分子生物学.docx

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分子生物学

第一章绪论

一简答题

1.21世纪是生命科学的世纪。

20世纪后叶分子生物学的突破性成就，使生命科学在自然科学中的位置起了革命性的变化。

试阐述分子生物学研究领域的三大基本原则，三大支撑学科和研究的三大主要领域？

答案：

（1）研究领域的三大基本原则：

构成生物大分子的单体是相同的；生物遗传信息表达的中心法则相同；生物大分子单体的排列（核苷酸，氨基酸）导致了生物的特异性。

（2）三大支撑学科：

细胞学，遗传学和生物化学。

（3）研究的三大主要领域：

主要研究生物大分子结构与功能的相互关系，其中包括DNA和蛋白质之间的相互作用；激素和受体之间的相互作用；酶和底物之间的相互作用。

2.分子生物学的概念是什么？

答案：

有人把它定义得很广：

从分子的形式来研究生物现象的学科。

但是这个定义使分子生物学难以和生物化学区分开来。

另一个定义要严格一些，因此更加有用：

从分子水平来研究基因结构和功能。

从分子角度来解释基因的结构和活性是本书的主要内容。

3二十一世纪生物学的新热点及领域是什么？

答案：

结构生物学是当前分子生物学中的一个重要前沿学科，它是在分子层次上从结构角度特别是从三维结构的角度来研究和阐明当前生物学中各个前沿领域的重要学科问题，是一个包括生物学、物理学、化学和计算数学等多学科交叉的，以结构（特别是三维结构）测定为手段，以结构与功能关系研究为内容，以阐明生物学功能机制为目的的前沿学科。

这门学科的核心内容是蛋白质及其复合物、组装体和由此形成的细胞各类组分的三维结构、运动和相互作用，以及它们与正常生物学功能和异常病理现象的关系。

分子发育生物学也是当前分子生物学中的一个重要前沿学科。

人类基因组计划，被称为“21世纪生命科学的敲门砖”。

“人类基因组计划”以及“后基因组计划”的全面展开将进入从分子水平阐明生命活动本质的辉煌时代。

目前正迅速发展的生物信息学，被称为“21世纪生命科学迅速发展的推动力”。

尤应指出，建立在生物信息基础上的生物工程制药产业，在21世纪将逐步成为最为重要的新兴产业；从单基因病和多基因病研究现状可以看出，这两种疾病的诊断和治疗在21世纪将取得不同程度的重大进展；遗传信息的进化将成为分子生物学的中心内容”的观点认为，随着人类基因组和许多模式生物基因组序列的测定，通过比较研究，人类将在基因组上读到生物进化的历史，使人类对生物进化的认识从表面深入到本质；研究发育生物学的时机已经成熟。

在21世纪，遗传信息的进化研究成果，将成为解决发育问题的基础，发育问题这一难题可望获得突破性进展；在21世纪，生物技术产业化的趋势将不断加剧。

基因工程技术、转基因技术和基因治疗技术等将对21世纪的产业结构产生深远的影响。

当前，生命科学基础研究中最活跃的前沿主要包括：

分子生物学、细胞生物学、神经生物学、生态学，并由这些活跃的前沿引伸出诸如：

基因组学、蛋白质组学、人类基因组计划、后人类基因组计划、克隆羊、克隆鱼、“脑的十年”、生物的多样性等时髦的名词和热门话题。

相应的应用研究或技术研究也正趋成熟并逐渐普及，如生物工程，即基因工程、蛋白质工程、发酵工程、酶工程、细胞工程、胚胎工程等。

由于生命科学与人类生存、人们健康、社会发展密切相关，必将成为21世纪全球关注的领域。

4.简述分子生物学的发展历程。

答案：

从1847年施旺和施莱登提出细胞学说——证明动植物是由细胞组成的，到今天人们对生物大分子——细胞的化学组成确有了深刻地认识。

孟德尔的遗传规律最先使人们对性状遗传产生了理性认识，而Morgan的基因学说则进一步将“性状”与“基因”相偶联，成为现代遗传学的奠基石。

随着核酸化学研究的进展，Watson和Crick又提出了脱氧核糖核酸的双螺旋模型，为充分揭示遗传信息的传递规律铺平了道路。

在蛋白质化学方面，继Sumner在1936年证实酶是蛋白质之后，Sanger利用纸电泳及层析技术于1953年首次阐明胰岛素的一级结构，开创了蛋白质序列分析的先河。

