《环境微生学》.docx
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《环境微生学》
《环境微生物学》
课程大纲
华东师范大学资源与环境科学学院环境科学系
《环境微生物学》课程建设小组
内容提要:
主要介绍环境中微生物的主要类群及它们的生理、生态特性、微生物与环境污染的关系,污染物的微生物降解于转化规律,微生物在环境污染防治中的应用,以及环境微生物学实验、研究的基本方法和技能。
教材:
参考书目:
《环境微生物学》,史家樑、徐亚同、张圣章编著,华东师范大学出版社,上海,1993;
徐亚同、史家樑、张明编著,《污染控制微生物工程》,北京,化学工业出版社,2001
沈萍主编,《微生物学》,高等教育出版社,北京,2000;
周群英,高廷耀编著,《环境工程微生物学》(第二版),北京,高等教育出版社,2000;
马文漪,杨柳燕编著,《环境微生物工程》,南京,南京大学出版社,1998;
王建龙、文湘华编著,《现代环境生物技术》,北京,清华大学出版社,2001;
贺延龄、陈爱侠编著,《环境微生物学》,北京,中国轻工业出版社,2001;
戴华生、邱文芳编著,《环境微生物学》,南昌,江西教育出版社,1985;
翁稣颖等编著,《环境微生物学》,科学出版社,北京,1985;
J.Nicklin,K.Graeme-Cook,T.Paget&R.Killington,InstantNotesinMicrobiology(影印版),科学出版社、BiosScientificPublishersLimited,1999;
王占生、刘文君编著,《微污染水源饮用水处理》,北京,中国建筑工业出版社,1999;
周德庆著,《微生物学教程》,北京,高等教育出版社,1993年。
1.绪论
1.1前言
微生物在生态系统中的地位和作用
1.2环境微生物学的形成和发展
1.2.1微生物的发现和微生物学的发展
●微生物的发现
●微生物学发展过程
●微生物学发展过程中的重大事件、奠基人
●环境微生物学的形成
1.2.2现代环境微生物学
1.2.321世纪环境微生物学展望
1.3学习环境微生物的目的
1.4本书的主要内容和组织
小结
思考题
2.环境中微生物的主要类群
2.1微生物的特点
2.1.1个体小、种类多、分布广、代谢类型多样
✧小知识:
最小和最大的细菌
2.1.2繁殖快
2.1.3代谢强度大:
2.1.4数量多
2.1.5易变异
2.2微生物的分类
2.2.1微生物的分类单位与命名
2.2.2微生物的分类依据
2.2.3微生物的分类系统
伍斯的三界生物分类系统树
2.3细菌和古生菌
2.3.1古生菌
2.3.2细菌的形态排列
2.3.3细菌的细胞大小
2.3.4细菌细胞的结构和功能
●细胞壁(细胞壁与革兰氏染色)
✧小知识:
染色的历史发展和染色原理
●细胞膜
●细胞核
●细菌质粒(plasmid)
●细胞质及其内含物
●荚膜
●鞭毛
●芽孢
✧小知识:
伴孢晶体与微生物农药
2.3.5细菌的培养特征
✧小知识:
放线菌与抗生素
2.3.6细菌的繁殖
2.3.7环境中常见的细菌种类
2.4真菌
2.4.1酵母菌
2.4.2霉菌
✧小知识:
青霉素的发现
2.5藻类
2.5.1藻类的一般特征
✧小知识:
赤潮和水华
2.5.2藻类各门特征的简介
2.6原生动物
2.6.1原生动物的一般特征
2.6.2原生动物的主要类群
●纤毛虫类
●鞭毛虫类
●肉足虫类
●吸管虫类
2.7微型后生动物
2.7.1轮虫
2.7.2线虫
2.7.3顠体虫,颤蚓和水丝蚓
2.7.4浮游甲壳动物
2.8病毒
2.8.1.病毒的特点和定义
