一步一步教你读流式图凋亡和坏死的区别.docx

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一步一步教你读流式图凋亡和坏死的区别

一步一步教你读流式图:

凋亡和坏死的区别

2008-08-0500:

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流式图调亡坏死区别

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下图为坏死图。

坏死的位于G0/G1峰前的峰形为从左至右的反抛物线形。

如下:

而APOptosis则是一个较为对称的峰。

如下:

.

而有时凋亡和坏死同时存在。

如下图:

蓝色的为apo峰(第一个三角),而白色的为坏死峰。

第二个三角为G0/G1峰。

第三个为异倍体G0/G1峰。

实际上,很多时候我们诱导的凋亡峰不像上图那样明显,如下:

原因要从实验的原理开始,到细胞状态,实验步骤,试剂效能等,一一分析。

例如,某因素诱导的凋亡需要较长时间,而我们培养时间还没到,就有可能不出凋亡峰;或是在早期凋亡是用PI染色做SUB-G1,凋亡率会不高,而用API法则更好地测出其凋亡率。

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famsking

一步一步教你读流式图:

凋亡诱导

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流式图教程调亡诱导

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先发一张关于PI染色的uv诱导凋亡的图片,这是con:

 

这是诱导凋亡的流式图,我们称之为sampl:

那么怎么看这两张图呢?

首先,我们要知道各个参数的意义。

这在流式原理中有介绍。

然后,我们要知道各个图之间的联系。

大家看一下下面的图。

R1主要代表粘连细胞

R2主要代表G2/M期细胞

R3主要代表G0/G1期细胞

R4主要代表s期细胞

R5主要代表凋亡细胞

“主要”是因为大家可以看到设的gate后各个gate中的细胞有位置重叠。

FL2-W/FL2-A和FL2-A/COUNT之间的关系。

这两张图的最大区别在于G0/G1期前面的亚G1峰。

这个峰就是FL2-W/FL2-A图上的左下方的“小尾巴”,小尾巴越大,SUB-G1峰就越高。

也就是说凋亡的越多。

当然这需要跟整张图比较,就是选取mark后测量其gate%。

编辑:

famsking

一步一步教你读流式图:

表型CD4CD8

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表型CD4CD8流式图教程

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大鼠外周血T细胞CD亚群CD4/CD8比值所做的流式分析图

 

右上角的图片是CD4和CD8的双荧光检测。

右下象限是CD8单阳性,左上是CD4单阳,右上为二者双阳,左下为双阴。

比例如图。

剩下的二图为CD4、CD8直方图。

实际上用刚才的双标也可以看出比例来。

R1为淋巴细胞群体,是您的目的细胞群体,针对这一群细胞进行分析!

一步一步教你读流式图:

sub-G1凋亡图

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流式图sub-G1凋亡图教程

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凋亡都比较多,但遗憾的是与G1峰分得不是很开,因此,Modfit分析的时候,会根据结果用统计学原理将它们分为Apo和G1,但这样可能掩盖真正的结果!

建议做PI染色的时候,在PBS洗两次后,加入PCbuffer,这是一种轻破膜剂,可以使断裂成小片断的DNA出细胞而降低其在FL2-Ad上的值,这样就容易区分G1和APO了。

凋亡诱导,左边为对照,右边为凋亡组

 

 

对照很好,cv值不错,凋亡率控制得也不错!

凋亡非常明显,而且峰也很漂亮。

唯一的美中不足就是凋亡峰的位移稍低,如能用PCbuffer轻破膜,效果将更漂亮!

请查阅cnki中关于Sub-G1法测凋亡的关于PCbuffer的使用方法(作者:

龚建平关键字:

Sub-G1查),将对实验有很大帮助!

细胞周期分析,modifit,不知凋亡细胞为什么没和G1期分开?

右图为对照,左图实验组

作者用的是muticycle,所以不太能确定。

但是不管是哪家的软件,都是按一定的数学模型(公式)结合数据进行模拟,所以在数据分布不够典型的时候是会产生很大误差的。

就像你的结果,我根据经验判断是modfit强行进行subG1计算,其实算进去的基本上都不是凋亡细胞,但是它没有模糊概念,生硬地套用了subG1的模拟方程,所以才有“subG1”的出现。

如果你对sample只进行onecycle模拟,结果会不一样的。

建议,除非subG1和G1分隔干净利落,否则不要随便应用cycle软件进行模拟,否则大部分结果是错误的,cycle软件本质上说适合作周期分析,作AP分析有较为严格的限制。

直接拉水平门就可以了。

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