动物育种数据管理与软件应用.docx
《动物育种数据管理与软件应用.docx》由会员分享，可在线阅读，更多相关《动物育种数据管理与软件应用.docx（41页珍藏版）》请在冰豆网上搜索。
动物育种数据管理与软件应用
第二十章动物育种数据管理与软件应用
动物育种数据从狭义上讲，是指性能测定数据。
广义上则包括种畜的基本档案、性能测定数据、有关系统环境因素、遗传评估结果等。
对育种数据的有效管理既是育种方案实施的基础，也是育种工作成败的关键因素之一。
本章主要介绍动物育种数据的收集和管理方法，并结合动物育种中重要的数据分析方法介绍有关软件的主要应用。
第一节育种数据的收集与整理
动物育种工作能否成功，在很大程度上取决于育种数据的正确性。
个体的编号丢失或有误意味着育种资料的丢失，测量数据有误会导致育种工作前功尽弃。
因此，准确可靠的数据是育种工作取得成效的基本保证。
一、动物的测量
动物育种中的所有数据都来源于测量，花费于测量上的时间往往较其他育种工作花费的时间还要多。
有些测量如定期称重是件很繁琐的工作，而且有时很危险。
所以，动物的测量是一项既繁琐而又非常重要的工作。
（一）测量前的准备
测量前准备工作的充分与否与测量的准确性及测量速度有很大关系，为此，必须做好测量前的准备工作。
1．了解所要测量畜种的品种、年龄、性别等。
2．掌握测量的项目及其各项目的测量方法，将各项目列于记录纸或笔记本上。
3．掌握各种量具的使用方法。
使用前，要对所用量具进行检查，检验量具的准确性，必要时须对量具进行校正。
在某些量具如磅秤、天平等运输或搬动时要特别小心，尽量避免大的振动。
4．进入牧场和畜舍前要注意消毒，进入后要保持安静。
（二）测量中应注意的事项
在牧场和畜舍进行测量往往是一项嘈杂的操作，为使人畜安全且收集到准确数据，避免或减小噪音很关键。
噪音往往导致读错标签、听错号码，甚至使操作受阻，使操作人员精疲力竭。
在整个操作过程中应注意以下事项：
1．减小噪音，保持安静首先应保证记录人员保持平静，注意力集中，避免因环境过热、过冷或过干燥以及灰尘大等引起的注意力分散。
要尽量排除其他噪音来源，如拴系所有不必要的狗；避免使用噪音很大的仪器设备；润滑测量点周围的所有门轴，以消除因关门或开门引起的挤压声或碰撞声，在任何金属与金属容易碰撞的表面粘上橡胶（如自行车内胎）以减小碰撞声。
此外，操作过程中，要尽量避免谈话，更不应聊天。
如必须谈话，可远离测量点，否则会使测量人员和记录人员注意力分散。
2．保持人畜安全家畜走向测量点时，避免饲养员用棍棒或刺棒捅，也不能用棍棒加以驱逐、追赶或鞭打。
接触家畜时，应从其左前方缓慢接近，并注意其有无恶癖，特别是诸如牛、马之类的大家畜，以确保人畜安全。
3．注意测量方法测量过程中，应随时注意器械的校正和正确使用。
某些量具（如磅秤）及家畜应置于平坦地面，不能在斜坡或高低不平的地面测量。
家畜站立的姿势应保持正确。
测量时将量具（如卷尺、卡尺、圆形测定器等）轻轻对准测量点，并注意量具松紧程度，使其紧贴体表，不能悬空量取。
4．注意数据的读取和记录读取号码人员和操作人员与记录人员的位置很重要。
他们应尽量接近，以便能够清楚地听见所测数据。
读取号码和数据的人员应提高声音，口述清楚，应避免口中叼着烟斗或烟卷读取数据。
读数人员的声音最好高于周围的正常低噪音（如采食、饮水、家畜戏耍等引起的噪音）。
报数时，为清楚起见，应一位一位的报。
例如数字125，读作1—2—5，而不要读作一百二十五；记录人员听到报数后，应重复回报一下，如1—2—5。
一旦两个数字不符，再由读数人员报数而后再记录。
读号人员和读数人员最好视力良好，如视力不好，操作时应保证戴上眼镜。
此外，为保证数据的准确性，在整个操作过程中，或者在整个育种过程中，尽量保证操作人员和读数人员不变，中途不得随意变换。
