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生物分类学
生物分类学
要想弄清楚生物的分类，首先要理解几个基本的名词：
1．原核细胞、原核生物：
原核细胞（prokaryoticcell）没有核膜，遗传物质集中在一没有明确界限的低电子密度区，故只有原核或称为拟核。
DNA为裸露的环状分子，通常没有结合蛋白，环的直径约为，周长约几十纳米。
细胞结构含有：
荚膜（capsule），细胞壁（mureincellwall），细胞膜（cellsurfacemembrane），脱氧核糖核酸分子（circularDNA）,中膜体（mesosome）或间体,thykoloid,核糖体（ribosome）,鞭毛（flagellum）等，没有叶绿体（chloroplast）、（mitochondrion）等（organelles）。
没有恒定的内膜系统，为70S型，不进行有丝分裂（mitosis）和减数分裂（meiosis）、无丝分裂，脱氧核糖核酸（DNA）复制后，细胞随即分裂为二。
不发生流动，观察不到变形虫样运动。
原核细胞构成的生物称为原核生物（prokaryote），均为单细胞生物，原核（Cyanophyta），是现存生物中最简单的一群，以分裂生殖繁殖后代。
原核生物曾是地球上唯一的生命形式，它们独占地球长达20亿年以上。
如今它们还是很兴盛，而且在营养盐的循环上扮演着重要角色。
原核生物界至少包括4000种生物。
蓝藻细胞结构图
2．真核细胞、真核生物：
真核（eukaryoticcell）指含有真核（被核膜包围的核）的细胞。
其在一个以上，能进行，还能进行和变形运动。
在真核细胞的核中，与等蛋白质共同组成染色体结构，在核内可看到。
在细胞质很发达，存在着、、和等，分别行使特异的功能。
而光合作用和氧化磷酸化作用则分别由和线粒体进行。
植物细胞模式图
动物细胞模式图
由真核细胞构成的生物称为真核生物（eukaryote）。
包括原生生物、真菌、植物和动物。
3．非细胞生物：
没有细胞结构的一类生物，包括病毒（virus）、类病毒（viroid）、朊病毒（prion）、拟病毒（virusoid）等。
生物分类
生物分类学是研究生物分类的方法和原理的生物学分支。
分类就是遵循分类学原理和方法，对生物的各种类群进行命名和等级划分.瑞典生物学家将生物命名后，而后的生物学家才用域（Domain）、界（Kingdom）、门（Phylum）、纲（Class）、目（Order）、科（Family）、属（Genus）、种（Species）加以分类。
种（物种）是。
随着研究的进展，分类层次不断增加，单元上下可以附加次生单元，如亚门（Subphylum）、总纲（超纲）、亚纲（Subclass）、次纲、总目（Superoder、超目）、亚目（Suborder）、次目、总科（Superfamily超科）、亚科（Subfamily）等等。
此外，还可增设新的单元，如股、群、族、亚属（Subgenus）、组等等，其中最常设的是族，介于亚科和属之间。
总界（域）、界、门、亚门、总纲、纲、亚纲、总目、目、亚目、次目、总科、科、亚科、族、属、亚属、种、亚种。
例如，现代人类中的一个黄色人种，就是可以分为：
真核生物域→动物界→脊索动物亚门→脊椎动物总纲（超纲）→哺乳纲→兽亚纲→真兽次亚纲→灵长总目（超目）→真灵长半目→直鼻猴亚目→人猿次目→狭鼻下目→真狭鼻小目→人超科（总科）→人科→人亚科→人族→人属→人亚属→智人种→现代人种→黄色人种（蒙人种）。
三域系统
三域系统是由卡尔·沃斯（CarlWoese）在1977年提出的生物分类﹐根据细胞墙结构和化学性质、细胞膜结构、新陈代谢功能的差异，将分成了两大类﹐起初称为（Eubacteria）和（Archaebacteria）。
Woese依据16SrRNA序列上的差别﹐认为这两组生物和真核生物从一个具有原始遗传机制的共同祖先分别进化而来﹐因此将三者各划为一类﹐作为比界高的分类系统，称作“域”（Domain）或者“总界”（Superkingdom）。
