重组DNA技术_精品文档.pptx
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DNA重组和重组DNA技术DNARecombinationandRecombinantDNAtechnology,第二十一章,DNA重组(DNArecombination)是指不同DNA分子断裂和连接而产生DNA片段的交换并重新组合形成新DNA分子的过程。
重组DNA技术(recombinantDNAtechnology)是指在体外将两个或两个以上DNA分子重新组合并在适当细胞中增殖形成新DNA分子的过程。
第一节自然界DNA重组和基因转移DNARecombinationandGeneTransferinNature,DNA重组,同源重组(homologousrecombination)位点特异的重组(site-specificrecombination)转座重组(transpositionrecombination)接合作用(conjugation)转化作用(transformation)转导作用(transduction),发生在同源序列间的重组称为同源重组(homologousrecombination),又称基本重组(generalrecombination)。
是最基本的DNA重组方式,通过链的断裂和再连接,在两个DNA分子同源序列间进行单链或双链片段的交换。
以E.coli的同源重组为例,了解同源重组机制的Holliday模型,一、同源重组是最基本的DNA重组方式,二、位点特异重组是发生在特异位点间的DNA整合,位点特异重组(site-specificrecombination)是由整合酶催化,在两个DNA序列的特异位点间发生的整合。
三、转座重组可使基因移位,由插入序列和转座子介导的基因移位或重排称为转座(transposition)。
大多数基因在基因组内的位置是固定的,但有些基因可以从一个位置移动到另一位置。
这些可移动的DNA序列包括插入序列和转座子。
四、原核细胞可通过接合、转化和转导进行基因转移或重组,
(一)接合作用,当细胞与细胞、或细菌通过菌毛相互接触时,质粒DNA从一个细胞(细菌)转移至另一细胞(细菌)的DNA转移称为接合作用(conjugation)。
可接合质粒如F因子(Ffactor),细菌染色体外的小型环状双链DNA分子。
质粒,
(二)转化作用,通过自动获取或人为地供给外源DNA,使细胞或培养的受体细胞获得新的遗传表型,称为转化作用(transformation)。
例:
溶菌时,裂解的DNA片段被另一细菌摄取。
(三)转导作用,当病毒从被感染的(供体)细胞释放出来、再次感染另一(供体)细胞时,发生在供体细胞与受体细胞之间的DNA转移及基因重组即为转导作用(transduction)。
噬菌体的生活史,溶菌生长途径(lysispathway)溶源菌生长途径(lysogenicpathway),第二节重组DNA技术,RecombinantDNATechnology,重组DNA技术相关概念,克隆(clone):
来自同一始祖的相同副本或拷贝的集合。
获取同一拷贝的过程称为克隆化(cloning),即无性繁殖。
技术水平:
分子克隆(molecularcloning)(即DNA克隆)细胞克隆个体克隆(动物或植物),其主要过程包括:
在体外将目的DNA片段与能自主复制的遗传元件(又叫载体)连接,形成重组DNA分子,进而在受体细胞中复制、扩增,从而获得单一DNA分子的大量拷贝。
重组DNA技术,又称分子克隆(molecularcloning)或DNA克隆(DNAcloning)或基因工程(geneticengineering)技术,一、重组DNA技术中常用的工具酶,限制性核酸内切酶DNA聚合酶逆转录酶T4DNA连接酶碱性磷酸酶末端转移酶TaqDNA聚合酶,重组DNA技术中常用的工具酶,限制性核酸内切酶(restrictionendonuclease),限制性核酸内切酶(restrictionendonuclease,RE)是一类核酸内切酶,能识别双链DNA分子内部的特异序列,并裂解磷酸二酯键。
+,BamH,定义:
与甲基化酶共同构成细菌的限制修饰系统,限制外源DNA,保护自身DNA。
、(基因工程技术中常用型),分类:
作用:
第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;第四个字母代表株;用罗马数字表示发现的先后次序。
命名:
Hind,Haemophilusinfluenzaed株流感嗜血杆菌d株的第三种酶,类酶识别序列特点回文结构(palindrome),切口:
平端切口、粘端切口,BamH,+,Hind,+,平端切口,黏端切口,有些限制性内切酶虽然识别序列不完全相同,但切割DNA后,产生相同的粘性末端,称为同尾酶。
这两个相同的粘性末端称为配伍末端(compatibleend)。
BamH,Bgl,+,+,同尾酶,来源不同的限制酶,但能识别和切割同一位点,这些酶称同裂酶或同功异源酶。
