dbGaP数据库申请步骤说明.docx
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dbGaP数据库申请步骤说明
dbGaP数据库申请步骤说明
【dbGaP数据据简介】
基因型和表型数据库(dbGaP,)是国立卫生研究院(NIH)赞助的用于归档、精选和发布由调查基因型和表型间相互作用的研究所产生的信息的数据仓库。
该数据库收录的资料来自由NIH资助的全基因组关联分析(genome-wideassociationstudy,GWAS)结果。
dbGap是有NCBI开发并负责维护的数据库,该数据库主要存放外显子测序和DNA测序数据,以研究表型和基因型之间的对应关系为主要目的。
目前dbGaP数据库收录的数据来自25个研究项目,用户可以通过疾病名称或基因名称进行搜索、浏览。
为了保证研究项目的机密性,dbGaP数据库只接受“去识别(de-identified)”的数据,同时还要求使用个人资料(individual-level)的研究者接受审核。
不过,用户可以不受任何限制的浏览研究文件、操作流程和项目问卷调查等资料。
申请数据无需缴纳费用,只需申请账号,然后申请欲下载数据的下载权限,下载相应数据,使用SRAtoolkit对下载数据进行解压,并生成对应格式文件。
dbGaP数据库是一个关于基因型和表型的individual-leveldata数据库。
dbGaP数据库的申请有两种方式,一是申请eRAcommons账号,二是NIH账号(仅供美国NIH内部人员使用)。
SAM注册()、注册(s.gov/web/grants/.)
Duns编码()、
NCAGE编码注册()、和官方验证()。
注意:
在注册eRAcommons()时,必须先将SAM注册成功后才可以进行注册,两者都注册成功后进行eRAcommons注册。
郑州大学Duns编码已注册成功,信息如下(注:
必须一字不差填写,因为其中一步是核对填写信息和对方平台贮存信息是否一致,如下图)
DUNS:
LegalBusinessName:
ZhengzhouUniversity
AddressLine1:
NO.75,DaxueNorthRd.,Er’qiDistrict(英文半角)
City:
Zhengzhou
States:
Henan
PostalCode:
450052
NCAGE编码注册步骤:
申请之前的countrycheck
Typeofentity--(选择Other)
Emergencylevel--(选择Emergency)
Istheentitytoberegisteredassupranationalorganization?
--(选择No)
Country—China
Step1of4:
InitiatorData
(注意:
Firstname:
san(如:
张三)Lastname:
zhang,organizationname:
ZhengzhouUniversity,Adress:
NO.75,DaxueNorthRd.,Er’qiDistrict必须和DUNS地址一致)
Step2of4:
(N)CAGEData
(注意:
Organizationname:
ZhengzhouUniversity,Adress:
DaxueNorthRd必须和DUNS地址一致)
Step3of4:
RequestData
Questionnaire-Typeofactivity
DevelopmentofPublicStandards--No
DesignerofGoods--No
ManufacturerofGoods--No
VendorofGoods--No
ServiceProvider--No
Questionnaire-Futurebusiness
TheCAGECodeNeededforanInvitationtoTender--No
AContractWithanArmedForceoraNATOAgencyIsinPreparationorAlreadySigned?
--No
TheCAGECodeisRequestedbytheSystemforAwardManagement(SAM)--Yes
Questionnaire-FormerCAGEcode
ACAGECodeWasPreviouslyAllocated--No
Detailsofyourrequest.(浏览并核对一下信息)
点击create,邮箱会收到邮件点击clickheretoseeyourrequest看一下申请信息,然后点击链接激活。
SAM注册
点击createanaccount--ChooseAccountType--UserInformation
(注意:
password:
8-15个字符,至少包含一个数字、一个字母和一个特殊符号!
)
点击next,进入Summary即YourAccountInformation,核对信息!
点击sumbit,之后出现确认页,邮箱会收到邮件,点击链接激活!
注册
点击register--RegisteringasanOrganizationApplicant
eRAcommons注册
步骤()
注册网址()--eRAcommonslogin
点击registernow
第六步中使用第五步邮件发过来的Commons账号和密码登录,此时系统会提醒你更改密码。
然后需要PrincipalSigningOfficial(刘炯天校长)需要电子签字,电子签名发过去之后账号会被激活!
激活账号之后,申请欲下载数据的下载权限,下载相应数据,使用SRAtoolkit对下载数据进行解压,并生成对应格式文件。
dbGapAuthorizedAccess网址: