现代分子生物学思考题答案Word下载.docx
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1957年、Fraenkel-Conrat等人、将两个不同的TMV株系(S株系和HR株系)的蛋白质和RNA分别提取出来、然后相互对换、将S株系的蛋白质和HR株系的RNA、或反过来将HR株系的蛋白质和S株系的RNA放在一起、重建形成两种杂种病毒、去感染烟草叶片。
5、定义DNA重组技术
DNA重组技术:
目的是将不同的DNA片段(如某个基因或基因的一部分)按照人们的设计定向连接起来、然后在特定的受体细胞中与载体同时复制并得到表达、产生影响受体细胞的新的遗传性状。
6、写出分子生物学的主要研究内容。
1、DNA重组技术;
2、基因表达调控研究;
3、生物大分子的结构功能研究----结构分子生物学;
4、基因组、功能基因组与生物信息学研究。
7、分子生物学的定义
答:
广义的分子生物学:
蛋白质及核酸等生物大分子结构和功能的研究都属于分子生物学的范畴,即从分子水平阐明生命现象和生物学规律狭义的分子生物学:
偏重于核酸(基因)的分子生物学,主要研究基因或DNA的复制、转录、表达和调控等过程,当然也涉及与这些过程相关的蛋白质和酶的结构与功能的研究
第二章
1、染色体具备哪些作为遗传物质的特性?
1、分子结构相对稳定;
2、能够自我复制、使得亲子代之间保持连续性;
3、能够指导
蛋白质的合成、从而控制整个生命活动的过程;
4、能够产生可遗传的变异。
2、核小体结构特点。
①每个核小体单位包括200bp左右的DNA链、一个组蛋白八聚体及一分子H1。
②组蛋白八聚体构成核小体的盘状核心结构,由H2A、H2B、H3、H4各两分子形成。
③146bp的DNA分子超螺旋盘绕组蛋白八聚体1.75圈,组蛋白H1在核心颗粒外结合额外20bpDNA,锁住核小体DNA的进出端,起稳定核小体的作用。
④相邻核心颗粒之间为一段连接DNA,连接DNA上有组蛋白H1和非组蛋白。
5、简述DNA的一、二、三级结构特征。
1、DNA的一级结构、就是指4种核苷酸的连接及排列顺序,表示了该DNA分子的化学成分;
2、DNA的二级结构是指两条多核苷酸连反向平行盘绕所形成的双螺旋结构;
3、DNA的高级结构是指DNA双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的特定空间结构。
6、原核生物DNA与真核生物有哪些不同的特征?
(1)DNA双螺旋是由两条互相平行的脱氧核苷酸长链盘绕而成的,多核苷酸的方向由核苷酸间的磷酸二酯键的走向决定、一条是5---3、另一条是3-----5。
(2)DNA双螺旋中脱氧核糖和磷酸交替连接、排在外侧、构成基本骨架、碱基排列在内侧(3)其两条链上的碱基通过氢键相结合、形成碱基对
意义:
该模型揭示了DNA作为遗传物质的稳定性特征、最有价值的是确认了碱基配对原则、这是DNA复制、转录和反转录的分子基础、亦是遗传信息传递和表达的分子基础。
该模型的提出是20世纪生命科学的重大突破之一、它奠定了生物化学和分子生物学乃至整个生命科学飞速发展的基石
8、DNA复制通常采取哪些方式。
一、线性DNA双链的复制:
1、将线性复制子转变为环装或者多聚分子;
2、在DNA末端形成发卡式结构、使分子没有游离末端;
3、在某种蛋白质的介入下(如末端蛋白、terminal
protein)、在真正的末端上启动复制。
二、环状DNA的复制:
1、θ型;
2、滚环形;
3、D—环形(D--loop)。
9、简述原核生物的DNA复制特点。
1、与真核生物不同、原核生物的DNA复制只有一个复制起点;
2、真核生物的染色体全部完成复制之前、各个起始点上DNA的复制不能在开始、而在快速生长的原核生物中、复制起始点上可以连续开始新的DNA的复制、变现为虽然只有一个复制单元、但可有多个复制叉;
13、细胞通过哪些修复系统对DNA损伤进行修复?
