全集生信方法数据库挖掘精品论文解读干货收藏.docx

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全集生信方法数据库挖掘精品论文解读干货收藏

全集生信方法数据库挖掘精品论文解读(干货收藏)

生信草堂时间如过隙之驹小编已经陪大家一起学习生物信息相关知识近一年感谢大家对我们的支持和关注在此小编特整合不同系列方便广大读者阅读感兴趣的文章温故知新DNA系列甲基化1.干货|全基因组甲基化测序分析

(一)2.精品推荐|年龄相关的DNA甲基化的改变与疾病的联系3.干货|甲基化和表达数据整合分析策略|FEM包4.一型糖尿病与DNA甲基化的关联——甲基化研究的新思路5.文献解读|CRISPR-Cas9系统靶向编辑DNA甲基化

GWAS1.GWAS的基因型填充是怎么回事?

2.GWAS还能走多远?

——十年的思考3.GWAS+lncRNA是否能成为后基因组研究的宠儿?

4.精品论文|如何利用分子实验验证GWAS发现的SNP?

5.GWAS研究的转机|转录因子(PU.1)参与调节阿兹海默症(AD)6.NatureGenetics上的肠道菌群GWAS研究是怎么做的--【文章解读】7.Nature-medicine教你用GWAS+RNA-Seq研究精神分裂症分子机制

8.GWAS+公共数据库=Nature9.生信速递:

如何用PrediXcan建立o受SNP调控的基因表达和性状的关系

CRISPR1.利用CRISPR/Cas9系统在哺乳动物细胞中进行基因编辑2.CRISPR/Cas9系统在哺乳动物细胞中进行基因编辑

(2)3.【CRISPR:

Geneeditingandbeyond】withsubtitle...4.利用CRISPR/Cas9系统在哺乳动物细胞中进行基因编辑(三)5.Cell报道通过CRISPR全基因组扫描的生信分析发现癌症关键基因

其它1.液体活检来临的时代:

ctDNA与癌症全周期管理2.基因芯片小知识

(一)3.基因芯片小知识

(二)4.基因芯片小知识(三)5.关于ICA不得不说的秘密

(一)6.关于Haplotype,看完这个你就明白了7.功能基因组学研究利器——ChIA-PET8.功能基因组学研究利器——Hi-C9.干货|DNA提取笔记10.技术推荐|文献解读|Hi-C还原我们染色体的真实构想

RNA系列CircRNA1.CircRNA预测软件大对比

(一)2.干货|CircRNA预测软件之find_circ使用流程3.干货|CircRNA预测软件之find_circ使用流程

(二)4.CircRNA预测软件之CIRCexplorer2使用流程(三)5.circRNA高分文章解读——高通量分析篇(上)6.Science告诉你circRNA也能成为microRNA的“神助攻”!

lncRNA1.什么鬼,lncRNA原来这么分析?

2.读一文掌握LncRNA研究套路3.不做实验也能圆你高分SCI的梦--miRNA在精神分裂症中的作用4.实例解读|高分文章|lncRNA-miRNA作用于心脏肥大5.实例解读|lncRNA在胃癌中的作用6.文献分享|转录组测序|mRNA-miRNA-lncRNA分析|心力衰竭研究

其它1.meQTL分析,你分析过吗?

2.转录组分析之SNPcalling研究流程3.小白的tophat2学习笔记4.HISAT2,取代TopHat的宠儿5.STAR,效如其名6.RNA-Seq分析|RPKM,FPKM,TPM,傻傻分不清楚?

7.影响实验精确度的RNA分析套路及优化8.cufflinks学习笔记9.我们得到的差异基因的FDR都是错的?

10.精品RNA分析软件|kallisto,卡丽丝多11.Nature-medicine教你用GWAS+RNA-Seq研究精神分裂症分子机制12.转录组分析之名词专题13.名词专题|RNA-seq常见名词解释14.小麦未知基因的快速克隆方法6—利用BSA+RNA-Seq进行快速定位

生信软件系列1.基因表达分析工具--CLUE2.CircRNA预测软件大对比

(一)3.干货|CircRNA预测软件之find_circ使用流程4.干货|CircRNA预测软件之find_circ使用流程

(二)5.CircRNA预测软件之CIRCexplorer2使用流程(三)

6.小白的tophat2学习笔记7.HISAT2,取代TopHat的宠儿8.STAR,效如其名9.cufflinks学习笔记10.精品RNA分析软件|kallisto,卡丽丝多

11.关于ICA不得不说的秘密

(一)12.关于Haplotype,看完这个你就明白了13.这里有你想知道的Everything14.Carthagene--遗传图谱构建软件15.快来算算你的遗传关联分析的power够不够-

16.生信必备,centos安装,上篇17.生信必备,CentOS安装,中篇18.生信必备,centOS安装,下篇19.开年联配新方法:

DART20.解决你软件安装疑难杂症的docker21.“LinkedOmics”TCGA第三方软件中的战斗机!

22.基因组共线性工具MCScanX使用说明23.高分作图:

circos圈图之软件安装篇24.临床医学中的生存分析|如何R作生存曲线图?

|在线作生存曲线图25.超好用的PubMed文献管理插件

26.NCBI官方基因组坐标转换工具27.Cytoscape:

强大的pathway分析可视化工具

数据库系列1.数据库|新生突变研究,突变速率不容忽视|mirDNMR

2.UCSC的使用方法

(一)3.UCSC数据库,全方位巡视一段DNA序列

4.GeneSpringGX中文教程

(一)5.GeneSpringGX中文教程

(二)(三)事

6.TCGA数据库讲解与数据下载7.TCGA三级数据下载攻略8.构建生物网络实践TCGA肿瘤数据库下载9.TCGA初相识

10.几分钟,使用MedSci搜索SCI期刊最新的信息11.最全长链非编码RNA数据库介绍(全)12.如何从ENCODE数据库中快速获取组蛋白chip-Seq的可视化数据13.dbGaP加密数据权限申请和数据解密14.MAGMA很好的GWAS数据通路富集方法|别样的公共数据库挖掘(内有练习资料)15.小麦生信必备网站和数据库

生信语言系列Linux1.干货|Linux常用命令小结

(一)2.Windows玩够了?

试试用VMware虚拟机安装Linux3.推荐一个巨好用的Linux服务器连接客户端!

4.让我带你玩转”Linux“5.Linux脚本编写“学前班”6.linux文本截取与处理之awk7.linux文本截取与处理之sed8.linux文本截取与处理之cut9.Linuxshell基础篇10.Linuxshell应用篇

Python1.Python包安装详解2.干货|用几行简单的python代码轻松获得GEO转录组表达矩阵数据

Perl1.干货小卖铺|Perl语言与生物信息分析入门

(一)2.经验分享|如何从Perl语言小白变成大神3.Perl编程基础4.手把手教你学perl编程之题目篇

(一)5.Perl|解题系列1-1(基础题)6.Perl|解题系列1-2(附加题)7.利用perl下载OMIM数据

R1.如何利用不同的R包画韦恩图2.看了这个你就会画热图了3.[可视化]利用ggplot2绘制散点图4.【可视化】利用ggplot2绘制条形图5.逐步深入绘制热图6.如何用三步做出样本相关性矩阵热图7.基于R的文本挖掘及可视化--挖一挖音乐诗人李健8.超过六个元素的韦恩图你就玩不转了?

其它1零基础测序分析图表解读大全:

老板再也不愁我的文献阅读了!

宏基因组扩增子(箱线,散点,热,曼哈顿,火山,韦恩,三元,网络)2.扩增子统计热图与曼哈顿图的绘制与解读3.如何写一个脚本4.使用远程服务器的几个技巧5.生信软件安装神器

微生态系列1.被你嫌弃的它,却为科学打开了“一扇门”2.“菌”情初探3.“它的前半生”肠道微生物与人类密切相关的方方面面4.肠道微生态|NatureMedicine揭秘“神药”二甲双胍降糖新机制5.NatureGenetics:

GWAS证明遗传和饮食决定肠道微生物组结构6.肠道微生物调节黑色素瘤病人抗PD-1免疫治疗效果

SCI写作系列1.公共数据库,SCI怎么发?

(一)2.公共数据库,SCI怎么发?

(二)3.公共数据库,SCI怎么发?

(三)

4.想发Meta的看这里|Meta分析,SCI怎么发?

5.迟早会用到的SCI句型

杂记系列1.标书如人——轻松撰写国家自然科学基金申请书2.让你关注的文章漂洋过海来找你3.干货|外泌体领域研究及样本处理4.|大数据分析学起来|今天走了几步啦看人家用计算步数发表的Nature5.MDD的前世今生6.那些互联网上的基因检测服务到底靠不靠谱?

7.干货打包|实验方法大全+生信学习资料+实例分析,视频讲解8.不要因为电网质量影响你的实验数据9.我与生物信息学10.远程协助,助力国庆回家团聚、工作两不误11.既然买Macbook太剁手,那还是买超薄本加虚拟机吧!