而Kendrew和Perutz利用X射线衍射技术解析了肌红蛋白及血红蛋白的三维结构，论证了这些蛋白质在输送分子氧过程中的特殊作用，成为研究生物大分子空间立体构型的先驱。

20世纪40年代被认为是分子生物学的孕育时期。

1941年，曾在摩尔根实验室工作过的美国遗传学家比德尔同美国生物化学家塔特姆合作，把生物化学引进了遗传学，推导出“一个基因一种酶”的新概念（后来有所修改），40年代中期被普遍承认，从而建立了生物化学、遗传学。

有两项研究成果促进了分子生物学的发展。

一项是由德国移居美国的物理学家M.德尔布吕克和其同事们在1946年发现不同种的噬菌体在一定条件下能进行基因交换重组。

另一项是，1946～1947年，美国微生物学家J.莱德伯格同E.L.塔特姆合作，以大肠杆菌为材料，也发现了基因分离和重组现象。

这两项突破以及他们对噬菌体和大肠杆菌的一些基本研究，对分子生物学的发展起了十分重要的作用。

1944年，美国细菌学家O.T.埃弗里发现DNA是不同种的肺炎双球菌之间的转化因子。

第一次证明 DNA携带着遗传信息。

这一十分重要的成果却引起很大争论，一方面受传统思想的影响，很多人怀疑他所分离出的DNA不纯，可能还是混杂的蛋白质在起作用；但是这一成就无疑地也刺激了人们对DNA化学组成和晶体结构的研究。

1953年4月25日在英国的《自然》杂志上刊登了美国的J.D.沃森和英国的F.H.C.克里克在英国剑桥大学合作的结果──DNA 双螺旋结构的分子模型。

这一成就后来被誉为20世纪以来生物学方面最伟大的发现，也被认为是分子生物学诞生的标志。

50年代在蛋白质的结构分析方面也取得了重要成果。

英国生物化学家F.桑格第一次分析出含有51个氨基酸的胰岛素的氨基酸顺序。

这一成果对准确地研究蛋白质本身结构和功能之间的关系，以及蛋白质的人工合成和蛋白质的生物合成都是必要的基础。

到1973年已有300多种蛋白质的氨基酸被分析清楚。

1977年F.桑格又建立了DNA碱基顺序的分析方法并完成了分析φχ174噬菌体DNA的全部约5400个碱基的顺序，促进了基因调节控制的研究。

至于蛋白质晶体结构分析，则建立在英国的布口刺格父子及他们的学生创立并发展的X射线晶体衍射技术的基础上。

该实验室的M.F.佩鲁茨自30年代末开始，就系统地研究了血红蛋白的结构。

1969年完成了全部64种密码的破译。

至此，基因控制蛋白质合成之谜得到了初步解答。

遗传密码的破译，被认为是分子遗传学发展史上最辉煌的成果之一。

1961年法国细胞遗传学家F.雅各布和J.莫诺德共同合作，提出了乳糖操纵子理论，以后被证实为在原核细胞中基因控制的普遍方式。

美国分子生物学家H.M.特明和D.巴尔的摩长期从事肿瘤病毒研究的基础上，于1970年分别独立地发现鸡肉瘤病毒和白血病病毒都是RNA病毒。

在此基础上他们发现了依赖于RNA的DNA聚合酶即反转录酶。

反转录酶能使RNA链上的遗传密码反转录给DNA。

这一发现不仅对某些肿瘤的病因作了分子生物学的阐明，而且动摇了中心法则的不可逆性，成为中心法则的重要补充。

真核细胞内的调控机制要复杂得多，也是当前生物学家重点探索的问题之一。

在此基础之上，分子生物学发展的速度越来越快。

第2，3章核酸及基因的结构和功能习题

一选择题

1.一分子DNA核苷酸可能有下列哪一项组成:

A›核糖,磷酸基团,和腺嘌呤.B›磷酸基团,脱氧核糖,和胞嘧啶.