必须变换时，第一个操作或读数人员应将其操作或读数方法告知第二个以保证测量方法的准确和一致。
二、档案记录
无论是育种，还是经营管理，都需要建立档案制度，为育种和生产工作提供不可缺少的科学依据。
（一）常用的记录
为了做好周密完整的记录。
应按需要设计和准备有关育种记录表格，以便及时记录各种数据和有关情况，便于查考、总结和分析，使育种工作正常有效地进行。
1．配种记录为确定血统和亲缘关系所必须，主要记录与配的公、母畜编号、品种、年龄（或胎次）、配种日期以及交配方式，并推算出预产期。
2．分娩记录除登录父母亲的编号、品种、年龄、胎次、分娩日期、怀孕期等外，主要记录全部后代的个体号、性别、断奶日期、哺乳期中生长发育和死亡情况以及毛色等外形特征。
如出现寄养情况，则应注明从哪头母畜转移给哪头母畜代哺。
3．生长发育记录留作种用的后备家畜或育种群的家畜应定期称量体重和测量体尺。
测定的项目和间隔日期应根据育种计划的要求而定。
为方便起见，可统一日期进行测定，并用相应的校正方法校正至规定日龄的体尺、体重。
4．生产记录各种畜禽的产品不同，生产性能的表现方式相差也很大。
例如，奶牛和蛋鸡原则上每天都应做记录；而猪和其他肉用种畜本身不直接生产肉品，其生产记录就常用同胞或后裔的肥育性能或本身的生长发育记录来取代。
在生产记录中，不仅要记录产品的数量，而且有时还要记录其质量，如乳脂率、蛋重等。
5．饲料消耗记录饲料用量对畜禽的生长发育和生产性能都有显著影响，直接关系到育种和生产成本，逐日准确记录实际消耗对育种工作是非常有帮助的。
主要记录内容是日粮组成及各阶段各类饲料的消耗总量。
通常不是以个体，而是以小群（或组）为单位来记录。
6．种畜系谱卡这是每头种畜的总结材料，除记载个体号、出生日期、出生地点、性别、品种等外，一般还包括三代简易系谱、本身各时期的生长发育记录、体质外形特征、有无遗传缺陷等。
对于种公畜，还应记载历年的配种成绩；对于种母畜，还应记载各胎次的繁殖哺育成绩。
7．疾病防治记录一般应包括各主要传染病的免疫程序及其执行情况，抗体监测及其死畜的剖检记录，重大疫情及其处理记录。
（二）育种记录注意事项
为了既准确又迅速地获取育种所需的各种数据，减少操作费用，应注意以下几方面：
1．准备好记录表格和相关用具记录表格中始终应将个体号置于第一项，这可减少因误记个体号而产生误差的机会。
记录表格最好是印刷品，纸质应既轻便又坚实，如可能的话，可用防水纸。
记录用笔最好是中等硬度的铅笔，而不要用钢笔或圆珠笔，因为铅笔往往在潮湿或者油污的纸上都能写。
还要携带备用铅笔、铅笔刀。
记录表格中应包括影响性状表现的各种可以辨别的系统环境因素（如年度、季节、场所、操作人员等），以便于数据的遗传和统计分析。
2．注意记录方法和速度为做到迅速记录，减少时间浪费和重复工作，可将记录表格放在硬质板上用纸夹夹住以防风吹。
可能的话，应避免翻页，可将记录表一并摆放在较大的硬质板上。
如记录表很多，必须翻页时，可在各页边缘贴上一块小纸，其上写上该页记录上所有个体的起止编号，以便迅速翻页找到所需号码。
3．减少不必要的记录誊写作育种记录时，应尽量避免由一张记录表誊写至另一张记录表，因为每次誊写一系列数据，往往会造成误差。
一个例子便是在现场作了记录之后，转抄一份室内记录，然后再转抄一份作为永久记录卡或者作为向计算机输入的材料。
如果数据必须转抄，为防止原始数据丢失，应在现场收集之后马上转抄。
转抄时应注意字体和数据清晰，避免潦草。
4．注意记录的保护对于育种资料，应建立一套完整的保存方法。
现场记录时，可将各种记录表放进一个干净的塑料袋中以防下雨或受潮。
记录时应保持两手干燥和干净，防止弄湿或弄脏记录表。