12.美女小编的学习笔记|用服务器进行FastQC的基本步骤13.今天朋友圈被“小朋友”的画刷屏了,可你真的了解自闭症吗?

14.基于Kmer的基因组调查15.NatMed:

全球首个万人晚期癌症测序成果发布16.轻松搞定服务器外网登录

17.小心权威杂志的GEO数据出错了18.是时候戒烟了!

19.机器学习能否预测疾病风险

实战练习系列1.零基础大数据挖掘

(一):

基因数据库的利用2.零基础大数据挖掘

(二)--大数据系列3.零基础大数据挖掘(三)--富集分析4.生信大数据系列--总结篇

5.生物医学大数据解读和分析--构建生物网络实践

(一)6.生物医学大数据解读和分析

(二)--构建生物网络案例实践Cytoscape7.构建生物网络实践TCGA肿瘤数据库下载8.生物医学大数据解读和分析--使用Cytoscape构建miRNA-mRNA网络

9.MAGMA很好的GWAS数据通路富集方法|别样的公共数据库挖掘(内有练习资料)

10.手把手教你学perl编程之题目篇

(一)11.Perl|解题系列1-1(基础题)12.Perl|解题系列1-2(附加题)

文献分享系列1.不做实验也能圆你高分SCI的梦--miRNA在精神分裂症中的作用2.实例解读|高分文章|lncRNA-miRNA作用于心脏肥大3.实例解读|lncRNA在胃癌中的作用4.想发Meta的看这里|Meta分析,SCI怎么发?

5.文献分享|转录组测序|mRNA-miRNA-lncRNA分析|心力衰竭研究

6.circRNA高分文章解读——高通量分析篇(上)7.重磅|抑郁症发病生物学机制“男女有别”8.NatureGenetics上的肠道菌群GWAS研究是怎么做的--【文章解读】9.抗抑郁药真的会增加自杀风险吗?

10.一型糖尿病与DNA甲基化的关联——甲基化研究的新思路

11.Nature-medicine教你用GWAS+RNA-Seq研究精神分裂症分子机制12.GWAS+公共数据库=Nature13.肠道微生态|NatureMedicine揭秘“神药”二甲双胍降糖新机制14.NatureGenetics:

GWAS证明遗传和饮食决定肠道微生物组结构15.肠道微生物调节黑色素瘤病人抗PD-1免疫治疗效果

16.精品论文|如何利用分子实验验证GWAS发现的SNP?

17.GWAS研究的转机|转录因子(PU.1)参与调节阿兹海默症(AD)18.Science告诉你circRNA也能成为microRNA的“神助攻”!

19.用机器学习的方法预测宏基因组数据中的抗生素抗性基因20.公共数据挖掘|利用GWAS和GEOexpression数据揭示心血管疾病和二型糖尿病的共同分子调控网络

21.震惊!

维生素B竟然还有如此作用!

22.你真的能做好环状RNA敲除实验吗?

23.ERβ如何介导的circRNA调控24.花小钱办大事|低廉芯片表达数据也能帮助药物研发!

25.又见数据挖掘|遗传与调控数据揭示肺癌亚型之间的若即若离

植物系列1.“我要上PC”—小麦领域PlantCell上论文合辑

(一)2.“我要上PC”—小麦领域PlantCell上论文合辑

(二)3.“我要上PC”—小麦领域PlantCell上论文合辑(三)4.“我要上PC”—小麦领域PlantCell上论文合辑(四)5.“我要上PC”—小麦领域PlantCell上论文合辑(五)

6.在大数据时代重新审视植物miRNA注释的标准7.“我要上PC”—小麦领域PlantCell上论文合辑(六)8.“我要上PC”—小麦领域PlantCell上论文合辑(七)9.小麦未知基因的快速克隆方法7—AgRenSeq技术

10.小麦穗粒数转录组分析

(一)

11.“我要上PC”—小麦领域PlantCell上论文合辑(九)12.小麦基因组测序研究进展13.全基因组水平基因分型方法14.水稻广谱抗病基因的克隆15.小麦特异microRNA9678介导靶基因产生次级小RNA并通过GA和ABA通路参与小麦种子萌发

16.一作解读:

紫粒小麦中调控花青素合成转录因子的克隆与功能解析

新闻纪实系列本周生物资讯锦集本周生物资讯锦集本周生物资讯锦集本周生物资讯锦集本周生物资讯锦集本周生物资讯锦集相约华家池—转录组分析讲习班回顾悼霍金,天空中最亮的星抄袭是不对的杭城又出大手笔!

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