现代分子生物学名词解释朱玉贤.docx
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现代分子生物学名词解释朱玉贤
ABC模型:
即控制花形态发生的模型。
该模型把四轮花器官同时发生作为基本前提,强调花形态突变体产生不同花器官的生理位置变化。
该模型中正常花的四轮结构的形成是由三组基因A、B、C共同作用完成的,每一轮花器官特征的决定分别依赖于A、B、C三组基因中的一组或两组基因的正常表达oA组基因控制萼片、花瓣的发育,B组基因控制花瓣、雄蕊的发育,C组基因控制雄蕊、心皮的发育oA、C组基因互相拮抗,抑制对方在自身所控制的区域中表达,如其中任何一组或更多的基因发生突变而丧失功能,花的形态就出现异常。
AP位点(APsite):
所有细胞中都带有不同类型、能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。
cDNA(complementaryDNA):
在体外以mRNA为模板,利用反转录酶和DNA聚合酶合成的一段双链DNA。
C值(Cvalue):
通常是指一种生物单倍体基因组DNA的总量,以每细胞内的皮克(pg)数表示。
C值反常现象(Cvaluedox):
也称C值谬误。
指C值往往与种系的进化复杂性不一致的现象,即基因组大小与遗传复杂性之间没有必然的联系,某些较低等的生物C值却很大,如一些两柄动物的C值甚至比哺乳动物还大。
Dane颗粒:
HBV完整颗粒的直径为42nm,称为Dane颗粒,由外膜和核壳组成,有很强的感染性。
DNA(deoxyribonucleicacid):
脱氧核糖核酸,是世界上所有已知高等真核生物和绝大部分低等生物的遗传物质。
DNA的半保留复制(semi-conservativereplication):
DNA在复制过程中,每条链分别作为模板合成新链,产生互补的两条链。
这样新形成的两个DNA分子与原来DNA分子的碱基顺序完全一样。
因此,每个子代分子的一条链来自亲代DNA,另一条链则是新合成的,这种复制方式被称为DNA的半保留复制。
DNA的半不连续复制(serru-cliscontinuousreplication):
DNA复制过程中前导链的复制是连续的,而另一条链,即后随链的复制是中断的、不连续的。
DNA甲基化:
CpG二核苷酸(CpG岛)通常成串出现在DNA上,在甲基转移酶的作用下,胞嘧啶(C)的第5位碳原子能被修饰加上甲基oDNA甲基化除形成5-甲基胞嘧啶(5-mC)之外,还能产生少量的N6甲基腺嘌呤(N6-mA)及7-甲基鸟嘌呤。
DNA聚合酶(DNApolymerase):
一种催化由脱氧核糖核苷三磷酸合成DNA的酶。
因为它以DNA为模板,所以又被称为依赖于DNA的DNA聚合酶。
不同种类的DNA聚合酶可能参与DNA的复制和/或修复。
DNA酶I超敏感位点:
染色质中特殊的一段长约200bp、甲基化程度较低且对DNaseI高度敏感的DNA序列,一般在转录起始点附近或者相关部位。
DNA拓扑异构酶(DNAtopoisomerase):
能在闭环DNA分子中改变两条链的环绕次数的酶,它的作用机制是首先切断DNA,让DNA绕过断裂点以后再封闭形成双螺旋或超螺旋DNA。
DNA重组技术(recombinantDNAtechnology):
又称基因工程(geneticen-gineering),将不同的DNA片段(如某个基因或基因的一部分)按照预先的设计定向连接起来,在特定的受体细胞中与载体同时复制并得到表达,产生影响受体细胞的新的遗传性状的技术。
GU—AG法则(GU-AGrule):
多数细胞核mRNA前体中内含子的5,边界序列为GU,3’边界序列为AGc因此,GU表示供体衔接点的5,端,AG代表接纳体衔接点的3’端序列。
习惯上,把这种保守序列模式称为GU-AG法则。
HLA:
即人类白细胞抗原,是受遗传控制的个体特异性抗原,广泛分布于皮肤、肾、脾、肺、肠和心等组织器官有核细胞的细胞膜上,是到日前为止免疫反应中最复杂、最具多态性的体系。
