测序结果分析及序列拼接_精品文档.ppt

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Oligo6四、引物的评估四、引物的评估3.2测序结果分析测序结果分析（p60）测序图谱分析测序图谱分析理想的测序图谱峰形尖锐理想的测序图谱峰形尖锐，峰间距均匀，信噪比高，各种颜峰间距均匀，信噪比高，各种颜色的峰高度均匀，基线平直。

色的峰高度均匀，基线平直。

以以ABI3730xABI3730x进行测序，在反应良好时，进行测序，在反应良好时，3030800bp800bp间的序列间的序列为可信区。

为可信区。

1、测序反应良好的结果、测序反应良好的结果2、测序出现杂峰的结果、测序出现杂峰的结果3、测序出现套峰的结果、测序出现套峰的结果3.3序列拼接实例分析序列拼接实例分析lDNAmanDNAmanlVectorNTIVectorNTI中的中的ContiExpressContiExpresslLasergeneLasergene中的中的SeqManSeqMan一、序列拼接软件一、序列拼接软件二、利用二、利用DNAman软件拼接序列软件拼接序列1、启动、启动DNAman软件软件22、导入序列、导入序列1.点击点击Addfile2.点击点击Assemble导入待拼接序列及参数设置导入待拼接序列及参数设置33、拼接序列、拼接序列点击点击Showresult序列拼接效果图序列拼接效果图点击点击Export点击点击“是是”44、导出结果、导出结果数据的保存数据的保存数据的比对验证数据的比对验证http:

/www.ncbi.nlm.nih.gov/数据的比对验证数据的比对验证数数据据的的比比对对验验证证数据的比对验证数据的比对验证考核操作题

（二）考核操作题

（二）利用利用DNAmanDNAman软件拼接软件拼接“1.seq1.seq”、“2.seq2.seq”、“3.seq3.seq”三个序列三个序列,要求如下（要求如下（1010分分）。

）。

新建一个新建一个wordword文档，报告三个序列拼接后文档，报告三个序列拼接后cDNAcDNA总长总长度及可能的基因名称度及可能的基因名称，附上，附上NCBIblastNCBIblast窗口图。

窗口图。