脂肽抗生素的研究概况.docx

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脂肽抗生素的研究概况

6脂肽抗生素的研究概况之阿布丰王创作

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二O二一年七月二十九日

脂肽（Lipopeptide）又名脂酰肽（Acylpeptide）,是一类重要的抗菌肽,主要来源于一些由细菌、酵母菌、真菌分泌的代谢产物,其种类繁多、结构复杂,是一类由脂肪链和肽链组成的具有两亲结构的微生物次级代谢产物（Kosaric,1987）.脂肽一般来源于植物、植物和微生物,但年夜大都脂肽来源于微生物,而其中又以来源于细菌的脂肽居多.在细菌中,脂肽一般是革兰氏阳性芽孢杆菌发生的代谢产物.1968年,Arima等首次从枯草芽孢杆菌株发现脂肽类概况活性剂,呈晶状,商品名为概况活性素（surfactin）（Arima,1968）.目前发现的抗菌脂肽主要有概况活性素（surfactin）、芬荠素（Fengycin）、伊枯草菌素（iturin）、和杆菌霉素（Bacillomycin）,抗霉枯草菌素（mycosubtilin）、制磷脂菌素（plipstatin）等.脂肽分子由亲水的肽键和亲油的脂肪烃链两部份组成,脂肽分子中多个氨基酸组成的肽链形成亲水基,脂肪烃链形成亲油基.由于其特殊的化学组成和两亲型分子结构,脂肽除具有抗菌活性之外还具有生物概况活性剂的特性（Stein,2005）.脂肽在环境治理,医药、微生物采油等领域有重要的应用前景（Jitemdra,1997；Banat,2003）.

6.1脂肽抗生素的种类及结构特性

芽孢杆菌发生的抗菌脂脂肽的分子结构由脂肪酸链和肽链两部份组成,分子中的多个氨基酸组成的肽链形成亲水基,β-羟基或者氨基脂肪酸的烃链形成亲油基,即是具两亲性的生物概况活性剂.其中亲水的氨基酸通过肽键相互连接,再与脂肪烃链上的羧基和β-羟基或者氨基结合形成环状,因此,抗菌脂肽一般是以内脂或者酰胺键结合而成的环脂肽（刘向阳,2005；吕应年,2005；Wang,2004）.芽孢杆菌脂肽抗生素主要包括概况活性素（Surfactin）,伊枯草菌素（Iturin）,芬荠素（Fengycin）三年夜类.

6概况活性素（Surfactin）

Surfactin类群的脂肪酸的碳链长度在13~16个,具有LLDLLDL的手性七肽通过一内酯键与脂肪酸链碳原子的β-羟基基相连,其在水溶液中分子成“马鞍状”构像,该家族成员包括枯草芽孢杆菌发生的概况活性素（Surfactin）,地衣芽孢杆菌发生的地衣芽孢杆菌素（Llichenyishin）,短小芽孢杆菌的概况活性剂（Pumilacidin）、埃斯波素（Esperin）,其中Liehenyishin、Pumilacidin、Esperin主要应用于工业和环境治理（Meijietal.,1969.；Yakimoetal.,1995；Naruseetal.,1990）.而Surfactin是一种脂肽类抗菌物质,它是由β-羟基脂肪酸和7个氨基酸残基的小肽组成,肽链的第7位氨基酸上的羧基和脂肪酸的β-羟基缩合形成环状结构（如图1-1）.Surfactin主要存在两种类型,即7位上的氨基酸是Leu和Val.肽链中典范的氨基酸组成顺序为（L-）Glu-（L-）Leu-（D-）Leu-（L-）Val-（L-）Asp-（D-）Leu-（L-）Leu（Kowalletal.,1998；杨世忠等,2004）.可是由于其2位（Leu/Ile/Val）、4位（Val/Leu/Ile/Ala）、7位（Leu/Val/Ile）氨基酸的分歧及脂肪酸链长短（C13~C15）的分歧其类似物也较多（刘向阳等,2005）.1991年Baumgart用二维H-NMR证明BacillussubtilisATCC21332和BacillussubtilisOKB105培养液中提取的Surfactin具有三种结构类似物（Baumgartetal.,1991）,分别命名为SurfactinA、SurfactinB、SurfactinC、其中surfaetinA是主要成份,它的环状肽链上第七个氨基酸为Leu,SurfactinB的七位氨基酸为Val,SurfactinC的七位氨基酸为Ile.1992年Oka等采纳优化后的高效液相色谱（HPLC）,首次对枯草芽孢杆菌发生的六种概况活性素分离胜利,并发现了两种具有分歧脂肪酸取代物的新概况活性素.1995年俄罗斯科学家研究从发酵液中获得5个Surfactin的结构类似物,通过质谱技术、化学修饰和二维核磁共振技术确定了它们的结构.随后的研究更精确地测定了十余种Surfactin的同系物（Kowalletal.,1998）,如表1-1（Vateretal.,2002）.Surfactin暗示出抗病毒、抗肿瘤和支原体以及一定水平的抗细菌活性,它自己其实不具备抗真菌活性,但可增强其它脂肽特别是伊枯草菌素的抗真菌活性（Kimetal.,2004）.

图1-1Surfactin的结构示意图

Fig.1-1Structureofsurfactin

表l-1surfactin同系物的种类

Table1-1Sortsofsurfactinisoforms

6芬荠素（Fengycin）

Fengycins类群包括芬荠素（Fengycin）和制磷脂素（plipastatinAl、A2、B1、B2）脂肪酸链碳链长度一般在14~18个,8个氨基酸成环,线状部份包括2个氨基酸和脂肪酸链（Nongnuchetal.,1986）.肽链中氨基酸组成顺序为（L-）Glu-（D-）Orn-（L-）Tyr-（D-）Thr-（L-）Glu-（D-）Ala（Val）-（L-）pro-（L-）Gln-（D-）Tyr-（L-）Ile,肽链的第10位Ile上的羧基和第3位的Tyr上羟基缩合形成环状结构（Vanittanakometal.,1986；Ongena,2005；Sehneider,1999）,如图1-2.Fengycin能够抑制丝状真菌生长,对酵母和细菌无作用（Vanittanakometal.,1986）.它和Surfactin一样有许多同系物,往往同时共存于发酵液中.它们被分成FengycinA和FengycinB两种类型,当肽链的6位上是Ala时,属于fengyeinA；而当肽链的6位上是Val时,属于FengyeinB（WangJ,2004；StellerS,1999；Deleu,2005）.2008年Das还发现了苏云金芽孢杆菌cMB26（CMB26）发生的结构类似于Fengycin的脂肽抗生素（Kimetal.,2004）.罕见的fengycin同系物如表1-2（Stinson,2003；高学文,2003）.

图1-2FengycinA的结构示意图

Fig.1-2StructureofFengycinA

表l-2Fengycin同系物的种类

Table1-2Sortsoffengycinisoforms

6伊枯草菌素（Iturin）

Iturin家族包括伊枯草菌素（Iturin）A、B,杆菌抗霉素（Bacillomycin）D、F、L,抗霉枯草菌素（Mycosubtilin）以及杆菌肽素（Bacillopeptin）A、B、C（陈华等,2008；Franeoiseetal.,1984；Aichaetal.,1982；Yoshioetal.,1995）,其脂肪酸链碳链长度一般在14~17个,具有LDDLLDL手性7个强极性氨基酸短肽的N端氨基通过形成肽键脂肪酸链羧基相连（图1-3）.其中最有代表性的IturinA是由一个含有C14~C17的β-氨基脂肪酸和7个氨基酸残基的环状结构组成,7位上的Ser的羧基基和β-氨基脂肪酸的氨基缩合形成环状结构（Hiradateetal.,2002；Bessonetal.,1978）.伊枯草菌素具有较强的抗真菌活性（Bessonetal.,1978）,也有部份抑制细菌的作用.Iturin的种类及其分子量见表l-3.Iturin能强烈抑制植物病原真菌还有部份细菌甚至还有杀虫作用.

图1-3Iturin的结构示意图

Fig.1-3StructureofIturin

表l-3Iturin同系物的种类

Table1-3SortsofIturinisoforms

6.2脂肽抗生素的合成机理

Lipmann在20世纪70年代首次开展了对肽生物合成的非核糖体机制分析,随后越来越多抗菌脂肽合成的相关基因被克隆、分析,结合全基因组测序的开展,获得了年夜量脂肽抗生素合成和调控的遗传信息（chenetal.,2009）.总之,芽孢杆菌的脂肽类抗生素的合成受一个由合成基因、调控基因共同组成年夜的基因簇控制,这些基因簇含有一个或多个转录单位,而且他们的表达是协同调控的,相似主链结构的脂肽抗生素产物是由相似的合成基因合成的.酶的活性或者存在于一个年夜的功能卵白的分歧结构域中,或者组织于一个多酶复合体中,脂肽抗生素的合成相关基因见表1-4.与核糖体合成的卵白分歧,非核糖体合成的脂肽抗生素的生物合成不以mRNA作为模板,也不需要携带工具tRNA,而是由多个肽合成酶组成的巨年夜复合物NRPS（non-ribosomalpeptidesynthetases）,通过一种称为“多载体硫模板机制（MultipleCarrierThiotemplateMechani-sm）”的方式来合成的（Mohamed,1997；Sasehaetal.,2001）.NRPS是目前已知分子量最年夜的酶,它的运作是不依赖于核酸模板的非核糖体机制,它们在一种模板的指导下,能够识别特定的氨基酸并将其直接连接形成多肽链.每个肽合成酶都有一个或几个模块（module）,每个模块都是一个自力的功能单位,年夜约由1000个氨基酸残基组成,负责将特定的氨基酸掺入肽链中.肽合成酶的模块排列顺序决定了产物中氨基酸的排列顺序,因此肽合成酶既是肽链合成的催化剂,也是肽链合成的模板.每一块模板负责一个反应循环,主要包括识别选择性底物并将其活化为相应的腺苷酸化合物,固定共价中间物和形成肽键.每一块模板在结构上又可以分为3个结构域：

腺苷酸化结构域A、疏基化结构域T和缩合结构域C.腺苷酸化结构A域负责识别特定底物并通过ATP对底物进行活化；疏基化结构域T也被称为肽酰基载体卵白（PCP）,它负责固定反应中间物硫酯；缩合结构域C可以催化第一个模块的氨基酸脱离其载体,进而与第二个模块上的氨基酸形成肽键,如此新合成的肽链便向前移动了一个模块,不竭延伸直到形成脂肽化合物.芽孢杆菌以分歧的模块为模板,结构域有机结合发挥作用,形成多种多样的非核糖体肽.

表1-4脂肽抗生素合成相关基因

Tablel-5Lipopeptidessynthesase-relatedgenes

6.3脂肽抗生素的应用

抗菌肽的应用研究主要集中在农业生物防治、食品工业、畜牧生财富、医药行业、环境呵护等领域.

农业生物防治主要是是指脂肽应用于植物病原菌的生物防治（高芬等,2003；Vollenbroich,1997）.这是由于脂肽抗生素具有广谱的抗霉菌作用和一定的抗细菌作用,而其抗菌机理又分歧于一般的抗生素,它可以使微生物的细胞膜上形成孔洞而使细胞内容物流出而死亡或鳌合一、二价阳离子从而抑制了多种酶类活性,不容易发生耐药性（Steller,1999；Deleu,2005）.另外,肽类物质在自然界中易分解,属于环境友好类制剂,所以,在医药、植物病原菌的控制等方面具有广阔的应用前景.一些学者已经将抗菌脂肽的研究应用于植物病原真菌的抑制.黄现青研究了枯草芽孢杆菌fmbJ发生的脂肽对点青霉AS3.4356的抑制活性,测定了其抗菌谱,并进行了桃防腐试验.桃防腐试验标明其防腐效率可以到达76.5%,具有良好的桃防腐应用前景.Yu等将Bacillusamyloliquefaciens发生的iturinA用来防治西红柿的丝核病菌（Yuetal.,2002）.

在食品行业中的应用主要是把脂肽作为食品防腐剂,并对此进行了年夜量的应用研究.食品平安和植物食品平安有赖于生产过程的各个环节,解决问题的一个关键就是使用无污染、无残留、无毒副作用的食品添加剂.抗菌脂肽是小分子短肽,介入生命过程,具有平安无毒副作用的生物学特性（Zasloff,2002）.

脂肽还可以用于环境呵护方面.脂肽作为概况活性剂,由于他们带有负电荷,可以结合带正电荷的金属阳离子,所以可以选择性去除土壤中的Pb、Zn、Cu等金属离子,其中Cu是最易去除的.有文献报道地衣芽孢杆菌发生的脂肽地衣素是比概况活性素更稳定的阳离子鳌合剂（Catherineetal.,2001）.

脂肽抗生素也可以用于医药行业.医药行业上脂肽的研究主要集中在植物疾病防治及人类抗真菌药物、抗病毒药物、抗肿瘤药物、抗原虫药物的研制上（Hinoetal.,2001.；Rowleyetal.,2004；Boulangeretal.,2004；汪以真等,2004）.

脂肽类概况活性剂也可用于微生物采油方向.由地衣芽孢杆菌NK-X3发生一种脂肽类生物概况活性剂,在pH为4~12和钙离子质量浓度为4000mg/L的条件下,于120℃高温下不失活,这些特点有利于该产物在原油的增采和输送中使用（范立梅,2000；梅建凤,2001）.BacillussubtilisZW-3是王年夜威等人从年夜庆油田分离到一株枯草芽孢杆菌,其代谢发生的脂肽概况活性剂具有优良的乳化和降低油水界面张力的能力,可以提高采油率9.2%,在微生物采油中具有良好的应用前景（王年夜威等,2008）.

6.4脂肽抗生素的分离和鉴定

6脂肽抗生素的分离纯化

脂肽抗生素的分离纯化方法主要有沉淀法、萃取法、色谱法、超滤法、吸附法、泡沫分离法、液膜分离法（黄翔峰等,2009）.沉淀方法有多种,如硫酸盐（80%）沉淀、MnCl2（10mM）沉淀、浓盐酸（6N）沉淀等.酸沉淀是调节样品溶液的pH值,使其到达酸性条件（一般pH=2）,4℃静置过夜使溶液中的物质完全沉淀或经轻微搅动加速其沉降,最后离心获得粗产物.酸沉淀是使用最普遍的,原因是脂肽抗生素绝年夜大都都具有耐强酸的性质,且把持简单,效果显著.但酸沉淀法获得的产物往往纯度不是很高.有文献报道,酸沉淀获得Surfactin产物的回收率可达97%,但纯度只有55%（Chen,2008）.萃取法主要是去除脂肽抗生素粗产物中的亲水性杂质.经常使用的萃取剂有甲醇、二氯甲烷、氯仿、乙酸乙酯、己烷等,这些溶剂既可以独自使用,也可以混合使用.使用最普遍的是甲醇,能够溶解绝年夜大都脂肽抗生素.色谱法可以提高样品的纯度,这是沉淀法和萃取法很难做到的.色谱法主要有高效液相色谱（highperformanceliquidchromatography,HPLC）、凝胶渗透色谱（gelpermeationchromatography,GPC）、吸附色谱（adsorptionchromatography,AC）、硅胶柱层析（silicagelcolumnchromatography）以及薄层层析（thinlayerchromatography,TLC）等.高效液相色谱分离获得的产物纯度高,是分离纯化脂肽抗生素应用较多的一种色谱技术.别小妹用高效液相法标明了BacillussubtilisfmbR抗菌物质含有保管时间与Surfactin相似的成份（别小妹等,2006）.Kowall等以100RP18-TS为色谱柱分离出Surfactin的13种分歧结构体（Kowalletal.,1998）.

