已测序植物基因组汇总.docx

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已测序植物基因组汇总

已测序植物基因组大全

NCBI Assembly ID

拉丁名

中文名

组装水平

GCA_000467755.1

Actinidia chinensis （eudicots）

猕猴桃

Contig

GCA_000347335.1

Aegilops tauschii （monocots）

粗山羊草

Scaffold

GCA_000411095.1

Aethionema arabicum （eudicots）

阿拉伯岩芥菜

Scaffold

GCA_000753965.1

Amaranthus hypochondriacus （grain amaranth）

千穗谷

Scaffold

GCA_000180655.1

Amaranthus tuberculatus （eudicots）

长芒苋

Contig

GCF_000471905.1

Amborella trichopoda （flowering plants）

无油樟

Scaffold

GCF_000471905.2

Amborella trichopoda （flowering plants）

无油樟

Scaffold

GCA_001661175.1

Ananas comosus （pineapple）

菠萝

Scaffold

GCA_001540865.1

Ananas comosus （pineapple）

菠萝

Chromosome

GCA_000696445.1

Aquilaria agallochum （eudicots）

沉香

Scaffold

GCA_000523005.1

Arabidopsis halleri subsp. gemmifera （eudicots）

鼠耳芥

Scaffold

GCF_000004255.1

Arabidopsis lyrata subsp. lyrata （lyrate rockcress）

玉山筷子芥 

Scaffold

GCA_000524985.1

Arabidopsis lyrata subsp. petraea （lyrate rockcress）

玉山筷子芥 

Scaffold

GCA_000222365.1

Arabidopsis thaliana （thale cress）

拟南芥

Scaffold

GCF_000001735.3

Arabidopsis thaliana （thale cress）

拟南芥

Chromosome

GCA_000222345.1

Arabidopsis thaliana （thale cress）

拟南芥

Scaffold

GCA_000211275.1

Arabidopsis thaliana （thale cress）

拟南芥

Chromosome

GCA_000222385.1

Arabidopsis thaliana （thale cress）

拟南芥

Scaffold

GCF_000001735.1

Arabidopsis thaliana （thale cress）

拟南芥

Complete Genome

GCF_000001735.2

Arabidopsis thaliana （thale cress）

拟南芥

Chromosome

GCA_000835945.1

Arabidopsis thaliana （thale cress）

拟南芥

Contig

GCA_000222325.1

Arabidopsis thaliana （thale cress）

拟南芥

Scaffold

GCA_001651475.1

Arabidopsis thaliana （thale cress）

拟南芥

Chromosome

GCA_000612745.1

Arabis alpina （gray rockcress）

小花南芥

Contig

GCA_000733195.1

Arabis alpina （gray rockcress）

小花南芥

Chromosome

GCA_001484125.1

Arabis montbretiana （eudicots）

南芥菜花

Contig

GCA_001484925.1

Arabis nordmanniana （eudicots）

南芥菜花

Scaffold

GCF_000817695.1

Arachis duranensis （eudicots）

蔓花生A亚基因组

Chromosome

GCA_001687015.1

Arachis duranensis （eudicots）

蔓花生A亚基因组

Scaffold

GCF_000816755.1

Arachis ipaensis （eudicots）

蔓花生B亚基因组

Chromosome

GCA_000439995.1

Azadirachta indica （eudicots）

印度苦楝树

Contig

GCA_000439995.2

Azadirachta indica （eudicots）

印度苦楝树

Contig

GCA_000439995.3

Azadirachta indica （eudicots）

印度苦楝树

Contig

GCA_000397105.1

Beta vulgaris subsp. vulgaris （beet）

甜菜

Scaffold

GCA_000511025.2

Beta vulgaris subsp. vulgaris （beet）

甜菜

Chromosome

GCA_000510975.1

Beta vulgaris subsp. vulgaris （beet）

甜菜

Chromosome

GCA_000510485.1

Beta vulgaris subsp. vulgaris （beet）

甜菜

Scaffold

GCA_000510875.1

Beta vulgaris subsp. vulgaris （beet）

甜菜

Scaffold

GCA_000510465.1

Beta vulgaris subsp. vulgaris （beet）

甜菜

Scaffold

GCA_000729925.1

Beta vulgaris subsp. vulgaris （beet）

甜菜

Contig

GCA_000510365.1

Beta vulgaris subsp. vulgaris （beet）

甜菜

Scaffold

GCF_000511025.1

Beta vulgaris subsp. vulgaris （beet）

甜菜

Chromosome

GCA_000327005.1

Betula nana （alpine birch）

高山桦木

Scaffold

GCF_000005505.1

Brachypodium distachyon （stiff brome）

二穗短柄草

Chromosome

GCF_000005505.2

Brachypodium distachyon （stiff brome）

二穗短柄草

Chromosome

GCF_000686985.1

Brassica napus （rape）

油菜

Chromosome

GCA_000751015.1

Brassica napus （rape）

油菜

Scaffold

GCA_001682895.1

Brassica nigra （black mustard）

黑芥

Chromosome

GCA_000604025.1

Brassica oleracea var. capitata （cabbage）

卷心菜

Scaffold

GCF_000695525.1

Brassica oleracea var. oleracea （eudicots）

卷心菜

Chromosome

GCF_000309985.1

Brassica rapa （field mustard）

荠菜

Chromosome

GCA_000340665.1

Cajanus cajan （pigeon pea）

木豆

Chromosome

GCA_000230855.1

Cajanus cajan （pigeon pea）

木豆

Contig

GCF_000633955.1

Camelina sativa （false flax）

亚麻荠

Chromosome

GCA_000496875.1

Camelina sativa （false flax）

亚麻荠

Scaffold

GCA_001509995.1

Cannabis sativa （hemp）

亚麻荠

Scaffold

GCA_000230575.1

Cannabis sativa （hemp）

亚麻荠

Scaffold

GCA_001510005.1

Cannabis sativa subsp. indica （hemp）

亚麻荠

Contig

GCF_000375325.1

Capsella rubella （eudicots）

拟南芥近缘种

Scaffold

GCF_000710875.1

Capsicum annuum （eudicots）

辣椒

Chromosome

GCA_000512255.1

Capsicum annuum （eudicots）

辣椒

Scaffold

GCA_000950795.1

Capsicum annuum var. glabriusculum （eudicots）

野生辣椒

Chromosome

GCA_000150535.1

Carica papaya （papaya）

木瓜

Scaffold

GCA_001310045.1

Carica papaya （papaya）

木瓜

Chromosome

GCA_001633085.1

Carthamus tinctorius （safflower）

红花素

Scaffold

GCA_000763605.1

Castanea mollissima （Chinese chestnut）

板栗

Scaffold

GCA_001292525.1

Catharanthus roseus （Madagascar periwinkle）

长春花

Contig

GCA_001292565.1

Catharanthus roseus （Madagascar periwinkle）

长春花

Contig

GCA_000949345.1

Catharanthus roseus （Madagascar periwinkle）

长春花

Scaffold

GCA_001687005.1

Chenopodium pallidicaule （eudicots）

苍白茎藜

Scaffold

GCA_001683475.1

Chenopodium quinoa （quinoa）

奎奴亚藜

Scaffold

GCA_001687025.1

Chenopodium suecicum （eudicots）

藜

Scaffold

GCA_000347275.2

Cicer arietinum （chickpea）

鹰嘴豆

Chromosome

GCF_000331145.1

Cicer arietinum （chickpea）

鹰嘴豆

Chromosome

GCA_000347275.1

Cicer arietinum （chickpea）

鹰嘴豆

Scaffold

GCA_000238415.1

Citrullus lanatus （wild melon）

野生甜瓜

Contig

GCF_000493195.1

Citrus clementina （eudicots）

柑橘

Scaffold

GCA_000695605.1

Citrus sinensis （sweet orange）

甜橙

Scaffold

GCF_000317415.1

Citrus sinensis （sweet orange）

甜橙

Chromosome

GCA_000775935.1

Conyza canadensis （horseweed）

小蓬草

Contig

GCF_000313045.1

Cucumis melo （muskmelon）

甜瓜

Scaffold

GCF_000004075.1

Cucumis sativus （cucumber）

黄瓜

Scaffold

GCF_000224045.1

Cucumis sativus （cucumber）

黄瓜

Scaffold

GCA_001483825.1

Cucumis sativus （cucumber）

黄瓜

Contig

GCF_000004075.2

Cucumis sativus （cucumber）

黄瓜

Chromosome

GCF_001625215.1

Daucus carota subsp. sativus （carrot）

胡萝卜

Chromosome

GCA_001605985.1

Dendrobium catenatum （monocots）

石斛兰

Scaffold

GCA_000512335.1

Dianthus caryophyllus （clove pink）

香石竹

Scaffold

GCA_001633215.1

Dichanthelium oligosanthes （monocots）

*

Scaffold

GCA_000774125.1

Diospyros lotus （eudicots）

莲花

Scaffold

GCA_001598015.1

Dorcoceras hygrometricum （eudicots）

旋蒴苣苔

Scaffold

GCA_001647135.1

Eichhornia paniculata （monocots）

凤眼蓝

Scaffold

GCF_000442705.1

Elaeis guineensis （African oil palm）

油棕榈

Chromosome

GCA_001672495.1

Elaeis guineensis （African oil palm）

油棕榈

Scaffold

GCA_000441515.1

Elaeis oleifera （American oil palm）

美国油棕

Scaffold

GCA_000818735.1

Ensete ventricosum （monocots）

阿比西尼亚红脉蕉

Scaffold

GCA_000331365.2

Ensete ventricosum （monocots）

阿比西尼亚红脉蕉

Scaffold

GCA_000818735.2

Ensete ventricosum （monocots）

阿比西尼亚红脉蕉

Scaffold

GCA_000331365.1