C›尿嘧啶,磷酸基团和脱氧核糖.D›胸腺嘧啶,脱氧核糖,和羟基

2. 下列哪一项最准确地代表了细胞中遗传信息的组织水平 

A›基因→核苷酸→染色体→基因组B›基因组→基因→核苷酸→染色体.

C›染色体→基因→核苷酸→基因组 D› 核苷酸→基因→染色体→基因组

3.真核细胞和原核细胞的差别在于只有前者含有

A›核糖体B›细胞质C›DNA.D› 细胞核

4.下面那种原核生物是多种遗传学研究的研究对象?

A›酿酒酵母B›粗糙脉孢菌C›大肠杆菌D› 果蝇

5.下列哪一元素不会在DNA分子中发现？

A›C.B›S.C›N.D› O.

6.下列哪一项只在RNA中存在，而不会在DNA分子中出现？

A›P.B›腺嘌呤.C›核糖.D› 胞嘧啶.

7.DNA分子中的两条多核苷酸链是依赖于哪一种类型的化学键结合在一起的？

A›磷酸二酯键.B›磷酸盐.C›肽键.D› 氢键.

8.组成细菌染色体的DNA形态是

A›单链.B›环状和超螺旋.C›和组蛋白组合在一起.D› 上面全是.

9.下面哪一种是DNA分子碱基对?

A›A-T.B›T-C.C›A-U.D› G-T.

10.下面哪一种是RNA分子碱基对?

A›A-T.B›A-C.C›U-C.D›U-A.

11.在真核生物的染色体中，DNA和组蛋白组成的结构称为

A›proteosomes.蛋白体B›nucleosomes.核小体C›telomeres.端粒D›centromeres.着丝粒

12.在转化试验过程中，弗雷德里克•格里菲斯观察到致病的肺炎荚膜链球菌菌株形成___菌落

A›光滑,有光泽的B›粗燥,干燥C›异常大的D›不寻常的颜色

13.病毒基因组的可能组成是

A›仅由RNA组成.B›仅由DNA组成.C›RNA或DNA.D›RNA和DNA.

14.Hershey和Chase利用混合实验得出的主要结论是

A›单基因指导单个多肽的合成.B›DNA是遗传物质.C›DNA是双螺旋链.D›遗传物质定位在细胞核内

15.在活细胞中最普遍存在的DNA构型是

A›A.B›B.C›C.D›Z

16.基因位于真核生物染色体___区域时最有可能被转录?

A›着丝粒.B›端粒.C›常染色质D›异染色质

17.核苷的基本组成是

A›戊糖和含N碱基.B›磷酸基团和含N碱基.C›戊糖和磷酸基团.D›戊糖,磷酸基团和含N碱基

18. 原核生物染色体大多包含

A›只有DNA单一序列.B›只有DNA重复序列

C›DNA单一序列或DNA重复序列D›DNA单一序列或DNA重复序列

19.制备某生物染色体组,___时期的染色体被铺在载玻片上并染色.

A›间期.B›末期.C›分裂中期D›后期

20研究发现一条从一未知微生物中发现的染色体中只含有单一序列DNA,那么这一未知生物最有可能是

 A›病毒B›细菌.C›真菌D›原生动物.  

21.在真核生物中,遗传物质存在于什么细胞器?

A›核糖体B›细胞核C›内质网.D›细胞质 

22.格里菲斯通过实验将死细菌与活细菌提取物混合后注射到老鼠体内是为了证明（选择正确的答案）

A›DNA是双螺旋连B›真核生物的mRNA和原核生物不同

C›某种因子可以将一种细菌类型转变为另外一种

D›如果帮助细胞存在,细菌可以从热处理中复苏

23.罗莎琳德•富兰克林获得的X射线衍射图像的数据表明（选择正确的答案）

A›DNA是双螺旋结构,每3.4nm重复一次.

