BrainNet Viewer使用Word文件下载.docx

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6的矩阵，包含了节点的坐标、颜色、大小和标签信息

3）边文件（edgefiles）：

ASCII文件，后缀名为“edge”，为n

n的矩阵，即节点间的相关矩阵

4）三维图像文件（volumefiles）：

NIFTI或Analyze格式，后缀名为配对的“hdr”和“img”该文件仅用于体素到曲面的映射绘制.

主要功能：

（1）脑网络的多视角显示

（2）显示多种由脑曲面，节点和边构成的不同组合

（3）多种方式调节节点的颜色和大小

（4）多种方式调整边的颜色和大小

（5）自定阀值来提取相关矩阵中的边信息

（6）实现体素图像到曲面的映射

（7）支持输出常用的包括TIFF、BMP、JPEG、PNS和EPS五种格式图片

（8）支持输出图片尺寸和分辨率的调整

（9）可进行放大和缩小，旋转等交互式操作

功能和使用：

（1）Installation

打开matlab，把BrainNetViewer添加当前路径（注意全是英文路径，否则出现读取错误），在matlab工作区内输入BrainNet即打开如下图片：

Fig1.BrainNetViewer界面

（2）picture：

产生的组合图片。

（提供参考）

Fig.2各种组合

（3）LoadFiles

点击File-LoadFile出现以下图片：

Fig.3加载界面

1.点击Browse（Surfacefile）选择.\Data\SurfTemplate\BrainMesh_ICBM152.nv

（BrainNetViewer提供2中不同类型的大脑模板CH2\ICBM152,根据自己所需，选择不同模板）

2.点击Browse（node）选择.\Data\ExampleFiles\AAL90\Node_AAL90.node（可以选择不同节点模板，一共提供ALL90、Brodmann82、Custom、Dos160、Fair34、HOA112、LPBA40，在这其中进行选择）

3.点击Browse（edge）选择.\Data\ExampleFile\AAL90\Edge_AAL90_Binary.edge

4.点击Browse（volume）选择双样本t检验结果。

点击OK：

（4）Visualizeoption

1Layoutpanel（如下图）

Fig4.BrainNet选择

Fig5.不同选择产生不同结果

2.Globalpanel

Fig6全脑控制面板和各种全脑样本

3.Surfacepanel

Fig7表面面板和双脑模型

4.Nodepanel

Fig8节点控制面板

5.Edgepanel

Fig.9边控制面板和边、节点表面的组合

6.Volumepanel

Fig.10三维控制面板和三维脑表面现象表示

7.Imagepanel

Fig.11图像控制面板

操作实例：

（1）BrainSurface

Fig.12大脑表面

直接在Browse（Surface）中输入.\Date\SurTemplate\BrainMesh_ICBM152.nv,其他默认设置，点OK。

（2）Nodes

在Browse（node）中输入.\Date\ExampleFiles\AAL90\Node_ALL90.node

在Node选项中Label选AboveThreshold设置大小为1.94,；

在color中选取Colormap，点OK。

图像如下：

Fig.13节点

（3）Surface&

Nodes

1.Browse（Surface）加入.\Date\SurTemplate\BrainMesh_ICBM152.nv。

2..Browse（Node）中加入.Data\ExampleFiles\AAL90\Node_AAL90.node。

3.在Node选项中Color选取中选取Modular选项，其他不变点OK，图像产生如下：

Fig14.节点和表面

（4）Nodes&

Edges

1.Browse（Node）中加入.Data\ExampleFiles\AAL90\Node_AAL90.node。

2.Browse（edge）中加入.Data\ExampleFiles\AAL90\Edge_AAL90_Binary.edge。

在Node选项中选取Color的Modular；

在Edge中选取Nodemodule。

Fig15.节点和边

（5）Surfacemapping

1点击Browse（Surface）加入.\Date\SurTemplate\BrainMesh_ICBM152.nv,

2.1选择Browse（Voluse）加入mark_user_Resliced\Resliced_FG.nill（此为双样本t检验产生的结果（55-56区））

Fig.16感兴趣区

3.在Global中的ObjectMaterial选择Shiny；

在Surface中选取0.70，其他不变。

2.2选择Browse（Voluse）加入t-two\spm_0001.img（此为注意和非注意实验下产生双样本检验的结果：

Fig.17注意区

2.3选择Browse（Voluse）加入mark_user_Resliced\Resliced_FG.nill（此为双样本t检验产生的结果（55-56区））在layout中选取Axial；

在Surface中选取0.70在Volume中选取ROIdrawing，

Fig.18感兴趣区