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最新Menke体外产气法

 

Menke体外产气法

Menke体外产气法(Syringe系统)——管子

(一)基础知识

体外产气法主要理念

通过体外产气装置模拟瘤胃发酵

体外产气系统组成

体外产气装置:

产气管(相当于独立的瘤胃)、恒温水浴摇床(模拟瘤胃温度和蠕动速度);微生物培养液:

由瘤胃液与人工唾液按1:

2的体积比混合,搅拌均匀而成

影响实验成败的主要因素

实验过程中产气装置的温度,整个操作过程的厌氧状态、微生物活力是影响实验成败的关键

(二)试验前准备

试配产气管①更换注入口处老化的塑胶管;②试配外管和内塞,要求推拉自如又不过松(现已将可匹配的外管和内塞统一编号,依号装配即可)。

称量样品①产气管编号;②用自制的带长柄的称量纸,准确称取待测样品约200mg(DM),置于体外产气管底部,注意不要让样品进入产气管注入口和沾染30ml以上管壁;③样品称取完毕后,管塞上均匀涂抹凡士林,将管塞塞回对映的外管,扣好夹子。

配制原液正式实验前一天,配制好人工唾液中的微量元素溶液(A液)、缓冲液(B液)、常量元素溶液(C液)和刃天青溶液(D液)(可过量配制,常温下存放,配制方法见附表1)。

其它①调试恒温水浴摇床的温度至39±0.5℃,摇动速度5×10转/min,如果使用两个恒温水浴摇床要求两者温度和摇动速度尽量一致,另外还需要将一多联水浴锅温度调至39±0.5℃(以实际量取温度为准);②准备二层、四层、六层纱布各2-4块(纱布可重复使用);③贮备两瓶热水,准备收集瓶(收集和过滤瘤胃液用)、水桶、温度计,以备次日取瘤胃液用。

(三)正式试验

配制人工唾液①将恒温水浴摇床、多联水浴锅打开后;②计算人工唾液需要量:

体外培养时每根产气管内微生物培养液的体积是30ml(10ml瘤胃液和20ml人工唾液),依据试验设计的产气管数计算人工唾液和瘤胃液的需要量(预留20%,以备操作手法不当造成浪费);③配制还原剂(E液,见附表1);④按附表2的顺序和比例将配制好的各原液混合后,置入水浴摇床或水浴锅内,通入CO2气体(气流不易过大),使人工唾液由蓝色转变为粉红色,最终为无色。

采集与处理瘤胃液为方便读取12h产气量,瘤胃液最好在7:

30前取回。

所取瘤胃液为早饲前2h瘤胃液。

①到牧场后,将热水倒入水桶,调节水温度至39±0.5℃,用于瘤胃液保温(应经常用热水调节);②用真空泵抽取三只湖羊的瘤胃液,混合,倒入收集瓶(注意盖上瓶盖,以防氧气对微生物的影响);③回到实验室后,将收集瓶置于水浴锅内,四层纱布过滤(应尽量快,以保持微生物的活力),获得的滤液用CO2气体饱和;④用量筒量取所需量的无色人工唾液和瘤胃液混合,不间断地通入CO2气体。

吸取微生物培养液用空的产气管吸取微生物培养液30ml,通过三通管推入已经装有样品的产气管。

记录初始微生物培养液量排气过程:

将注入口处夹子打开的同时,用手下拉管塞,以防样品冲入塑胶管;摇晃产气管使样品与瘤胃液混合后,旋转管塞,排出管内空气;读数:

将产气管竖直,注入口向下,读取刻度。

排气后的产气管应随机置于恒温水浴摇床内培养(摇床在操作过程中处于摇动状态,以免温度上升)。

空白对照和标准对照

实验过程中要有至少3个空白对照和3个标准干草对照(样多时,对照一定要多,尤其是空白对照)。

空白对照不加样品直接加入30ml微生物培养液,标准干草对照以200mg(DM)干草(优质的过80目筛的羊草)为底物,加入30ml微生物培养液。

为了消除操作顺序和恒温水浴摇床条件的差异,要求空白对照和标准对照平均分布于试验前期、中期和后期,放置于水浴摇床的不同位置。

整个过程要尽量快,特别是吸培养液和排气,最好不要超过15min

记录产气量培养2、4、6、9、12、24、36、48、72、96h时(试验样品为粗料,一般培养到72h或96h;精料一般培养到24h或48h即可终止培养,若要计算产气常数,一般要72h),记录产气管的刻度读数(读数时轻摇产气管,旋动管塞后读数,读数时,以管塞刻度的中部为准)。

