最新PubMed中文使用手册.docx
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最新PubMed中文使用手册
PubMed-中文使用手册
PubMed使用手冊
PubMed使用手冊
PubMed為NationalLibraryofMedicine（NLM）之NationalCenterforBiotechnologyInformation（NCBI）所研發製作之醫學相關文獻資料庫，免費提供外界查詢使用。
◆Coverage:
1.MEDLINE:
mid-1960’s
15millioncitations,4,800biomedicaljournals
70+countries
English-languagesourcesorabstractinEnglish
2.OLDMEDLINE
1950-1965
2millioncitations
noMeSHindexandabstract
3.InProcessCitations
4.在收錄MEDLINE資料庫前的基本書目資料，為日更新（TuesdaythroughSaturday）而且顯示註記[PubMed-inprocess]. 新增資料加上MeSHterms,publicationtypes,GenBankAccessionnumbers等相關資料後顯示註記[PubMed-indexedforMEDLINE].
5.Publisher-SuppliedCitations
6.出版社提供PubMed電子書目資料註記[PubMed-assuppliedbypublisher]，新出版社提供資料更新從星期二至星期六，多數資料處理過程從"in-process"到後來的"indexedforMEDLINE"。
然而沒有做索引的書目資料將維持註記[PubMed-assuppliedbypublisher]or[PubMed]。
◆PubMed檢索功能
1.關鍵字：
可使用AND,OR,NOT（需大寫）
2.作者：
∙Entertheauthor’snameintheformatoflastnamefollowedbyinitials.Omitpunctuation.如Simthja
∙如要停止系統做自動作切截查詢，可輸入雙引號和作者欄位名稱，e.g.,"smithj"[au]
3.期刊名：
有下列方式
∙fulljournaltitle（e.g.,molecularbiologyofthecell）
∙titleabbreviation（e.g.,molbiolcell）
∙ISSNnumber,astandardizedinternationalcode（e.g.,1059-1524）
4.片語：
PubMed自動將檢索詞對照MESH主題表，如需直接以phrase查詢，用雙引號註明。
∙Enclosethephraseindoublequotes:
“kidneyallograft”
∙Useasearchtag:
kidneyallograft[tw]
∙Useahyphen:
SARS-CoV
∙Truncate:
kidneyallograft*
5.切截Truncate：
在字根後輸入星號，eg.Flavor*。
如結果超過六百個變化字，系統將出現警示語。
◆
SearchResult
∙Display有Summary,Brief,Abstract,MEDLINE….等格式，如批次轉入DDS，需為Summary格式。
如要轉入EndNote/RM，需為MEDLINE格式。
∙Show螢幕顯示筆數可設定5,10,20,100,200,500筆
∙Sortby可以Author,Journal,PublicationDate作排序
∙Sendto可選擇Text,File,Clipboard,E-mail,RSSFeed,Order。
∙以RSS為例，勾選檢索結果的紀錄後，選擇SendtoRSSFeed，再按下CreateFeed：
∙
點選XML之後產生新視窗，將其URL加入RSS閱讀器內，便可隨時由RSSReader（如:
Mxie）收到最新資料。
另一種方式為設定MyNCBI，將以e-mail寄送最新資料。
其設定方式在最後一個章節介紹。
∙CitationFilter,檢索結果自動產生All和Review文章兩種結果。
除了Review文章外，可由MyNCBI自訂filters，亦將在MyNCBI介紹設定方式。
∙
∙每篇紀錄之圖示
無摘要/有摘要，如本院有訂購此電子期刊，在IP範圍內可閱讀全文。
本院電子期刊清單詳圖書館網頁。
（橘色）PubMedCentral,isafreedigitalarchiveoffull-textjournalarticlesmaintainedbyNIH
（綠色）Freefrompublisher
∙RelatedArticles依據該筆記錄Title,Abstract,MESH欄位搜尋相關文獻。
∙Links依據該筆記錄連結至其他資源，如：
CitedArticles參考文獻
CitedinPMC
FreeinPMC
Books電子書
LinkOut:
publishers,aggregators,libraries,biologicaldatabases,sequencecenters等。
◆FeatureBar工具列介紹
1.Limitation
可作欄位、資料類型、年齡、語言、人類或動物、子類目Subset、性別及日期的限制查詢。
2.Preview/Index
輸入檢索詞後按Preview顯示檢索筆數，可用來調整檢索策略進行AND,OR,NOT查詢。
或者按Index顯示索引典和資料筆數，可term按住CTRL選擇多個，再點選AND,OR,NOT作查詢。
在此只顯示最近三筆檢索策略。
3.History
顯示檢索歷史，但只保存八小時，可再用布林邏輯作檢索策略整合查詢。
e.g.,#2AND#6
4.Clipboard
從PubMed檢索結果勾選需要的紀錄，在Sendto欄位選擇Clipboard存放在暫存區，所選擇的筆數將轉為綠色號碼，最多可存500筆記錄，可保留八個小時。
另外，Clipboard的書目編號訂為#0,可再和其他檢索策略作布林邏輯查詢
5.Detail要查驗檢索詞的執行情況，可選擇“Details”鍵。
可進行編輯檢索策略或按URL產生網頁加入「我的最愛」。
備註：
如果用History功能#1AND#2執行檢索者，無法產生URL。
◆
PubMedServices
⏹JournalDatabase，查詢該期刊的資訊：
全名、簡稱、ISSN。