B›嘌呤通过氢键和嘧啶连接Purinesarehydrogenbondedtopyrimidines

C›DNA左手螺旋结构

D›DNA被组装成核小体

24.格里菲斯将不同类型的细菌注射到老鼠体内，请根据注射的细菌类型，判断老鼠是存活还是死亡？

a.typeⅡRb.typeⅢSc.heat-killedⅢSd.typeⅡR+heat-killedⅢS

A›活活死死

B›死活死活

C›活死活死

D›死死活活

二填空题

1．基因敲除（Geneknock-out）即是（），它是研究（）的一种反向遗传学方法。

2．（）是与有功能的基因在基因结构的组成上非常相似，却不具表达功能的基因。

3．在原核生物的基因表达调控中，因为没有核膜，（）和（）是耦联的。

4．一个核小体由两拷贝的（），（），（），（）组蛋白，一拷贝组蛋白（），and（）bpofDNA.

三简答题

1．从化学（键）的角度，说明双链DNA比较稳定的原因

2．Chargaff规则的内容是什么？

3．使DNA超螺旋化需要能量，并可使生物学事件有序进行。

超螺旋中的能量的主要用于哪两种生化作用？

4．YouhaveisolatedaplasmidDNAthatisaclosedcircularmolecular1050bpinlengthwith5negativesupercoils.Whatarethelinkingnumber,helicalturns,writhe,andsuperhelicaldensity?

你分离出的质粒DNA为1050bp长度的共价闭合环状分子，具5个负超螺旋。

请问这个DNA分子的连接数（L）、螺旋数（缠绕数T）、扭曲数（W）、以及超螺旋密度是多少？

5．什么是假基因？

你如何识别出假基因？

6.在真核细胞中，DNA被包装成染色质，其重复单元为核小体。

（1）每个核小体单元是由什么组成的？

（2）DNA被包装后，对转录会产生怎样的影响后果？

7．在核小体中，每个组蛋白二聚体分别由哪几种组蛋白组成？

8．通过对DNA晶体的X-射线衍射分析，鉴定出了DNA的不同形式。

DNA分子的二级结构存在三种不同的构型即A-DNA、B-DNA、Z-DNA，每一种构型各有其独特的分子特征。

（1）在活的生物细胞中，普遍存在的分子构型是哪一种？

（2）Z-DNA与B-DNA相比，每圈螺旋含有较多的碱基对数，请进一步说明Z-DNA的结构特点，在活的生物细胞中，Z-DNA具有怎样的功能？

（3）在活的生物细胞中，哪一种构型没被发现。

9．Benzer用一般遗传学方法测出T4噬菌体rⅡ突变型的一个cistron中含有许多个突变子（或重组子）并且指出一个突变子的大小是1-3个核苷酸，后来证明这是科学上的一个惊人的预见。

请回答：

（1）他的工作对基因概念的发展有何意义?