如果产气量过多,下一时间点产气量可能超出刻度范围,则需放气,其操作与排气相同。

产气量计算

(管子)

式中,GPt为样品在t时刻的产气量(ml);Vt为样品发酵t小时后,产气管刻度读数(ml);V0为样品在开始培养时产气管刻度读数(ml);W为样品干物质重(mg);GP空白为空白对照在t时刻的产气量,其计算方式与GPt一致。

重复试验要求体外产气试验至少培养两次,两次标准干草产气量相对偏差小于10%(若标准干草产气量与实验室积累的平均值29.5相差太大,应考虑重作,检查动物状况)。

(四)样品采集

测定项目

取样时间

取样部位

取样量

重复数

处理

保存温度

VFA

实际需要

上清液

1ml

-

加入0.2ml8.2%偏磷酸,20000g离心10min

4℃

NH3-N

24或48h

混合液

5ml

-

-20℃

MCP

24或48h

混合液

24ml

-

-20℃

附表1:

人工唾液原液配制表

A、微量元素溶液:

CaCl2.2H2O13.2g;

MnCl2.4H2O10.0g;

CoCl2.6H2O1.0g;

FeCl3.6H2O8.0g;

加蒸馏水至100ml

B、缓冲液:

NH4HCO34.0g;

NaHCO335.0g;

加蒸馏水至1000ml

C、常量元素溶液:

Na2HPO4.12H2O9.45g

KH2PO46.2g

MgSO4.7H2O0.6g

加蒸馏水至1000ml

D、0.1%刃天青溶液:

100mg刃天青溶解于

100ml蒸馏水

E、还原剂溶液(现用现配):

1MNaOH4.0mlNa2S9.H2O625mg加蒸馏水95ml

附表2:

人工唾液配制表(1000ml)

顺序

原液

体积(ml)

1

蒸馏水

520.2

2

微量元素溶液(A液)

0.1

3

缓冲液(B液)

208.1

4

常量元素溶液(C液)

208.1

5

0.1%刃天青溶液(D液)

1.0

6

还原剂溶液(E液)

62.4

嘌呤法测定体外微生物蛋白产量

(一)操作流程图

(二)试剂配制及具体操作

1、试验试剂

A

0.2M磷酸二氢铵

23g磷酸二氢铵溶解于700ml蒸馏水,定容至1000ml

B

pH=2的蒸馏水

在蒸馏水中加少许硫酸至pH=2

C

0.4M硝酸银

准确称取1.6987g硝酸银,溶解于15ml蒸馏水中,待完全溶解后定容至25ml。

溶液需用棕色瓶存放,避光保存,并外覆不透光的黑纸

D

0.5M盐酸

用蒸馏水稀释10ml盐酸(37%)至240ml

E

28.5mM磷酸二氢铵

用蒸馏水稀释100ml0.2M磷酸二氢铵至700ml

F

85%磷酸

G

0.6M高氯酸

用蒸馏水稀释10ml高氯酸(70%,12M)至200ml

2、测定步骤

A.酵母RNA标准曲线的制作:

①分别称取5、15、25、35、45、55mg酵母RNA于10ml离心管中,并加入2ml0.6MHClO4,于90-95℃水浴1小时,冷却;

②再分别加入6ml28.5mMNH4H2PO4,于90-95℃水浴15min,冷却后在3000g,4℃条件下离心10min;

③取1.6ml上清液,向上清夜中加入6ml0.2MNH4H2PO4溶液,并用85%磷酸调整溶液pH为2–3(一般需85%磷酸25µl);

