各种缓冲液配方之欧阳术创编.docx

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各种缓冲液配方之欧阳术创编

三、核酸电泳相关试剂、缓冲液的配制方法

时间:

2021.02.02

创作:

欧阳术

50×TAEBuffer(pH8.5)

组份浓度2MTris-醋酸,100mMEDTA

配制量1L

配制方法1.称量下列试剂,置于1L烧杯中。

Tris

242g

Na2EDTA·2H2O

37.2g

2.向烧杯中加入约800ml的去离子水,充分搅拌溶解。

3.加入57.1ml的乙酸,充分搅拌。

4.加去离子水将溶液定容至lL后,室温保存。

10×TBEBuffer(pH8.3)

组份浓度890mMTris-硼酸,20mMEDTA

配制量1L

配制方法l.称量下列试剂,置于lL烧杯中。

Tris

108g

Na2EDTA·2H2O

7.44g

硼酸

55g

2.向烧杯中加入约800ml的去离子水,充分搅拌溶解。

3.加去离子水将溶液定容至lL后,室温保存。

10×MOPS(3-吗啉基丙磺酸)Buffer

组份浓度200rnMMOPS,20mMNaOAc,10mMEDTA

配制量1L

配制方法1.称41.8gMOPS,置于1L烧杯中。

2.加约700mlDEPC处理水,搅拌溶解。

3.使用2NNaOH调节pH值至7.0。

4.再向溶液中加入下列试剂。

1MNaOAc(DEPC处理)

20ml

0.5MEDTA(pH8.0)(DEPC处理)

20ml

5.用DEPC处理水将溶液定容至1L。

6.用0.45m滤膜过滤除去杂质。

7.室温避光保存。

注:

溶液见光或高温灭菌后会变黄。

变黄时也可使用,但变黑时不要使用。

溴乙锭(10mg/ml)

组份浓度10mg/ml溴乙锭

配制量100ml

配制方法1.称量1g溴乙锭,加入到100ml容器中。

2.加入去离子水100ml,充分搅拌数h完全溶解溴乙锭。

3.将溶液转移至棕色瓶中,室温避光保存。

4.溴乙锭的工作浓度为0.5g/ml。

注意:

溴乙锭是一种致癌物质,必须小心操作。

Agarose凝胶

配制方法1.配制适量的电泳及制胶用的缓冲液(通常是0.5×TBE或1×TAE)。

2.根椐制胶量及凝胶浓度,准确称量琼脂糖粉,加入适当的锥形瓶中。

3.加入一定量的电泳缓冲液(总液体量不宜超过锥形瓶的50%容量)。

注:

用于电泳的缓冲液和用于制胶的缓冲液必须统一。

4.在锥形瓶的瓶封上保鲜膜,并在膜上扎些小孔,然后在微波炉中加热熔化琼脂糖。

加热过程中,当溶液沸腾后,请戴上防热手套。

小心摇动锥形瓶。

使琼脂糖充分均匀熔化。

此操作重复数次,直至琼脂糖完全熔化。

必须注意,在微波炉中加热时间不宜过长,每次当溶液起泡沸腾时停止加热,否则会引起溶液过热暴沸,造成琼脂糖凝胶浓度不准,也会损坏微波炉。

熔化琼脂糖时,必须保证琼脂糖充分完全熔化,否则,会造成电泳图像模糊不清。

5.使溶液冷却至60℃左右,如需要可在此时加入溴乙锭溶液(终浓度0.5µg/ml)。

并充分混匀。

注:

溴乙锭是一种致癌物质。

使用含有溴乙锭的溶液时,请戴好手套。

6.将琼脂糖溶液倒入制胶模中,然后在适当位置处插上梳子。

凝胶厚度一般在3~5min之间。

7.在室温下使胶凝固(大约30min~1h),然后放置于电泳槽中进行电泳。

注:

凝胶不立即使用时,请用保鲜膜将凝胶包好后在4℃下保存,一般可保存2~5天。

琼脂糖凝胶浓度与线形DNA的最佳分辨范围

琼脂糖浓度

最佳线形DNA分辨范围(bp)

0.5%

0.7%

1.0%

1.2%

1.5%

2.0%

1,000~30,000

800~12,000

500~10,000

400~7,000

200~3,000

50~2,000

6×LoadingBuffer(DNA电泳用)

组份浓度

30mM

EDTA

36%(V/V)

Glycerol

0.05%(W/V)

XyleneCyanolFF

0.05%(W/V)

BromophenolBlue

配制量500ml

配制方法1.称量下列试剂,置于500ml烧杯中。

EDTA

4.4g

BromophenolBlue

250mg

XyleneCyanolFF

250mg

2.向烧杯中加入约200ml的去离子水后,加热搅拌充分溶解。

3.加入180ml的甘油(Glycerol)后,使用2NNaOH调节pH值至7.0。

4.用去离子水定容至500ml后,室温保存。

10×LoadlngBuffer(RNA电泳用)

组份浓度

10mM

EDTA

50%(V/V)

Glycerol

0.25%(W/V)

XyleneCyanolFF

0.25%(W/V)