Igo.Ig+.Ig-:
为区分免疫球蛋白基因的各种状态,科学上将未发生重排的种系构型等位基因称为Igo.将发生重排并具备功能表达的等位基因称为Ig',将发生无效蘑排的无活性等位基因称为Ig一。
MADS-box:
在金鱼草、拟南芥等多种植物中存在一个参与花器官发育和分化的基因家族的保守区域,该家族的成员可能参与不同的分化过程。
根据这几个家族基因名称(MCM1、AG、DEFA和SRF)的第一个字母,将该保守区命名为MADS-boxo
N区:
Ig重链基因重排过程中,由于DNA聚合酶或脱氧核酸转移酶的作用,有时会在结合处插入一个脱氧核苷酸,形成所谓“N区”插入序列,致使重链V区重排后形成VHNDHNJH基因单位。
上述重排机制使重链V区变得更为复杂。
P转座子(P-element):
足一种能够诱发杂种不育(hybriddysgenesis)的果蝇转座子,果蝇中几乎所有的杂种不育都是由于P转座子插入基因组W位点而引起的n所有P转座子两翼都有31个碱基的倒置重复序列,P转座子转座导致靶DNA复制产生8碱基正向重复序列。
RACE(rapidamplificationofcDNAends.cDNA末端的快速扩增):
是利用PCR技术在已知部分cDNA序列的基础上特异性克隆其5’端或3’端缺失序列的方法nRAPD(randomamplifiedpolymorphicDNA.
随机扩增的多态性DNA):
用长度为10或II个碱基的单一固定序列作引物扩增基因组DNA.随机获得大小不同的DNA片段。
因其具有种质特异性而常用作遗传学的分子标记。
RFLP(restrIctionfragmentlengthpolymorphism,限制性片段长度多态性:
使用限制性DNA内切酶消化某个DNA分子后出现的长度多样性。
因其具有种质特异性而常用作遗传学的分子标记。
RNA的编辑(RNAediting):
是某些RNA,特别是mRNA前体的一种加T方式,如插入、删除或取代一些核苷酸残基,导致DNA所编码的遗传信息发生改变,因为经过编辑的mRNA序列发生了不同于模板DNA的变化。
RNA的再编码(RNArecoding):
是指RNA编码和读码方式的改变。
RNA干涉(RNAinterference.RNAi):
是利用双链小RNA高效、特异性降解细胞内同源mRNA.从而阻断体内靶基因表达,使细胞出现靶基因缺失表型的方法。
RNA的剪接(RNAspliang):
从mRNA前体分子中切除被称为内含子(in-tron)的非编码区,并使基因中被称为外显子(exon)的编码区拼接形成成熟mRNA的过程就称为RNA的剪接。
RNA聚合酶(RNApolymerase):
使用DNA作为模板合成RNA的酶,也称为DNA依赖性RNA聚合酶。
SARS-CoV:
-种新型冠状病毒,属于冠状病毒科冠状病毒属,是一种大的、有包膜的正链RNA病毒,其基因组由约30000个核苷酸组成,直径约70—140nm,电镜下可见电子,密度致密的核心和围绕的包膜,包膜上有冠状的刺突。
对脂溶剂敏感,戊二醛、甲醛、过氧化氢、表面活性剂、紫外线照射等可使病毒失去感染力。
可导致传染性非典型肺炎(SARS,severeacuterespiratorysyndrome)-严重急性呼吸系统综合症。
SD序列(Shine—Dalgarnosequence):
存在于原核生物起始密码子AUG上游7一12个核苷酸处的一种4—7个核苷酸的保守片段,它与16SrRNA3,端反向互补,所以可将mRNA的AUG起始密码了置于核糖体的适当位置以便起始翻译作用。
根据首次识别其功能意义的科学家命名。
SNP(singlenucleotidepolymorphism):
单核苷酸多态性,指基因组DNA序列中由于单个核苷酸(A,T,C和G)的突变而引起的物种多态性。
T—DNA:
根癌农杆菌Ti(tumorinducing)或Ri(rootinducing)质粒中的一段DNA序列,可以从农杆菌巾转移并稳定整合到植物基因组中,是植物分子生物学中广泛应用的遗传转化载体。
