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比旋是α-氨基酸的物理常数之一,它是鉴别各种氨基酸的一种根据。

参与蛋白质组成的氨基酸中色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸在紫外区有光吸收,这是紫外吸收法定量蛋白质的依据。

核磁共振(NMR)波谱技术在氨基酸和蛋白质的化学表征方面起重要作用。

氨基酸分析分离方法主要是基于氨基酸的酸碱性质和极性大小。

常用方法有离子交换柱层析、高效液相层析(HPLC)等。

习题

1.写出下列氨基酸的单字母和三字母的缩写符号:

精氨酸、天冬氨酸、谷氨酰氨、谷氨酸、苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸。

[见表3-1]

表3-1 

氨基酸的简写符号

名称 

 

三字母符号 

单字母符号 

单字母符号

丙氨酸(alanine) 

Ala 

亮氨酸(leucine) 

Leu 

L

精氨酸(arginine) 

Arg 

赖氨酸(lysine) 

Lys 

K

天冬酰氨(asparagines) 

Asn 

甲硫氨酸(蛋氨酸)(methionine) 

Met 

M

天冬氨酸(asparticacid) 

Asp 

苯丙氨酸(phenylalanine) 

Phe 

F

Asn和/或Asp 

Asx 

半胱氨酸(cysteine) 

Cys 

脯氨酸(praline) 

Pro 

P

谷氨酰氨(glutamine) 

Gln 

丝氨酸(serine) 

Ser 

S

谷氨酸(glutamicacid) 

Glu 

氨酸(threonine) 

Thr 

T

Gln和/或Glu 

Gls 

甘氨酸(glycine) 

Gly 

色氨酸(tryptophan) 

Trp 

W

组氨酸(histidine) 

His 

酪氨酸(tyrosine) 

Tyr 

Y

异亮氨酸(isoleucine) 

Ile 

缬氨酸(valine) 

Val 

V

2、计算赖氨酸的εα-NH3+20%被解离时的溶液PH。

[9.9]

解:

pH=pKa+lg20% 

pKa=10.53(见表3-3,P133)

pH=10.53+lg20%=9.83

3、计算谷氨酸的γ-COOH三分之二被解离时的溶液pH。

[4.6]

pH=pKa+lg2/3% 

pKa=4.25

pH=4.25+0.176=4.426

4、计算下列物质0.3mol/L溶液的pH:

(a)亮氨酸盐酸盐;

(b)亮氨酸钠盐;

(c)等电亮氨酸。

[(a)约1.46,(b)约11.5,(c)约6.05]

5、根据表3-3中氨基酸的pKa值,计算下列氨基酸的pI值:

丙氨酸、半胱氨酸、谷氨酸和精氨酸。

[pI:

6.02;

5.02;

3.22;

10.76]

pI=1/2(pKa1+pKa2)

pI(Ala)=1/2(2.34+9.69)=6.02

pI(Cys)=1/2(1.71+10.78)=5.02

pI(Glu)=1/2(2.19+4.25)=3.22

pI(Ala)=1/2(9.04+12.48)=10.76

6、向1L1mol/L的处于等电点的甘氨酸溶液加入0.3molHCl,问所得溶液的pH是多少?

如果加入0.3molNaOH以代替HCl时,pH将是多少?

[pH:

2.71;

9.23]

7、将丙氨酸溶液(400ml)调节到pH8.0,然后向该溶液中加入过量的甲醛,当所得溶液用碱反滴定至Ph8.0时,消耗0.2mol/LNaOH溶液250ml。

问起始溶液中丙氨酸的含量为多少克?

[4.45g]

8、计算0.25mol/L的组氨酸溶液在pH6.4时各种离子形式的浓度(mol/L)。

[His2+为1.78×

10-4,His+为0.071,His0为2.8×

10-4]

9、说明用含一个结晶水的固体组氨酸盐酸盐(相对分子质量=209.6;

咪唑基pKa=6.0)和1mol/LKOH配制1LpH6.5的0.2mol/L组氨酸盐缓冲液的方法[取组氨酸盐酸盐41.92g(0.2mol),加入352ml1mol/LKOH,用水稀释至1L]

10、为什么氨基酸的茚三酮反映液能用测压法定量氨基酸?

茚三酮在弱酸性溶液中与α-氨基酸共热,引起氨基酸氧化脱氨脱羧反映,(其反应化学式见P139),其中,定量释放的CO2可用测压法测量,从而计算出参加反应的氨基酸量。

11、L-亮氨酸溶液(3.0g/50ml6mol/LHCl)在20cm旋光管中测得的旋光度为+1.81º

计算L-亮氨酸在6mol/LHCl中的比旋([a])。

[[a]=+15.1º

]

12、标出异亮氨酸的4个光学异构体的(R,S)构型名称。

[参考图3-15]

13、甘氨酸在溶剂A中的溶解度为在溶剂B中的4倍,苯丙氨酸在溶剂A中的溶解度为溶剂B中的两倍。

利用在溶剂A和B之间的逆流分溶方法将甘氨酸和苯丙氨酸分开。

在起始溶液中甘氨酸含量为100mg,苯丙氨酸为81mg,试回答下列问题:

(1)利用由4个分溶管组成的逆流分溶系统时,甘氨酸和苯丙氨酸各在哪一号分溶管中含量最高?