BromophenolBlue

配制置10ml

配制方法1.称量下列试剂,置于10ml离心管中。

0.5MEDTA(pH8.0)

200µl

BromophenolBlue

25mg

XyleneCyanolFF

25mg

2.向离心管中加入约4ml的DEPC处理水后,充分搅拌溶解。

3.加入5ml的甘油(Glycerol)后,充分混匀。

4.用DEPC处理水定容至10ml后,室温保存。

四、核酸、蛋白质杂交用相关试剂、缓冲液的配制方法

20×SSC

组份浓度3.0MNaCl,0.3MNa3citrate·2H2O(柠檬酸钠)

配制量1L

配制方法1.称量下列试剂,置于lL烧杯中。

NaCl

175.3g

Na3citrate·2H2O

88.2g

2.向烧杯中加入约800ml的去离子水,充分搅拌溶解。

3滴加14NHCl,调节pH值至7.0后,加去离子水将溶液定容至1L。

4.高温高压灭菌后,室温保存。

20×SSPEBuffer

组份浓度3.0MNaCl,0.2MNaH2PO4,0.02MEDTA

配制量1.L

配制方法1.称量下列试剂,置于lL烧杯中。

NaCl

175.3g

NaH2PO4·H2O

27.6g

Na2EDTA·2H2O

7.4g

2.向烧杯中加入约800ml的去离子水,充分搅拌溶解。

3.加NaOH调节pH值至7.4(约6.5ml的10NNaOH)。

4.加去离子水将溶液定容至lL。

5.高温高压灭菌后,室温保存。

50XDenhardt’S溶液

1%(W/V)

Ficoll400(菲可400/水溶性聚蔗糖400)

1%(W/V)

Polyvinylpyrrolidone

(聚维酮/聚乙烯吡咯烷酮)

1%(W/V)

BSA

组份浓度

配制量500ml

配制方法1.称量下列试剂,置于500ml烧杯中。

Flcoll400

5g

PoLyvlnylpyrrolldone

5g

BSA

5g

2.加去离子水约400ml,充分搅拌溶解

3.加去离子水将溶液定容至500ml。

4.用0.45µm滤膜过滤后,分装成每份25ml。

5.-20℃保存。

0.5M磷酸盐Buffer

组份浓度0.5MNa2HPO4。

配制量lL

配制方法1.称量134gNa2HPO4·7H2O置于lL烧杯中。

2.加入约800ml的去离子水充分搅拌溶解。

3.加入85%的H3PO4(浓磷酸)调节溶液pH值至7.2。

4.加去离子水定容至1L。

5.高温高压灭菌后,室温保存。

SalmonDNA(鲑鱼精DNA)

组份浓度10mg/mlSalmonDNA

配制量约100ml

配制方法1.称取鲑鱼精DNA2g置于500ml烧杯中,加入约200ml的TEBuffer。

2用磁力搅拌器室温搅拌2~4h,溶解后加入4ml的5MNaCl,使其终浓度为0.1M。

3.用苯酚和苯酚/氯仿各抽提1次。

4.回收水相溶液后,使用17号皮下注射针头快速吸打溶液约20次,以切断DNA。

5.加入2倍体积的预冷乙醇进行乙醇沉淀。

6.离心回收DNA后,溶解于100ml的去离子水中。

测定溶液的OD260值。

7.计算溶液的DNA浓度后,稀释DNA溶液至10mg/ml。

8.煮沸10min后,分装成小份(1ml/份)。

-20℃保存。

9.使用前在沸水浴中加热5min后,迅速冰浴冷却。

DNA变性缓冲液

组份浓度1.5MNaCl,0.5MNaOH

配制量1L

配制方法1.称量下列试剂,置于lL烧杯中。

NaCl

87.7g

NaOH

20g

2.向烧杯中加入约800ml的去离子水,充分搅拌溶解。

3.加去离子水将溶液定容至lL后,室温保存。

预杂交液/杂交液(DNA杂交用)

SSC(或SSPE)

Denhardt’s

0.5%(W/V)

SDS

100µg/ml

SalmonDNA

组份浓度

配制置100ml

配制方法1.称量下列试剂,置于200ml烧杯中。

20×SSC(或SSPE)

30ml

50×Denhardt’s

10ml

10%SDS

5ml

10mg/mlSalmonDNA

1ml

dH2O

54ml

2.充分混匀后,使用0.45µm滤膜滤去杂质后使用。

预杂交液/杂交液(RNA杂交用)

SSC(或SSPE)

Denhardt‘s

0.5%(W/V)

SDS

100g/ml

SalmonDNA

50%(V/V)

Formamlde

组份浓度

配制量100mL

配制方法1.称量下列试剂,置于200ml烧杯中。

20×SSC(或SSPE)

30ml

50×Denhardt’s

10ml

10%SDS

5ml

10mg/mlSalmonDNA

1ml

Formamide(甲酰胺)

50ml

dH2O

4ml

2.充分混匀后,使用0.45µm滤膜滤去杂质后使用。

膜转移缓冲液(Western杂交用)

