基于正交实验优化创伤弧菌金属蛋白酶融合蛋白的表达Word文件下载.docx
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金属蛋白酶；
正交设计；
直观分析；
方差分析
AbstractObjective:
Tooptimizetheexpressionof
recombinantmetalloproteaseofVvibriovulnificusin
E.coliBL21/DE3inducedbyIPTG.Method:
Theplasmidof
pET-32a-vvp/E.coliBL21wasconstructedbyourlaboratory.Fourdifferentfactors,includingtime,temperature,agitationspeedandconcentrationofIPTG,werestudiedbyorthogonalexperimentaldesign.ThedatawereanalyzedbydirectcalculationandANOVAmethod.Results:
TheRvalueofagitationrateresultingfromdirectcalculationwashighestamongfourfactors.ThePvalueofagitationratewaslowerthan0.05.ThePvalueoftheotherfactorswerehigherthan0.05.Conclusions:
Theexpressionlevelisremarkableaffectedbytheagitationrate.TheexpressionlevelofVVPproteinishighestwhenagitationrateis250rpm.Thereforewehaveestablishedamethodforhigh-levelexpressionofVVP-fourhours-inducingtime,37°
C-inducingtemperature,1mmol/L
concentrationofIPTGandagitationratein250rpm.
Keywordsvibriovulnificus;
metalloprotease;
orthogonalexperimentaldesign;
directanalysis;
analysisofvariance（ANOVA）很多临床病例及动物实验已经证明，进食被创伤弧菌（Vibrio
vulnificus,Vv）污染的食物或者皮肤破损接触Vv均可引起Vv感染,
主要表现为严重的蜂窝组织炎和败血症］1~3］。
一旦出现败血症，其死亡率高达50%以上］4~6］。
因其病情凶险，故对创伤弧菌感染的临床早期快速诊断尤为重要。
目前,Vv的致病机制尚未明了。
但有研究表明该菌分泌的金属蛋白酶（VVP）具有增加血管通透性，引起出血性损伤的作用，已被证实是创伤弧菌的主要毒力因素之一］7~9］,
并且vvp基因在不同创伤弧菌菌株之间具有咼度保守性。
故金属蛋白酶可作为创伤弧菌感染重要的临床实验室检测靶标。
而要制备以VVP
为靶标的Vv免疫检测试剂盒，首先必须获得作为足量高纯度的VVP抗原来制备抗体。
但是金属蛋白酶作为创伤弧菌种特征性的外毒素，其自然分泌产量并不高，且由于方法学的限制，采用常规生化方法获得足量高纯度溶细胞素相当困难。
而通过基因工程的方法，我们可以在一个合适的系统中，使外源基因高效表达，从而生产有价值的蛋白质，对其应用或进行功能的研究。
但是外源基因在工程菌中的诱导表达受很多因素的影响，例如，诱导时间、诱导温度、诱导剂浓度及摇菌的转数等。
因此，如何得到一种最佳的诱导条件组合，从而使蛋白高效稳定的表达是我们研究的基础。
1材料与方法
1.1材料
1.1.1菌株和质粒
原核表达载体pET-32a-vvp由本课题组构建；
宿主菌E.coliBL21/DE3由南方医科大学公共卫生与热带医学学院吴昆博士惠赠。
1.1.2诱导剂IPTG和筛选用氨苄青霉素
购自鼎国生物制品有限公司。
1.2方法
1.2.1实验设计
针对诱导过程中对菌体表达蛋白产生影响的4个因素诱导时
间、诱导温度、诱导剂浓度以及诱导时摇菌的转数，运用SPSS11.5统计学软件进行正交实验设计。
因素及水平见表1。
表1因素水平表
（略）
1.2.2诱导
质粒pET-32a-vvp转化E.coliBL21/DE3后，挑取单菌落接种于
含氨卞青霉素（100mg/L）的LB培养基中,37C活化过夜，次日按1:
100的比例转接,37C培养至0D600约0.8时即根据不同诱导条件进行诱导，诱导条件见实验设计。
离心收集菌体，做SDS-PAGE分析,考马斯亮蓝染色、脱色后观察。