p因子:
是一个相对分子质量为2.Oxl05的六聚体蛋白,它能水解各种核苷三磷酸,是一种NTP酶,它通过催化NTP的水解促使新生RNA链从三元转录复合物中解离出来,从而终止转录。
σ因子(sigmafactor):
是原核生物RNA聚合酶全酶的一个亚基,是聚合酶的别构效应物,帮助聚合酶专~性识别并结合模板链上的启动子,起始基因转录。
A
癌(cancer):
是一种无限制向外周扩散、浸润现象。
癌症患者的主要特征是发病组织或器官的细胞生长分裂失控,并由原发部位向其他部位播散。
如小能控制这种细胞播散,将侵犯要害器官并引起衰竭,最终导致有机体死亡。
安慰性诱导物(gratuitousinducer):
指的是与转录调控中实际诱导物相似的一。
类高效诱导物,但不是该诱导酶的底物。
氨酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNAsynthetase):
是一类催化氨基酸与tRNA相结合的特异性酶。
B摆动假说(wobblehypothesis):
Crick为解释反密码产中某些稀有成分(如I)的配对以及讦多氨基酸有2个以上密码子的问题而提出的假说。
比较基因组学(comparativegenomics):
在基因组图潜和序列分析的基础上,对已知基因和基因组结构进行比较,了解基因的功能、表达调控机制和物种进化过程的学科。
编码链(codingstrand):
指DNA双链中与mRNA序列(除T/U替换外)和方向相同的那条DNA链,又称有意义链(sensestrand)。
表达序列标签(expressedsequencetag.EST):
通过对随机选择的cDNA克隆进行5’或3’端一次测序所获得的核苷酸序列,代表了完整基因的一小部分。
EST-般来源于用特定环境下某个组织总mRNA所构建的cDNA文库,因此EST数量也能在一定程度上说明该组织中各基因的表达水平。
病毒癌基因(v-onc):
一些病毒能引发癌症,原因是病毒基因片段进人被感染者基因组中,导致被感染者自身基因行为发生改变而出现细胞癌变。
科学上,将这种可以引发癌症的病毒基因片段称为“病毒癌基冈”。
病毒载体:
对病毒基因组进行改造后获得的适合H用于基因治疗的载体,主要是删除病毒的致病基因,使其对机体没有致病力,该载体应能携带外源基因、装配成病毒颗粒并介导外源基因的转移和表达。
C操纵子(operon):
是指原核生物中由一个或多个相关基因以及转录翻译调控元件组成的基因表达单元。
插入序列(insertionalsequence.IS:
是最简单的转座子,是细菌的一小段可转座元件,它不含有任何宿主基因而常被称为插入序列,它们是细菌染色体或质粒DNA的正常组成部分。
长末端重复序列LTR):
指反转录病毒基因组两端的长末端重复序列(longterminalrepeats),不编码蛋白质,但含有启动子、增强子等调控元件,病毒基因组的LTR整合到细胞原癌基因邻近处,使这些原癌基因在LTR强启动子和增强子的作用下被激活,将正常细胞转化为肉瘤细胞。
超螺旋(superbelix.supercoil):
双螺旋DNA进一步扭曲盘绕所形成的特定空间结构,是DNA高级结构的主要形式,可分为正超螺旋与负超螺旋两大类。
按DNA双螺旋的相反方向缠绕而成的超螺旋称为负超螺旋,反之,则称为正超螺旋。
所有天然的超螺旋DNA均为负超螺旋。
成对规则基因:
参与果蝇体节精细结构形成的基因,一般以两个体节为单位相互间隔一个副体节表达,其分布具有周期性。
功能是把间隙基因确定的区域进一步分化成体节。
成对规则基因的表达是胚胎出现分节的最早标志之一,沿前一后轴形成一系列斑马纹状的表达条带,把胚胎分为预定的体节。
重叠基因(overlappinggene.nestedgene):
具有部分共用核苷酸序列的基因,即同一段DNA携带了两种或两种以上不同蛋白质的编码信息。
