完整word版细菌分类.docx

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完整word版细菌分类

环丝菌属（Brochothrix）李斯特氏菌属（Listeria）（Paenibacillaceae）（Ammoniphilus）（Aneurinibacillus）（Brevibacillus）（Cohnella）（Oxalophagus）（Paenibacillus）（Thermicanus）（Thermobacillus）（Planococcaceae）（Filibacter）（Kurthia）（Planococcus）（Planomicrobium）（Sporosarcina）芽孢乳杆菌科（Sporolactobacillaceae）（Marinococcus）（Sinococcus）

芽孢乳杆菌属（Sporolactobacillus）

（Tuberibacillus）

葡萄球菌科（Staphylococcaceae）孪生菌属（Gemella）（Joetgalicoccus）

（Macrococcus）

（Salinicoccus）

葡萄球菌属（Staphylococcus）

（Thermoactinomycetaceae）

（Laceyella）

（Mechercharimyces）

（Planifilum）

（Seinonella）

（Shimazuella）

（Thermoactinomyces）

（Thermoflavimicrobium）

（Turicibacteraceae）

（Turicibacter）科未定（Pullulanibacillus）乳杆菌目（Lactobacillales）气球菌科（Aerococcaceae）（Abiotrophia）气球菌属（Aerococcus）

（Dolosicoccus）（Eremococcus）（Facklamia）（Globicatella）（Ignavigranum）肉杆菌科（Carnobacteriaceae）（Agitococcus）（Alkalibacterium）（Allofustis）

（Alloiococcus）（Atopococcus）（Atopostipes）肉杆菌属（Carnobacterium）德库菌属（Desemzia）（DSM，Z德国微生物与细胞保藏中心）（Dolosigranulum）（Granulicatella）

（Isobaculum）（Lactosphaera）（Marinilactibacillus）（Trichococcus）肠球菌科（Enterococcaceae）（Atopobacter）（Catellicoccus）肠球菌属（Enterococcus）（Melissococcus）（Pilibacter）（Tetragenococcus）漫游球菌属（Vagococcus）乳杆菌科（Lactobacillaceae）乳杆菌属（Lactobacillus）（Paralactobacillus）片球菌属（Pediococcus）明串珠菌科（Leuconostocaceae）明串珠菌属（Leuconostoc）（Oenococcus）（Weissella）颤螺旋菌科（Oscillospiraceae）颤杆菌克（Oscillibacter）颤螺旋菌属（Oscillospira）链球菌科（Streptococcaceae）乳球菌属（Lactococcus）（Lactovum）链球菌属（Streptococcus）科未定

（Acetoanaerobium）

互营球菌属（Syntrophococcus）

梭菌纲（Clostridia）梭菌目（Clostridiales）梭菌科（Clostridiaceae）（Acetanaerobacterium）（Acetivibrio）（Acidaminobacter）（Alkaliphilus）（Anaerobacter）（Anaerotruncus）（Anoxynatronum）（Bryantella）（Caloramator）（Caloranaerobacter）（Caminicella）（Clostridiisalibacter）梭菌属（Clostridium）（Coprobacillus）（Dorea）（Ethanoligenens）（Faecalibacterium）（Fastidiosipila）（Garciella）（Gracilibacter）（Guggenheimella）（Hespellia）（Natronincola）（Oxobacter）（Parasporobacterium）八叠球菌属（Sarcina）（Soehngenia）（Sporacetigenium）（Sporobacter）（Subdoligranulum）（Tepidibacter）（Tepidimicrobium）（Thermobrachium）（Thermohalobacter）（Tindallia）优杆菌科（Eubacteriaceae）醋杆菌属（Acetobacterium）（Alkalibacter）

（Anaerofustis）

（Anaerovorax）优杆菌属（Eubacterium）（Mogibacterium）（Pseudoramibacter）太阳杆菌科（Heliobacteriaceae）太阳杆状菌属（Heliobacillus）太阳杆菌属（Heliobacterium）嗜日菌属（Heliophilum）（Heliorestis）毛螺旋菌科（Lachnospiraceae）（Acetitomaculum）（Anaerofilum）（Anaerostipes）丁酸弧菌属（Butyrivibrio）（Catenibacterium）（Catonella）粪球菌属（Coprococcus）（Johnsonella）（Lachnobacterium）毛螺旋菌属（Lachnospira）（Moryella）

