电荷密度差分图.docx
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电荷密度差分图
【求助】请问那个电子密度差图怎么得来的
如下那个图是complex与单体的电子密度差，我不明白怎么取得的，请高手指点
[Lasteditedbyloovfndon2009-8-27at09:
06]
附件1:
（2009-08-2618:
59:
05,K）
2009-08-2618:
59:
051
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你帮楼主在下面弄个教程吧！
8-2620:
03
高斯说明书关于cubeman的解释
看一遍就会了
《计算与模拟研究》编辑部诚招英才
2009-08-2619:
24:
072
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我在利用cubeman时有有个警告Waring:
Mismatchinfiles结果恍如也不正确，请问是什么地方的问题？
2009-08-2621:
17:
153
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forestwolf9291
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你弄错了，这不是电子密度图，而是电子密度差图8-2621:
30
将gaussian中可执行程序formchk考到chk文件所在的目录，点击formchk后按提示输入,取得文件，chem3d打开。
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Originallypostedbylb1586551at2009-8-2618:
59:
如下那个图是complex与单体的电子密度差，我不明白怎么取得的，请高手指点
2009-08-2621:
24:
544
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lb1586551
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Originallypostedbyforestwolf9291at2009-8-2621:
24:
将gaussian中可执行程序formchk考到chk文件所在的目录，点击formchk后按提示输入,取得文件，chem3d打开。
请问是指单体仍是络合物的？
用gaussianview打开也行吗？
2009-08-2621:
46:
125
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有，写吧，写了，我评！
8-2709:
04
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Originallypostedbyloovfndat2009-8-2620:
03:
你帮楼主在下面弄个教程吧！
有赏钱吗？
有赏钱我就写个教程
《计算与模拟研究》编辑部诚招英才
2009-08-2709:
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426
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loovfnd
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Originallypostedbyyjcmwgkat2009-8-2709:
03:
有赏钱吗？
有赏钱我就写个教程
电子密度图and电子密度差图区别在哪？
站在巨人的肩膀上掉下来摔得更惨！
2009-08-2709:
05:
117
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Gaussian中cubman的操作方式
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loovfnd（金币+10,VIP+0）:
辛苦了，期待你的另一个教程！
8-2716:
31
loovfnd（金币+0,VIP+0）:
下面这三个图都表示密度差？
密度差主要用来解释什么呢！
8-2716:
37
中午临时有事，就不写教程了，周日再写吧。
Gaussian中cubman的操作方式，见下面的例子：
以两种不同状态的乙烯分子为例，介绍如何取得它们的电子密度散布的不同。
大家都是用Gaussian的，我就不多解释了，直接上gjf文件吧。
若是gjf文件看不懂，就别在这儿混了。
====gjf文件开始===
%chk=G:
\sundries\C2H4\
#hf/sto-3g
Lowspin
01
C0.
H0.1.
H-0.1.
C-0.
H0.-1.
H-0.-1.
--Link1--
%chk=G:
\sundries\C2H4\
#hf/sto-3g
Highspin
03
C0.
H0.1.
H-0.1.
C-0.
H0.-1.
H-0.-1.
====gjf文件结束====
运行那个gjf文件，取得和两个文件以后，打开DOS（那个DOS指的是Windows的命令行操作系统DiskOperationSystem）红色字体是我输入的，黑色字体是DOS的提示
====DOS操作开始====
MicrosoftWindowsXP[VersionCopyright1985-2001MicrosoftCorp.
C:
\DocumentsandSettings\Administrator>d:
D:
\>cdprogramfiles\gaussian03w
D:
\ProgramFiles\gaussian03w>formchkG:
\sundries\C2H4\G:
\sundries\C2H4\
ReadcheckpointfileG:
\sundries\C2H4\
WriteformattedfileG:
\sundries\C2H4\
Rotatingderivatives,DoTrsp=TIDiff=1LEDeriv=353LFDPrp=0LDFDPr=0.
D:
\ProgramFiles\gaussian03w>formchkG:
\sundries\C2H4\G:
\sundries\C2H4\
ReadcheckpointfileG:
\sundries\C2H4\
WriteformattedfileG:
\sundries\C2H4\
Rotatingderivatives,DoTrsp=TIDiff=1LEDeriv=353LFDPrp=0LDFDPr=0.
D:
\ProgramFiles\gaussian03w>cubegen0densityG:
\sundries\C2H4\G:
\sundries\C2H4\0h
D:
\ProgramFiles\gaussian03w>cubegen0densityG:
\sundries\C2H4\G:
\sundries\C2H4\0h
D:
\ProgramFiles\gaussian03w>cubman
Action[Add,Copy,Difference,Properties,SUbtract,SCale,SQuare]?
subtract
Firstinput?
G:
\sundries\C2H4\
Isitformatted[no,yes,old]?
yes
OpenedspecialfileG:
\sundries\C2H4\.
Secondinput?
G:
\sundries\C2H4\
Isitformatted[no,yes,old]?
yes
OpenedspecialfileG:
\sundries\C2H4\.
Outputfile?
G:
\sundries\C2H4\
Shoulditbeformatted[no,yes,old]?
yes
OpenedspecialfileG:
\sundries\C2H4\.
Inputfiletitles:
Highspindensity
ElectrondensityfromTotalSCFDensity
Inputfiletitles:
Highspindensit
ElectrondensityfromTotalSCFDensity
SumAP=SumAN=SumA=
CAMax=XYZ=
CAMin=XYZ=SumBN=SumB=
CBMax=CBMin=
SumOP=SumON=SumO=
COMax=COMin=
DipAE=
DipAN=
DipA=
DipBE=
DipBN=
DipB=
DipOE=
DipON=
DipO=
D:
\ProgramFiles\gaussian03w>
====DOS操作结束====
用GaussView打开，生成附件中的三个图，就OK了
[Lasteditedbyyjcmwgkon2009-8-27at10:
31]
附件1:
未命名.JPG（2009-08-2710:
22:
43,K）
《计算与模拟研究》编辑部诚招英才
2009-08-2710:
17:
028
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Originallypostedbyloovfndat2009-8-2709:
05:
电子密度图and电子密度差图区别在哪？
两个电子密度图的density相减，就成了电子密度差图
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