+,BamH,+,Bst,同裂酶:
二、重组DNA技术中常用的载体,定义为携带目的基因,实现其无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用的一些DNA分子。
载体按功能分为克隆载体(cloningvector)表达载体(expressionvector),克隆载体(cloningvector)为使插入的外源DNA序列被扩增而特意设计的载体称为克隆载体。
表达载体(expressionvector)为使插入的外源DNA序列可转录翻译成多肽链而特意设计的载体称为表达载体。
(一)克隆载体,至少有一个复制起点使载体在宿主细胞中进行自主复制;至少有一个选择标志(selectionmarker):
选择标志是区分含与不含载体的细胞所必需的,如抗生素抗性基因。
有适宜的RE的单一切点:
载体中一般都构建有一段特异性核苷酸序列,在这段序列中包含了多个RE的单一切点,可供外源基因插入时选择,叫多克隆位点(multiplecloningsites,MCS)。
1.克隆载体应具备的基本特点,
(1)质粒(plasmid),特点:
能在宿主细胞内独立自主复制;带有某些遗传信息,会赋予宿主细胞一些遗传性状。
2.常用的克隆载体,噬菌体DNA改造系统gt系列(插入型,适用cDNA克隆)EMBL系列(置换型,适用基因组克隆),
(2)噬菌体(phage),M13噬菌体DNA改造系统(含lacZ基因)M13mp系列pUC系列,柯斯质粒(cosmid)载体(又称黏粒载体)酵母人工染色体(yeastartificialchromosome,YAC)细菌人工染色体(bacterialartificialchromosome,BAC)动物病毒DNA改造的载体(如腺病毒,腺病毒相关病毒,逆转录病毒),(3)其他克隆载体,
(二)表达载体,表达载体是指用来在宿主细胞中表达外源基因的载体。
根据宿主细胞分为:
原核表达载体真核表达载体,1.原核表达载体,原核表达载体的基本组成,R:
调节序列;P:
启动子;SD:
SD序列;TT:
转录终止序列,2.真核表达载体,真核表达载体的基本组成,OriPro:
原核复制起始序列;P:
启动子;MCS:
多克隆位点;TT:
转录终止序列;orieuk:
真核复制起始序列。
第三节重组DNA技术基本原理和操作步骤,基本原理,以质粒为载体的DNA克隆过程,
(一)目的基因的分离获取分,化学合成法要求:
已知目的基因的核苷酸序列或其产物的氨基酸序列。
从基因组DNA文库和cDNA文库中获取目的DNA(见第20章)PCR法(见第20章)其他方法(见第20章),组织或细胞染色体DNA,基因片断,克隆载体,重组DNA分子,含重组分子的转化菌,限制性内切酶,受体菌,基因组DNA文库存在于转化细胞内由克隆载体所携带的所有基因组DNA的集合,从基因组DNA文库获取目的基因,从cDNA文库获取目的基因,
(二)载体的选择与构建选,目的不同,操作基因的性质不同,载体的选择和改建方法也不同。
目的:
获得某一目的基因或DNA片段获得目的DNA片段所编码的蛋白质,不同载体的克隆容量及适宜宿主细胞,(三)目的DNA与载体连接接,方式:
(1)单一相同黏端连接
(2)不同黏端连接(3)通过其他措施产生黏端进行连接,黏端连接,BamH切割反应,T4DNA连接酶15C,单一相同黏端连接,不同黏端连接(定向克隆),平端连接,限制性内切酶切割产生的平端粘端补齐或切平形成的平端,适用于:
受体菌条件:
安全宿主菌限制酶和重组酶缺陷处于感受态(competent),导入方式:
转化(transformation)转染(transfection)感染(infection),(四)重组DNA转入受体细胞转,1.借助载体上的遗传标志进行筛选
(1)利用抗生素抗性标志筛选
(2)利用基因的插入失活/插入表达特性筛选(3)利用标志补救筛选(4)利用噬菌体的包装特性进行筛选,(五)重组体的筛选与鉴定筛,2.序列特异性筛选
(1)RE酶切法
(2)PCR法(3)核酸杂交法(4)DNA测序法3.亲和筛选法,插入失活筛选带有重组载体的克隆,互补筛选(蓝-白筛选),菌落或噬斑原位杂交筛选重组体,重组DNA技术操作过程可形象归纳为:
小结,重组DNA技术操作的主要步骤,表达体系的建立:
表达载体的构建受体细胞的建立表达产物的分离纯化,(六)克隆基因的表达,标准:
选择标志强启动子翻译调控序列多接头克隆位点E.coli表达体系的不足:
不宜表达真核基因组DNA;不能加工表达的真核蛋白质;表达的蛋白质常形成不溶性包涵体(inclusionbody);很难表达大量可溶性蛋白。
1.原核表达体系(E.coli表达体系最为常用),优点:
可表达克隆的cDNA及真核基因组DNA可适当修饰表达的蛋白质表达产物分区域积累缺点:
操作技术难、费时、经济,转染将表达载体导入真核细胞的过程,方法:
磷酸钙转染DEAE葡聚糖介导转染电穿孔脂质体转染显微注射,2.真核表达体系(酵母、昆虫、乳类动物细胞),