重叠的部分可以在调控区,也可以在结构基因区。
常见于病毒和噬菌体基因组中。
重组种系理论:
是有关生物体为何能产生上百万种Ig分子的假说。
重组种系理论认为.V区和C区不同片段在DNA分子水平上的各种排列组合是形成Ig分子多态的根本原因。
错配修复(mismatchrepair):
是对DNA错配区的修复。
通过母链甲基化原则找出区分母链与子链从而修正子链上错配的碱基。
错义突变(missensemutation):
由于结构基因中某个核苷酸的变化使一种氨基酸的密码变成另一种氨基酸的密码。
D代谢物阻遏效应(cataboliterepression):
有葡萄糖存在时,不论诱导物存在与否,操纵子都没有转录活性,结构基因都不表达。
单倍型(haplotype):
是指位于染色体上某一区域的一组相关联的SNP等位位点。
单核苷酸的多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNPs):
单核甘酸多态性指在基因组中不同个体的DNA序列上的单个碱基差异。
同一位置上的每个碱基类型叫做一个等位位点。
单顺反子mRNA(monocistronicmRNA):
只编码一个蛋白质的mRNA称为单顺反子mRNA。
蛋白激酶:
催化ATP的7一磷酸基团转移到蛋白质分子中的酶。
蛋白质磷酸化:
指由蛋白质激酶催化的把ATP或GTP上γ位的磷酸基转移到底物蛋白质氨基酸残基上的过程,是生物体内一种普遍的调节方式,在细胞信号转导的过程中起重要作用。
蛋白质乙酰化:
在乙酰基转移酶的作用下,在蛋白质特定的位置添加乙酰基的过程,是细胞控制基因表达、蛋白质活性或生理过程的一种机制。
蛋白质组(proteome)与蛋白质组学(proteomics):
蛋白质组是指1个基因组所表达的全部蛋白质,而蛋白质组学则是指在蛋白质组水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平、翻译与修饰、蛋白与蛋白相互作用等,并由此获得关于疾病发生、发展及细胞代谢等过程的整体认识。
等位基因(allele):
指位于一一对同源染色体的相同位置上控制某一性状的不同拷贝。
不同的等位基因产生具有遗传特征的变化,例如,发色或血型等等位基因控制相对性状的显隐性关系及遗传效应。
等位排斥与同型排斥:
淋巴细胞中产生免疫球蛋白的基因位于两条同源染色体上,而免疫球蛋白基因的表达只发生在其中一条t,这种因为一条染色体上的基因表达而抑制另一条染色体上相同基因表达的现象称为等位基因排斥。
而同型排斥则是指B淋巴细胞的轻链表达时,只生成一种链(K链或是入链).不会同时表达K链和入链。
等位位点:
柒色体DNA同一位置上的每个碱基类型叫做一个等位位点。
多聚A位点(polyA位点):
在多聚A聚合酶的催化下,在mRNA前体3,端接上一个约200一250个腺嘌呤核苷酸(A)的尾巴,起到稳定mRNA的作用。
多顺反子mRNA(polycistronicmessengerRNA):
一种能作为两种或多种多肽链翻译模板的信使RNA.由DNA链卜的邻近顺反子所界定。
E
二组分系统(two-componentsystem):
由位于细胞质膜上的传感蛋白(该蛋白常常具有激酶活性)以及位于细胞质中的应答调节蛋白组成。
传感激酶常在受到膜外环境信号刺激时被磷酸化,并将其磷酸基团转移到应答调节蛋白上,使该磷酸化的应答调节蛋白成为阻遏物或诱导蛋白,通过对操纵子的阻遏或激活作用调控下游基因表达。
F
翻译Itranslation):
指将mRNA链上的核苷酸从一个特定的起始位点开始,按每3个核苷酸代表一个氨基酸的原则,依次合成一条多肽链的过程。
翻译后转运机制(post-translationaltranslocationl:
蛋白质从核糖体上释放后才发生转运。
翻译一转运同步机制(co-translationaltranslocation):
某个蛋白质的合成和转运是同时发生的。
泛素、泛蛋白(ubiquitinl:
含有高度保守的76个氨基酸的序列,它以羧基基团连接到目标蛋白质的赖氨酸残基的ω位氮基上,其主要作用是起始蛋白质的降解。
反式作用因子:
是指能直接或间接地识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上参与调控靶基因转录效率的蛋白质。
非核苷酸型反转录酶抑制剂:
该类化合物可与病毒的反转录酶相结合,通过限制该酶的移动性而影响它的活性,终止病毒DNA的合成。
非组蛋白:
是染色体中除了组蛋白之外的结构蛋白。
分子伴侣(molecularchaperone):
它是细胞中一类能够识别并结合到不完全折叠或装配的蛋白质上以帮助这些多肽正确折叠、转运或防止它们聚集的蛋白质,其本身不参与终产物的形成。
负控诱导:
是原核生物转录调控的一种方式,当阻遏物不与效应物(诱导物)结合时,结构基因不转录。
负控阻遏:
是原核生物转录调控的一种方式,当阻遏物与效应物(诱导物)结合时,结构基因不转录。
复制叉(replicationfork):
复制时,双链DNA要解开成两股链分别进行DNA合成,所以,复制起点呈叉子形状,被称为复制叉。
复制起始点(replicationorigin):
是DNA链上独特的具有起始DNA复制功能的碱基顺序。
大肠杆菌的复制起点包括OriC和OriH,OriC是首选的复制起点,而OriH是在RNaseH缺失突变株巾发现的一系列复制起点。
复制子(replicon):
单独复制的一个DNA单元被称为一个复制子.它是一个可移动的单位。
一个复制子在任何一个细胞周期只复制1次。
G冈崎片段(Okazakifragment):
是在DNA半不连续复制巾产生的长度为l000~2000个碱基的短的DNA片段,能被连接形成一条完整的DNA链。
高速泳动蛋白(highmobilitygroupprotein.HMG蛋白):
是一类能用低盐溶液抽提、能溶于2%的三氯乙酸、相对分子质量在3.Oxl04以下的非组蛋白。
因其相对分子质量小、在凝胶电泳中迁移速度快而得名。
分为HMGI和HMG2两大类。
这类蛋白的特点是能与DNA结合,也能与H.作用,但与DNA的结合并不牢固,可能与DNA的超螺旋结构有关,在DNA复制和重组中起重要作用。
果蝇:
一种双翅日昆虫,其幼虫和成虫依赖于正在腐烂的果实。
个体小、生命周期快、繁殖容易,每只雌虫两周就可以产生约300个后代。
此外,果蝇细胞中的巨大多线染色体使它非常适合于遗传分析和基因定位,是基因与发育领域最重要的模式生物之一。
H
核定位序列(nuclearlocalizatlonsequence.NLS):
蛋白质中的一种常见的结构域,通常为一短的氨基酸序列,它能与人核载体相互作用,将蛋白质运进细胞核内。
核苷酸型反转录酶抑制剂:
其结构与脱氧核苷酸类似,多为双脱氧核苷衍生物,可与细胞内自由核苷竞争性地结合反转录酶,终止反转录反应,使病毒DNA的合成受阻。
核酶(rlbozymel:
是一类具有催化活性的RNA分子,通过催化靶位点RNA链中磷酸二酯键的断裂,特异性地剪切底物RNA分子,从而阻断基因的表达。
核小体(nucleosome):
是染色质的基本结构单位,由大约200bp的DNA和组蛋白八聚体及外围Hi蛋白所组成。
后随链(laggingstrand):
在DNA复制过程中,与复制叉运动方向相反的方向不连续延伸的I)NA链被称为后随链或滞后链。
花分生组织决定基因:
这类基冈促进从花序分生组织产生花分生组织并进一步分化产生花器官原基,但.产生何种花器官则由同源域基因所控制。
花分生组织决定基因可以在一定程度上激活同源域基因。
J
基因(gene):
产生一条多肽链或功能RNA所需的全部核苷酸序列。
基因表达调控(generegulation):
所有生物的遗传信息,都是以基因的形式储存在细胞内的DNA(或RNA)分子巾,随着个体的发育,DNA分子能有序地将其所承载的遗传信息,通过密码子一反密码子系统,转变成蛋白质或功能RNA分子,执行各种生理牛物化学功能。