1、错配修复、恢复错配;
2、切除修复、切除突变的碱基和核苷酸序列;
3、重组修复、复制后的修复、重新启动停滞的复制叉;
4、DNA的直接修复、修复嘧啶二聚体和甲基化的DNA;
5、SOS系统、DNA的修复、导致突变。
14、什么是转座子?
可以分为哪些种类?
转座子是存在于染色体DNA上可自主复制和移位的基本单位。
转座子可分为两大类:
插入序列和复合型转座子。
第三章
1、什么是编码链?
什么是模版链?
与mRNA序列相同的那条DNA链称为编码链(或有意义链);
另一条根据碱基互补原则指导mRNA合成DNA链称为模版链(或反义链)。
4、简述RNA转录的概念及其基本过程。
RNA转录:
以DNA中的一条单链为模板、游离碱基为原料、在DNA依赖的RNA聚合酶催化下合成RNA链的过程。
基本过程:
模版识别—转录开始—转录延伸—转录终止。
6、大肠杆菌的RNA聚合酶有哪些组成成分?
各个亚基的作用如何?
大肠杆菌的RNA聚合酶由2个α亚基、一个β亚基、一个β’亚基和一个ω亚基组成的核心酶、加上一个σ亚基后则成为聚合酶全酶。
α亚基肯能与核心酶的组装及启动子的识别有关、并参与RNA聚合酶和部分调节因子的相互作用;
β亚基和β’亚基组成了聚合酶的催化中心、β亚基能与模版
DNA、新生RNA链及核苷酸底物相结合。
7、什么是封闭复合物、开放复合物以及三元复合物?
模版的识别阶段、聚合酶与启动子可逆性结合形成封闭性复合物;
封闭性复合物形成后、此时、DNA链仍然处于双链状态、伴随着DNA构象的重大变化、封闭性复合物转化为开放复合物;
开放复合物与最初的两个NTP相结合并在这两个核苷酸之间形成磷酸二脂键后即转变成包括RNA聚合酶、DNA和新生RNA的三元复合物。
8、简述σ因子的作用。
1)σ因子的作用是负责模版链的选择和转录的起始、它是酶的别构效应物、使酶专一性识别模版上的启动子;
2)σ因子可以极大的提高RNA聚合酶对启动子区DNA序列的亲和力;
3)σ因子还能使RNA聚合酶与模版DNA上非特异性位点结合常数降低。
9、什么是
Pribnow
box?
它的保守序列是什么?
pribnow
box是原核生物中中央大约位于转录起始位点上游10bp处的TATA区,所以又称作-10区。
它的保守序列是TATAAT。
10、什么是上升突变?
什么是下降突变?
上升突变:
细菌中常见的启动自突变之一、突变导致Pribnow区共同序列的同一性增加;
下降突变:
细菌中常见的启动子突变之一、突变导致结构基因的转录水平大大降低、如Pribnow区从TATAAT变成AATAAT。
11、简述原核生物和真核生物mRNA的区别。
1)原核生物mRNA常以多顺反子的形式存在。
真核生物mRNA一般以单顺反子的形式存在;
2)原核生物mRNA的转录与翻译一般是偶联的、真核生物转录的mRNA前体则需经转录后加工、加工为成熟的mRNA与蛋白质结合生成
信息体后才开始工作;
3)原核生物mRNA半寿期很短、一般为几分钟、最长只有数小时。
真核生物mRNA的半寿期较长、如胚胎中的mRNA可达数日;
4)原核与真核生物mRNA的结构特点也不同、原核生物的mRNA的5’端无帽子结构、3’端没有或只有较短的polyA结构。
13、大肠杆菌的终止子有哪两大类?