扫描后运用图像分析软件QuantityOne得
出各不同诱导条件下融合蛋白VVP的表达浓度。
1.2.3正交试验直观分析法
分别计算每个因素各水平下的平均收率，用各因素各个水平平均收率的极差R（极差=平均收率的最大值-平均收率的最小值）来反映各因素的水平变动时对试验结果影响的大小］10］。
1.2.4方差分析
运用SPSS11.5统计学软件对正交设计资料进行分析
125结果验证
在由上述方法得出的最佳诱导条件下，对转化了质粒pET-32a-vvp的E.coliBL21/DE3进行诱导，并对结果进行SDS-PAGE分析，以验证此组合的诱导条件的诱导表达效果。
并设置转化空载体组及未诱导组进行对照。
2结果
2.1SDS-PAGE结果
取16组经不同诱导条件诱导的菌液作组间平行SDS-PAGE,经
QuantityOne对染色凝胶做图像分析，来确定融合蛋白VVP表达的相对比例。
SDS-PAGE结果见图1，图上方的数字代表组别。
经扫描得到各组VVP的表达比例见表2。
2.2优化结果
2.2.1正交试验直观分析法
运用正交试验直观分析法得出的条件优化结果见表2和图2，
K1、K2、K3、K4分别表示每个因素各水平下的蛋白表达量的均值
:
10］。
由极值R的大小推知，各因素的重要性依次为诱导摇菌转数、诱导时间、诱导温度、诱导剂IPTG浓度。
本实验的最佳搭配诱导条件为摇菌转数250r/m、诱导时间4h、诱导温度37C、诱导剂IPTG浓度1mmol/L。
表2实验设计与结果分析（略）
2.2.2方差分析
运用SPSS11.5统计学软件对进行正交设计资料进行方差分析得出的条件优化结果见表3。
摇菌转数的P值小于0.05,即该因素对试实验结果影响显著；
而时间、温度及IPTG浓度的P值均大于0.05。
表3方差分析表（略）
222结果的验证
在诱导条件为摇菌转数250r/m、诱导时间4h、诱导温度37C、诱导剂IPTG浓度1mmol/L的情况下，VVP的表达量达到了40.67%。
而其它4组对照组均无表达，见图3。
3讨论
正交试验设计是一种安排多因素多水平试验，并利用普通的统计分析方法来分析试验结果的一种试验设计方法］10］。
对于多因素多水平的问题,通常都希望通过试验找出因素的主次关系和最优搭配条件。
用正交设计合理地安排试验，可以做到省时、省力、省钱，同时又能得到基本满意的试验效果［10］。
因此在本研究中，我们运用这种实验设计方法对融合蛋白VVP在工程菌中的诱导表达条件进行优
化，旨在获得稳定高效表达的VVP蛋白，从而为VVP的致病机理研究以及Vv免疫检测试剂盒制备奠定基础。
目的基因在大肠杆菌中的诱导培养方式主要有两种，即化学物质诱
导和温度诱导，pET32a载体带有启动子T7lac，可采用化学物质IPTG进行化学诱导［11］。
要实现蛋白产物的高表达，需要考虑重组菌生长和产物表达的最适环境条件，包括诱导时间、诱导温度、摇菌的转数及最适诱导剂浓度等。
细菌在诱导后，大量能量会消耗在外源蛋白的表达上，使细菌的生长提前进入衰亡期，过度诱导会造成溶菌。
因此需要对诱导时间进行控制，找到能使外源蛋白充分表达而又不会导
致溶菌的适当诱导时间，我们在实验中设计了3个连续的时间水平
1h、2h、3h。
在诱导温度上，不同的蛋白对温度有不同的要求。
有研究表明，有些外源蛋白在低温下才能大量表达］12］;
而本实验中的工程菌大肠杆菌的最适生长温度是37C。
考虑到这两方面的要求，我们在实验中设计了3个温度水平：
20C、30C、37C。
摇菌的转数对细菌的生长也是极为重要的。
体系溶解氧是影响菌体代谢的重要参数,外源基因在高效转录和翻译时需要大量能量，及时给予饱和需氧量对高效表达有意义［13］。
加入诱导剂后通过改变搅拌转数（r/min）来改变氧传递推动力和液相体积氧传递系数，以达到调节体系溶解氧的目的。
通常搅拌转数愈大液相体积氧传递系数愈大，但当r/min很
大时，体系产生不可避免的泡沫而阻止了氧的传递；
同时r/min过大则产生较大的剪切力，亦对菌体生长不利［11］。
我们在实验中设计了3个r/min水平：
100、180、250。
诱导剂IPTG的浓度对外源蛋白的表达水平有较大影响，浓度过高会对宿主菌造成损害，过低则影响诱导剂的效用。
因此实验中设计了4个浓度水平：
0.1mmom/L、
0.5mmom/L、1mmom/L、2mmom/L。
本实验设计的因素水平不等，因此在对正交设计资料进行直观分析时，我们运用平均蛋白表达量K1、K2、K3值的大小来反映各因素
的不同水平对实验结果（蛋白表达量）影响的大小，并以此确定实验的最佳搭配。
用各因素各个水平蛋白平均表达量的极差R来反映各因
素的水平变动时对实验结果影响的大小。
极差大的就表示该因素的水平变动时对实验结果的影响大，极差小的就表示该因素的水平变动时
对实验结果的影响小。