1990年，CarlWoese为了避免把古细菌也看作是细菌的一类，又把三域目前这三域改称为（Bacteria）﹑（Archaea）和真核生物（Eukarya）。
在细胞结构和代谢上，古菌在很多方面接近其它原核生物。
然而在基因转录这两个分子生物学的中心过程上，它们并不明显表现出细菌的特徵，反而非常接近真核生物。
比如，的转译使用真核的启动和延伸因子，且转译过程需要真核生物中的TATA框结合蛋白和TFIIB。
古菌还具有一些其它特徵。
与大多数细菌不同，它们只有一层细胞膜而缺少细胞壁。
而且，绝大多数细菌和真核生物的细胞膜中的脂类主要由甘油酯组成，而古菌的膜脂由甘油醚构成。
这些区别也许是对超高温环境的适应。
古菌鞭毛的成分和形成过程也与细菌不同。
与真细菌主要区别：
1、形态学上，古细菌有扁平直角形状的细胞，而在真细菌中从未见过。
2、中间代谢上，古细菌有独特的辅酶。
如产甲烷菌含有F420，F430和COM及B因数。
3、有无内含子（introns）上,许多古细菌有内含子。
4、膜结构和成分上，古细菌膜含醚而不是酯，其中甘油以醚键连接长链异戊二烯，而不是以酯键同脂肪酸相连。
5、呼吸类型上，严格厌氧是古细菌的主要呼吸类型。
6、代谢多样性上，古细菌单纯，不似真细菌那样多样性。
7、在分子可塑性（molecularplasticity）上，古细菌比真细菌有较多的变化。
8、在进化速率上，古细菌比真细菌缓慢，保留了较原始的特性
两界系统
三界系统
四界系统
五界系统
六界系统
1．原核生物界KingdomMonera：
具原核细胞结构的各类原核生物所组成的一大类群。
它包括（其中也包括）、蓝藻门、原绿藻门、立克次氏体、支原体和衣原体等。
蓝藻门和原绿藻门为绿色自养生物，细菌门中也有少数光能或化能自养细菌。
但绝大多数细菌和其他各类均为异养，腐生或寄生。
立克次氏体，是介于病毒和细菌之间的一类很小的专性细胞内的寄生物，球状或杆状。
支原体也称类菌质体，是介于立克次氏体和细菌之间的营独立生活的微生物。
它没有细胞壁，柔软，形态多变，呈球状或长短不一的丝状及分枝状。
衣原体，是一类专性寄生物。
2．原生生物界KingdomProtista：
原生生物（protist/protoctists）是最简单的，大部分都是，亦有部份是多细胞的，但不具组织分化。
这个界别是真核生物中最低等的。
它们的内具有和有膜的。
全部生活在水中，没有角质。
比更大、更复杂。
有些原生生物可以利用制造食物，至少包含5万种的。
可分为三大类，藻类（如diatom等）、原生动物类（如amoeba、ciliate等）、原生（如slimemolds、水霉watermolds等）。
其中，原生菌类的外表特征与真菌界的成员相似，且皆为异营，储藏肝醣，细胞壁含与几丁质（chitin），因此有些分类学家仍将它们归在真菌界。
但他们与菌物界的成员的关系并不密切，如他们有（swiwmingcells），具鞭毛；或行运动，而与菌类不同；黏菌有吞噬作用，吞入固体食物，而菌类则分泌酵素，将食物分解而行吸收。
此外，有些水霉会储藏一种一mycolaminarin，此物质很像褐藻中的储藏物质，但与菌类、植物、动物者不同。
所以，原生菌类在传统上被视为菌类，但经由以上特征，他们较适合归在原生生物界。
黏菌又分为原生质体黏菌（plasmodialslimemolds）和细胞性黏菌（cellularslimemolds）。
水霉又分为单鞭毛可动细胞（uniflagellatemotilecells）和双鞭毛可动细胞（biflagellatemotilecells）
原生动物门PhylumProtozoa
鞭毛虫纲ClassMastigophora
肉足虫纲ClassSarcodina
纤毛虫纲ClassCiliophora
孢子虫纲ClassSporozoa
裸藻植物门PhylumEuglenophyta
金褐藻植物门PhylumChrysophyta
甲藻植物门PhylumPyrrophyta
等等