（Oribacterium）假丁酸弧菌属（Pseudobutyrivibrio）（Roseburia）

瘤胃球菌属（Ruminococcus）（Shuttleworthia）（Sporobacterium）消化球菌科（Peptococcaceae）（Carboxydothermus）（Cryptanaerobacter）（Dehalobacter）（Desulfitobacterium）（Desulfonispora）（Desulfosporosinus）（Desulfotomaculum）（Pelotomaculum）消化球菌属（Peptococcus）（Syntrophobotulus）（Thermincola）（Thermoterrabacterium）消化链球菌科（Peptostreptococcaceae）（Anaerococcus）

（Filifactor）

（Finegoldia）（Fusibacter）（Gallicola）（Helcococcus）微单胞菌属（Parvimonas）（原名Micromonas）（Peptoniphilus）消化链球菌属（Peptostreptococcus）（Sedimentibacter）（Sporanaerobacter）（Tissierella）互营单胞菌科（Syntrophomonadaceae）（Aminiphilus）（Aminobacterium）

（Aminomonas）（Anaerobaculum）（Anaerobranca）（Caldicellulosiruptor）（Carboxydocella）（Dethiosulfovibrio）（Pelospora）互营单胞菌属（Syntrophomonas）（Syntrophospora）互营热菌属（Syntrophothermus）（Thermaerobacter）（Thermanaerovibrio）（Thermohydrogenium）（Thermosyntropha）（Thermovirga）韦荣氏菌科（Veillonellaceae）（Acetonema）氨基酸球菌属（Acidaminococcus）（Allisonella）（Anaeroarcus）（Anaeroglobus）（Anaeromusa）（Anaerosinus）（Anaerovibrio）（Centipeda）（Dendrosporobacter）（Dialister）（Megamonas）（Megasphaera）光冈菌属（Mitsuokella）（Papillibacter）

（Natranaerobiales）

（Natranaerobiaceae）

（Natranaerobius）（Thermoanaerobacteriales）（Thermoanaerobacteriaceae）

（Pectinatus）（Pelosinus）（Phascolarctobacterium）（Propionispira）（Propionispora）（Quinella）（Schwartzia）新月形单胞菌属（Selenomonas）鼠孢菌属（Sporomusa）（Sporotalea）（Succiniclasticum）（Succinispira）（Thermosinus）韦荣氏菌属（Veillonella）（Zymophilus）科未定（Anaerovirgula）（Dethiosulfatibacter）（Geosporobacter）（Howardella）（Proteiniborus）盐厌氧菌目（Halanaerobiales）盐厌氧菌科（Halanaerobiaceae）盐厌氧菌属（Halanaerobium）（Halocella）（Haloincola）（Halothermothrix）盐拟杆菌科（Halobacteroidaceae）（Acetohalobium）（Halanaerobacter）盐拟杆菌属（Halobacteroides）（Halonatronum）（Natroniella）（Orenia）（Selenihalanaerobacter）（Sporohalobacter）盐碱厌氧菌目盐碱厌氧菌科盐碱厌氧菌属热厌氧杆菌目热厌氧杆菌科

（Acetogenium）（Ammonifex）（Caldanaerobacter）

（Carboxydibrachium）

（Coprothermobacter）（Desulfovirgula）（Gelria）

（Mahella）（Moorella）（Sporotomaculum）（Tepidanaerobacter）（Thermacetogenium）热厌氧单胞菌属（Thermanaeromonas）（Thermoanaerobacter）（Thermoanaerobium）（Thermoanaerobacterium）热厌氧菌属（Thermoanaerobium）（Thermobacteroides）（Thermosediminibacter）（Thermovenabulum）

热脱硫菌科（Thermodesulfobiaceae）热脱硫菌属（Thermodesulfobium）目未定

（Desulfitibacter）（Symbiobacterium）

热石杆菌纲（Thermolithobacteria）热石杆菌目（Thermolithobacterales）热石杆菌科（Thermolithobacteraceae）