Ensete ventricosum （monocots）

阿比西尼亚红脉蕉

Scaffold

GCA_000970635.1

Eragrostis tef （tef）

抗旱粮食作物

Scaffold

GCF_000504015.1

Erythranthe guttata （spotted monkey flower）

地黄猴面花

Scaffold

GCA_000260855.1

Eucalyptus camaldulensis （Murray red gum）

赤桉

Scaffold

GCF_000612305.1

Eucalyptus grandis （rose gum）

巨桉

Scaffold

GCA_000325905.2

Eutrema salsugineum （eudicots）

山嵛菜

Chromosome

GCA_000325905.1

Eutrema salsugineum （eudicots）

山嵛菜

Scaffold

GCF_000478725.1

Eutrema salsugineum （eudicots）

山嵛菜

Scaffold

GCA_001661195.1

Fagopyrum esculentum （common buckwheat）

普通荞麦

Scaffold

GCA_000511975.1

Fragaria iinumae （eudicots）

古二倍体草莓

Scaffold

GCA_000512025.1

Fragaria nipponica （eudicots）

日本草莓

Scaffold

GCA_000511995.1

Fragaria nubicola （eudicots）

西藏草莓

Scaffold

GCA_000517285.1

Fragaria orientalis （eudicots）

东方草莓

Scaffold

GCF_000184155.1

Fragaria vesca subsp. vesca （wild strawberry）

野生草莓

Chromosome

GCA_000511835.1

Fragaria x ananassa （strawberry）

草莓

Scaffold

GCA_000511695.1

Fragaria x ananassa （strawberry）

草莓

Scaffold

GCA_000576895.1

Fraxinus excelsior （European ash）

 欧洲草莓

Scaffold

GCA_000441915.1

Genlisea aurea （eudicots）

螺旋狸藻

Scaffold

GCF_000004515.3

Glycine max （soybean）

大豆

Chromosome

GCF_000004515.4

Glycine max （soybean）

大豆

Chromosome

GCF_000004515.2

Glycine max （soybean）

大豆

Chromosome

GCA_001269945.1

Glycine max （soybean）

大豆

Contig

GCA_001269945.2

Glycine max （soybean）

大豆

Contig

GCF_000004515.1

Glycine max （soybean）

大豆

Chromosome

GCA_000722935.1

Glycine soja （wild soybean）

野生大豆

Scaffold

GCA_000722935.2

Glycine soja （wild soybean）

野生大豆

Scaffold

GCF_000612285.1

Gossypium arboreum （tree cotton）

树棉

Chromosome

GCA_000787975.1

Gossypium arboreum （tree cotton）

树棉

Scaffold

GCA_000612285.1

Gossypium arboreum （tree cotton）

树棉

Scaffold

GCF_000987745.1

Gossypium hirsutum （eudicots）

陆地棉

Chromosome

GCA_000331045.1

Gossypium raimondii （eudicots）

雷蒙德氏棉

Scaffold

GCF_000327365.1

Gossypium raimondii （eudicots）

雷蒙德氏棉

Chromosome

GCA_001654055.1

Hevea brasiliensis （eudicots）

橡胶树

Scaffold

GCA_000340545.1

Hevea brasiliensis （eudicots）

橡胶树

Scaffold

GCA_001696755.1

Hibiscus syriacus （Rose-of-Sharon）

木槿

Scaffold

GCA_000582825.1

Hordeum pubiflorum （monocots）

大麦

Scaffold

GCA_000947855.1

Hordeum vulgare （barley）

大麦

Contig

GCA_000227425.1

Hordeum vulgare subsp. vulgare （domesticated barley）

驯化大麦

Contig

GCA_001077415.1

Hordeum vulgare subsp. vulgare （domesticated barley）

驯化大麦

Scaffold

GCA_000326125.1

Hordeum vulgare subsp. vulgare （domesticated barley）

驯化大麦

Scaffold

GCA_000326085.1

Hordeum vulgare subsp. vulgare （domesticated barley）

驯化大麦

Scaffold

GCA_000830395.1

Humulus lupulus var. cordifolius （European hop）

葎草

Scaffold

GCA_000831365.1

Humulus lupulus var. lupulus （European hop）

葎草

Scaffold

GCA_000978395.1

Ipomoea trifida （eudicots）

甘薯近缘野生种

Scaffold

GCA_000981105.1

Ipomoea trifida （eudicots）

甘薯近缘野生种

Scaffold

GCA_000208675.1

Jatropha curcas （eudicots）

麻风树

Contig

GCF_000696525.1

Jatropha curcas （eudicots）

麻风树

Scaffold

GCA_000208675.2

Jatropha curcas （eudicots）

麻风树

Scaffold

GCA_001411555.1

Juglans regia （English walnut）

英国胡桃木

Scaffold

GCA_000227445.1

Lactuca sativa （eudicots）

莴苣

Contig

GCA_000466325.1

Lagenaria siceraria （white-flowered gourd）