济南药谷基因检测公共服务平台建设.docx
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济南药谷基因检测公共服务平台建设
济南药谷基因检测公共服务平台建设
实验室设备招标技术参数
序号
仪器名称
技术参数要求
数量(台)
产地
1
基因测序仪
1设备用途:
未知物种全基因组测序,已知物种再测序,全基因表达组定量分析,全基因组小RNA分析,染色质免疫互沉淀(ChIP)研究,转录组分析,扩增子测序,外显子测序,定向重测序。
2技术规格
2.1高数据通量:
每次反应可生成>150亿(15G)碱基数据;
2.2每次运行至少可生成可读25M个片段标签序列;
2.3可以在8小时内完成样品制备、测序和数据分析,用于快速鉴定;
2.4数据读长:
单端读取序列,读长不低于300个碱基;
2.5双端读取序列:
读长不低于2x300个碱基;
2.6样品用量:
DNA样本需1ng;
2.7读取精度:
当测序长度为2x150bp时,80%以上的碱基数据质量高于Q30,当测序长度为2x250bp时,70%以上碱基数据质量高于Q30。
2.8可精确读取≥12个的连续单个重复碱基(如AAAAAAAAAAAAAAA)
2.9不同样品并行性:
提供稳定成熟的≥96个样品的混合接头
2.10可同时进行96个样品的1536重PCR产物的测序
2.11测序结果给出严格的Q30的数据
2.12采用SBS(边合成边测序)的测序原理,通过可逆终止子的方法,可以根据应用的需求控制测序片段的长度
2.13无需进行emusionPCR反应
2.14扩增、测序和数据分析服务器在同一台仪器上完成;
2.15提供简单优化的生物信息学支持软件:
如新物种拼接,小RNA分析,扩增子分析,
重测序,16S宏基因组分析,文库质量QC等。
2.16具有RFID(无线电射频识别)技术的耗材,可以追溯
2.17需提供生产厂家针对本项目授权。
1
进口
2
高压蒸气灭菌器
1.方式:
自动高压蒸汽灭菌
2使用温度范围:
45~135℃45~80℃(预热温度)/45~60℃(保温工程)/65~100℃(溶解工程)/105~135℃(灭菌工程)
3.最高使用压力:
0.255MPa
4.盖部结构:
手动上下开关式,有安全锁结构
5.排气阀:
全排气及缓慢排气各1个、辅助排气1个
6.冷却风扇:
轴流风机。
装备此冷却系统,使温度下降所需的时间仅需要约3分钟,大大提高了工作效率。
需要自然冷却的时候,可以关闭冷却系统。
7.温度控制、设定/显示方法:
通过电脑进行PID控制,用上下键进行数码设定/显示
8.定时:
0或1分~99小时59分,分辨率:
1分
9.多种操作模式可供选择:
器具灭菌工程、液体灭菌工程、灭菌保温工程、溶解保温工程、手动操作模式
10.其他功能:
按键锁功能、预约功能、记忆功能、预热功能、强制冷却功能、程序锁功能、警报发生记录功能(20件)、时间积算显示、时刻显示、操作音开/关设置
11.安全装置:
传感器异常、SSR短路、加热器断线、防止空烧(液胀式温控器),冷却水壶未设置警告、盖锁异常、记忆异常、压力安全阀(0.255MPa),储存有20种故障信息
12.腔体上标准配备两个传感器接口,有GLP/GMP对应配件供选择。
13.前面门内面设置了透明排水塑料桶,便于观察水位,装备大的排水管,便于进行维护。
14严格执行国家法令法规,具有中国压力容器制造许可证,中国医疗器械生产许可证,全面保障人身及财产的安全。
15.缸体有效内容积≥45L
16.感应式电源,200~240VAC。
随电压的波动进行调整。
1
进口
3
全自动病原微生物
检测系统
1.主要用途
