个含有大约30个氨基酸的环和一个与环上的4个Cys或2个Cys和2个His配位的Zn2+构成,形成的结构像手指状。
21.Northern Blotting:
northern杂交。
将电泳凝胶中的RNA转移到叠氮化的或其他化学修饰的活性滤纸上,通过共价交联作用使它们结合。
22.Molecular Cloning:
分子克隆。
将核酸分子插入到可在原核或真核细胞中无性繁殖的载体中,经过筛选获得单一克隆群体的技术。
23.ShuttleVector:
穿梭载体。
指含有两个亲缘关系不同的复制子,能在两种不同的生物中复制的克隆载体。
24.TiplasmidandT-DNA:
Ti质粒和转移DNA。
Ti质粒根瘤农杆菌染色体外的环状双链DNA质粒,能诱导植物产生异常氨基酸和冠瘿碱或二者之一,并诱生冠瘿瘤。
转移DNA是指农杆菌质粒中的一段可以从农杆菌中转移并稳定整合到植物核基因组中的DNA序列。
25.Genomic Library:
基因组文库。
某种生物全部基因组DNA序列的随机片段重组DNA克隆的群体。
26.SinglecistronmRNA:
单顺反子mRNA。
只编码一条多肽链的顺反子mRNA。
27.Proteasome:
蛋白酶体。
存在于部分原核细胞所有真核细胞中,降解细胞质溶酶体外蛋白质的体系,由10~20个不同亚基组成,可显示多种肽酶活性。
28.Post-translational Translocation:
29.GroupIITransmembraneProtein:
II类跨膜蛋白质。
整合质膜蛋白的一种,在一次跨膜时,多肽链的C端在细胞膜外,N端在细胞膜内。
30.RNAProcessing:
RNA加工。
初级转录产物转变为成熟RNA的过程,如通过剪接切除内含子、mRNA5’端加帽,3’端加尾等。
31.RNaseH:
降解RNA-DNA异源双链中的RNA链的核酸酶。
32.RibozymeII:
核酶II。
33.AlternativeSplicingofRNA:
RNA的剪接。
hnRNA在加工成为mRNA的过程中,切掉内含子,拼接外显子的RNA加工过程。
34.Topoisomerase:
拓扑异构酶。
存在于细胞核内的能够催化DNA链的断裂和结合,从而控制DNA的拓扑状态的异类酶。
35.DenaturationofDNAandTm:
DNA变性和变性温度。
DNA热变性时,其紫外吸收增加值到达总增加值一半时的温度,称为DNA的变性温度。
36.Semiconservative replication:
半保留复制。
DNA复制时亲代DNA的两条链解开,每条链作为新链的模板,从而形成两个子代DNA分子,每一个子代DNA分子包含一条亲代链和一条新合成的链。
37.RNA terminator:
RNA终止子。
38.Transcription:
转录。
以DNA的碱基序列为模板,在RNA聚合酶催化下合成互补的单链RNA分子的过程。
39.Footprinting:
足迹法。
一种用来测定DNA-蛋白质专一性结合的方法,用于检测与特定蛋白质结合的DNA序列的部位,可展示蛋白质因子同特定DNA片段之间的结合区域。
40.σfactor:
σ因子。
原核生物中与RNA聚合酶核心酶相结合而特异性识别启动子选择转录起始点的一个蛋白质亚基。
41.Telomere and telomerase:
端粒和端粒酶,端粒是真核染色体两臂末端由特定的DNA重复序列构成的结构。
使正常染色体端部间不发生融合,保证每条染色体的完整性。
端粒酶是指一种自身携带模板的逆转录酶,由RNA和蛋白质组成,RNA组分中含有一段短的模板序列与端粒DNA的重复序列互补,而其蛋白质组分具有逆转录酶活性,以RNA为模板催化端粒DNA的合成,将其加到端粒的3′端,以维持端粒长度及功能。
42.Trans-acting products:
反式作用元件。
一类与基因表达调控有关的蛋白质因子,与顺式作用元件相作用。
43.CRP(CAP):
cAMP受体蛋白,是指能与细胞内第二信使cAMP特异结合的蛋白受体。
44.UCEandUBF:
上游控制序列和上游结合因子。
UCE指在启动子上游存在的TATA框,CAAT框和多个GC框,它们均对启动子的启动过程起调控作用。
UBF是一种特异的DNA结合蛋白,可以与UCE结合,还可以与核心元件上游的一段序列结合。
45.Internal promoter:
内部启动子,存在于RNA聚合酶Ⅲ中。
46.Enhancer:
增强子,是指增强基因启动子工作效率的顺式作用序列,能够在相对于启动子的任何方向和任何位置(上游或下游)上都发挥作用。
47.Geneexpression:
基因表达,使基因所携带的遗传信息表现为表型的过程。
包括基因转录成互补的RNA序列。
对于结构基因,信使核糖核酸(mRNA)继而翻译成多肽链,并装配加工成最终的蛋白质产物。
48.General(basal) transcription factors:
通用转录因子,RNA聚合酶介导基因转录时所必需的一类辅助蛋白质,帮助聚合酶与启动子结合并起始转录。
与作用于特定基因的调节蛋白不同,对所有基因都是必需的。
49.Codondegeneracy:
密码子的简并性,一个氨基酸由一个以上的三联体密码编码的现象叫做密码子的简并性。
50.Acidic activation domains:
酸性激活域,转录激活区的一种,该结构域含有很高比例的酸性氨基酸,故名。
51.Proteinsorting:
蛋白质的分选,主要是指膜结合核糖体上合成的蛋白质,通过信号肽,在翻译的同时进入内质网,然后经过各种加工和修饰,使不同去向的蛋白质带上不同的标记,最后经过高尔基体反面网络进行分选,包装到不同类型的小泡,并运送到目的地。
广义的蛋白质分选也包括在游离核糖体上合成的蛋白质的定位。
52.Cot1/2:
半变Cot值。
DNA初始浓度与复性完成一半时间的乘积。
53.Leadingstrandandlaggingstrand:
前导链和后滞链。
前导链:
与复制叉移动的方向一致,通过连续的5ˊ-3ˊ聚合合成的新的DNA链。
54.D-loopReplication:
D-环复制,双螺旋的两条链并不同时进行复制,轻链先开始复制,稍后重链再开始复制,当复制沿轻链开始时,重链上产生了D环,随环形轻链复制的进行,D环增大,重链后亦开始复制,最后两条链完成复制形成两条新的DNA又螺旋。
55.Primarytranscript:
初级转录产物。
初级转录RNA中既包含编码蛋白质的外显子,也包含非编码的内含子,即为成熟的RNA前体。
56.Rho-dependentterminator:
依赖ρ因子的终止子,在大肠杆菌中,有两种类型的终止子:
一类终止子必须在ρ因子的存在下才能终止转录,因此称为依赖ρ因子的终止子。
57.Cis-actingsequence:
顺式作用序列,存在于基因旁侧序列中能影响基因表达的序列。
它们的作用是参与基因表达的调控,本身不编码任何的蛋白质,仅仅提供一个作用位点,要与反式作用因子相互作用才能起作用。
58.Alternative σ factor:
替代σ因子。
从一套基因的转录到另一套基因的表达是噬菌体感染的共同特点,这些改变通过RNA聚合酶的合成来完成或通过变换σ因子完成。
59.CTD andTFIIH:
反式作用因子,是指能直接或间接的识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上参与调控靶基因转录效率的蛋白质;TFIIH是一个大的既有激酶活性又有螺旋酶活性的多组分蛋白质复合体。
60.UBFandSL1:
上游结合因子和选择性因子1。
上游结合因子是一种特异的DNA结合蛋白,可以与UCE结合,还可以与核心元件上游的一段序列结合。
61.TAFIIs:
TBP相联因子。
62.Leucinezipperprotein:
亮氨酸拉链。
一种蛋白质中常见的结构模体,由一组重复片段组成,每个重复片段的第7个氨基酸残基均为亮氨酸,两条含有此模体的多肽链可形成卷曲螺旋结构,最初发现于DNA结合蛋白,但也可存在于其他类型蛋白质。
63.Basal transcription apparatus:
基本转录装置。
64.Genetic code:
遗传密码,包含在脱氧核糖核酸或核糖核酸核苷酸序列中的遗传信息。
65.Leader sequence of protein:
蛋白质的前导序列。
蛋白质短的N端序列,负责进出膜。
66.Physical map:
物理图谱,是利用限制性内切酶将染色体切成片段,再根据重叠序列确定片段间连接顺序,以及遗传标志之间物理距离[碱基对(bp)或千碱基(kb)或兆碱基(Mb)]的图谱。
67.Anti-senseRNA and Antisense DNA strand:
反义RNA和DNA反义链。
反义RNA是指与mRNA互补的RNA分子,也包括与其他RNA互补的RNA分子;DNA反义链是与DNA模板链互补的不参与转录的DNA分子。
68.Preprotein:
前体蛋白。
由mRNA翻译来的未经加工的多肽链。
69.Geneexpression:
基因表达,使基因所携带的遗传信息表现为表型的过程。
包括基因转录成互补的RNA序列。
对于结构基因,信使核糖核酸(mRNA)继而翻译成多肽链,并装配加工成最终的蛋白质产物。
70.Transcriptional Terminator:
转录终止子。
一种位于poly(A)位点下游,长度在数百碱基以内的结构。
71.Enchancer:
增强子,增强基因启动子工作效率的顺式作用序列,能够在相对于启动子的任何方向和任何位置(上游或下游)上都发挥作用。
72.Transcriptionunit:
转录单元,转录单元是一段以启动子开始至终止子结束的DNA序列。
73.Co-repressorand co-activator:
共阻遏和辅激活物
74.Attenuation of transcription:
转录衰减,指由RNA聚合酶的作用使DNA上的转录起始区域(启动基因)已开始了的转录反应,在操纵子内部的一定区域(转录衰减区)几乎停止,其以后的区域转录显著减少,此称转录衰减。
75.Attenuator:
衰减子,在色氨酸操纵子中的一个区域,此区域以形成不同二级结构的方式,利用原核生物转录与翻译的偶联对转录进行调节。
此区域只存在于原核生物合成代谢的操纵子中。
76.RT-PCR and cDNA library:
反转录PCR和cDNA文库。
反转录PCR是将反转录和cDNA的聚合酶链式扩增相结合的技术;cDNA文库是指包含细胞所有的mRNA信息的cDNA克隆集合。
77.Zincfingermotif:
锌指结构。
78.Leaderpeptidesequence:
蛋白质前导序列。
多顺反子mRNA的头一条多肽链合成起点同RNA分子的5’-P末端间距离可达数百个核苷酸,这段编码之前的不转录的mRNA区段称为前导序列。
79.cDNA and T-DNA:
cDNA是指与某一RNA链呈互补的碱基序列的单链DNA;T-RNA,农杆菌Ti或Ri质粒中的一段DNA序列,可以从农杆菌中转移并稳定整合到植物核基因组中;
80.Proteintranslocation:
81.CTDof RNA polymeraseII:
82.Promoter:
启动子,DNA分子上能与RNA聚合酶结合并形成转录起始复合体的区域,在许多情况下,还包括促进这一过程的调节蛋白的结合位点。
83.Operon:
操纵子,指包含结构基因、操纵基因以及调节基因的一些相邻基因组成的DNA片段,其中结构基因的表达受到操纵基因的调控。
84.Ribozyme:
核酶,是具有催化功能的RNA分子,是生物催化剂,核酶又称核酸类酶、酶RNA、核酶类酶RNA。
85.Transcription activation domains:
转录激活结构域:
包括酸性氨基酸的激活结构域、富含Gln的结构域和富含Pro的结构域。
86.Transcription repressor domains:
转录阻遏物结构域。
间接干扰转录激活物的功能而对转录起阻遏作用的区域。
87.SL1:
选择性因子1,由四个亚基组成,三个TAF1和一个TBP.SL1为RNA聚合酶I转录所必需.它结合并稳定UBF-DNA复合物,且与核心元件游离的下游部分相互作用。
SL1的结合使得RNA聚合酶I能与上述复合物结合并起始转录,对rRNA转录非常重要。
88.CAP:
降解物活化蛋白,又称分解代谢基因活化蛋白,在分解代谢阻遏中调节基因的产物是降解物基因活化蛋白(CAP),它能与环腺苷酸(cAMP)结合而被活化,帮助RNA聚合酶与启动子结合,促进转录进行。
降解物活化蛋白降解物活化蛋白降解物活化蛋白降解物活化蛋白
89.Replicon:
复制子,一个复制单位,包括真核的复制起点和位于两侧的复制终点之间的区域。
90.Expressionvector:
表达载体,设计好的克隆载体,使编码序列插入特定的位点,能够转录和翻译成蛋白质。
91.CloningVector:
克隆载体,携带插入外源片段的质粒或噬菌体,从而产生更多物质或蛋白质产物。
92.Semi-DiscontinuousReplication:
半不连续复制,一条新链连续合成而另一条链不连续合成的模式。
93.OriginofReplication/ori:
复制起点,基因组中单一DNA复制时的所需要的起始序列。
含AT碱基对丰富,易解链。
真核细胞染色体含有多个起始点,而细菌染色体和质粒中只有一个。
94.Frame-shifting:
移码,在DNA编码区插入或缺失碱基导致下游密码子的可读框发生移动或改变。
95.Pre-mRNA:
不均一核RNA,真核生物mRNA的前体 真核生物mRNA通常都有相应的前体。
从DNA转录产生的原始转录产物可称作原始前体(或mRNA前体)。
一般认为原始前体要经过不均一核RNA阶段,最终才被加工为成熟的mRNA.