（2）你能说出在当时的条件下（没有DNA序列分析技术，遗传密码还没发现）用什么样的研究方案能得出一个突变子是1~3个核苷酸的结论。

10．比较基因组的大小和基因组复杂性的不同：

一个基因组有两个序列，一个是A，另一个是B，各有2000bp长。

其中一个是由400bp的序列重复5次而组成，另一个则由50bp的序列重复40次而组成，请问：

（1）这个基因组的大小怎样？

（2）这个基因组的复杂性如何？

11．我们有什么证据表明在DNA分子的螺旋构型中，在每一个碱基对中都含有一个嘌呤碱基和一个嘧啶碱基？

12．Watson和Crick在其他研究者成果的基础上提出了DNA双螺旋模型，这些研究成果可以划分为两类即DNA的化学组成与DNA的物理结构。

请详细阐述这两类研究成果的具体结论。

13．Hershey-Chase所做的噬菌体转染实验中，为什么32P只标记在DNA分子中，而35S只标记在蛋白质的外壳上？

如果用35S标记的噬菌体去感染细菌，那么在子代病毒中是否会出现带35S标记的病毒？

如果是用32P标记的噬菌体重复实验，那么在子代病毒中是否可以找到带32P标记的病毒？

第2，3章核酸及基因的结构和功能答案

一选择题

1.✓B›2. ✓D› 3.✓D› 4.✓C›5.✓B›6..✓C›7.✓D› 8.✓B›9.✓A›10.✓D›11.✓B›

12.✓A›13.✓C›14.✓B›15.✓B›16.✓C›17.✓A›18.✓A›19.✓C›20✓B›21.✓B›22.✓C›

23.✓A›24.✓C›

二填空题

1．（将特定基因失活的过程），基因功能）

2．（假基因‘pseudogene’）

3．，（转录）和（翻译）

4．（H2A），（H2B），（H3），（H4）（H1），（200

三简答题

1．

答案：

碱基之间的氢键以及疏水的碱基堆积力。

2．

答案：

在双螺旋DNA结构中,A%=T%和G%=C%.腺嘌呤和胸腺嘧啶的摩尔数相等，即A=T；鸟嘌呤和胞嘧啶的摩尔数相等，即G=C；含氨基的碱基（A和C）总数等于含酮基的碱基（G和T）总数，即A+C=G+T；嘌呤的总数等于嘧啶的总数，即A+G=C+T。

3．

答案:

超螺旋中的能量可以使双链分开,用于以下DNA复制和DNA转录两种反应

4．

答案：

Writhe=W=-5；helicalturns=T=1050/10.5=100；L=T+W=100+（-5）=95

Superhelicaldensity=σ=W/T=-5/100=-0.05

5．

答案：

假基因是指与正常基因结构相似，但丧失正常功能的DNA序列，即不能翻译出有功能蛋白质的基因。

canberecognizedbytheoccurrenceofoneormoremutationsthatobviouslyrenderthemnon-functional.可以利用补偿其功能的突变体而区分出假基因。

6.

答案：

每个核小体单元由146bp核心DNA和各两分子的组蛋白H2A、H2B、H3、H4组成的八聚体构成。

（2）DNA被包装成染色质结构后，会抑制转录。

因为这一结构能够阻止转录机构及转录因子与DNA之间的相互接近。

7．

答案：

H组蛋白H3和H4形成一个二聚体；组蛋白H2A和H2B形成另一个二聚体。

8．

答案：

（1）B-DNA是活细胞中DNA的普遍存在形式。

（2）与B-DNA相比，双螺旋链Z-DNA比较长而且细,并且是左手螺旋结构。

轴贯穿小沟，每个螺旋有12个碱基，和轴的垂直平面呈8.8°夹角；相比较，B-DNA的轴贯穿碱基，每个螺旋只有10个碱基，和轴的垂直平面呈2°夹角.Z-DNA的大沟不太明显，因为沟很细而且和较平，但B-DNA的大沟很宽而且较深（介于A-DNA和Z-DNA之间）。

Z-DNA的小沟及其窄且深，B-DNA的小沟较窄且深度中等。

推测含有Z-DNA的区域将提供左手螺旋的伸展，可以参与到DNA的复制，重组和转录。

左手螺旋的伸张将帮助在这些过程中B-DNA区域解螺旋。

Z-DNA在极端的环境条件下能够更加稳定。

A-DNA只在DNA处于脱水状态下才被发现。

所以在活细胞中不会被发现。

9．

答案：

基因是DNA分子中含有特定遗传信息的一段核苷酸序列，是遗传物质的最小功能单位。

基因内可以较低频率发生基因内的重组，交换。

通过大量的成对突变型的杂交，测得其最小的重组频率为0.02%，即0.02个遗传图距。

已知T4噬菌体的基因组是1.8×105bp，其长度为1500个图距单位。

因此可求算出0.02个遗传图距相当于多少核苷酸：

1.8×105÷1500×0.02=2.4bp

因此指出一个突变子是1-3个核苷酸，暗示了三联体密码的存在。

10．

答案：

基因组的大小是指在基因组中DNA的总量。

复杂性是指基因组中所有单一序列的总长度。

（1）这个基因组的大小为4000bp；

（2）这个基因组的复杂性为450bp

11．

答案：

.有两方面的证据支持在DNA分子的螺旋构型中，每一个碱基对中都含有一个嘌呤碱基和一个嘧啶碱基

（1）化学成分分析：

当Chargaff对多种有机体的双螺旋DNA链的化学成分进行定量分析时发现，嘌呤碱和嘧啶键的含量相同；进一步分析发现腺嘌呤和胸腺嘧啶的含量相等；鸟嘌呤和胞嘧啶的含量相等。

解释这一发现的最简单的假说是互补碱基配对的存在，即一条链上的A和另一条链上的T配对,G和C配对.