⏹MESH（MedicalSubjectHeadings）是MEDLINE的控制詞彙索引典，提供詞彙的層級關係，做更有效的檢索。
如以AIDS查看MESH，其Display格式中的PubMedLink可連至PubMed以該term檢索，如勾選多個標題彼此以OR關係做查詢。
每個標題右側的Links包括下列連結：
∙PubMed–連至PubMed查詢MeSHterm
∙ClinicalQueries–連至theClinicalQueriesquerybox
∙NLMMeSHBrowser–連至NLMMeSHBrowser
在Sendto欄位中，SearchBox功能提供標題的布林邏輯檢索
1.選擇FullDisplay，勾選MeSH標題及其副標題
2.使用Sendtopull-downmenu選擇SearchBoxwithAND,OR,NOT作查詢
3.可再查詢其他MeSHterm,加入SearchBox
4.完成後點選SearchPubMed
⏹SingleCitationMatcher單筆引文查詢:
可利用journal、date、volume、issue…來查該篇文章的資料
點選Go之後出現該篇文章
BatchCitationMatcher批次引文查詢，輸入100筆之記錄以取得該文獻之PMID號碼。
資料輸入特定格式的順序依次為:
|Journal_Title|year|volume|first_page|Author_Name|Your_key|
再以PMID號碼輸入PubMed檢索欄內，獲得該筆記錄資料。
如果該篇紀錄無法找到，將顯示下列三種情況：
∙INVALID_JOURNAL期刊縮寫不正確
∙NOT_FOUND有效的期刊名，但其他資訊錯誤
∙AMBIGUOUS所提供資訊查到超過一篇紀錄
⏹ClinicalQueries包括三類
（1）SearchbyClinicalStudyCategory:
限制在特殊方法上的臨床文獻，可設定查詢範圍較廣或較小。
如查詢囊胞性纖維症診斷的研究researchondiagnosingcysticfibrosis
ClinicalQueriesusingResearchMethodologyFilters
Category
OptimizedFor
Broad/Narrow
PubMedEquivalent
therapy
sensitive/broad
99%/70%
（（clinical[Title/Abstract]ANDtrial[Title/Abstract]）ORclinicaltrials[MeSHTerms]ORclinicaltrial[PublicationType]ORrandom*[Title/Abstract]ORrandomallocation[MeSHTerms]ORtherapeuticuse[MeSHSubheading]）
specific/narrow
93%/97%
（randomizedcontrolledtrial[PublicationType]OR（randomized[Title/Abstract]ANDcontrolled[Title/Abstract]ANDtrial[Title/Abstract]））
diagnosis
sensitive/broad
98%/74%
（sensitiv*[Title/Abstract]ORsensitivityandspecificity[MeSHTerms]ORdiagnos*[Title/Abstract]ORdiagnosis[MeSH:
noexp]ORdiagnostic*[MeSH:
noexp]ORdiagnosis,differential[MeSH:
noexp]ORdiagnosis[Subheading:
noexp]）
specific/narrow
64%/98%
（specificity[Title/Abstract]）
etiology
sensitive/broad
93%/63%
（risk*[Title/Abstract]ORrisk*[MeSH:
noexp]ORrisk*[MeSH:
noexp]ORcohortstudies[MeSHTerms]ORgroup*[TextWord]）
specific/narrow
51%/95%
（（relative[Title/Abstract]ANDrisk*[Title/Abstract]）OR（relativerisk[TextWord]）ORrisks[TextWord]ORcohortstudies[MeSH:
noexp]OR（cohort[Title/Abstract]ANDstud*[Title/Abstract]））
prognosis
sensitive/broad
90%/80%
（incidence[MeSH:
noexp]ORmortality[MeSHTerms]ORfollowupstudies[MeSH:
noexp]ORprognos*[TextWord]ORpredict*[TextWord]ORcourse*[TextWord]）
specific/narrow
52%/94%
（prognos*[Title/Abstract]OR（first[Title/Abstract]ANDepisode[Title/Abstract]）ORcohort[Title/Abstract]）
clinicalpredictionguides
sensitive/broad
96%/79%
（predict*[tiab]ORpredictivevalueoftests[mh]ORscor*[tiab]ORobserv*[tiab]ORobservervariation[mh]）
specific/narrow
54%/99%
（validation[tiab]ORvalidate[tiab]）
（2）FindingSystematicReviews:
查詢系統化評論文獻，包括下列主題之生醫文獻：
osystematicreviews
ometa-analyses
oreviewsofclinicaltrials
oevidence-basedmedicine
oconsensusdevelopmentconferences
oguidelines
ocitationsfromjournalsspecializinginclinicalreviewstudies
如查詢SystematicReviewsoninhalationtherapyforpneumonia肺炎吸入療法