热石杆菌属（Thermolithobacter）

梭杆菌门（Fusobacteria）

梭杆菌纲（Fusobacteria）梭杆菌目（Fusobacteriales）梭杆菌科（Fusobacteriaceae）梭杆菌属（Fusobacterium）（Ilyobacter）

纤毛菌属（Leptotrichia）（Propionigenium）（Sebaldella）

（Sneathia）

（Streptobacillus）科未定

（Cetobacterium）

芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）

芽单胞菌纲（Gemmatimonadetes）芽单胞菌目（Gemmatimonadales）芽单胞菌科（Gemmatimonadaceae）芽单胞菌属（Gemmatimonas）

黏胶球形菌门

（Lentisphaerae）

（Lentisphaerae）

（Lentisphaerales）

黏胶球形菌纲

黏胶球形菌目

黏胶球形菌科（Lentisphaeraceae）黏胶球形菌属（Lentisphaera）食物谷菌目（Victivallales）食物谷菌科（Victivallaceae）食物谷菌属（Victivallis）

硝化螺旋菌纲硝化螺旋菌目硝化螺旋菌科

（Nitrospira）

（Nitrospirales）

（Nitrospiraceae）钩端螺菌属（Leptospirillum）硝化螺旋菌属（Nitrospira）磁杆菌属（Magnetobacterium）*热脱硫弧菌属（Thermodesulfovibrio）

浮霉菌门（Planctomycetes）

浮霉菌纲（Planctomycetacia）浮霉菌目（Planctomycetales）浮霉菌科（Planctomycetaceae）（Blastopirellula）

（Gemmata）（Isosphaera）小梨形菌属（Pirellula）浮霉菌属（Planctomycetes）红小梨形菌属（Rhodopirellula）（Schlesneria）

科未定（均未能分离培养，见厌氧氨氧化菌）（Brocadia）*

（Kuenenia）*（Scalindua）*

海绵杆菌门（Poribacteria）*

变形菌门（Proteobacteria）a-变形菌纲（Alphaproteobacteria）

柄杆菌目（Caulobacterales）柄杆菌科（Caulobacteraceae）（Asticcacaulis）

短波单胞菌属（Brevundimonas）柄杆菌属（Caulobacter）

苯基杆菌属（Phenylobacterium）（Kordiimonadales）（Kordiimonadaceae）

（Kordiimonas）

短小盒菌目（Parvularculales）短小盒菌科（Parvularculaceae）短小盒菌属（Parvularcula）根瘤菌目（Rhizobiales）橙单胞菌科（Aurantimonadaceae）橙单胞菌属（Aurantimonas）（Fulvimarina）

（Martelella）

巴通体科（Bartonellaceae）巴通体属（Bartonella）（Grahamella）

（Rochalimaea）

拜叶林克氏菌科（Beijerinckiaceae）拜叶林克氏菌属（Beijerinckia）（Chelatococcus）

（Methylocapsa）

（Methylocella）慢生根瘤菌科（Bradyrhizobiaceae）阿菲波菌属（Afipia）

农单胞菌属（Agromonas）（Balneimonas）

芽生杆菌属（Blastobacter）

（Bosea）

慢生根瘤菌属（Bradyrhizobium）硝化杆菌属（Nitrobacter）（Oligotropha）

（Rhodoblastus）

红假单胞菌属（Rhodopseudomonas）

布鲁氏菌科（Brucellaceae）布鲁氏菌属（Brucella）（Crabtreella）

（Daeguia）支动菌属（Mycoplana）苍白杆菌属（Ochrobactrum）

（Pseudochrobactrum）

黏着杆菌科（Cohaesibacteraceae）黏着杆菌属（Cohaesibacter）生丝微菌科（Hyphomicrobiaceae）（Ancalomicrobium）（Angulomicrobium）水杆菌属（Aquabacter）芽绿菌属（Blastochloris）（Devosia）

（Dichotomicrobium）（Filomicrobium）

（Gemmiger）

生丝微菌属（Hyphomicrobium）（Methylorhabdus）

土微菌属（Pedomicrobium）突柄微菌属（Prosthecomicrobium）红微菌属（Rhodomicrobium）（Rhodoplanes）

（Seliberia）

甲基杆菌科（Methylobacteriaceae）（Meganema）

甲基杆菌属（Methylobacterium）

（Microvirga）

（Protomonas）

甲基孢囊菌科（Methylocystaceae）（Albibacter）

甲基孢囊菌属（Methylocystis）（Methylopila）

（Methylosinus）（Pleomorphomonas）（Terasakiella）叶杆菌科（Phyllobacteriaceae）（Aminobacter）