组份浓度39mMGlycine,48mMTris,0.037%(W/V)SDS,20%(V/V)甲醇

配制量1L

配制方法1.称量下列试剂,置于lL烧杯中。

Glycine

2.9g

Tris

5.8g

SDS

0.37g

2.向烧杯中加入约600ml的去离子水,充分搅拌溶解。

3.加去离子水将溶液定溶至800ml后,加入200ml的甲醇。

4.室温保存。

TBSTBuffer(Western杂交膜清洗液)

组份浓度20mMTris-HCl,150mMNaCl,0.05%(V/V)Tween20

配制量1L

配制方法1.称量下列试剂,置于lL烧杯中。

NaCl

8.8g

1MTris-HCl(pH8.0)

20ml

2.向烧杯中加入约800ml的去离子水,充分搅拌溶解。

3.加入0.5mlTween20后充分混匀。

4.加去离子水将溶液定容至lL后,4℃保存。

封闭缓冲液(Western杂交用)

组份浓度5%(W/V)脱脂奶粉/TBSTBuffer

配制量100ml

配制方法1.称5g脱脂奶粉加入到100mlTBSTBuffer中,充分搅拌溶解。

2.4℃保存待用(本封闭液应该现配现用)。

五、实验室常用培养基的配制方法

Ampicillin(氨卡青霉素)(100mg/ml)

组份浓度100mg/mlAmpicillin

配制量50ml

配制方法1.称量5gAmpicillin置于50ml离心管中。

2.加入40ml灭菌水,充分混合溶解后,定容至50ml。

3.用0.22µm过滤膜过滤除菌。

4.小份分装(1ml/份)后,-20℃保存。

IPTG(异丙基-β-D-硫代半乳糖苷)(24mg/ml)

组份浓度24mg/mLIPTG

配制量50mL

配制方法1.称1.2gIPTG置于50ml离心管中。

2.加入40ml灭菌水,充分混合溶解后,定容至50ml。

3.用022µm过滤膜过滤除菌。

4小份分装(1ml,份)后,-20℃保存。

X-Gal(20mg/ml)

组份浓度20mg/mlX-Gal

配制量50ml

配制方法1.称量lgX-Gal置于50ml离心管中。

2.加入40mlDMF(二甲基甲酰胺),充分混合溶解后,定容至50ml。

3.小份分装(1ml/份)后,-20℃避光保存。

LB培养基

组份浓度1%(W/V)Tryptone(胰蛋白胨),0.5%(W/V)YeastExtract(酵母提取物),1%(W/V)NaCl

配制量1L

配制方法1.称取下列试剂,置于lL烧杯中。

Tryptone

10g

YeastExtract

5g

NaCl

10g

2.加入约800ml的去离子水,充分搅拌溶解。

3.滴加5NNaOH(约0.2m1),调节pH值至7.0。

4.加去离子水将培养基定容至1L。

5高温高压灭菌后,4。

C保存。

LB/Amp培养基

组份浓度

1%(W/V)

Tryptone

0.5%(W/V)

YeastExtract

1%(W/V)

NaCl

0.1mg/ml

Ampicillin

配制量1L

配制方法1.称取下列试剂,置于lL烧杯中。

Tryptone

10g

YeastExtract

5g

NaCl

10g

2.加入约800ml的去离子水,充分搅拌溶解。

3.滴加5NNaOH(约0.2mL)。

调节pH值至7.0。

4.加去离子水将培养基定容至1L。

5.高温高压灭菌后,冷却至室温。

6.加入1mlAmpicillin(100mg/ml)后均匀混合。

7.4℃保存。

1.2%(W/V)

Tryptone

2.4%(W/V)

YeastExtract

0.4%(V/V)

Glycerol

17mM

KH2PO4

72mM

K2HPOa

TB培养基

组份浓度

配制量1.L

配制方法1.配制磷酸盐缓;中液(0.17MKH2PO4,0.72MK2HPO4)100ml。

溶解2.31gKH2PO4和l2.54gK2HPO4于90ml的去离子水中,搅拌溶解后,加去离子水定容至100ml,高温高压灭菌。

2.称取下列试剂,置于lL烧杯中。

Tryptone

12g

YeastExtract

24g

Glycerol

4m

3.加入约800ml的去离子水,充分搅拌溶解。

4.加去离子水将培养基定容至1L后,高温高压灭菌。

5.待溶液冷却至60℃以下时,;加入100ml的上述灭菌磷酸盐缓冲液。

6.4℃保存。

TB/Amp培养基

组份浓度

1.2%(W/V)

Tryptone

2.4%(W/V)

YeastExtract

0.4%(V/V)

Glycerol

17mM

KH2PO4

72mM

K2HPO4

0.1mg/ml

Ampicillin

配制量1L

配制方法1.配制磷酸盐缓冲液(0.17MKH2PO4,0.72MK2HPO4)100ml。

溶解2.31gKH2PO4,和12.54gK2HPO4于90ml的去离子水中,搅拌溶解后,加去离子水定容至100ml,高温高压灭菌。

2.称取下列试剂,置于lL烧杯中。

时间:

2021.02.02

创作:

欧阳术

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