请分别介绍一下它们的结构特点。
大肠杆菌的终止子可以分为不依赖于p因子和依赖于p因子两大类。
不依赖于p因子的终止子结构特点:
1、位于位点上游一般存在一个富含GC碱基的二重对称区、由这段DNA转录产生的RNA容易形成发卡式结构。
2、在终止位
点前面有一端由4—8个A组成的序列、所以转录产物的3’端为寡聚U。
依赖于p因子的终止子的结构特点:
14、真核生物的原始转录产物必须经过哪些加工才能成为成熟的mRNA、以用作蛋白质合成的模版。
加工包括:
(1)5’端连接“帽子”结构;
(2)3’端添加polyA“尾巴”;
(3)hnRNA被剪接、把内含子(DNA上非编码序列)转录序列剪掉、把外显子(DNA上的编码序列)转录序列拼接上(真核生物一般为不连续基因)。
(4)分子内部的核苷酸甲基化修饰
15、简述Ⅰ、Ⅱ类内含子的剪接特点。
Ⅰ类内含子的剪接主要是转酯反应、即剪接反应实际上是发生了两次磷酸二脂键的转移。
I类内含子的切除体系中、在第一个转酯反应由一个游离的鸟苷或者鸟苷酸介导、鸟苷或鸟苷酸的3’—OH作为亲核基团攻击内含子5’端的磷酸二脂键、从上游切开RNA链。
在第二个转酯反应中、上游外显子的自由3’—OH作为亲核基团攻击内含子3’位核苷酸上的磷酸二脂键、使内含子被完全切开、上下游两个外显子通过新的磷酸二脂键相连。
Ⅱ类内含子主要存在于真核生物的线粒体和叶绿体rRNA基因中、在Ⅱ类内含子切除体系中、转酯反应无需游离鸟苷或鸟苷酸、而是由内含子本身的靠近3’端的腺苷酸2’—OH作为亲核基团攻击内含子5’端的磷酸二脂键、从上游切开RNA链后形成套索结构。
再由上游外显子的自由3’—OH
作为亲核基团攻击内含子3’位核苷酸上的磷酸二脂键、使得内含子被完全切开、上下游两个内含子通过新的磷酸二脂键相连。
17、什么是RNA编辑?
其生物学意义是什么?
RNA
编辑是指某些RNA特别是mRNA前体经过插入、删除或取代一些核苷酸残疾等操作、导致DNA所编码的遗传信息的改变、使得经过RNA编辑的mRNA序列发生了不同于模版的DNA的变化。
生物学意义:
1、校正作用,有些基因在突变的途中丢失的遗传信息可能通过RNA的编辑得以恢复;
2、调控翻译,通过编辑可以构建或去除其实密码子和终止密码子、是基因表达调控的一种方式;
扩充遗传信息,3、能使基因产物获得心得结构核功能、有利于生物的进化。
18、核酶具有哪些结构特点?
核酶的结构特点:
核酶的锤头结构特点是:
三个茎区形成局部的双链结构;
其中含13个保守的核苷酸、N代表任何核苷酸;
1、核酶是继反转录现象之后对中心法则的有一个重要的修正、说明RNA既是遗传物质又是酶;
2、核酶的发现为生命起源的研究提供了新思路—--也许曾(经存在以RNA为基础的原始生命.
第四章
2、遗传密码有哪些特征?
1、密码的连续性、密码之间无间断也没有重叠;
2、密码的简并性、许多氨基酸都有多个密码子;
3、密码的通用性和特殊性、遗传密码无论在体内还是在体外、无论是对病毒、细菌、动物还是植物而言都是通用的、但是也有少数例外;
4、密码子和反密码子的相互作用。
3、有几种终止密码子?
它们的序列和别名分别是什么?