3．植物界KingdomPlantae：
现存于地球上的植物,估计约为50余万种。
（注：
此处本应划分到原生生物界的藻类和原生动物类因早期藻类是植物的祖先，早期的原生动物是动物的祖先，所以人们对生物进行分类时，常把藻类归于植物界，把原生动物归于。
而原核生物界的细菌由于其也具有细胞壁而置于广义的植物界。
）
1．藻类植物（Algae）
裸藻门Euglenophyta
裸藻纲（Euglenophyceae）
裸藻目（Euglenales）
柄裸藻目（Colaciales）
绿藻门Chlorophyta
绿藻纲（Chlorophyceae）
团藻目（Volvocales）
四胞藻目（Tetrasporales）
色球藻目（Chlorococcales）
丝藻目（Ulotrichales）
胶毛藻目（Chaetophorales）
石莼目（Ulvales）
溪菜目（Prasiolales）
鞘藻目（Oedogoniales）
刚毛藻目（Cladophrales）
管藻目（Siphonales）
（Siphonocladales）
绒枝藻目（Dasycladales）
双星藻目（Zygnematales）
轮藻门Charophyta
轮藻纲（Charophyceae）
轮藻目
金藻门Chrysophyta
金藻纲（Chrysophyceae）
金胞藻目（Chrysomonadales）
（Rhizochrysidales）
金囊藻目（Chrysocapsales）
（Chrysosphaerales）
金枝藻目（Phaeothamniales）
甲藻门Pyrrophyta藻类
纵裂甲藻纲（Desmophyceae）
原甲藻目（Prorocentrales）
横裂甲藻纲（Dinophyceae）
多甲藻目（Peridi-niales）
变形甲藻目（Dinamoebidiales）
胶甲藻目（Gloeodiniales）
球甲藻目（Dinococcales）
丝甲藻目（Dinotrichales）
褐藻门Phaeophyta（sporeplant）植物
等世代纲
不等世代纲
无孢子纲
红藻门Rhodophyta隐花植物低等植物
红藻纲
紫菜亚纲
真红藻亚纲
蓝藻门Cyanophyta（孢子植物）（无胚植物）
蓝藻纲（Cyanophyceae）
色球藻目（Chroococcales）
管胞藻目（Chamaesiphonales）
颤藻目（Osillatoriales）
（Xanthophyta）（Chromophyta）
（Xanthophyceae）
异鞭藻目（Heterochloridales）
根黄藻目（Rhizochloridales）
异囊藻目（Heteroglocales）
柄球藻目（Mischococcales）
异丝藻目（Heterotrichales）
气球藻目（Botrydiales）
硅藻门（Bacillariophyta）
中心硅藻纲
圆筛藻目
盒形藻目
羽纹硅藻纲
无壳藻目
短壳藻目
双壳藻目
管壳藻目
2．细菌门Bacteriophyta由于其也具有细胞壁而置于广义的植物界。
3．粘菌门Myxomycophyta
4．真菌门Eumycophyta
5．地衣植物
地衣门Lichens
子囊衣纲（Ascolichens）
担子衣纲（Basidiolichens）
半知衣纲（Deuterolichens）
6．苔藓植物
苔藓植物门（Bryophyta）
苔纲（Hepaticae）
藻苔目
地钱目
美苔目
囊果苔目
藓纲（Musci）
泥炭藓亚纲（Sphagnidae）
黑藓亚纲（Asdreaeidae）
真藓亚纲（Bryidae）
角苔纲（Anthocerotae）
7．蕨类植物
蕨类植物门Pteridophyta（seedplant）颈卵器植物高等植物
石松亚门（Lycophytina）
石松纲Lycopsida
水韭亚门（Isoephytina）
水韭纲Isoetinae
水韭目Isoetales
水韭科Isoetaceae
水韭属Isoetesspp.