准确、快速检测病原菌,该系统全自动在80分钟之内鉴定出各类样本中的目标微生物。
2.技术指标
2.1基本原理:
本系统以实时荧光定量PCR技术为基础用于病原菌检测和食品质量控制,结合了独特的引物和高特异性基因探针,内设阳性质控,目标病原菌独特的基因信号可以在70-80分钟之内被检测完成
2.2光学检测系统:
2.2.1光源:
五个LED,各LED激发波长不同,保证每个通道的荧光素由最佳的激发光激发
2.2.2探测器:
CCD,确保整板同时检测,数据间可比性强
2.2.3激发波长范围:
475nm–640nm
2.2.4发射波长范围:
520nm–740nm
2.2.5五个检测通道:
最多同时能做四色检测
2.2.6线性范围:
11个数量级
2.2.7灵敏度:
可检测到单拷贝
2.3PCR仪部分:
2.3.1半导体模块加热制冷
2.3.2样品容量:
24孔
2.3.3升温速率>5℃/秒,降温速率>4.5℃/秒
2.3.4温度精度:
±0.2℃
2.3.5温度均一性:
温度均一性:
≤±0.3℃
2.3.6温控范围:
4℃–99.9℃
2.3.7熔解曲线检测时,升降温速率可精确到0.01℃/sec可调
2.3.8热盖温度:
30℃–110℃可调
2.4检测量:
一台电脑可控制5台荧光定量PCR,一次最多可运行120个样品,在同一块PCR板上可同时对多个项目进行检测,实验室环境:
常规微生物实验室。
2.5检测项目(致病菌筛选项目):
沙门氏菌、治贺氏菌、金黄色葡萄球菌、副溶血菌、大肠杆菌O157:
H7、单增李斯特氏菌、李斯特属、以上项目检测过程全自动,无需离心机、核酸提取仪等仪器或相关等同操作步骤、无需专门的核酸提取试剂盒,所有的项目都是同一个检测流程,同时出结果
2.6全自动封闭操作系统,上机后一指键完成全部实验
2.7配套试剂:
除DNA模板外所有试剂呈药片状预装在开盖即用的PCR反应管中,每个PCR反应管带有质控,无需单独阳性和阴性对照
2.8全封闭药片化试剂(预装引物和试剂),无需冷冻保存。
2.9所有检测项目仅需一步增菌,无需二步增菌或重新生长,省时省力。
2.10软件自动比较目标扩增和内部扩增质控(IAC)用于结果的确认。
2.11需提供生产厂家针对本项目授权。
1
进口
4
PCR仪
1.记忆功能:
可储存100个方法(包括PCR前处理,PCR循环,PCR后处理)
2.显示屏:
A7*40字节可显示倒计时时间和已完成循环数,闪烁图形提示温度变化当前状态。
3.可编程序:
可任意修改预设的程序(包括前处理,后处理和25个循环);设定好的程序可以储存并可以加密保护防止无意改写
4.软件功能:
循环时间和温度自动延伸/自动下降,可停程序;有时间日期显示,自动断电保护,恢复供电后自动执行未完成循环,保证扩增过程安全运行计算Tm值,温度验证功能
5.用户自检:
用户可常规运行多种诊断程序以检测仪器升降温速度和升降温精度
6.温度范围:
4.0-99.9℃
7.温度显示:
仪器显示经计算机计算的实际样品温度,精确到0.1℃
8.实际样品的平均升/降温速度:
1℃/秒
9.样品基座升降温速度:
2.7℃/秒
10.静态样品基座温度均匀性:
±0.5℃,95℃计时后30秒
11.温度准确性:
±0.5℃,35-100℃范围
12.热盖:
维持105℃温度,满足无油操作PCR扩增
13.重现性:
达到设定温度的时间误差小于5秒
1
中国
5
荧光定量PCR仪
1.整机独立3个32孔模块控温并兼容96×0.2ml样品槽;
2.温度范围:
0℃-100℃;
3.温度显示:
显示经计算机计算的样品实际温度,精确到0.1℃;
4.最高升降温速率可达4°C/秒,并且升降温速率可以调节,样品实际平均温度变化速度≥3℃/秒;