(2)在这样的管中每种氨基酸各为多少毫克?

[

(1)第4管和第3管;

(2)51.2mgGly+24mgPhe和38.4mgGly+36mgPhe]

根据逆流分溶原理,可得:

对于Gly:

Kd=CA/CB=4=q(动相)/p(静相) 

p+q=1=(1/5+4/5)

4个分溶管分溶3次:

(1/5+4/5)3=1/125+2/125+48/125+64/125

对于Phe:

Kd=CA/CB=2=q(动相)/p(静相) 

p+q=1=(1/3+2/3)

(1/3+2/3)3=1/27+6/27+12/27+8/27

故利用4个分溶管组成的分溶系统中,甘氨酸和苯丙氨酸各在4管和第3管中含量最高,其中:

第4管:

Gly:

64/125×

100=51.2mg 

Phe:

8/27×

81=24mg

第3管:

48/125×

100=38.4mg 

12/27×

81=36mg

14、指出在正丁醇:

醋酸:

水的系统中进行纸层析时,下列混合物中氨基酸的相对迁移率(假定水相的pH为4.5):

(1)Ile, 

Lys;

(2)Phe,Ser(3)Ala,Val,Leu;

(4)Pro,Val 

(5)Glu,Asp;

(6)Tyr,Ala,Ser,His.

[Ile>

lys;

Phe,>

Ser;

Leu>

Val>

Ala,;

Val>

Pro;

Glu>

Asp;

Tyr>

Ala>

Ser≌His]

根据P151图3-25可得结果。

15.将含有天冬氨酸(pI=2.98)、甘氨酸(pI=5.97)、亮氨酸(pI=6.53)和赖氨酸(pI=5.98)的柠檬酸缓冲液,加到预先同样缓冲液平衡过的强阳离交换树脂中,随后用爱缓冲液析脱此柱,并分别收集洗出液,这5种氨基酸将按什么次序洗脱下来?

[Asp,Thr,Gly,Leu,Lys]

在pH3左右,氨基酸与阳离子交换树脂之间的静电吸引的大小次序是减刑氨基酸(A2+)>

中性氨基酸(A+)>

酸性氨基酸(A0)。

因此氨基酸的洗出顺序大体上是酸性氨基酸、中性氨基酸,最后是碱性氨基酸,由于氨基酸和树脂之间还存在疏水相互作用,所以其洗脱顺序为:

Asp,Thr,Gly,Leu,Lys。

第四章 

蛋白质的共价结构

蛋白质分子是由一条或多条肽链构成的生物大分子。

多肽链是由氨基酸通过肽键共价连接而成的,各种多肽链都有自己特定的氨基酸序列。

蛋白质的相对分子质量介于6000到1000000或更高。

蛋白质分为两大类:

单纯蛋白质和缀合蛋白质。

根据分子形状可分为纤维状蛋白质、球状蛋白质和膜蛋白质。

此外还可按蛋白质的生物学功能分类。

为了表示蛋白质结构的不同组织层次,经常使用一级结构、二级结构、三级结构和四级结构这样一些专门术语。

一级结构就是共价主链的氨基酸序列,有时也称化学结构。

二、三和四级结构又称空间结构(即三维结构)或高级结构。

蛋白质的生物功能决定于它的高级结构,高级结构是由一级结构即氨基酸序列决定的,二氨基酸序列是由遗传物质DNA的核苷酸序列规定的。

肽键(CO—NH)是连接多肽链主链中氨基酸残缺的共价键,二硫键是使多肽链之间交联或使多肽链成环的共价键。

多肽链或蛋白质当发生部分水解时,可形成长短不一的肽段。

除部分水解可以产生小肽之外,生物界还存在许多游离的小肽,如谷胱甘肽等。

小肽晶体的熔点都很高,这说明短肽的晶体是离子晶格、在水溶液中也是以偶极离子存在的。

测定蛋白质一级结构的策略是:

(1)测定蛋白质分子中多肽链数目;

(2)拆分蛋白质分子的多肽链;

(3)断开多肽链的二硫桥;

(4)分析每一多肽链的氨基酸组成;

(5)鉴定多肽链的N-末端和C-末端残基;

(6)断裂多肽链成较小的肽段,并将它们分离开来;

(7)测定各肽段的氨基酸序列;

(8)利用重叠肽重建完整多肽链的一级结构;

(9)确定半胱氨酸残基形成的S-S交联桥的位置。

序列分析中的重

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