2.8.2病毒的宿主范围
2.8.3病毒的分类和命名
2.8.4病毒的形态结构和化学组成
2.8.5病毒的复制
2.8.6病毒与宿主的相互关系
2.8.7亚病毒因子
●卫星病毒
●卫星RNA
●类病毒
●朊病毒
小结
思考题
3.环境中微生物的生理
3.1微生物的营养
3.1.1微生物的营养要求
●微生物细胞的化学组成
●营养物质及其生理功能
●微生物的营养类型
3.1.2微生物的培养基
●配制培养基的原则
●培养基类型及应用
✧小知识:
琼脂和固体培养基
3.1.3物质的运输
●扩散
●促进扩散
●主动运输
●膜泡运输
3.2微生物的代谢
3.2.1代谢概论
3.2.2微生物的产能代谢
✧小知识:
不喝酒而醉酒的秘密
3.2.3微生物的耗能代谢
3.2.4微生物次级代谢和次级代谢产物
3.3微生物的生长繁殖
3.3.1微生物生长的概念
✧小知识:
不可培养的微生物
3.3.2测定微生物群体生长的方法
3.3.3微生物群体生长繁殖
●细菌群体生长规律
●细菌群体生长的数学模型和主要生长参数
●同步培养
●连续培养
3.3.4环境对对微生物生长的影响
●温度
✧小知识:
微生物生存的温度极限
●氧气
●pH
●营养物质
●水的活性
3.3.5微生物生长繁殖的控制
✧小知识:
灭菌、消毒、防腐和化疗
●化学物质
●物理因素
小结
思考题
4微生物的遗传和变异
4.1遗传变异的物质基础
4.1.1DNA
✧小知识:
微生物产生的抗生素为什么不杀死自己?
4.1.2RNA
4.1.3细菌质粒
✧小知识:
“第二遗传密码”-“折叠密码”?
4.2基因突变和诱变育种
4.2.1基因突变
4.2.2诱变育种
✧小知识:
DNAShuffling技术育种
4.3基因重组
4.3.1原核微生物的基因重组
4.3.2真核微生物的基因重组
✧小知识:
体内基因重组育种
4.4基因工程
4.4.1基因工程的发展历史
4.4.2基因工程的基本过程
✧小知识:
基因工程载体的分类
4.4.3基因工程的应用及展望
4.5菌种的衰退、复壮和保藏
5微生物生态
5.1微生物在自然环境中的分布
5.1.1自然环境中微生物的生态学特点
●微环境或微生境(Microhabitat)
●表面环境与附着
●营养
●生长速度
●影响生态系统的群体水平
5.1.2陆生生境中的微生物
●土壤中的微生物
5.1.3水生生境中微生物
●陆地水域中的微生物
●海洋中的微生物
5.1.4大气生境中的微生物
5.1.5极端环境中的微生物
✧小知识:
极端环境微生物与PCR
5.2微生物群落发展和演替
5.2.1演替及其类型
5.2.2微生物群落的演替实例
●可溶性有机物进入湖泊时发生的演替
●土壤形成过程及微生物的演替
●落叶的分解及微生物的演替
●水田土壤的还原过程
●食品腐败和发酵中的微生物演替
●人与动物肠道中微生物类群的动态变化
5.3微生物在自然界物质循环中的作用
5.3.1碳素循环
●碳素循环的过程
●微生物与含碳有机物的分解
✧小知识:
吃温室气体的细菌
●水生环境中的碳素循环
5.3.2氮素循环
●氮素同化
●氨化作用
●硝化作用
✧小知识:
硝化细菌的AMO基因
●反硝化作用
●固氮作用
5.3.3硫素循环
●硫素同化
●硫素矿化
●硫素的氧化作用
5.3.4磷素转化
●有机磷的矿化作用
●难溶性无机磷的可溶化作用
✧小知识:
磷矿开采与水体富营养化
●磷的同化作用
5.4微生物间以及它与其它生物间的相互关系
5.4.1微生物间的相互关系
●种间共处
●互生
●共生
●拮抗
●竞争
●寄生
●捕食
5.4.2微生物与高等植物间的相互关系
●互生关系
●共生关系
●寄生关系
