NCBI序列比对方法与实例操作_精品文档.ppt
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点击点击进入进入点击此处进入核酸序列比对点击此处进入核酸序列比对将将FASTA格式的序列输入这格式的序列输入这里里此处可自动识别比对序此处可自动识别比对序列名称列名称点击此处进入序列比对点击此处进入序列比对已知序列编号已知序列编号所查询分子类型所查询分子类型比对序列长度比对序列长度序列相似性比对图谱序列相似性比对图谱数据库名称数据库名称不同颜色代表两种比对序列不同颜色代表两种比对序列具有的相同的碱基数目不同。
具有的相同的碱基数目不同。
例如，红色，代表与比对的例如，红色，代表与比对的核酸序列有核酸序列有200个以上的碱基个以上的碱基是相同的是相同的。
序列长度序列长度序列相似性比对结果序列相似性比对结果相似序列一：
番茄相似序列一：
番茄ch07染色体全基因组染色体全基因组相似序列二：
潘那丽番茄相似序列二：
潘那丽番茄ch07染色体全基因组染色体全基因组数据库相似序列名称数据库相似序列名称类似性类似性积分积分E值为匹配期望值为匹配期望值。
说明可以找值。
说明可以找到与搜索序列相到与搜索序列相匹配的其它序列匹配的其它序列的几率。
的几率。
E值越值越接近零，越不可接近零，越不可能找到其它的匹能找到其它的匹配序列，其背后配序列，其背后的含义就是的含义就是E值值越少，匹配度越越少，匹配度越好好相似度相似度数据库数据库标识标识序列编号序列编号匹配序列长度匹配序列长度匹配匹配范围范围对比空白对比空白相似序列，即输入序列相似序列，即输入序列和搜索到序列的匹配率和搜索到序列的匹配率输入序列被随机搜索出来输入序列被随机搜索出来的概率，该值越小越好的概率，该值越小越好询问序列和数据库询问序列和数据库里面序列的互补链里面序列的互补链匹配匹配分数越高，则同源性越好分数越高，则同源性越好空白空白ZB04091969（MALINGSHU）-A68-M13+_D09预测：
马铃薯预测：
马铃薯单酰基甘单酰基甘油脂酶油脂酶ABHD-6相似相似mRNAZB04091969（MALINGSHU）-A69-M13+_E09番茄番茄ch03染色体全基因组染色体全基因组
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