5.温度精确度:
±0.25°C(35-99.9°C)
6.三重温度区域用于条件优化,可同时运行三个不同试验,区域间温度差异最大可以达到5°C,整板温差可以达到15°C,控温精确,重现性好;
7.重现性:
任意温度达到时间误差小于5秒;
8.8英寸彩色TFTLCD彩色触摸屏,编程快速简便直观
9.显示屏显示倒计时时间和已完成循环数,闪烁图形提示温度变化当前状态
10.存储能力:
主机可储存PCR程序800个,若使用U盘存储则无限制
11.自动断电保护,恢复供电后自动执行未完成循环
12.软件功能:
循环时间和温度自动延伸/自动下降;有时间日期显示;
13.用户自检程序:
用户可常规运行多种诊断程序以检测仪器升降温速度和升降温精度;
14.软件具有自动计算Tm值功能,温度验证功能
1
进口
6
组织细胞破碎仪
1.可以同时处理24个2ml提取管,12个5ml提取管。
2.提取管:
有2ml和5ml两种规格,提供空管及各种碾磨珠组合预装提取管。
3.样本量:
最低10mg,最大根据提取管配置。
4.碾磨珠:
有0.1mm~5ml直径范围,氧化锆材质。
5.破碎原理:
将样品放入已装有碾磨珠的提取管中,仪器产生高频震荡,使得碾磨珠进行高速运动,撞击撕裂细胞壁和细胞膜,释放细胞内物质,从而达到破碎目的。
6.仪器操作:
触摸液晶显示屏进行操作,方便直观。
7.运行速度:
仪器本身可以达到2000~6000rpm的转速,带动提取管达到1.0~12.0m/s的运动速度。
8.运行频率:
0~100Hz的频率,0~999秒的设定范围。
9.温度显示:
温度传感器实时显示电机及主腔体温度,随时掌握样品环境温度。
10.降温:
增加干冰盘设计,可在破碎过程中加入干冰,保证样品低温破碎。
11.加速:
能在2秒内达到最大速度。
12.减速:
能在2秒内完全停止运行。
13.碾磨方式:
可适用于湿磨、干磨、低温碾磨。
14.增加助力器设计,在使用过程中省时省力。
15.运行稳定性:
自主研发防震体系,仪器运行过程中避免大幅运动及位移。
16.运行噪音:
<65db,独有的隔音设计,使噪音大幅降低。
17.安全:
增加紧急停止按钮设计,异常情况随时停止运行。
18.仪器运行环境温度:
10℃~30℃
19.需提供生产厂家针对本项目授权。
2
中国
7
双人生物安全柜
(全排放)
1、安全柜基本参数:
(1)分类:
B2型,100%外排,
(2)外部尺寸≥(L×D×H)1500mm×760mm×2250mm;
(3)内部尺寸≥(L×D×H)1350mm×600mm×660mm。
(4)台面距离地面高度:
770mm(尺寸可根据要求订制修改)
(5)风速:
平均下降风速:
0.33±0.025m/s;平均吸入口风速0.53±0.025m/s
(6)系统排风总量:
1270m3/h
(7)额定功率:
1800W(包含操作区插座负载500W)
(8)噪音等级:
≤65dB(A)
(9)照明:
≥1000lx
(10)过滤效率:
送风和排风过滤器均采用世界知名品牌的硼硅酸盐玻璃纤维材质的
HEPA(ULPA)高效过滤器,对0.3μm(0.12)颗粒过滤效率≥99.999%(99.9995%)
2、生物安全性:
(1)人员安全性:
用碘化钾(KI)法测试,前窗操作口的保护因子应不小于1×105
(2)产品安全性:
菌落数≤5CFU/次
(3)交叉污染安全性:
菌落数≤2CFU/次
2
中国
8
单人生物安全柜
1、安全柜基本参数:
(1)分类:
A2型,30%外排,70%循环
(2)外部尺寸≥(L×D×H)1100mm×750mm×2250mm;
(3)内部尺寸≥(L×D×H)940mm×600mm×660mm。