5.4.3微生物与人体及动物间的相互关系
●互生
●共生
✧小知识:
会种“粮食”的白蚁
●寄生
6微生物对环境造成的污染和危害
6.1耗氧有机物对水体的污染
6.2耐酸细菌与酸性矿水的污染
6.3微生物引起的管道堵塞与厌氧锈蚀
6.4微生物引起的硝酸盐还原对人体的影响
6.4.1引起高铁血红蛋白症
6.4.2生成亚硝胺
6.5汞的生物甲基化
6.6砷的还原与甲基化
6.7微生物毒素与食品污染
6.7.1霉菌毒素
6.7.2细菌毒素
6.7.3放线菌毒素
6.7.4藻类毒素
7微生物对污染物的降解和转化
7.1有机污染物的生物降解
7.1.1有机污染物的降解
7.1.2微生物的生物化学降解作用
7.2微生物分解有机污染物的巨大潜力
7.2.1极其多样的代谢类型,使自然界存在的有机物几乎都能被微生物所分解。
7.2.2很强的变异性,使很多微生物获得了降解人工合成大分子有机物的能力。
7.2.3共代谢机制的存在,大大拓展了微生物对难降解有机污染物的作用范围。
7.2.4通过改变有机物的化学结构,提高生物降解性。
7.3有机污染物生物降解性的测定方法
7.3.1测定生物氧化率
7.3.2测呼吸线
7.3.3测定相对耗氧速率曲线
7.3.4B/C比
7.3.5COD30
7.3.6培养法
7.4微生物降解动力学
7.4.1指数速度模型
7.4.2双曲线速度模型
7.4.3有机化合物降解过程与降解反应速度方程的拟合
7.5污染物生物降解途径
7.5.1有机物的微生物降解途径
●生物组分的大分子有机物的降解
●烃类的微生物降解与转化
●农药的微生物降解与转化
●其他合成有机物的微生物降解与转化
7.5.2金属的微生物转化
7.5.3微生物脱硫
8微生物在环境污染防治中的应用
8.1微生物在水污染控制中的应用
8.1.1水污染指标
●BOD
●COD
8.1.2废水生物处理的原理
●天然水体的自净作用
●废水生物处理的原理
8.1.3活性污泥法
8.1.4生物膜法
8.1.5厌氧生物处理
8.1.6光合细菌法处理
8.1.7生物脱氮
8.1.8生物除磷
8.1.9微污染饮用源水的微生物处理
8.2微生物在固体废弃物处理中的应用
8.2.1城市生活垃圾的微生物处理
8.2.2污泥的微生物处理
8.2.3禽畜粪便处理与资源化工程
8.2.4废弃物的微生物资源化
8.3微生物在大气污染控制中的应用
8.3.1微生物脱臭和对有机废气的处理
8.3.2微生物固定二氧化碳
8.4微生物在污染预防中的应用
8.4.1煤的微生物脱硫
8.4.2化石燃料的微生物脱氮
8.4.3生物制浆
8.5生物修复
8.6废弃物的微生物资源化
8.7绿色环保产品的开发和应用
8.8环境监测与微生物
8.8.1粪便污染的指示菌
8.8.2评价水质的污水生物系统
8.8.3致癌物的微生物检测
8.8.4环境毒物的发光细菌检测法
8.8.5微生物传感器
9环境微生物学方法
9.1显微镜和显微技术
9.2常用来研究细菌的实验技术
9.3环境中微生物类群的观察
9.4水质的细菌学检测
9.4.1水中细菌总数的检测
9.4.2水中大肠菌群细菌的检测
9.5活性污泥及生物膜生物相观察
9.5.1活性污泥或生物膜微生物的显微镜观察及微型动物的计数
9.5.2活性污泥中丝状微生物的鉴别污染物高效降解微生物的分离培养应用技术
9.6活性污泥耗氧速率及脱氢酶活性测定
9.7厌氧污泥活性的测定
9.8污染物高效降解微生物的分离培养
9.9遗传工程技术
9.10分子生物学技术在环境微生物研究中的应用
9.11利用发光细菌法监测环境中有毒污染物
9.12用Ames法检测环境中致癌物
9.13微生物菌剂的生物安全性检测