6质谱在物质鉴定中的应用

1918年,丹姆斯德（A.J.Dempster）制成了半圆形磁场的第一台单聚焦质谱仪,1958年克劳斯·比曼（KlausBiemann）教授首先用质谱仪分析氨基酸.质谱有多种电离方法,包括场解吸、等离子体解吸、激光解吸、快速粒子轰击、电喷雾电离和年夜气压电离等（李承雷,2007）.1987年由于在生物分子中引入了基质辅助激光解吸电离（Matrix-AsistedLaserDesorptionIonization,MALDI）以及电喷雾电离（ElectrosprayIonization,ESI）,质谱技术有了跃进.这两种电离技术也给肽和卵白质分析带来了极年夜飞跃.目前生物质谱的质量分析器主要有四类：

离子阱（iontrap,IT）、飞行时间（TOF）、四极杆（Q）、和付立叶变换离子回旋共振（Fouriertransformioncyclotroresonance,FTICR）.他们在设计和构造上各有分歧,因而各有优缺点,既可以独自使用,也可以互相组合形胜利能更强年夜的仪器.

ESI-MS是美国耶路年夜学Fenn教授和他的同事在80年代后期提出的.ESI是现今有机质谱中最软的电离技术,它是将卵白质的弱酸性水或水溶剂溶液通过毛细管导入年夜气压电离源内（AtmospherePressureIonization,API）,在气化气的帮手下和源内毛细管终端和反电极之间的强电场作用下,样品溶液形成带电荷的雾,即电喷雾.这些雾滴在热氮气流下蒸发,半径逐渐缩小,雾滴概况的电场不竭增强到某一临界点时发生离子的场发射,或溶剂完全蒸发.生成的样品气相离子经质量分析器分析,测出它们的质/荷比.ESI-MS既可分析年夜分子也可分析小分子.对分子量在1000Da以下的小分子,会发生[M+H]+或[M-H]﹣离子,选择相应的正离子或负离子形式进行检测,就可获得分子量（杨松成,2000）.而高达20000Da年夜分子在ESI-MS中生成一系列多电荷离子,通过数据处置系统能够获得样品的分子量,准确度高于0.01%.ESI-MS不单可与四级质谱相连,它还能与离子阱、飞行时间质谱及付立叶变换离子回旋共振.研究标明,ESI-MS技术是分析脂肽化合物复合体中各组分的相对分子质量及分子结构的有效工具（陈华等,2008）.

基体辅助激光解析电离（MALDI）是由德国科学家Karas和Hillenkamp所发现的.MALDI通常与无质量检测上限飞行时间质谱（TOF-MS）联用,称MALDI-TOF-MS,广泛用于对卵白质的分析、鉴定（Mulleretal.,2006；Howardetal.,2007）.MALDI-TOF-MS具有灵敏度高、准确度高及分辨率高等特点,为生命科学领域的研究提供了一种强有力的分析手段（王晔茹,2007）.它的工作原理是：

将微量样品与过量小分子基体的混合溶液点加在样品的靶盘上,溶剂挥发后样品与基体在靶上形成共结晶.将靶盘装入质谱仪的离子源内,当脉冲激光照射到靶点上时,基体吸收了激光的能量跃迁到激发态,招致了样品分子的电离和气化.电离通常是基体上的质子转移到样品分子上或者从样品分子上获得质子.然后由高电压将电离的样品分子从离子源转送到质量分析器内,将检测到的离子峰为纵坐标,离子质荷比（m/z）为横坐标,形成质量图谱（杨松成,2000）.MALDI-TOF-MS分析时样品制备是分析成败的关键.MALDI-TOF-MS分析时能耐受一定量的小分子像盐、去污剂等,且信息直观、把持简单、快速准确（吴多加,2005）,是在微生物检测和鉴定中应用的一种质谱新技术.表1-5是部份脂肽抗生素物质分子单同位素理论分子量及相应离子质荷比值.

表1-5脂肽抗生素理论分子量及相应离子质荷比值

Tablel-5Theoreticalmolecularmassoflipopeptidesandcorrespondingm/zvalue

脂肽M[M+H]+[M+Na]+[M+K]+

C13

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