(4)台面距离地面高度:
750mm(尺寸可根据要求订制修改)
(5)风速:
平均下降风速:
0.33±0.025m/s;平均吸入口风速0.53±0.025m/s
(6)系统排风总量:
360m3/h
(7)额定功率:
1100W(包含操作区插座负载500W)
(8)噪音等级:
≤65dB(A)
(9)照明:
≥1000lx
(10)过滤效率:
送风和排风过滤器均采用世界知名品牌的硼硅酸盐玻璃纤维材质的HEPA(ULPA)高效过滤器,对0.3μm(0.12)颗粒过滤效率≥99.999%(99.9995%)
2、生物安全性:
(1)人员安全性:
用碘化钾(KI)法测试,前窗操作口的保护因子应不小于1×105
(2)产品安全性:
菌落数≤5CFU/次
(3)交叉污染安全性:
菌落数≤2CFU/次
2
中国
9
超纯水系统
1.电阻率18.2 MΩ·cm
2.产水流速3l/h、5l/h、8l/h
3.瞬时流速>0.5l/min(带终端精制器)
4.TOC(无185/254 nm紫外灯)<10ppb
5.TOC(有185/254 nm紫外灯)<5ppb
6.微粒(粒径)>0.22μm)**<1particulate/ml
7.细菌<0.1cfu/ml
8.内毒素(热源)<0.001 EU/ml
9.RNases<0.01 ng/ml
10.DNases<4pg/μl
11.纯水(III级)产水水质
12.离子截留率>96%
13.MW有机物截留率>200>99%
14.细菌和微粒>99%
15.需提供生产厂家针对本项目授权。
1
进口
序号
仪器名称
技术参数要求
数量(台)
产地
1
病毒载量测定装置
1.原理和功能
1.1原理:
通过将反应体系进行微滴化处理,使含有目标核酸分子的反应体系分成若干个液化微滴,形成的每个微滴都作为一个独立的PCR反应体系,经PCR扩增后,利用微滴检测仪逐个对每个微滴进行扫描检测,利用分析软件计算出目标靶分子的绝对起始拷贝数及绝对浓度,从而实现对核酸的绝对定量。
1.2用途:
适用于依靠Ct值(通过荧光定量实时PCR技术得到)不能很好达到分辨效果的应用领域:
微量微生物检测、真假食品检定、转基因检测、拷贝数变异、稀有核酸序列检测、基因相对表达研究(如等位基因不平衡表达)、二代测序结果验证、miRNA表达分析、单细胞基因表达分析等。
2.性能与技术要求
2.1主要性能
2.1.1样本类型:
能对DNA与RNA分子进行直接的绝对定量。
2.1.2适用方法:
适用于Taqman探针法和染料法两种检测方法,无须Rox校正。
2.1.3样本处理要求:
样品无需前处理,对于分析样品的DNA片段大小没有限制。
2.1.4微滴生成方式:
无需外接氮气等其他装置,能将每个样品的反应体系分为不少于20,000个油包水微滴,以避免芯片法对液滴分割的不均匀。
可同时处理8个样品,完成时间不超过3分钟,即在45分钟内完成96个样品的制备。
2.1.5反应体系稳定性:
保证微滴在50个PCR循环后仍然保持稳定而不会彼此融合。
2.1.6微滴检测方式:
可进行FAM/HEX(VIC)双荧光通路同时检测。
无需人工干预情况下,可同时一次性自动检测96个样品(每个样品20000次独立反应),以便于做复孔检测和阴/阳性对照;可任意设置对照样品,确保实验结果的准确性,并保证检测的灵敏性。
2.2主要技术要求
2.2.1每个微滴的体积约为0.9nL,直径约为120um
2.2.2反应体系:
20µl
2.2.3检测器:
采用硅光子计数器
2.2.4单孔数字pcr检测动态范围:
5个数量级,1~100,000
2.2.5精确度:
10%(单孔反应可分辨出10个原始模板和11个原始模板的区别)
