自动化系生物信息学二级学科清华大学自动化系Word格式.docx

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为适应生物信息学领域交叉学科研究的特点,导师可以成立有相关学科导师及校内外专家参加的指导小组，必要时可聘请相关学科的博士生导师作为联合指导教师，共同指导其博士生。

3、副导师、联合指导教师、指导小组成员经系主管负责人审查批准后,报校学位办公室备案.

四、知识结构及课程学习的基本要求

1、知识结构的基本要求

Ａ、掌握生物信息学领域坚实宽广的基础理论，做到灵活应用,能够解决有关科学技术问题；

Ｂ、掌握生物信息学领域必要的专业基础知识,做到融会贯通，能够创造性地解决问题;

C、掌握生物信息学领域有关的前沿动态，在跟踪领域前沿的基础上提倡原创性的工作；

Ｄ、掌握一定的交叉学科知识,鼓励开展跨学科特别是新兴交叉学科的研究。

2、课程学习及学分组成

A、直博生。

攻读博士学位期间,要完成本学科规定的各项培养环节和要求,需获得学位学分不少于３5（考试学分不少于２５）。

自学课程学分另记。

相关学分要求及课程设置见附录一。

B、普博生。

攻读博士学位期间,要完成本学科规定的各项培养环节和要求，需获得学位学分不少于16（考试学分不少于１1）。

相关学分要求及课程设置见附录二。

五、主要培养环节及有关要求

１、制定个人培养计划

博士生培养计划包括课程计划和论文工作计划两部分。

课程计划在入学三周内完成,经导师签字后报系业务办公室备案。

计划执行过程中如因特殊情况需要变动，须征得导师同意后,在每学期选课期间修改.修改后的课程学习计划,经导师及系主管负责人签字后送系业务办公室备案。

论文工作计划在导师指导下完成。

内容包括:

研究方向、文献阅读、选题报告、科学研究、学术交流、学位论文及实践环节等方面的要求和进度计划。

论文工作计划在入学后三个月内完成。

直博生的学习年限一般为4－5年，普博生的学习年限一般为3-4年.

２、选题报告与资格考试

博士生的资格考试结合选题报告主要以口试的方式进行,每学期组织一次,由博士生本人提交书面申请,业务办公室统一安排。

资格考试委员会由5-７名具有高级技术职称的教师组成。

博士生首先要作论文选题报告,由资格考试委员会就选题报告内容、基础理论、专业知识、学科发展方向及其它有关问题提问,对博士生应具备的学科知识（包括基础理论和专业知识）、综合素质和能力进行全面考核。

详见《自动化系博士生资格考试方案》。

选题报告应包括文献综述、论文选题及其意义、主要研究内容、可行性、工作特色及难点、预期成果及可能的创新点、论文工作计划、发表文章计划等．评审通过的选题报告以书面形式交系业务办公室备案.在论文研究工作过程中，如果论文课题有重大变动,应重新做选题报告。

选题报告与资格考试一般在博士生入学后第三学期初（直博生在入学后第五学期初）完成。

３、社会实践

按照“清华大学研究生社会实践管理条例”执行。

４、学术活动与学术报告

实行博士生学术报告制度。

博士生在学期间必须参加３0次以上一级或二级学科的学术活动;

至少有一次在全国性或国际学术会议上宣读自己撰写的论文。

学术报告记录表由导师签字，申请答辩前交研究生科记载成绩.博士生完成规定的学术报告并取得要求的学分后方可申请答辩。

５、论文中期检查

学位论文实行中期检查制度.在研究生学位论文工作的中期,研究所组织考查小组（３—5人组成）对研究生的综合能力、论文工作进展以及工作态度、精力投入等进行全方位的考查。

通过者,准予继续进行工作．博士生的论文中期检查可与学术报告统筹安排。

６、学术论文发表的要求

博士生在学期间应积极进行课题的研究工作，并及时将研究成果总结为学术论文进行发表.博士生在申请论文答辩时发表学术论文的质量及数量需达到下列标准之一：

1．发表一篇学术论文,ＳCI收录，影响因子大于等于5；

2．发表两篇学术论文，均为ＳCI收录，累计影响因子大于等于７;

3．发表三篇学术论文,其中至少有两篇为SＣI收录，其余为ＥI或核心刊物收录；

4．在核心刊物上发表至少四篇论文.其中至少有一篇发表在SＣI收录的期刊上,或有两篇发表在EI收录的期刊上（其中一篇可以是已被ＥI收录的国际会议论文）．

发表的学术论文必须与博士学位论文工作有关，并以第一作者署名（当第一作者为导师时,可为第二作者）。

详细说明参见《研究生在学期间发表论文基本要求》.