（2）X-衍射分析：

更直接的证据来自于X-衍射分析。

通过分析建立了DNA双螺旋结构的外形尺寸，可以来分析已知大小碱基的配对关系。

双螺旋结构的直径是2nm，刚好容纳一个嘧啶和一个嘌呤配对,而对于嘌呤-嘌呤配对则太小，对嘧啶-嘧啶配对则太大。

12．

答案：

化学组成即DNA碱基组成的Chargaff规则：

腺嘌呤和胸腺嘧啶的摩尔数相等，即A=T；鸟嘌呤和胞嘧啶的摩尔数相等，即G=C；含氨基的碱基（A和C）总数等于含酮基的碱基（G和T）总数，即A+C=G+T；嘌呤的总数等于嘧啶的总数，即A+G=C+T。

DNA的碱基组成具有生物种的特异性。

物理结构：

DNA分子是由核苷酸组成，核苷酸有含氮的碱基、戊糖、磷酸构成。

根据富兰克林和威尔金斯的x射线衍射图像表明：

DNA分子是一个十分有序的双螺旋结构，每两个相邻碱基平面的垂直距离是3.4Å，每个螺旋包含10个碱基对。

13．

答案：

因为DNA分子中含大量磷酸基团，不含硫；而蛋白质中部分氨基酸含硫，但都不含磷，所以32P只标记在DNA分子中，而35S只标记在蛋白质的外壳上。

如果用35S标记的噬菌体去感染细菌，那么在子代病毒中不会出现带35S标记的病毒。

因为噬菌体感染细菌时其蛋白质外壳并不进入细菌体内，子代噬菌体的蛋白质外壳是在细菌体内新合成的，因此不带标记。

如果用32P标记的噬菌体去感染细菌，那么在子代病毒中会出现带35P标记的病毒。

因为噬菌体感染细菌时其核酸部分进入细菌体内，并作为遗传物质传给子代噬菌体，因此在子代噬菌体可以找到带35P标记的病毒。

第4章DNA复制习题

一选择题

1.以大肠杆菌DNA为研究对象，Meselson和Stahl通过实验证明DNA复制是

A›全保留.B›半保留.C›加倍D› 分散.

2.已知DNA的复制方式，那么组成DNA双螺旋的两条链分别是

A›一条母链和一条子链.B›两条母链和两条子链.

C›新合成的两条子链间隔分布着母链strands.D›两条新合成的链 

3.DNA聚合酶的功能是

A›以DNA为模板合成DNAB›以DNA为模板合成RNA

C›以RNA为模板合成DNAD›以RNA为模板合成RNA

4.为了能够起始DNA的复制，一段短的___引物必须预先合成

A›DNAB›RNAC›多肽D›组蛋白

5.在大肠杆菌中，哪一种DNA聚合酶对新合成的DNA具有校正功能，能把错配的碱基移去？

A›只有DNA聚合酶IB›只有DNA聚合酶III

C›DNA聚合酶I和IIID›所有三种DNA聚合酶都含有校正功能

6.在DNA合成过程中,所有DNA聚合酶以什么方向添加核苷酸?

A›从左到右B›从3’到5’C›从5’到3’D›每次合成不止一个方向

7.在真核生物中,DNA复制在细胞周期的哪一期?

A›SB›G1C›G2D›M

8.下面那一项对DNA合成反应不是必须的?

A›dCTPsB›模板DNAC›DNA聚合酶D›钙离子

9.DNA聚合酶催化下面哪两个基团间形成磷酸二酯键

A›5’磷酸anda5’羟基基团.B›3’磷酸anda5’羟基基团.

C›5’磷酸anda3’羟基基团.D›3’磷酸anda3’羟基基团.

10.如果一条链上的核苷酸序列为5’-CCACTGG-3’,则另一条互补链上的DNA序列是?

A›5’-CCACTGG-3’B›3’-CCACTGG-5’

C›5’-GGT