2.2.6检测微滴总数:
150万/96孔板;支持微滴内PCR产物回收功能。
2.2.7软件功能:
数据不采用远端服务器分析处理,操作人员可单机直接操作,可编辑报告模式、格式,显示每个微滴FAM通道(或EvaGreen)和HEX(VIC)通道的荧光信号、计算给出每个样品中含有靶分子的起始拷贝数或浓度(copies/ul)、拷贝数变异分析功能、结果可直接打印输出或导入Excel表格。
2.2.8拥有原厂数字PCR平台的突变检测试剂、NGS测序文库质控试剂盒、拷贝数变异分析、KRAS多重筛选试剂盒、宿主细胞残留DNA检测预混液等。
2.2.9需提供生产厂家针对本项目授权。
1
进口
2
凝胶成像系统
1.功能:
1.1核酸凝胶成像
1.2蛋白凝胶成像
1.3蛋白免染成
2.性能指标:
2.1图像分辨率:
≥120万
2.2CCD动态范围:
>3OD
2.3曝光时间:
最短0.001s,每0.001s步进
2.4样品盘种类:
紫外、白光、免染
2.5一键成像功能:
放入样品后,不需要手动调整对焦、光圈、曝光时间等参数,只需要点击主机按钮即可得到成像结果。
2.6软件可控制曝光时间以看到微弱信号
2.7显示过饱和像素保证精确定量
2.8具有免染技术:
不需要对蛋白凝胶进行染色、脱色,可直接在5分钟内对凝胶进行成像,成像效果与考染相当。
2.9分隔EB污染区:
EB所对应的紫外托盘与主机与其他托盘分开,避免对主机及其他样品托盘的污染。
3.软件功能:
3.1中/英文软件,无安装次数限制,免费升级;同时具备采集图像,及数据处理功能。
3.2全自动专业成像及分析软件对系统进行自动控制,包括采集、优化、定量、分析图像及报告输出。
3.3软件可自动检测泳道和条带,并自动进行分子量和浓度的分析,分析结果可输出为Excel或数据库格式。
3.4自动条带检测,自动分子量测算,自动条带浓度测算。
3.5添加各种格式的文字注释。
3.63D图像观察及输出。
3.7可选DPI输出,300、600及自定义DPI,满足期刊对图片质量要求。
3.8图像输出格式:
.tif、.bmp、.png、.jpg。
3.9报告输出:
包括图像仪名称、仪器序列号、使用者姓名、成像时间、光源名称、滤光片名称、泳道图示、条带标注等。
3.10需提供生产厂家针对本项目授权。
1
进口
3
超低温冰箱
1、技术指标
1.温度:
微电脑控制,温度调节单位1℃,箱内温度-40℃~-86℃可调,可设定开停温差;
2.显示:
采用微电脑微处理控制系统,键盘式数据输入。
3.有效容积≥330L
4.材料:
箱壳采用冷轧钢板;内胆采用全防腐特殊耐低温材料,保温层采用高隔热VIP航空隔热真空保温材料;
5.样式/外观:
立式冰箱。
保温箱层数:
3层4个间室。
5.压缩机:
国际知名斯科普压缩机,双压缩机复叠制冷,功率1HP*2;噪音≤52.0dB。
6.风机:
采用德国高端EBM冷凝风机,智能开停,节能环保。
7.安全系统多种故障报警(高低温报警、传感器报警、高低电压报警、冷凝器散热差报警、环温超标报警、断电报警、电池电量低报警、)。
两种报警方式(声音蜂鸣报警、灯光闪烁报警。
多重保护功能(开机延时保护、超低电压补偿保护、超高电压补偿保护、密码保护功能)。
8.门/锁:
外门1个,内发泡门2个;双重锁定,且带挂锁锁孔和一体式门锁手把设计。
9.密封:
2个发泡内门,都具有密封条,单独密封,可分别存取;有效降低箱内温度波动,创新设计的四层密封结构,最大程度保护样本安全。
门体独特的四道密封结构加隔热系统专利设计,有效消除结霜现象。
10.电压调节宽带电压(185V~260V)设计,同时拥有自动调压功能
11.功率:
900W.