④取调整pH值后的溶液3.8ml,并向其中加入0.2ml0.4MAgNO3,混合,于5℃条件下避光、过夜;

⑤过夜后于3000g,4℃条件下离心10min,弃上清液;用4.5mlpH=2的蒸馏水冲洗沉淀;再于3000g,4℃条件下离心10min,弃上清液;

⑥向沉淀中加入5ml0.5MHCl溶液,混匀,在90-95℃条件下水浴30min后,以3000g离心10min;

⑦上清液用0.5MHCl稀释40倍后,以0.5MHCl溶液作参比,在260nm下比色,根据光密度值作出标准曲线。

B.培养液中微生物蛋白质的测定:

①取8ml均匀发酵液于3个10ml离心管,在20000g,4℃条件下离心20min;弃上清液后加入2.104ml0.6MHClO4,于90–95℃水浴1小时,冷却;

②按照制作标准曲线的步骤②-⑥操作;

③以0.5MHCl溶液作参比,在260nm下比色,根据光密度值和标准曲线求出RNA测定值;

④根据下面公式计算微生物蛋白氮产量:

其中,RNA含氮量为17.83%,细菌氮中RNA含氮量为10%。

浙江大学奶业科学研究所

比色法测定培养液氨态氮浓度

(一)操作流程图

(二)试剂配制及具体操作

1试验试剂

A

0.2M盐酸溶液

将18ml浓盐酸用蒸馏水稀释到1000ml

B

14%水杨酸钠溶液

称取14g水杨酸钠,用蒸馏水溶解,定容至100ml

C

0.3M氢氧化钠溶液

1.2g氢氧化钠用蒸馏水溶解并定容至100ml

D

D液

称取0.08g亚硝基铁氰化钠溶解于100ml14%水杨酸钠溶液中

E

E液

量取2ml次氯酸钠溶液(商品名安替福明,含活性氯5.2%),混于100ml0.3M氢氧化钠溶液中摇匀

2测定步骤

A、氨氮标准系列溶液制备

①准确称量0.382g氯化铵,用0.2M盐酸溶解,并定容到100ml,作为保存液,在冰箱中可存放数月。

②取保存液10ml,用蒸馏水稀释定容至100ml,为工作液。

含氮量为10mg/100ml。

③取工作液0、1、2、4、6ml置于5个编号的50ml容量瓶内,接着分别加入蒸馏水10、9、8、6、/4ml,使之都成为10ml,再用0.2M盐酸定容。

这就是每100ml中含氮量为0、0.2、0.4、0.8、1.2mg的标准系列溶液。

B、比色与计算

①准确量取标准系列溶液0.4ml分置于5个10ml试管内,各管中再依次加入D液和E液2ml,摇匀,静置10分钟后比色。

波长700nm,0.5cm的比色皿,用不含氮的0号管液作空白对照。

记录各消光值。

②用消光值作自变量,溶液含氮量作从变量导出回归方程式。

③样品处理:

取5ml瘤胃培养液在3500-4000转/分下,离心10分钟,量取2ml上清液(若含氮量较高,可取1ml上清液再加1ml蒸馏水),置于15ml试管内,再加入8ml0.2M盐酸至10ml摇匀(稀释倍数为5或10)。

比色操作同:

准确量取各溶液0.4ml置于10ml试管内,各管内再依次加入D液和E液2ml,摇匀,静置10分钟后比色。

波长700nm,0.5cm的比色皿,用不含氮的0号管液作空白对照。

记录各消光值。

把测得的消光值代入回归公式,计算的结果乘以样品稀释的倍数就是原样中氨氮的含量。

浙江大学奶业科学研究所

体外发酵产物中挥发性脂肪酸浓度的测定

(一)操作流程图

(二)试剂配制及具体操作

1混标制备

按表1或表2中梯度,配制6个梯度的混合标样,用于制作标准曲线。

表1乙酸、丙酸和丁酸混合标样的配制(umol/ml)

1

2

3

4

5

6

乙酸

10

20

40

80

160

320

丙酸

1

2

4

8

16

32

丁酸

1

2

4

8

16

32

表2乙酸、丙酸和丁酸混合标样的配制(ul/ml)