本实验中，我们得到因素的主次顺序为诱导摇菌转数、诱导时间、诱导温度、诱导剂IPTG浓度。
主要因素应取较好的水平，而次要因素，则可根据对成本、时间、收益等方面的统筹考虑而选取适当的水平。
正交试验的直观分析法简便、直观、计算量小，但不能估计试验误差，即不能区分是由于各因素的水平变化而导致试验结果的差异，还是由于试验的随机波动而导致试验结果的差异。
为解决此问题，可对试验结果做方差分析。
由表3可知，摇菌转
数的P值小于0.05，而时间、温度及IPTG浓度的P值均大于0.05。
按方差分析法的观点，只须对有显著意义的因素确定好水平，而其它
对试验结果没有什么影响的因素，则可按实际需要来确定适当的水
平。
方差分析的结果与直观分析方法得到的结果相同。
并且这一结果
也通过VVP的高表达（表达浓度达到了40.67%）得到了验证。
由此得本研究的试验最佳组合为摇菌转数250rpm、诱导时间4h、诱导温度37C、诱导剂IPTG浓度1mmol/L。
【参考文献】
1LeeCT,AmaroC,SanjuanE,etal.IdentificationofDNAsequencesspecificforVibriovulnificusbiotype2strainsbysuppressionsubtractivehybridization.ApplEnvironMicrobiol,2005，71（9）:
5593~5597.
2BisharatN,AgmonV,FinkelsteinR,etal.Clinical,epide
miological,andmicrobiologicalfeaturesofVibriovulnificus
biogroups3causingoutbreaksofwoundinfectionandbacteraemiainIsrael.lsraelVibrioStudyGroup.Lancet,1999,
354（9188）:
1421~1424.
3郑晶，申洪，陈清.海水环境创伤弧菌感染的病理学研究.中华创伤杂志，2007，23（11）:
874~878.
4Chatzidaki-LivanisM,JonesMK,WrightAC.Genetic
variationintheVibriovulnificusgroup1capsularpolysaccharideoperon.JBacteriol，2006Mar;
188（5）:
1987~1998.
5CampbellMS,WrightAC.Real-TimePCRAnalysisof
VibriovulnificusfromOysters.ApplEnvironMicrobiol，2003，69（12）:
7137~7144.
6郑晶，申洪，陈清.创伤弧菌经食管感染小鼠的致病性.世界华人消化杂志，2005，13（7）:
860~863.
7OliverJD,WearJE,ThimasMB,etal.ProductionofextracellularenzymesandcytotoxicitybyVibrioVulnificus.Diagn
MicrobiolInfectDis,1986,5
（2）:
99~111.
8MiyoshiS.EffectsofVibrioVulnificusmetalloprotease
onthecapillaries:
pathologicalactionsandinactivationby
alpha-macroglobulin.YakugakuZasshi,2000,120（11）:
1149~1157.
9MiyoshiS,NarukawaH,TomochikaK,etal.Actionsof
Vibriovulnificusmetalloproteaseonhumanplasma
proteinase-proteinaseinhibitorsystems:
acomparativestudyofnativeproteasewithitsderivativemodifiedbypolyethyleneglycol.MicrobiolImmunol,1995,39（12）:
959~966.
10祝国强,滕海英，黄平.正交试验设计方法在医药学中的应用.数理医药学杂志，2007，20（4）:
568~569.
11pET系统操作手册Novagen.
12陈丽丹，曹虹，黄胜和，等.脑膜炎大肠杆菌新基因cglE的表达及生物信息学分析.中国人兽共患病杂志，2006，22（5）:
419~422.
13杨旭,郭葆玉，叶正良，道书艳,张冉.重组人胸腺素原a在
大肠杆菌中的表达优化.药物生物技术，2001,8（3）:
135~138.
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