CTan使用说明资料下载.pdf

CTan使用说明资料下载.pdf

《CTan使用说明资料下载.pdf》由会员分享，可在线阅读，更多相关《CTan使用说明资料下载.pdf（79页珍藏版）》请在冰豆网上搜索。

用户名；

组织名称；

程序认证码（在下载并第一次运行CTAn时能看到此信息）在这些数据的基础上，你会收到SkyScan的license文件“CTAn.lic”，此文件需与“CTAn.exe”放在同一目录，运行CTAn将出现一个对话框，要求输入你的个人信息和程序认证码，对应输入即可，以后运行CTAn将不再要求输入。

请妥善保存您的个人信息及认证码，当程序检查license或者安装CTAn到其他电脑时，需要重新输入此信息。

你可以在Help/AboutCTAn对话框中看到程序认证码（ProductID）和程序版本信息。

下载升级CTAn和CTVol不需再次激活程序，只需覆盖“CTAn.exe”文件即可。

但是此时AboutSkyScanCT-Analyser用户手册v.1.102010窗口中的ProductID已经不同于原始程序ID，所以不能用于其他电脑CTAn程序的安装。

你可以去http:

/www.skyscan.be/next/downloads.htm下载最新版本的CTAn。

2.1.不同用户的授权情况不同用户的授权情况输入CTAn的license时，需要使用管理员身份运行程序，点击鼠标右键，选择“runasadministrator”运行程序，输入license，见下图：

如想让所有用户均可运行CTAn，在选项中，选择“高级”，在底部有一个选项（下图），勾选后即可。

上面项打勾后，需要以管理员的身份重新运行程序，并重新输入用户名称、序列号等信息，完成后，任何用户都被许可运行CTAn程序而无需管理员身份。

3.设置参数设置参数要改变程序参数，调整CTAn设定选项以适合特定应用，点击File/Preferences，打开参数选择窗口，几个标签页中有许多的设置和选项，如下：

选项卡简述：

常规选项卡常规选项卡：

2维和3维参数测量的输出选项，包含名称、单位、标记法和报告文件的扩展名等；

其他选项支持导入的不同图像格式；

JPEG的压缩级别。

动画动画：

此栏可以调节视频显示和输出AVI文件的动画播放速度。

兴趣区域：

包含选择的兴趣区域（ROI）的默认形状正方形或圆形；

保存兴趣区域数据集的尺寸选项；

加载ROI（.roi）文件的选项（详见第8章）。

直方图：

此选项卡用于骨密度（BMD）的校准。

请注意，其他非骨物质的BMD也可以在此校准（详见第9章）。

体积：

CTAn中所建3维模型的分辨率水平，当然，分辨率的瓶颈取决于显卡配置。

工具：

在此输入SkyScanCTVol程序路径，以便自动打开在CTAn中创建的3维模型。

目录：

在此指定临时文件目录和用户自定义的插件目录（详见第11章）.高级：

高级：

选项包括：

（a）三维模型的表面渲染算法；

（b）行间距平均的截取长度（MIL）和SkyScanCT-Analyser用户手册v.1.102010各向异性分析；

（c）三维形态运算的多种选项；

等等。

4.打开文件打开文件程序支持三种类型的文件（BMP,JPG,TIFF），但这三种类型并不都能进行分析：

BMP-文件：

所有bmp类型的文件均可打开查看，但只有1位（单色）和8位的图像才能用于分析；

JPG-文件：

所有jpg类型的文件均可打开查看，但只有8位（灰色）的图像能用于分析；

TIFF-文件：

程序只支持查看和分析SkyScan设备和软件产生的8位和16位图像。

彩色图像彩色图像CTAn可以打开RGB格式的BMP或JPG图像，但是不能执行分析功能，须转换为灰度格式图像，才可以进行分析。

（详见下面的4.1节）不同位深度的图像：

不同位深度的图像：

在打开16位的TIFF图像时，CTAn会出现转换16位图像到8位图像对话框，跟据直方图的亮度选择转变成8位图像的灰度范围，并提供预览。

可以用键盘输入亮度限制的范围。

默认情况下，此范围映射亮度的指数。

如果该文件包含密度校准信息，可以指定亮度范围为Hounsfield单位。

按下“Apply”按钮可以使选择的范围实时的显示在直方图上，按下“OK”就使选择的参数生效并执行转换。

定位每个图像文件都需要一定时间，因此当打开数据集较大或者从网络驱动器打开数据集文件时，就得花费较长时间，如果本地硬盘有足够大的空间，可以通过激活缓存选项来减少定位文件时间。

SkyScanCT-Analyser用户手册v.1.102010激活此选项后，原始文件将在缓存区建立相应的临时文件，以后CTAn调用此文件时，会到缓存空间调用临时文件，而不是每次都浪费时间去调用原档。

