R语言-mgcv包-gam()函数中文帮助文档(中英文对照).docx

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R语言-mgcv包-gam()函数中文帮助文档(中英文对照).docx

Generalizedadditivemodelswithintegratedsmoothnessestimation

                            广义加性模型与集成的平滑估计

描述----------Description----------

Fitsageneralizedadditivemodel(GAM)todata,theterm"GAM"beingtakentoincludeanyquadraticallypenalizedGLM.  Thedegreeofsmoothnessofmodeltermsisestimatedaspartoffitting.gamcanalsofitanyGLMsubjecttomultiplequadraticpenalties(including  estimationofdegreeofpenalization).Isotropicorscaleinvariantsmoothsofanynumberofvariablesareavailableasmodelterms,asarelinearfunctionalsofsuchsmooths;confidence/credibleintervalsarereadilyavailableforanyquantitypredictedusingafittedmodel;gamisextendable:

userscanaddsmooths. 

适合一个广义相加模型(GAM)的数据,“GAM”被视为包括任何二次处罚GLM。

模型计算的平滑度估计作为拟合的一部分。

gam也可以适用于任何GLM多个二次处罚(包括估计程度的处罚)。

各向同性或规模不变平滑的任意数量的变量的模型计算,这样的线性泛函平滑的信心/可信区间都是现成的使用拟合模型预测任何数量,“gam是可扩展的:

用户可以添加平滑。

Smoothtermsarerepresentedusingpenalizedregressionsplines(orsimilarsmoothers)withsmoothingparametersselectedbyGCV/UBRE/AIC/REMLorbyregressionsplineswithfixeddegreesoffreedom(mixturesofthetwoarepermitted).Multi-dimensionalsmoothsare  availableusingpenalizedthinplateregressionsplines(isotropic)ortensorproductsplines  (whenanisotropicsmoothisinappropriate).Foranoverviewofthesmoothsavailableseesmooth.terms.  Formoreonspecifyingmodelsseegam.models,random.effectsandlinear.functional.terms.Formoreonmodelselectionseegam.selection.Doreadgam.checkandchoose.k.

平滑术语表示使用惩罚回归花键(或类似的平滑)与由GCV/UBRE的/AIC/REML或由固定的自由度(两个的混合物被允许)的的回归花键与选择的平滑化参数。

多维平滑可使用惩罚薄板回归样条曲线(各向同性)或张量积样条线(各向同性的光滑是不恰当的)。

的平滑的概述,请参阅smooth.terms。

欲了解更多有关指定模型gam.models,random.effects和linear.functional.terms。

模型选择的更多信息,请参阅gam.selection。

不要读为gam.check和choose.k。

Seegamfrompackagegam,forGAMsviatheoriginalHastieandTibshiraniapproach(seedetailsfordifferencestothisimplementation).

见GAM包gam,GAMS通过原来的Hastie和Tibshirani方法(详情请参阅本实施方案的差异)。

Forverylargedatasetsseebam,formixedGAMseegammandrandom.effects.

对于非常大的数据集,请参阅bam,混合GAM看到gamm和random.effects。

用法----------Usage----------

gam(formula,family=gaussian(),data=list(),weights=NULL,subset=NULL,

  na.action,offset=NULL,method="GCV.Cp",

  optimizer=c("outer","newton"),control=list(),scale=0,

  select=FALSE,knots=NULL,sp=NULL,min.sp=NULL,H=NULL,gamma=1,

  fit=TRUE,paraPen=NULL,G=NULL,in.out,...)

参数----------Arguments----------

参数:

formula

AGAMformula(seeformula.gamandalsogam.models).  ThisisexactlyliketheformulaforaGLMexceptthatsmoothterms,sandtecanbeadded  totherighthandsidetospecifythatthelinearpredictordependsonsmoothfunctionsofpredictors  (orlinearfunctionalsofthese).  

一个GAM的公式(见formula.gam和gam.models)。

这是完全一样的公式,除非GLM那光滑的条款,s和te可以被添加到指定的线性预测依赖于光滑函数的预测(或线性泛函的右手边这些)。

参数:

family

Thisisafamilyobjectspecifyingthedistributionandlinktouseinfittingetc.Seeglmandfamilyformoredetails.Anegativebinomialfamilyisprovided:

seenegbin.  quasifamiliesactuallyresultintheuseofextendedquasi-likelihood  ifmethodissettoaRE/MLmethod(McCullaghandNelder,1989,9.6).  

这是一个家庭对象指定的分配和使用链接配件等glm和family更多的细节。

负二项分布家庭提供:

看到negbin。

quasi家庭实际上导致在使用扩展的拟似然method设置为一个RE/ML方法(McCullagh和Nelder,1989年,9.6)。

参数:

data

Adataframeorlistcontainingthemodelresponsevariableand  covariatesrequiredbytheformula.Bydefaultthevariablesaretaken  fromenvironment(formula):

typicallytheenvironmentfrom  whichgamiscalled.  

式所需的一个数据框或列表包含模型响应变量,协变量。

默认情况下,变量从environment(formula):

gam被称为典型的环境。

参数:

weights

priorweightsonthedata. 

现有的数据上的权重。

参数:

subset

anoptionalvectorspecifyingasubsetofobservationstobeusedinthefittingprocess. 

一个可选的矢量指定的装配过程中可以使用的观测值的一个子集。

参数:

na.action

afunctionwhichindicateswhatshouldhappenwhenthedatacontain"NA"s.  Thedefaultissetbythe"na.action"settingof"options",andis"na.fail"ifthatisunset.  The“factory-fresh”defaultis"na.omit". 

一个函数,它表示时会发生什么数据包含“NA”。

默认设置是“na.action设置选项,na.fail”如果是没有设置的。

“工厂新鲜的”默认“na.omit。

参数:

offset

Canbeusedtosupplyamodeloffsetforuseinfitting.Notethatthisoffsetwillalwaysbecompletelyignoredwhenpredicting,unlikeanoffset  includedinformula:

thisconformstothebehaviouroflmandglm. 

可以用来提供一个模型偏移量用于接头。

请注意,此偏移量总是被完全忽略当预测,不像一个偏移量包含在formula:

这符合的lm和glm的行为。

参数:

control

Alistoffitcontrolparameterstoreplacedefaultsreturnedby  gam.control.Valuesnotsetassumedefaultvalues.  

一个合适的控制参数,以取代默认值返回gam.control。

未设置假设值默认值。

参数:

method

Thesmoothingparameterestimationmethod."GCV.Cp"touseGCVforunknownscaleparameterandMallows'Cp/UBRE/AICforknownscale."GACV.Cp"isequivalent,butusingGACVinplaceofGCV."REML"  forREMLestimation,includingofunknownscale,"P-REML"forREMLestimation,butusingaPearsonestimate  o

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