7、最终学术报告

在博士学位论文工作基本完成以后,至迟于正式申请答辩前三个月,做一次论文工作总结报告,具体要求见《清华大学攻读博士学位研究生培养工作规定》。

六、学位论文工作及要求

1、博士学位论文是博士生培养质量和学术水平的集中反映，应在导师指导下由博士生独立完成。

2、博士学位论文应是系统完整的学术论文,应在科学上或专门技术上作出创造性的学术成果,应能反映出博士生已经掌握了生物信息学领域坚实宽广的基础理论和系统深入的专门知识，具备了独立从事教学或科学研究工作的能力。

3、学位论文工作时间按研究生院的有关规定执行。

附录一、直博生修读科目及学分要求

攻读博士学位期间，研究生需获得学位要求学分不少于35（考试学分不少于２5）。

１、公共必修课程（6学分）

（1）马克思主义理论课程（≥４学分,考试）

●自然辩证法

（6０610012）

２学分

（考试）

●现代科学技术革命与马克思主义

（90６10０４2）

（2）第一外国语（2学分,考试）

●博士生英语（或其他语种）

（906４00１２）

2学分

２、学科专业要求课程（学分不少于２4）

（1）基础理论课（至少2门，≥　7学分，考试）

●应用随机过程

（604200９4）

４学分

●基础泛函分析

（6０42０144）

●随机过程

（6０23０0１4）

4学分

●系统与控制理论中的线性代数

（６02５00１3）

3学分

●矩阵分析与应用

（6０250113）

●组合数学

（60240013）

●高等数值分析

（60420024）

●应用近世代数

（604２0153）

●分形几何

（８０420123）

注:

经学位分委员会主席批准，可在导师指导下选择数学、物理、及生物类研究生课程.

（2）专业基础课（≥　７学分,考试）

●实验设计与数据处理

（6042012３）

●统计学方法及其应用

（702503８3）

●模式识别

（70２500４３）

●智能技术基础

（902５0０72）

●信息论基础

（７0２5022２）

●最优化理论与应用

（702５0293）

●线性系统理论

（70250０２3）

●非线性系统理论

（70250２53）

３学分

●系统辨识理论与实践

（70250２８３）

●多传感器融合理论与应用

（７0２５0３０2）

●自动测试理论

（７0２50273）

●现代信号处理

（7025００3３）

●系统与控制中的随机方法

（70250362）

●应用软件系统分析与设计

（602５0023）

●系统学

（70250063）

●系统分析理论与方法

（702５0262）

●系统建模理论与方法

（70２5021２）

●凸优化

（70250403）

●离散优化

（７0250４13）

经学位分委员会主席批准,可在导师指导下选择其它相关的研究生课程.

（3）专业课程（≥6学分,其中考试学分≥3）

●生物信息学与功能基因组学

（８0４５0２５2）

●基因分子生物学

（７0450０22）

●蛋白质折叠机理

（80４5019２）

●生物物理前沿

（7045０043）

●生物工程前沿

（704５0083）

●发育生物学进展

（８045０232）

●生物大分子结构与功能

（7０450033）

●细胞信号转导与疾病的发生

（80４502２2）

●药理学与药理实验技术

（80450２42）

●生物波普学

（７045001３）

（7045０0２2）

●肿瘤生物学专题讨论课

（90450041）

１学分

●细胞骨架、细胞运动及人类疾病

（70450１6２）

●现代生命科学与生物技术实验

（6045００14）

（报告）

●生物医药工程前沿

（８40０0０５2）

●医学免疫新技术与新发展

（８4000０3２）

●算法与算法复杂度理论

（7024０193）

●统计学习理论导论

（８0250２７2）

●计算分子生物学引论

（８02５0553）

●生物信息学专题

（80２5０６82）

●科学精神、道德与表达

（70250371）

1学分

（考查）

●英文科技论文写作与学术报告

（602５0101）

●最优控制

（70２50102）

●稳定性理论　

（８０２5024２）

●鲁棒控制

（80２50282）

●鲁棒辨识

（80２50２3２）

●模糊控制系统的分析与设计

（80２5０303）

●嵌入式系统的软硬件设计

（８０2