3种、UAA、UAG和UGA、别名是无意义密码。
4、tRNA在组成和结构上有哪些特点
1.tRNA中含有稀有碱基,除ACGU
外还含有双氢尿嘧啶、假尿嘧啶等;
2.tRNA分子形成茎环节构;
3.tRNA分子末端有氨基酸接纳茎;
4.tRNA分子序列中很有反密码子。
5、简述摆动学说。
1966年、Crick根据立体化学原理提出摆动学说、解释了反密码子中某些稀有成分的配对。
摆动学说认为、在密码子与反密码子的配对中、前两对严格遵守碱基配对原则、第三对碱基有一定的自由度、可以“摆动”、因而使某些tRNA可以识别1个以上的密码子。
认为除A-U、G-C配对外、还有非标准配对、I-A、I-C、I-U、并强调密码子的5’端第1、2个碱基严格遵循标准配对、而第3个碱基可以非标准配对、具有一定程度的摆动灵活性。
7、比较原核与真核的核糖体组成。
1、真核细胞中的核糖体数量多余原核;
2、真核细胞中核糖体RNA占细胞中总RNA的量少于原核;
3、原核生物的核糖体通过与mRNA的相互作用、被固定在核基因组上、真核生物的核糖体则直接或间接的与细胞骨架有关联或者与内质网膜结构相连;
4、原核生物核糖体由约RNA占2/3及1/3的蛋白组成、真核生物核糖体中RNA占3/5、蛋白质占2/5。
8、什么是SD序列?
其功能是什么?
SD序列是指信使核糖核酸(mRNA)翻译起点上游与原核16S
核糖体RNA或真核18SrRNA
3′端富含嘧啶的7核苷酸序列互补的富含嘌呤的3~7个核苷酸序列(AGGAGG)、是核糖体小亚基与mRNA结合并形成正确的前起始复合体的一段序列。
功能:
SD序列对mRNA的翻译起重要作用。
9、核糖体有哪些活性中心?
核糖体包括多个活性中心、即mRNA结合部位、结合或接受AA-tRNA部位、结合或接受肽酰-tRNA部位、肽基转移部位及形成肽键的部位、此外还有负责肽链延伸的各种延伸因子的结合位点。
10、真核生物与原核生物在翻译起始过程中有哪些区别?
原核生物的起始tRNA是fMet-tRNA、真核生物是Met-tRNAMet。
原核生物中30S小亚基首先与mRNA模版相结合、再与fMet-tRNA结合、最后与50S大亚基结合。
而在真核生物中、40S小亚基首先与Met-tRNAMet相结合、再与模版mRNA结合、最后与60S大亚基结合生成
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11、链霉素为什么能够抑制蛋白质的合成?
链霉素是是一种氨基葡萄糖型抗生素、分子式C21H39N7O12、可以多种方式抑制原核生物核糖体、能干扰fMet-tRNA与核糖体的结合、从而阻止蛋白质合成的正确起始、也会导致mRNA的错读。
14、什么是信号肽?
它在序列组成上有什么特点?
有什么功能?
绝大部分被运入内质网腔的蛋白质都带有一个信号肽、该序列常常位于蛋白质的氨基端、长度一般都在13-16个残基、有如下三个特征:
1、一般带有10-15个疏水残基;
2、在靠近该序列N端常常带有一个或者数个带正电荷的氨基酸;
3、在其C端靠近蛋白酶切割位点处常常带有数个极性氨基酸。
完整的信号肽是保证蛋白质转运的必要条件。
15、简述叶绿体蛋白质的跨膜运输机制。
1、活性蛋白水解酶位于叶绿体基质内;
2、叶绿体膜能够特异性的与叶绿体蛋白的前体结合;
3、叶绿体蛋白质前体内可降解序列因植物和蛋白质种类不同而表现出明显的差异;
16、蛋白质有哪些翻译后的加工修饰?
1、氨基端和羧基端的修饰;
2.共价修饰:
磷酸化、糖基化、羟基化、二硫键的形成;
3.亚基的聚合;
4.水解断链、切除新生肽中非功能片段。
18、什么是核定位序列?
其主要功能是什么?