1

2

3

4

5

6

乙酸

0.571

1.143

2.285

4.570

9.140

18.280

丙酸

0.075

0.149

0.299

0.598

1.196

2.390

丁酸

0.092

0.184

0.367

0.735

1.470

2.939

2上机测定

色谱柱

HP-INNOWAX(19091N-133)毛细管柱,30m×0.25mm×0.25µm

气化室温度

200℃

检测室温度

220℃

柱温

采用程序升温,80℃持续1min后,以15℃/min升温至170℃后维持1.5min

载气及流速

载气为高纯氮,压力为100kpa,总流量63.8ml/min,柱流量1.19ml/min,分流比50,吹扫流量3ml/min,循环流量30ml/min

检测室气体流速

H2流量40ml/min,空气流量400ml/min

进样量

2µl

浙江大学奶业科学研究所

发酵气体中甲烷含量的测定

(一)标准曲线建立

用10µl的微量注射器分别抽取1.0、2.0、3.0、4.0、5.0、6.0µl的甲烷标准气,上机,根据甲烷的浓度和其峰面积的关系,确定甲烷的标准曲线。

由于在测定发酵气体时取样量是20µl,故设定1.0、2.0、3.0、4.0、5.0、6.0µl的甲烷标准气的浓度分别为5、10、15、20、25、30%。

(二)上机条件

色谱柱

HP-INNOWAX(19091N-133)毛细管柱,30m×0.25mm×0.25µm

气化室温度

100℃

检测室温度

120℃

柱温

80℃

载气及流速

载气为高纯氮,压力为179.5kpa,总流量46.2ml/min,柱流量2.7ml/min,分流比15,吹扫流量3ml/min,循环流量30ml/min

检测室气体流速

H2流量40ml/min,空气流量400ml/min

进样量

20µl

浙江大学奶业科学研究所

 

压力读取式体外产气法(RPT系统)——产气瓶

(一)基础知识

体外产气法主要理念

通过体外产气装置模拟瘤胃发酵

体外产气系统组成

体外产气装置:

产气瓶(相当于独立的瘤胃)、恒温培养箱(模拟瘤胃温度);微生物培养液:

1:

9的瘤胃液与人工唾液;压力传感器;PC

影响实验成败的主要因素

实验过程中产气装置的温度,整个操作过程的厌氧状态、微生物活力是影响实验成败的关键

(二)操作流程图

(三)试剂配制及具体操作

1、试验前准备

称量样品①产气瓶编号(因为产气量的计算涉及瓶子体积,所以尽量保留原产气瓶编号,使用新瓶时要量取瓶子体积);②加入磁力棒;③准确称取待测样品一般约750mg(DM,适用0.5-1.5mgDM),置于体外产气瓶底部。

配制人工唾液①计算人工唾液需要量:

体外培养时每个产气瓶内人工唾液的量为90ml,瘤胃液10ml,依据试验设计的产气瓶数计算人工唾液和瘤胃液的需要量(预留20%,以备操作手法不当造成浪费);②配制人工唾液中的微量元素溶液(A液)、缓冲液(B液)、常量元素溶液(C液)、刃天青溶液(D液)(可过量配制,常温下存放)和还原剂(E液,现用现配,见附表1)。

③按附表2的顺序和比例将配制好的各原液混合后,置入水浴摇床或水浴锅内,通入CO2气体(气流不易过大),使人工唾液由蓝色转变为粉红色,最终为无色。

分装人工唾液不间断地将CO2通入人工唾液瓶,用100ml注射器或产气管吸取人工唾液90ml,注入称有样品的产气瓶,并用CO2饱和(可通过三通管完成两路CO2的同时输入)。

盖紧橡胶塞后,39±0.5℃恒温培养箱内过夜(对于青贮类等含酸较多的样品,一定要过夜,而且在正式培养前将里面所产气体排空,不计入产气量)。

其它①准备二层、四层、六层纱布各2-4块(纱布可重复使用);②贮备两瓶热水,准备收集瓶(收集和过滤瘤胃液用)、水桶、温度计,以备次日取瘤胃液用。

2、正式试验

采集与处理瘤胃液为方便读取12h产气量,瘤胃液最好在7:

30前取回。

所取瘤胃液为早饲前2h瘤胃液。

①到牧场后,将热水倒入水桶,调节水温度至39±0.5℃,用于瘤胃液保温(应时经常热水调节);②用真空泵抽取三只湖羊的瘤胃液,混合,倒入收集瓶,盖好盖子;③回到实验室后,将收集瓶置于水浴锅内,依次用二层、四层和六层纱布过滤(应尽量快,以保持微生物的活力),获得的滤液不间断地通入CO2气体;④将密封的产气瓶从恒温箱中取出,用6.5号针头将产气瓶中多余气体放尽;⑤用20ml注射器吸取瘤胃液10ml,通过另一16号针头注入产气瓶,将两根针头取下,产气瓶置于39±0.5℃恒温箱中培养。

空白对照和标准对照

实验过程中要有至少3个空白对照和3个标准干草对照。

空白对照不加样品只有90ml人工唾液和10ml瘤胃液,标准对照以750mg(DM)干草(优质的过80目筛的羊草)为底物,加入90ml人工唾液和10ml瘤胃液。

为了消除操作顺序和恒温培养箱条件的差异,要求空白对照和标准对照平均分布于试验前期、中期和后期,放置于培养箱的不同位置。

记录产气量培养2、4、6、9、12、24、36、48h时,如果条件允许可延长培养时间,培养粗料时,至少96h或更长(有人培养一周),用压力传感器读取产气瓶内压力(轻拿、轻放),并放气。

要求:

使用压力传感器前,熟练软件的操作(有模拟程序可供练习)

产气量计算

(瓶子)

式中,GPt为样品在t时间段的产气量(ml);Pt为t时间段读取的压力(mPa);V0为瓶子体积;101.3为标准大气压(mPa);W为样品干物质重。

产气过程的总积累产气量为各时间段产气量之和。

瘤胃发酵样品制备①培养中途取样时,要求取样同时,向产气瓶内通入CO2,并于39℃水浴中操作;②取混合液(发酵液及固体残渣)时要求在控温磁力搅拌机上操作。

重复试验要求体外产气试验至少培养两次,两次标准干草产气量相对偏差小于10%。

附表1:

人工唾液原液配制表

A、微量元素溶液:

CaCl2.2H2O13.2g;

MnCl2.4H2O10.0g;

CoCl2.6H2O1.0g;

FeCl3.6H2O8.0g;

加蒸馏水至100ml

B、缓冲液:

NH4HCO34.0g;

NaHCO335.0g;

加蒸馏水至1000ml

C、常量元素溶液:

Na2HPO4.12H2O9.45g

KH2PO46.2g

MgSO4.7H2O0.6g

加蒸馏水至1000ml

D、0.1%刃天青溶液:

100mg刃天青溶解于

100ml蒸馏水

E、还原剂溶液(现用现配):

CysteineHCl625mg蒸馏水95ml1MNaOH4.0mlNa2S9.H2O625mg

附表2:

人工唾液配制表(1000ml)

顺序

原液

体积(ml)

1

蒸馏水

520.2

2

缓冲液(B液)

208.1

3

常量元素溶液(C液)

208.1

4

微量元素溶液(A液)

0.1

5

0.1%刃天青溶液(D液)

1.0

6

还原剂溶液(E液)

62.4

瘤胃液脂肪酸测定

(一)操作流程图

(二)试剂配制及具体操作

1、样品处理

①.取1ml样品于带盖的水解管,加入0.67ml5MNaOH和一滴饱和甲基橙指示剂后,充满N2;

②.85℃水浴30min,冷却至室温后,加入0.67ml5.1MHCl,使溶液pH低于2(溶液由橙色变为红色),如果不确定,可以用pH计检测;

③.加入1ml2mg/ml的内标C17:

0;

④.加入2.5ml氯仿/甲醇(2:

1,v/v)后,涡旋2min;

⑤.将样品在2000g下离心10min;

⑥.移去上层甲醇/水层,轻轻拨开中间杂质层,将下层溶液无损失转移;

⑦.通过含硫酸钠的干燥柱将下层氯仿滤入另一玻璃容量管;

⑧.用氮气将样品吹干;

⑨.用1.0ml正己烷悬浮后,简单涡旋;

⑩.2000rpm下离心10min,样品-20℃冷冻保存。

2、上机条件

色谱柱

HP-INNOWAX(19091N-133)毛细管柱,30m×0.25mm×0.25µm

气化室温度

260℃

检测室温度

270℃

柱温

采用程序升温,140℃持续5min后,以4℃/min升温至240℃后维持20min

载气及流速

载气为高纯氮,压力为100kpa,总流量87.9ml/min,柱流量0.84ml/min,线速度:

25.6cm/sec,分流比100,吹扫流量3ml/min,循环流量30ml/min

检测室气体流速

H2流量40ml/min,空气流量400ml/min

进样量

产气管,2µl;产气瓶4µl

浙江大学奶业科学研究所

Real-timePCR测定瘤胃微生物数量

一、样品采集

Invitro实验终止时,若分析混合微生物,可取1ml混合培养液于1.5ml灭菌离心管(也可直接用灭菌过的含0.3g0.1mm和0.1g0.5mm锆珠的2ml螺口管)-80度保存待用。

若要分别分析固、液相微生物时,将混合培养液过40um尼龙袋,滤液于4度500⨯g离心10,上清用于液体微生物DNA提取。

尼龙袋于39度灭菌水中冲洗至澄清用吸水纸吸干水份,-80度保存用于固相微生物DNA的提取。

InSacco方法与此相似。

二、总DNA的提取

1试验材料:

1.5mLEP管、螺口管、锆珠、1mL、200uL、20ul枪头(均需灭菌)、涡旋器、高速离心机等。

2所需试剂:

NaOH、Tris碱、EDTA二钠、NaCl、Tris饱和酚、氯仿、异戊醇、冷乙醇。

3.溶液配制方法:

试剂

方法

A

10MNaOH

称取40gNaOH,加到100mL水中。

无需除菌。

B

5MNaCl

称取29.22gNaCl,加水溶解定容至100mL。

C

1M,pH8.0Tris-HCl

称取12.114gTris碱,加80mL水,用浓盐酸调pH至8.0,加水定容至100mL。

D

0.5M,pH8.0EDTA

将18.61gEDTA-Na.加入80mL水中,在磁力搅拌器上剧烈搅拌。

用10N的NaOH调节溶液的pH值至8.0,加水定容至100mL。

E

TE缓冲液(10mMTris-HCl,1mMEDTA,

pH8.0)

吸取1mL1M的Tris-HCl和0.2mL0.5M的EDTA,加水定容至100mL。

F

TN150(10mMTris-HCl;

150mMNaCl,pH8.0)

1ml1M的Tris-HCl和3ml5MNaCl,加水定容至100ml。

G

Tris饱和酚(pH8.0)

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H

24:

1的氯仿∕异戊醇

240mL氯仿+10mL异戊醇

I

无水乙醇

-20度保存。

J

70%乙醇

70mL无水乙醇加30mL水-20度保存。

4提取步骤:

⑴液相微生物:

冰上解冻样品后于4度20000g离心5min,弃上清液。

加入1mLTN150悬浮沉淀,再加150µL的Tris饱和酚,Bead-beater匀浆(4600g,2min),冰上两分钟冷却,重复三次。

固相微生物:

称取0.35g固体培养物于2ml螺口管,再称0.3g0.1mm和0.1g0.5mm灭菌过的锆珠。

加入1mLTN150,150µL的Tris饱和酚,Bead-beater匀浆(4600g,2min),冰上冷却两分钟,重复三次。

以下步骤相同

(2)加入150µL氯仿∕异戊醇,涡旋混匀。

20000g离心5min,上清液转至已1.5mLEP管中。

(3)加入150

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