（Aquamicrobium）

（Defluvibacter）

（Hoeflea）

中慢生根瘤菌属（Mesorhizobium）（Nitratireductor）

叶杆菌属（Phyllobacterium）（Pseudaminobacter）根瘤菌科（Rhizobiaceae）土壤杆菌属（Agrobacterium）异根瘤菌属（Allorhizobium）嗜碳菌属（Carbophilus）螯合杆菌属（Chelatobacter）剑菌属（Ensifer）

（Kaistia）韧皮杆菌属（Liberibacter）*根瘤菌属（Rhizobium）中华根瘤菌属（Sinorhizobium）红菌科（Rhodobiaceae）（Anderseniella）（Parvibaculum）红菌属（Rhodobium）玫瑰螺菌属（Roseospirillum）黄色杆菌科（Xanthobacteraceae）（Ancylobacter）（Azorhizobium）

（Labrys）

（Pseudolabrys）

（Starkeya）黄色杆菌属（Xanthobacter）科未定

（Sneathiella）

红杆菌目（Rhodobacterales）生丝单胞菌科（Hyphomonadaceae）（Hirschia）

生丝单胞菌属（Hyphomonas）（Maricaulis）

（Oceanicaulis）（Robiginitomaculum）红杆菌科（Rhodobacteraceae）（Ahrensia）

（Albidovulum）（Amaricoccus）（Antarctobacter）（Catellibacterium）（Citreicella）

（Citreimonas）（Dinoroseobacter）（Donghicola）（Gemmobacter）（Haematobacter）（Jannaschia）（Ketogulonicigenium）（Labrenzia）

（Leisingera）（Loktanella）

（Maribius）（Marinovum）（Maritimibacter）（Methylarcula）（Nereida）（Nesiotobacter）（Oceanibulbus）海洋生菌属（Oceanicola）（Octadecabacter）（Palleronia）（Pannonibacter）副球菌属（Paracoccus）（Pelagibaca）（Phaeobacter）假红杆菌属（Pseudorhodobacter）（Pseudovibrio）（Rhodobaca）红杆菌属（Rhodobacter）（Rhodothalassium）小红卵菌属（Rhodovulum）（Roseibacterium）（Roseibium）（Roseicyclus）（Roseinatronobacter）（Roseisalinus）（Roseivivax）玫瑰杆菌属（Roseobacter）（Roseovarius）（Rubellimicrobium）（Rubrimonas）（Ruegeria）

（Sagittula）（Salipiger）（Shimia）（Silicibacter）（Staleya）（Stappia）（Sulfitobacter）（Tateyamaria）（Thalassobacter）（Thalassobius）（Thalassococcus）（Thioclava）硫球形菌属（Thiosphaera）

（Wenxinia）

木洞菌属（Woodsholea）杨氏菌属（Yangia）红螺菌目（Rhodospirillales）醋杆菌科（Acetobacteraceae）醋杆菌属（Acetobacter）（Acidicaldus）嗜酸菌属（Acidiphilium）酸球形菌属（Acidisphaera）酸胞菌属（Acidocella）酸单胞菌属（Acidomonas）（Asaia）

（Belnapia）脆弱球菌属（Craurococcus）葡糖醋杆菌属（Gluconacetobacter）葡糖杆菌属（Gluconobacter）（Granulibacter）

（Kozakia）鼠球菌属（Muricoccus）（Neoasaia）

（Paracraurococcus）红球状菌属（Rhodopila）（Rhodovarius）玫瑰球菌属（Roseococcus）玫瑰单胞菌属（Roseomonas）（Rubritepida）

（Saccharibacter）

（Stella）

（Swaminathania）（Teichococcus）（Zavarzinia）红螺菌科（Rhodospirillaceae）固氮螺菌属（Azospirillum）（Conglomeromonas）（Defluviicoccus）

（Inquilinus）磁螺菌属（Magnetospirillum）（Phaeospirillum）

（Rhodoc