楔叶蕨亚门（Sphenophytina）
楔叶蕨纲（Sphenopsida）
木贼目（Equisetales）
木贼科（Equisetaceae）
木贼属（Equisetum）
裸蕨亚门（Psilophytina）
裸蕨纲Psilopsida
松叶蕨目Psilotales
松叶蕨科Psilotaceae
真蕨亚门（Filicophytina）
厚囊蕨纲（Eusporangiopsida）
（Protolyptosporangiopsida）
薄囊蕨纲（Leptosporangiopsida）
8．裸子植物门Gymnospermae显花植物维管植物有胚植物
银杏纲（Ginkgopsida）
银杏目Ginkgoales
银杏科Ginkgoaceae
银杏属Ginkgo
银杏Ginkgobiloba
松柏纲（Coniferopsida）
科达目（已绝种）
（已绝种）
松柏目（Coniferales）
苏铁纲（Gycadopsida）
种子蕨目（Pteridospermae）（已绝种）
开通目（Caytoniales）（已绝种）
本内苏铁目（Bennettitales）（已绝种）
苏铁目（Cycabales）
买麻藤纲（Gnetopsida）
买麻藤目（Gnetales）
麻黄目（Ephedrales）
百岁兰目（Welwitschiales）
红豆杉纲（Taxopsida）
红豆杉目Taxales
9．被子植物门（门）Angiospermae或Magnoliophyta或floweringplants
（百合纲）Liliopsida
百合亚纲Liliidae
百合目Liliales
百合科Liliaceae
蒜属：
蒜，洋葱，韭菜
风信子科Hyacinthaceae
风信子属Hyacinthus：
风信子Hyacinth
田葱科Philydraceae
龙舌兰科Agavaceae
鸢尾科Iridaceae
百部科Stemonaceae
菝葜科Smilacaceae
薯蓣科Dioscoreaceae
蒟蒻薯科Taccaceae
兰目Orchidales
兰科Orchidaceae
水玉簪科Burmanniaceae
泽泻亚纲Alismatidae
泽泻目Alismatales
水鳖目Hydrocharitales
茨藻目Najadales
霉草目Triuridales
槟榔亚纲Arecidae
槟榔目Arecales
环花草目Cyclanthales
露兜树目Pandanales
天南星目Arales
天南星科Araceae
浮萍科Lemnaceae
鸭跖草亚纲Commelinidae
鸭跖草目Commelinales
目Eriocaulales
帚灯草目Restionales
灯心草目Juncales
莎草目Cyperales
禾本科Poaceae
竹Bamboo
莎草科Cyperaceae
香蒲目Typhales
姜亚纲Zingiberidae
Zingiberales
美人蕉科Cannaceae
闭鞘Costaceae
赫蕉科Heliconiaceae，蝎尾蕉科。
兰花蕉科Lowiaceae
竹芋科Marantaceae
芭蕉科Musaceae
鹤望兰科Strelitziaceae，旅人蕉科。
姜科Zingiberaceae
凤梨目Bromeliales
（木兰纲）Magnoliopsida
Magnoliidae
木兰目Magnoliales
樟目Laurales
胡椒目Piperales
睡莲目Nymphaeales
马兜铃目Aristolochiales
八角茴香目Illiciales
毛茛目Ranunculales
毛茛科Ranunculaceae
毛茛属Ranuculus
芍药属--芍药-牡丹