要激活此选项，点击File/Preference，在Advanced标签页中选择激活Cacheimages。

CTAn中打开数据集的方法中打开数据集的方法CTAn中，有几种方法加载和打开数据图像文件：

拖放一个数据图像文件到CTAn程序，此操作将打开一个CTAn程序实例并自动载入所有相关数据图像；

拖放一个数据图像文件到一个已经打开的CTAn实例窗口部分，此操作将使刚打开此拖放的图像数据集，并取代任何已经打开的数据图像集，因为一个CTAn实例只能同时打开一个数据图像集。

在命令行中指定完整的路径和数据集（参阅附录A）。

这种模式一般用于程序调用或文件批处理（BAT）。

此操作将打开一个CTAn程序实例并自动打开指定的数据集。

在CTAn程序中使用open菜单打开数据图像集。

要打开数据集文件，在CTAn菜单中选择命令File/Open.Ctrl+O,在打开的对话框中除标准功能外，CTAn还提供了一些额外并实用的功能，选定的图像可以在预览区显示预览，控制预览开关可以打开或者关闭预览。

如果想加载特定类型的文件，可以在“文件类型”菜单框中选择特定类型，这样，选择的类型显示，而其他类型将全部隐藏。

“Openas”下拉式菜单框中可以选择打开图像的两种模式：

1.Dataset，此模式将自动载入整个数据集图像文件；

2.Singlefile，此模式只打开选择的一个图像文件。

SkyScanCT-Analyser用户手册v.1.102010“Resizeby”开关控制图像的缩放，如果不选择此开关，CTAn打开的图像为原始尺寸，如果选择此开关，CTAn打开的图像为原始尺寸的1/X（X为选择的数字）。

新的尺寸会在此开关下方显示。

缩小图像尺寸会减少分析处理的数据量，加快分析处理速度。

定位图像需要时间，因此，当利用网络从远程驱动器获取规模较大的数据集时，加载时间问题就尤为重要。

如果有足够的本地磁盘空间，可以设置缓存目录，这样，访问原始文件只需一次，再次访问，就是访问缓存目录中的临时问题，大大缩短了访问时间。

要进行此设置，选择File/Preferences，在Advanced选项中选择Cacheimages项即可。

对于一个已经打开的数据集，选择缓存图像选项后，必须重载此数据集才能激活此数据集的缓存功能。

缓存选项只对下列文件类型有效：

BMP（1位和8位），TIFF（8位和16位），JPG（8位）。

为了避免临时文件目录所在的硬盘空间紧张，您可以指定此临时目录的路径，点击File/Preferences，到Directories标签页中设置“Temporaryfiles“为您指定的目录即可。

SkyScanCT-Analyser用户手册v.1.1020104.1.不同格式图像转换不同格式图像转换在“general”选项卡中，可选择输入图像可以转换的格式类型，见下图红色框部分：

RGBtogray:

这项提供了RGB彩色图像转换成灰度图像的功能，因为只有灰度图像才能在CTAn中进行分析。

彩色转换成灰度的选项为：

No:

无转换Luminance:

从RGB的加权平衡值计算一个灰度像素值的比例：

R:

G:

B0.2126:

0.7152:

0.0722.Redchannel:

仅采用红色通道值的灰度值Greenchannel:

仅采用绿色通道值的灰度值Bluechannel:

仅采用蓝色通道值的灰度值SkyScanCT-Analyser用户手册v.1.102010原始数据文件类型：

原始数据文件类型：

Raw使用“RAW”数据类型，可以打开非SkyScan格式的数据集，如下所示：

在“Fileoftype”中可以选择“Rawdata”，这样，就可以打开非SkyScan格式的文件。

原始数据文件（RDF）可能包含单组或者多组文件（如果文件有一个四位数的后缀）.对于一个多组的RDF，Z位置来自于四位数的后缀。

导入非SkyScan格式数据集，需在“importrawdata”窗口中选择各项参数：

Datatype数据类型（integer,floatingpoint,etc.）Byteorder字节顺序littleendian（WIN）Windows中小字节开头/bigendianSkyScanCT-Analyser用户手册v.1.102010（MAC）苹果系统中大字节开头参考维基百科：

http:

/en.wikipedia.org/wiki/EndiannessHeadersize,inbytes头大小，以字节为单位Pixelsize,inmicrons像素尺寸，以微米为单位Imagewidthandheight（pixels）图像宽度和高度（像素）“Majorandminorvalue”:

较大和较小值这些都是最低和最高的灰度值，默认情况下，这些被定义0到255对应8位格式，对于不同数据集的灰度级的位深度，必须指定最大和最小值。

Zsize,spacingandorigin:

Z尺寸、间距和起点用于必须指定单一组RDF的Z尺寸，Z轴间距和Z原点。

单一组RDF的Z位置由以下公式获得：

Zpos=Zorg+Zsp*n（where0=n“Preferences”并切换到直方图（Histogram）选项卡。

SkyScanCT-Analyser用户手册v.1.102010“Default”按钮复位方程到默认状态。

点击“Calibrate”按钮打开一个对话框，输入所测量的两个骨密度标样的HU密度值。

注意：

在输入校正值后重新打开此窗口，显示的