同时，应防止家畜意外地将记录表叼走，扔进粪坑或者吃掉。
对于所有育种记录应专人负责进行保护。
三、育种数据的管理体系
传统的动物育种管理方法由于其数据信息处理效率不高，导致育种操作难度大，效率低下，逐渐成为制约种畜生产的瓶颈。
利用现代信息处理工具，如计算机辅助育种技术和网络技术则可适应现代育种发展要求，极大地提高育种效率，对育种和生产工作提供有效帮助。
（一）育种数据库管理系统
动物育种数据库的结构、内容和功能因畜种、育种工作的需要不同而不同。
总体上来说，育种数据库的设计要考虑数据结构的合理性、完整性和安全性，便于程序设计及系统的维护和升级，便于进行统计和遗传分析。
从复杂程度来说，用于场内测定和遗传评估时，可相对简单一些。
但对于联合遗传评估，则要求统一方法进行性能测定和数据记录、统一格式建立育种数据库。
表20-1～表20-4列出了全国种猪遗传评估所要求的统一数据库格式，其中的个体编号实行全国统一的种猪编号系统，该编号系统由15位字母和数字构成。
其编号原则为：
前2位用英文字母表示品种：
DD表示杜洛克，LL表示长白，YY表示大白，HH表示汉普夏，二元杂交母猪用父系＋母系的第一个字母表示，例如长大杂种母猪用LY表示；
第3位至第6位用英文字母表示场号（由农业部统一认定）；
第7位用数字或英文字母表示分场号（先用1至9，然后用A至Z，无分场的种猪场用1）；
第8位至第9位用数字表示个体出生时的年度；
第10位至第13位用数字表示场内窝序号；
第14位至第15位用数字表示窝内个体号；
建议个体编号用耳标＋刺标或耳缺作双重标记，耳标编号为个体号第3位至第6位字母，即场号，加个体号的最后6位。
例如，DDXXXX209000101表示XXXX场第2分场1999年第一窝出生的第一头杜洛克纯种猪。
表20-1个体记录
字段
个体号
品种
性别*
出生日期
父亲号
母亲号
备注
名称
ID
BREED
SEX
BDATE
SIRE
DAM
NOTE
类型
字符
字符
字符
日期
字符
字符
备注
长度
15
2
1
8
15
15
—
小数位
—
—
—
—
—
—
—
*公猪用M、母猪用F表示。
表20-2生长性能测定记录
字段
个体号
达50kg
达100kg
30～100kg饲料转化率
备注
称重日期
体重
测定日期
体重
膘厚
眼肌厚度/面积
仪器＊
名称
ID
DATE50
WT50
DATE100
WT100
FAT
LMA
EQ
FCR
NOTE
类型
字符
日期
数字
日期
数字
数字
数字
字符
数字
备注
长度
15
8
5
8
6
5
5
1
4
—
小数位
—
—
2
—
2
2
2
—
2
—
*A表示A超系列、B表示B超系列。
表20-3屠宰测定记录
字段
个体号
屠宰日期
宰前重
胴体组成性状
肉质性状
备注
胴体重
后腿比例
膘厚＊
眼肌面积
pH值
肉色
滴水损失
大理石纹
名称
ID
SDATE
SWT
CWT
HAM
CFAT
CLMA
PH
COLOR
DRIP
MARBL
NOTE
类型
字符
日期
数字
数字
数字
数字
数字
数字
数字
数字
数字
备注
长度
15
8
5
5
5
5
5
4
3
5
3
—
小数位
—
—
2
2
2
2
2
2
1
2
1
—
*膘厚为三点平均膘厚，按国标执行。
表20-4母猪繁殖性能记录
字段
个体号
配种日期*
公猪号*
配种方式**
胎次
产仔记录
寄养情况
21日龄
备注
日期
总仔数
活仔数
死胎
畸形
木乃伊
寄出
寄入
头数
窝重
名称
ID
MDATE
BOAR
TYPE
PARITY
FDATE
TNB
NBA
SBN
ABN
MUM
OUT
IN
LN21
LWT21
NOTE
类型
字符
日期
字符
字符
数字
日
升级会员 