uniprot 蛋白库下载及添加到PD流程.docx

uniprot 蛋白库下载及添加到PD流程.docx

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uniprot蛋白库下载及添加到PD流程

Uniprot网址

http:

//www.uniprot.org/

1、打开网址

2、如果选择单个蛋白的数据库，则选择UniProtKB

3、输入蛋白名称，如breastmilk，回车搜索。

结果显示有10，395个蛋白。

4、点击download，在对话框中选择downloadall，FASTA文件可以选择正式蛋白，或者正式加同分异构体；选择不压缩文件。

点击GO，save。

5、如果选择下载蛋白质组，则选择Proteomes，在随后的搜索框中输入比如“HomoSpiens”（human智人的学名），其他同上方法下载。

注意：

下载过程中可能会下载不完全而显示下载完成的情况，这可能是由于网速不好造成的，可以多下载几次，比对数据库大小的差异，选择较为完整的数据库。

二、

1、打开PD软件，在任务栏点击Administration下拉的MaintainFASTAFiles

2、在打开的窗口任务栏点击Add，找到所下载的数据库文件即可。

3、等待状态显示为“Completed”即为添加完成。

4、打开原有Workflow平台，在SequestHT下更改ProteinDatabase文件即可。

5、在菜单栏中Workflow下选择SaveAsTemplate一个新名称即可