核定位序列:
蛋白质的一个结构域、通常为一短的氨基酸序列、它能与入核载体相互作用、使蛋白能被运进细胞核。
在绝大多数多细胞真核生物中、每当细胞发生分裂时、核膜被破坏、等到细胞分类完成后、核膜被重新建成、分散在细胞内的核蛋白必须被重新运入核内、为了核蛋白的重复定位、这些蛋白质中的信号肽----被称为核定位序列。
第七章基因的表达与调控
1.简述代谢物对基因表达调控的两种方式。
①转录水平上的调控
②转录后水平上的调控,包括mRNA加工成熟水平上的调控)和翻译水平上的调控
3.简述乳糖操纵子的调控模型。
A、乳糖操纵子的组成:
大肠杆菌乳糖操纵子含Z、Y、A三个结构基因,分别编码半乳糖苷酶、透酶和半乳糖苷乙酰转移酶,此外还有一个操纵序列O,一个启动子P和一个调节基因I。
B、阻遏蛋白的负性调节:
没有乳糖存在时,I基因编码的阻遏蛋白结合于操纵序列O处,乳糖操纵子处于阻遏状态,不能合成分解乳糖的三种酶;
有乳糖存在时,乳糖作为诱导物诱导阻遏蛋白变构,不能结合于操纵序列,乳糖操纵子被诱导开放合成分解乳糖的三种酶。
所以,乳糖操纵子的这种调控机制为可诱导的负调控。
C、CAP的正性调节:
在启动子上游有CAP结合位点,当大肠杆菌从以葡萄糖为碳源的环境转变为以乳糖为碳源的环境时,cAMP浓度升高,与CAP结合,使CAP发生变构,CAP结合于乳糖操纵子启动序列附近的CAP结合位点,激活RNA聚合酶活性,促进结构基因转录,调节蛋白结合于操纵子后促进结构基因的转录,对乳糖操纵子实行正调控,加速合成分解乳糖的三种酶。
D、协调调节:
乳糖操纵子中的I基因编码的阻遏蛋白的负调控与CAP的正调控两种机制,互相协调、互相制约。
5.什么是弱化作用?
1.当培养基中色氨酸的浓度很低时,负载有色氨酸的tRNATrp也就少,这样翻译通过两个相邻色氨酸密码子的速度就会很慢,当4区被转录完成时,核糖体才进行到1区(或停留在两个相邻的trp密码子处),这时的前导区结构是2-3配对,不形成3-4配对的终止结构,
所以转录可继续进行,直到将trp操纵子中的结构基因全部转录。
2.当培养基中色氨酸浓度较高时,核糖体可顺利通过两个相邻的色氨酸密码子,在4区被转录之前就到达2区,使2-3区不能配对,3-4区自由配对形成基一环终止子结构,转录被终止,trp操纵子被关闭。
第八章
1.基因家族的分类及其主要表达调控模式
(1)简单多基因家族,真核生物首先是prerRNA经过特异性甲基化,然后是经RNA酶的切割便可产生成熟rRNA分子。
原核生物则还要经过核酸酶降解才能产生成熟rRNA分子。
(2)复杂多基因家族,一般由几个相关基因家族构成,基因家族之间由间隔序列隔开,并作为独立的转录单位,可能存在具有不同专一性的组蛋白亚类和发育调控机制。
(3)发育调控的复杂多基因家族,每个基因家族中,基因排列的顺序就是他们在发育阶段的表达顺序。
2.何为外显子和内含子及其结构特点和可变调控
大多数真核基因都是由蛋白质编码序列和非蛋白质编码序列组成的,编码序列称为外显子(exon),非编码序列称为内含子(intron)。
结构特点:
一个结构基因中编码某一蛋白质不同区域的各个外显子并不连续排列在一起,而是常常被长度不等的内含子所隔离,形成镶嵌排列的断裂方式。
可变调控:
不少真核基因的原始转录产物可通过不同剪接方式,产生不同的mRNA,并翻译成不同的蛋白质。
另外,一些核基因由于转录是选择了不同的启动子或者在转录产物上选择了不同的PolyA位点而使转录产物产生不同的二级结构,因而影响剪接过程,最终产生不同的mRNA分子。
3.DNA甲基化对基因表达的的调控机制
答:
大量研究表明,DNA甲基化能关闭某些基因达的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。
三种调控机制:
一是DNA甲基化导致了某些区域DNA构象变化,从而影响了蛋白质和DNA的相互作用,抑制了转录因子与启动区DNA的结合效率。
二是促进阻遏蛋白的阻遏作用。
三是DNA的甲基化还提高了该位点的突变频率。
4真核生物转录元件组成及其分类
启动子,转录模版,RAN聚合酶Ⅱ基础转录所需的蛋白质因子(TFⅡ),RNA聚合酶Ⅱ,增强子,反式作用因子
5.增强子的作用机制。
增强子是指能使与它连锁的基因转录频率明显增加的DNA序列。
可能有3中作用机制:
(1)影响模版附近的DNA双螺旋结构,导致DNA双螺旋弯折或在反式因子的参与下,以蛋白质之间的相互作用为媒介形成增强子鱼启动子之间“成环”连接,活化基因转录。
(2)将模版固定在细胞核内特定位置,如连接在核基质上,有利于DNA拓扑异构酶改变DNA双螺旋结构的张力,促进RNA聚合酶Ⅱ在DNA链上的结合和滑动。
(3)增强子区可以作为反式作用因子或RNA聚合酶Ⅱ进入染色质结构的“入口”。
6.反式作用因子的结构特点及其对基因表达的调控
反式作用因子是能直接或间接的识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上,参与调控靶基因转录效率的蛋白质。
这些因子有两种独立的活性:
特异地与DNA结合位点相结合,然后激活转录。
两种活性可以独立分配给特定的蛋白结构域,分别称作DNA结合结构域和激活结构域,两者是相分离的。
它们在蛋白质的不同区域。
7举例说明蛋白质磷酸化如何影响基因表达。
蛋白质磷酸化主要影响细胞信号转导进而影响基因表达。
举例:
在糖原代谢过程中,激素与其受体在肌细胞外表面相结合,诱发细胞质cAMP的合成并活化A激酶,后者再将活化
磷酸基团传递给无活性的磷酸化酶激酶,活化糖原磷酸化酶,最终将糖原磷酸化,进入糖酵解途径并提供ATP。
(cAMP介导的蛋白质磷酸化过程)
8组蛋白乙酰化和去乙酰化影响基因转录的机制。
组蛋白乙酰转移酶和去乙酰化酶通过是组蛋白乙酰化和去乙酰化对基因表达产生影响。
组蛋白N端尾部上赖氨酸残基的乙酰化中和了尾部的正电荷,降低了它与组蛋白的亲和性,导致核小体构象发生有利于转录调节蛋白与染色质结合的变化,从而提高了基因转录的活性。
核心组蛋白H2A,H2B,H3,H4通过组蛋白尾部选择性乙酰化影响核小体的浓缩水平和可接近性。
由于乙酰化的组蛋白抑制了核小体的浓缩,使转录因子更容易与基因组的这一部分相接触,有利于提高基因的转录活性。
9激素影响基因表达的基本模式。
许多类固醇激素(如雌激素、孕激素、醛固酮、糖皮质激素和雄激素)以及一些代谢性激素(如胰岛素)的调控作用都是通过起始基因转录而实现的。
靶细胞具有专一的细胞质受体,可与激素形成复合物,导致三维结构甚至化学性质的变化。
经修饰的受体与激素复合物通过核膜进入细胞核与染色质的特定区域结合导致基因转录的起始或关闭。
靶细胞内含有大量激素受体蛋白,而非靶细胞中没有或很少有这类受体,这是激素调节转录组织特异性的根本原因。
10分子伴侣的分类及其影响基因表达的机制。
分子伴侣(molecularchaperone)是一类序列上没有相关性担忧共同功能的保守性蛋白质,它们在细胞内能帮助其他多肽进行正确的折叠、组装、运转和降解。
目前认为分子伴侣至少有两类:
热休克蛋白家族和伴侣素。
把能与某个(类)专一蛋白因子结合,从而控制基因特意表达的DNA上游序列称为应答元件(responseelement),如热休克应答元件,这些应答元件与细胞内转移的转录因子相互作用,协调相关基因的转录。