96.PrimarymRNA:
主要mRNA,信使RNA(mRNA):
把DNA上的控制蛋白质合成的遗传信息传递给核糖体的中介物质。
97.不均一核RNA(hnRNA):
它是mRNA的未成熟前体,需要经过加帽、加尾、剪切、剪接等步骤称为成熟mRNA。
98.转运RNA(tRNA):
携带氨基酸进入核糖体,在mRNA指导下合成蛋白质。
99.核糖体RNA(rRNA):
细胞内含量最多的RNA,它与蛋白质结合而形成核糖体,其功能是作为mRNA的支架,使mRNA分子在其上展开,实现蛋白质的合成。
100.核内小分子RNA(snRNA):
它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。
101.核仁小分子RNA(snoRNA):
真核生物中,指导rRNA前体的甲基化、假尿苷酸化和切割。
102.MultipleCloneSitea:
多克隆位点,DNA载体序列上人工合成的一段序列,含有多个限制内切酶识别位点。
能为外源DNA提供多种可插入的位置或插入方案。
103.Spliceosome:
剪接体,由核小RNA(snRNA,U1、U2、U4、U5、U6等)和蛋白质因子(约100多种)动态组成、识别RNA前体的剪接位点并催化剪接反应的核糖核蛋白复合体。
104.TranscriptionActivationDomain:
转录激活结构域,通过直接结合或间接作用于DNA、RNA等核酸分子,对基因表达发挥不同调节作用(激活或抑制)的各类蛋白质因子。
分子结构由两个结构域组成,一部分用来结合DNA,另一部分用来激活转录。
其中激活转录的部分叫做转录激活结构域。
105.snRNPs:
小核核糖核蛋白,核内小分子RNA与组蛋白结合在一起的复合物。
106.hnRNPs:
核不均一核糖核蛋白,不均一核RNA与组蛋白结合在一起的复合物。
107.DNAFingerPrintingDNA:
指纹图谱, 通过用限制性内切酶消化和与特异的核心探针杂交取得不同大小的DNA片段的多点区带图谱,并经与另一个休的DNA图谱比较以评价其相似性的技术。
对多点带图谱中个体的特异性进行评价的方法被称为“DNA指纹图谱法”。
是根据没有两个无亲缘关系的个体在同一位置上共有同相同的区带图谱的机率极低,所以DNA指纹图被认为对某一个体是独特的。
这种技术已广泛地应用地法医和亲子鉴定。
108.cis-actingelement:
顺式作用元件,DNA、RNA或者蛋白质中的一些特殊的核酸或氨基酸残基序列,只作用于与其连接在一起的靶,而不作用于不与其相连的靶。
109.cDNAclone,cDNA克隆,是以mRNA为原材料,经体外反转录合成互补的DNA(cDNA),再与载体DNA分子连接引入寄主细胞。
每一cDNA反映一种mRNA的结构,cDNA克隆的分布也反映了mRNA的分布。
110.Exon:
外显子,基因组DNA中出现在成熟RNA分子上的序列。
外显子被内含子隔开,转录后经过加工被连接在一起,生成成熟的RNA分子。
信使核糖核酸(mRNA)所携带的信息参与指定蛋白质产物的氨基酸排列。
111.PolycistronicmRNA,多顺反子mRNA,两个以上相关基因串在一起转录所得到的信使核糖核酸(mRNA)。
多顺反子mRNA一般可同步翻译产生功能相关的多个蛋白质或酶。
112.Okazakifragment:
冈崎片段,在DNA不连续复制过程中,沿着后随链的模板链合成的新DNA片段,其长度在真核与原核生物当中存在差别,真核生物的冈崎片段长度约为100~200核苷酸残基,而原核生物的为1000~2000核苷酸残基。
113.PCR,聚合酶链式反应,是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,由高温变性、低温退火及适温延伸等几步反应组成一个周期,循环进行,使目的DNA得以迅速扩增,具有特异性强、灵敏度高、操作简便、省时等特点。
114.Kinase:
激酶,
(1)全称“磷酸激酶(phosphokinase)”。
催化ATP上的5′-磷酸基团转移到其他化合物上的酶。
也偶尔催化其他三磷酸核苷上磷酸基团转移。
(2)催化酶原转变为有活性的酶。
115.Shine-Dalgarnosequence:
SD序列,信使核糖核酸(mRNA)翻译起点上游与原核16S核糖体RNA或真核18SrRNA3′端富含嘧啶的7核苷酸序列互补的富含嘌呤的3~7个核苷酸序列(AGGAGG),是核糖体小亚基与mRNA结合并形成正确的前起始复合体的一段序列。
116.Mismatchrepair:
错配修复,一种纠正DNA复制过程中错配碱基的机制。
核酸外切酶识别不能形成氢键的错配碱基,并切除一段多核苷酸,缺口由DNA聚合酶Ⅰ修补及DNA连接酶封口。
117.Excisionrepair:
切除修复