罂粟目Papaverales
十字花科
萝卜属
金缕梅亚纲Hamamelidae
金缕梅目Hamamelidales
悬铃木科Platanaceae
悬铃木属--英桐-美桐-法桐
Eucommiales
荨麻目Urticales
榆科Ulmaceae
朴属--白榆-榔榆
榆属--黑弹树
Moraceae
桑属--桑树
构树属--构树
柘树属--柘树
胡桃目Juglandales
胡桃科Juglandaceae
核桃属--核桃
枫杨属--枫杨
山毛榉目Fagales
桦科Betulaceae
石竹亚纲Caryophyllidae
石竹目Caryophyllales
仙人掌科Cactaceae
马齿苋科Portulacaceae
蓼目Polygonales
五桠果亚纲Dilleniidae
五桠果目Dillaniales
芍药科Paeoniaceae
山茶目Theales
猕猴桃科Actinidiaceae
猕猴桃属--猕猴桃
锦葵目Malvales
锦葵科Malvaceae
木槿属Hibiscus
梧桐科Sterculiaceae
椴树科Tiliaceae
猪笼草目Napenthales
堇菜目Violales
葫芦科Cucurbitaceae
西番莲科Passifloraceae
柽柳科Tamaricaceae
杨柳目Salicales
杨柳科Salicaceae
杨属-毛白杨-加杨-青杨-大官杨
柳属--旱柳-垂柳-杞柳
杜鹃花目Ericales
柿目Ebenales
柿科Ebenaceae
柿树属--柿树-软枣
蔷薇亚纲Rosidae
蔷薇目Rosales
蔷薇科Rosaceae
梨属--白梨
苹果属--苹果，海棠
山楂属--山楂
樱属--杏-桃
蔷薇属--月季-玫瑰-蔷薇
豆目Fabales
含羞草科Mimosaceae
合欢属--合欢
苏木科Caesalpinaceae
皂英属
皂英
蝶形花科Fabaceae
槐属--国槐
紫穗槐属--紫穗槐
刺槐属--刺槐
紫藤属--紫藤
桃金娘目Myrtales
石榴科Punicaceae
石榴属--石榴
使君子科Combretaceae
红树目Rhizophorales
山茱萸目Cornales
珙桐科Nyssaceae
珙桐属--珙桐
檀香目Santalales
卫矛目Celastrales
冬青科Aquifoliaceae
大戟目Euphorbiales
黄杨科Buxaceae
黄杨属--雀舌黄杨-锦熟黄杨
鼠李目Rhamnales
鼠李科Rhamnaceae
鼠李属--长叶冻绿-园叶鼠李-薄叶鼠李-冻绿
匀儿茶属--多花勾儿茶-
枳属--枳-毛枳
枣属--枣树
铜钱树属--铜钱树
猫乳属--猫乳
雀梅藤属--钩状雀梅藤
雀梅藤属--雀梅藤
葡萄科Vitaceae
葡萄属--葡萄-东南葡萄-薄叶葡萄-刺葡萄
蛇葡萄属--闪光蛇葡萄-蛇葡萄-小叶蛇葡萄
爬山虎属--爬山虎-粉叶爬山虎-三叶爬山虎
乌蔹莓属--乌蔹莓-
亚麻目Linales
古柯科Erythroxylaceae
无患子目Sapindales
苦木科Simaroubaceae
臭椿属--臭椿
楝科Meliaceae
楝属--苦楝
香椿属--香椿
橄榄科BurseraceaeAceraceae
芸香科Rutaceae
柑橘属
牻牛儿苗目Geraniales
凤仙花科Balsaminaceae
伞形目Apiales
山龙眼目Proteales
胡颓子科Elaeagnaceae
胡颓子属--铜色叶胡颓子木半夏-胡颓子-牛奶子
虎儿草目
茶藨子科
醋栗属
菊亚纲Asteridae
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