（3）MedicalGeneticsSearches,developedinconjunctionwiththestaffofGeneReviews:
GeneticDiseaseOnlineReviewsatGeneTests,UniversityofWashington,Seattle.作遺傳基因學方面不同主題查詢，如查詢geneticcounselingforsicklecellanemia鐮狀細胞性貧血的相關資料
MedicalGeneticsSearchFilters
Category
PubMedEquivalent
Diagnosis
（DiagnosisANDGenetics）
DifferentialDiagnosis
（DifferentialDiagnosis[MeSH]ORDifferentialDiagnosis[TextWord]ANDGenetics）
ClinicalDescription
（NaturalHistoryORMortalityORPhenotypeORPrevalenceORPenetranceANDGenetics）
Management
（therapy[Subheading]ORtreatment[TextWord]ORtreatmentoutcomeORinvestigationaltherapiesANDGenetics）
GeneticCounseling
（GeneticCounselingORInheritancepatternANDgenetics）
MolecularGenetics
（MedicalGeneticsORgenotypeORgenetics[Subheading]ANDgenetics）
GeneticTesting
（DNAMutationalAnalysisORLaboratorytechniquesandproceduresORGeneticMarkersORdiagnosisORtestingORtestORscreeningORmutagenicitytestsORgenetictechniquesORmoleculardiagnostictechniquesANDgenetics）
All
（（DiagnosisANDgenetics）OR（DifferentialDiagnosis[MeSH]ORDifferentialDiagnosis[TextWord]ANDgenetics）OR（NaturalHistoryORMortalityORPhenotypeORPrevalenceORPenetranceANDgenetics）OR（therapy[Subheading]ORtreatment[TextWord]ORtreatmentoutcomeORinvestigationaltherapiesANDgenetics）OR（GeneticCounselingORInheritancepatternANDgenetics）OR（MedicalGeneticsORgenotypeORgenetics[Subheading]ANDgenetics）OR（DNAMutationalAnalysisORLaboratorytechniquesandproceduresORGeneticMarkersORdiagnosisORtestingORtestORscreeningORmutagenicitytestsORgenetictechniquesORmoleculardiagnostictechniquesANDgenetics））
⏹SpecialQueries提供PubMed各種特殊主題限制查詢
⏹LinkOutisafeatureofEntrezthatisdesignedtoprovideuserswithlinksfromPubMedandotherEntrezdatabasestoawidevarietyofrelevantweb-accessibleonlineresources,includingfull-textpublications,biologicaldatabases,consumerhealthinformation,researchtools,andmore.
⏹MyNCBI可執行下列功能：
（1）Savesearches
（2）Setupe-mailalertsfornewcontent
（3）DisplaylinkstoWebresources（LinkOut）
（4）Choosefiltersthatgroupsearchresults
必須先註冊UserName（3-10alpha-numericcharacters）andaPassword（6-8alpha-numericcharacters）.
¤Savesearches
¤註冊進入MyNCBI後執行檢索，在欄位右邊點選SaveSearch，將詢問是否要收到emailupdate
¤Filter
先選擇資料庫PubMed:
（1）
QuickPicklistofcommonly-requestedfilters
（2）
BrowsetobrowsefiltersandLinkOutprovidersbycategory.
（3）SearchtosearchthefilterandLinkOutprovidernamesanddescriptions.例如查詢台灣所提供的連結
（4）MySelectionstoseealistofyourcurrentfilterandLinkOutprovidericonsettings
設定完成後檢索PubMed便可看到所設定的filter頁籤。
¤OutsideTool
OutsideToolallowsinstitutionstodisplayaniconlinkbacktotheirinstitutionontheAbstractandCitationformatforallPubMedcitations.TheiconlinkisthebaseURLprovidedbytheinstitutionandthePMIDofthecitation.機構的SFX連結可再檢索結果詳細紀錄內顯示
¤UserPreference
∙更改檢索結果格式
∙更改e-mailaddress設定
∙HighlightPubMedsearchwordsinyourretrieval必須設定才能從檢索結果看到所查詢的字
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