4
中国
4
高速冷冻离心机
1.无刷直流电机,免维护
2.电机:
高效电机
3.最大转速≥17,000rpm
4.最大离心力≥23,005×g
5.最大容量24×1.5/2.0ml或0.2ml×4PCRstrips(32hole)
6.温度范围﹣10℃~﹢40℃
7.加速时间15sec
8.减速时间15sec
9.开机预冷,快速制冷
10.时间控制99min59sec/短时离心/连续
11.液晶显示,定速计时
12.加速曲线5个,减速曲线5个
13.无阻尼刹车
14.转速离心力转换
15.转子自动识别
16.程序存储10个
17.电磁自动锁+机械锁(紧急开盖)
18.具备快速制冷功能:
室温情况下下降到4℃仅需3min;
19.具备瞬时离心功能:
可实现瞬时离心功能;
20.自动报警系统:
在不平衡、盖子未关好、电机过热情况下能自动报警,
并有紧急开盖功能;
1
进口
5
台式高速离心机
1.最大转速4000rpm
2.最大容量4×85ml
3.加速时间20sec
4.减速时间20sec
5.工作时间0~99min,连续工作,瞬时离心模式
1
中国
6
高效毛细管电泳仪
1、主要用途:
1.1 单重常规PCR检测;低分辨率多重PCR分析;质粒DNA检查
1.2STR/微卫星 (SSR)分析;AFLP/RFLP/RAPD分析;高分辨率多重 PCR分析
1.3 高分辨率基因分型
1.4 基因组DNA和大片段DNA分析
1.5 病毒核酸纯化总 RNA、cRNA、片段化 RNA、micro-RNA质控分析
1.6HLASSP分型
1.7 二代测序建库过程中的产物片段大小和浓度质控
2、技术指标
2.1毛细管电泳分析技术;
2.2高灵敏度PMT检测方式进行检测
2.3使用将凝胶,毛细管通道和检测通道已整合组装好的预制胶卡夹
2.4无需人工制备凝胶染料混合物。
2.5运行一次可平行分析处理12个样本
2.6可自动连续运行分析多至96个样品而无须包括更换卡夹等任何人工干预.
2.7采用全自动化的灌胶方式
2.8每轮分析后,仪器自动清洗毛细管,无须人工清洗
2.9采用毛细管从PCR产物孔板/孔管中直接全自动化上样的上样方式
2.10兼容0.2mlPCR管上样、12联管上样、8连管上样、96孔PCR板上样
2.11直接兼容3.14 运行时间:
最快3分钟可分析12个核酸样本;
2.12 检测灵敏度:
DNA分析,0.15ng/μl
2.13 检测灵敏度:
RNA分析,6ng/μl
2.14分辨率:
对<500bp的DNA片段,分辨率可达到3bp
2.15 样本消耗量小于0.2μl,上样后原样品不受影响,可直接用于下游应用
2.16 安全性:
凝胶内核酸染色剂含量极低,且封闭灌装,运行前、后均对操作人员和实验环境不产生污染,可以直接废弃处理;
2.17 软件自动识别并显示预制胶种类及效期等信息
2.18样品运行结束后,软件将自动处理、分析采集到的数据
2.19结果可以用电泳峰型图或胶图格式对分析结果进行显示
2.20RNA质控分析时提供RNA完整性得分RIS值
2.21自动对被分析样品中所需片段的大小、浓度和相对丰度出具报告
2.22软件可自动判定样品中是否有特定的条带并出具报告
2.23实验结果可以各种形式导出,可导出多种图像格式文件、excel表格等
2.24 软件具备专门用于基因组DNA质控的运行方式。
2.25 软件具备专门用于多重PCR产物分析的分析谱,可自动判定特定条带组合是否存在。
2.26 软件具备专门用于NGS文库质控分析的分析谱。
2.27需提供生产厂家针对本项目授权
2.28配主流品牌电脑1台、打印机1台
1
进口
7
核酸提取纯化系统
1.基于离心柱法的全自动样品制备工作站。
可实现样品裂解、裂解液转移、离心柱清洗、洗脱液回收等实验步骤的全自动操作,无需人工介入;
2.应用多样,可用于病毒核酸纯化(DNA&RNA)、microRNA纯化、DNA/RNA回收和蛋白质纯化;
3.可纯化粪便、FFPE组织及微量组织,进行PCR产物纯化、胶回收