这个从DNA到蛋白质或功能RNA的过程被称为基因表达,对这个过程的调节就称为基因表达的调控。
基因表达系列分析技术(serialanalysisofgeneexpression.SAGE):
是一种以DNA序列测定为基础定量分析全基因组表达模式的技术,能够直接读出任何一种细胞类型或组织的基因表达信息。
在转录组水平上,仟何长度超过9—10个碱基的核苷酸片段都可能代表一种特异性的转录产物,因此,朋特定限制性核酸内切酶分离转录产物中具有基因特异性的9~10个碱基的核苷酸序列并制成标签,将这些序列标签连接、克隆、测序后,根据其占总标签数的比例即可分析其对应编码基因的表达频率。
基因捕获(genetrapping):
是检测动植物细胞巾基因表达和基因功能的手段n向某个基因组中系统性随机导入带有报道基因的DNA片段,就可能在破坏靶基凶功能(获得新的表现型)的同时,了解靶基因的表达模式,确定被破坏基因的位置,为进一步克隆靶基因奠定物质基础。
基因量排:
通过基因的转座或DNA的断裂错接等形式使正常基因序列发生改变,使一个基因从远离启动子的地方移到距它较近的位点从而启动转录。
基因定点突变(site-directedmutagenesis):
向靶DNA片段中引入所需的变化,包括碱基的添加、删除或改变,是分子牛物学研究中一种非常有用的手段。
基因家族:
在基因组进化中,一个基因通过基因重复产生了两个或更多的拷贝,这些基因即构成一个基因家族,是具有显著相似性的一组基因,编码相似的蛋白质产物。
基因克隆(genecloning1:
在分子生物学上,人们把将外源DNA插人具有复制能力的载体DNA中,转入宿主细胞使之得以永久保存和复制的过程称为基因克隆。
基因工程或重组DNA技术则侧重于验证上述过程所获得遗传物质新组合在宿主细胞内的表达与功能鉴定。
基因领域效应:
当两个基因相距太近时,往往不易形成有利于高效转录的空间结构。
因此,基因与基因之间的间隔距离被定义为“基因领域”o同一DNA链上两个具有相同转录方向的基因间隔小于一定长度时,影响有效转录所必需的染色质结构的形成,从而使这两个基因中的一个或两个均不能转录或转录活性显著降低,既产生了所谓的“基因领域效应”。
基因敲除(geneknock-out)技术:
针对一个序列已知但功能未知的基因,从DNA水平上设计实验,彻底破坏该基因的功能或消除其表达机制,从而推测该基因的生物学功能。
基因组DNA文库(cDNA/genomicDNAlibrary):
是某一生物体全部或部分基因的集合。
将某个生物的基因组DNA或cDNA片段与适当载体在体外重组后,转化宿主细胞,所得的菌落或噬菌体的集合即为该生物的基因组DNA或cDNA文库。
基因芯片(DNAmlcroarray)技术:
把大量已知或未知序列的DNA片段点在尼龙膜或玻璃片上,再经过物理吸附作用达到固定化。
也可以直接在玻璃或金属表面进行化学合成,得到寡聚核苷酸芯片。
将芯片与待研究的cDNA或其他样品杂交,经过计算机扫描和数据处理,便可以观察到成千上万个基因在不同组织或同一组织不同发育时期或不同生理条件下的表达模式。
基因型(genotype)与基因分型Igenotyping):
除性染色体外,人类细胞内的染色体都有两份,因此,一个人所拥有的一对等位位点的类型被称作基因型。
事实上,基因型也可以泛指同一基因座位卜多个等位位点的类型。
确定某个体基因型的实验就称为基因分型。
基因治疗:
基因治疗是将具有治疗价值的基因,即“治疗基因”装配于带有在人体细胞中表达所必备元件的载体中,导人人体细胞,通过靶基因的表达来治疗遗传疾病。
基因治疗是从根本上治疗遗传病的唯一途径。
目前科学界关注的主要问题是基因治疗的有效性、安全性和质量可控性。
基因组(genome):
生物有机体的单倍体细胞中的所有DNA,包括核中的染色体DNA和线粒体、叶绿体等亚细胞器中的DNAo间隙基因:
参与果蝇体节精细结构形成的基因,该基因最初在整个胚胎中都有很弱的表达,以后随着卵裂的进行而逐渐转变成一些不连续的表达区带。
简并(degenera