分子生物学名词解释+简答.docx

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分子生物学名词解释+简答

一、名词解释

1、广义分子生物学:

在分子水平上研究生命本质的科学,其研究对象是生物大

分子的结构和功能。

2、狭义分子生物学:

即核酸(基因)的分子生物学,研究基因的结构和功能、

复制、转录、翻译、表达调控、重组、修复等过程,以及其中涉及到与过程相关

的蛋白质和酶的结构与功能

3、基因:

遗传信息的基本单位。

编码蛋白质或RNA等具有特定功能产物的遗

传信息的基本单位,是染色体或基因组的一段DNA序列(对以RNA作为遗传信

息载体的RNA病毒而言则是RNA序列)。

4、基因:

基因是含有特定遗传信息的一段核苷酸序列,包含产生一条多肽链或

功能RNA所必需的全部核苷酸序列。

5、功能基因组学:

是依附于对DNA序列的了解,应用基因组学的知识和工具

去了解影响发育和整个生物体的特定序列表达谱。

6、蛋白质组学:

是以蛋白质组为研究对象,研究细胞内所有蛋白质及其动态变

化规律的科学。

7、生物信息学:

对DNA和蛋白质序列资料中各种类型信息进行识别、存储、

分析、模拟和转输

8、蛋白质组:

指的是由一个基因组表达的全部蛋白质

9、功能蛋白质组学:

是指研究在特定时间、特定环境和实验条件下细胞内表达

的全部蛋白质。

10、单细胞蛋白:

也叫微生物蛋白,它是用许多工农业废料及石油废料人工培养

的微生物菌体。

因而,单细胞蛋白不是一种纯蛋白质,而是由蛋白质、脂肪、碳

水化合物、核酸及不是蛋白质的含氮化合物、维生素和无机化合物等混合物组成

的细胞质团。

11、基因组:

指生物体或细胞一套完整单倍体的遗传物质总和。

12、C值:

指生物单倍体基因组的全部DNA的含量,单位以pg或Mb表示。

13、C值矛盾:

C值和生物结构或组成的复杂性不一致的现象。

14、重叠基因:

共有同一段DNA序列的两个或多个基因。

15、基因重叠:

同一段核酸序列参与了不同基因编码的现象。

16、单拷贝序列:

单拷贝顺序在单倍体基因组中只出现一次,因而复性速度很慢。

单拷贝顺序中储存了巨大的遗传信息,编码各种不同功能的蛋白质。

17、低度重复序列:

低度重复序列是指在基因组中含有2~10个拷贝的序列

18、中度重复序列:

中度重复序列大致指在真核基因组中重复数十至数万(<105)

次的重复顺序。

其复性速度快于单拷贝顺序,但慢于高度重复顺序。

19、高度重复序列:

基因组中有数千个到几百万个拷贝的DNA序列。

这些重复

序列的长度为6~200碱基对。

20、基因家族:

真核生物基因组中来源相同、结构相似、功能相关的一组基因,

可能由某一共同祖先基因经重复和突变产生。

21、基因簇:

基因家族的各成员紧密成簇排列成大段的串联重复单位,定位于染

色体的特殊区域。

22、超基因家族:

由基因家族和单基因组成的大基因家族,各成员序列同源性低,

但编码的产物功能相似。

如免疫球蛋白家族。

23、假基因:

一种类似于基因序列,其核苷酸序列同其相应的正常功能基因基本

相同、但却不能合成功能蛋白的失活基因。

24、复制:

是指以原来DNA(母链)为模板合成新DNA(子链)的过程。

或生

物体以DNA/RNA为模板合成DNA/RNA的过程。

25、半保留复制:

DNA复制过程中,新合成的子代DNA分子中,一条链是新

合成的,另外一条链来自亲代,这种复制方式称为半保留复制。

26、复制子:

基因组上能够独立进行复制的单位,包括复制起点和复制终点。

所有的原核生物的染色体、噬菌体仅有一个复制子;真核生物的染色体有多个复

制子

27、复制起始点:

DNA分子上起始复制并控制复制起始频率的特定位置

28、复制终点:

终止复制的位点。

29、复制叉:

又称生长点,复制开始时,起始点处的DNA双螺旋要解链,松

开的两股链和未松开的双螺旋形状象一把叉子,称为复制叉,是复制有关的酶和

蛋白质组装成新的复合物和新链合成的部位。

30、引物:

是人工合成的与模板DNA互补的寡核苷酸序列

31、简并引物:

是指代表编码单个氨基酸所有不同碱基可能性的不同序列的混合

物。

32、相向复制:

从两个起点开始两条链的复制,形成两个复制叉,各以一条链为

模板单一方向复制出一条新链。

33、单向复制:

复制从一个起始点开始,只有一个复制叉,以同一方向生长出两

条链。

34、双向复制:

从一个起始点开始,沿着两个相反的方向形成两个复制叉,一方

向移动,两条DNA链都被作为模板,各生长出两条新链,形成一个复制泡,用

电子显微镜可以观察到复制泡的存在。

这是原核生物和真核生物DNA复制最主

要的形式

35、D环复制:

又称取代环复制,是线粒体DNA的复制形式。

复制中呈字母D

形状而得名。

36、DNA的半不连续复制:

DNA在复制过程中,一条链合成是连续的,而另一

条链合成是不连续的,这样的复制过程称为半不连续合成。

37、冈崎片段:

DNA复制时,以5’→3’方向的母链作为模板,子链沿5’→3’

最初合成长短不一、不连续核苷酸小片段,最后连接成为完整子链,这些小片段

称之为岗崎片段。

38、前导链:

以3’→5’方向DNA链为模板链,子代DNA以5’→3’方向连

续合成,称为前导链。

39、后随链:

以5’→3’方向DNA链为模板链,子代DNA以5’→3’方向不

连续合成,形成许多不连续的冈崎片段,最后连接成一条完整的DNA链,称为

后随链,又称后滞链。

40、引物酶:

又称引发酶,合成起始引物,引物长度为10-60个核苷酸,E.coli

中是DnaG蛋白。

41、RNA聚合酶:

以一条DNA链或RNA链为模板催化由核苷-5′-三磷酸合成

RNA的酶。

促进DnaA活性,促进复制起始。

42、端粒:

真核生物线性染色体DNA的两端是一种特殊结构称为端粒功能:

稳定染色体末端结构,防止染色体末端融合、重组、降解;补偿5’末端在切除

RNA引物后留下的空缺

43、DNA的损伤:

生物体生命过程中DNA双螺旋结构发生的任何改变都称之为

DNA损伤。

44、DNA修复:

是细胞对DNA受损伤后的一种反应。

主要包括:

直接修复、切

除修复、错配修复、重组修复、易错修复和SOS应急反应

45、光修复:

光裂合酶能特异地和嘧啶二聚体结合,在可见光下催化光化合反应,

使环丁烷环回复到两个独立的嘧啶,这一过程叫光复活作用。

46、应急反应(SOS反应):

许多能造成DNA损伤或抑制DNA复制的过程能引

起一系列复杂的诱导效应,这种效应称为应急反应(SOS反应)

47、同义突变:

指突变改变了密码子的组成,但由于密码子的简并性没有改变所

编码的氨基酸序列的突变

48、错义突变:

指基因突变改变了所编码氨基酸的序列,不同程度地影响蛋白质

和酶的活性。

49、无义突变:

指基因改变使代表某种氨基酸的密码子变为终止密码子,导致肽

链合成过早终止。

50、致死突变:

有些错义突变和无义突变严重影响到蛋白质活性甚至完全无活

性,从而影响了表现型。

51、渗漏突变:

有些错义的产物仍然有部分活性,使表现型介于完全的突变型和

野生型之间的中间类型。

52、中性突变:

有些错义突变不影响或基本上不影响蛋白质活性,不表现出明显

的性状变化。

53、电泳:

带电颗粒在电场的作用下,向着与其电性相反的电极移动,称为电泳。

54、迁移率:

是指带电颗粒在单位电场下泳动的速度。

影响迁移率的内在因素:

(1)样品所带静电荷的多少

(2)样品颗粒大小(3)样品分子空间构象影响

迁移率的外界因素:

电场强度、电泳缓冲液的离子强度、电泳缓冲液的pH值、

支持物及其浓度的影响、插入染料的影响、温度的影响、电渗

55、DNA重组:

又称遗传重组,指DNA分子内或分子间发生遗传信息的重新组

合,重组产物叫重组DNA

56、同源重组:

又称一般性重组,指发生在两条同源DNA分子之间,通过配对、

链断裂和再连接,而产生片段交换过程。

重组产物称为重组体

57、Holliday中间体:

同源重组中,两条同源的DNA分子经过配对、断裂和再连

接,形成的连接分子,称为Holliday中间体

58、Chi位点:

它是刺激重组的位点。

这一位点是由8个碱基组成的非对称序列

59、特异位点重组:

指发生在一个特定的短DNA序列内,由特异的酶和辅助因子

识别和作用的重组。

60、单链同化:

单链DNA与同源双链DNA分子发生链的交换,从而使重组过

程中DNA配对、Holliday中间体的形成、分支移动等步骤得以实现的过程。

61、转座子:

基因组上中可以移动的DNA片段。

转座子由基因组的一个位置转

移到另一个位置的过程叫转座

62、反转座子:

又称反转录转座子或反转录子,是一类在转座过程中需要以RNA

为中间体,经过反转录过程再分散到基因组中的转座子。

生物学意义:

对基因表

达的影响;反转座子介导基因的重排;反转座子在进化中的作用

63、转录:

生物体以DNA为模板合成RNA的过程。

64、反转录:

生物体以RNA为模板合成DNA的过程。

65、剪接:

真核生物RNA前体去除内含子,连接外显子的过程。

66、剪接体:

在mRNA前体内含子的剪接过程中,由多个核内小分子核糖核酸

(snRNA)和蛋白质组装形成催化剪接反应的复合体。

67、模板链:

“-链”、“反义链”,指用于转录的DNA单链,是合成RNA的模

68、编码链:

“+链”、“有义链”、“非模板链”,指模板链的对应DNA链,碱基

序列与mRNA一致(DNA:

T,RNA:

U)

69、编码序列:

编码序列从AUG开始以三核苷酸单位阅读直到出现终止密码

UGA,UAA或UAG之一。

70、RNA编辑:

是指转录后的RNA在编码区发生碱基的插入、丢失或替换等现

象。

编辑的生物学意义:

(1)改变和补充遗传信息;

(2)增加基因产物的多样性,

是基因调控的一种方式,有利于进化;(3)可能与学习和记忆有关

71、反式作用因子:

通过扩散到与其编码基因不在同一个DNA分子上的靶位置,

识别、结合而调节基因表达的分子。

如转录因子、RNA聚合酶

72、顺式作用元件:

通常只在原位影响与其处于同一个DNA分子上的、物理上

紧密相连、被表达的基因序列。

通常不编码蛋白,多位于基因旁侧或内含子中。

如启动子、终止子、增强子、操纵基因、MAR

73、启动子:

位于转录起始点附近,且为转录起始所必需,可被RNA聚合酶特

异性识别、结合,并起始转录的一段保守DNA序列,其本身不被转录。

74、-10序列(Pribnow框):

几乎所有原核基因的启动子中,在转录起始位点

上游-10bp位点区域都有一个典型的6bp区域,共有序列为TATAAT

(T80A95T45A60A50T96)序列,称为-10序列或Pribnow框。

75、-35序列(Sextama框):

转录起始位点上游约-35bp处有一段6bp区域,

共同序列为TTGACA(T82T84G78A65C54A45),称为-35序列(Sextama框)

76、操纵子:

是原核生物在分子水平上基因表达调控的单位,由调节基因、启动

子、操纵基因和结构基因等序列组成。

77、增强子:

指能使基因转录频率明显增加的DNA远端调控序列

78、强终止子:

无需其他蛋白质因子的帮助,而是依靠转录产物形成特殊的二级

结构就可以终止转录,这种终止子被称为内部终止子。

79、弱终止子:

需要在一种蛋白质因子ρ的帮助才能终止,所以又称为ρ依赖性

终止子。

80、结构基因:

编码参与细胞结构或代谢活动的结构蛋白、酶的基因。

81、操纵基因:

指操纵子中常与启动子相邻或重叠的序列,被有活性调节蛋白结

合后,影响启动子启动下游结构基因转录,是一类顺式作用元件。

82、调节基因:

编码控制其它基因表达的蛋白质或RNA的基因。

83、调节蛋白:

是调节基因产物,有活性调节蛋白可与操作基因结合,控制下游

结构基因转录。

84、效应物:

调节蛋白需要有一个小分子物质结合并改变其活性,共同调节结构

基因转录,这个小分子物质称为效应物(effector)

85、CAP:

(降解物活化蛋白)或CRP(环腺苷酸受体蛋白)是分子量为22.5kd

的二聚体

86、顺反子:

遗传学将编码一个蛋白质或多肽的遗传单位称为顺反子(cistron)。

87、多顺反子:

原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位,转录生成的

mRNA可编码几种功能相关的蛋白质,为多顺反子(polycistron)。

88、单顺反子:

真核mRNA只编码一种蛋白质,为单顺反子(singlecistron)。

89、遗传密码:

DNA(或mRNA)中的核苷酸序列与蛋白质中氨基酸序列之间的

对应关系称为遗传密码。

特点:

连续性、简并性、通用性、变异性、方向性、变

偶性

90、密码子:

mRNA上每3个相邻的核苷酸编码蛋白质多肽链中的一个氨基酸,

这三个核苷酸就称为一个密码子或三联体密码。

91、同义密码子:

同一种氨基酸具有两个或更多密码子的现象称为密码子的简并

性。

对应于同一种氨基酸的不同密码子称为同义密码子。

92、开放阅读框架:

从mRNA5AUG到3

的核苷酸序列,按照三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链,称为开放阅读

框架(openreadingframe,ORF)。

93、RNA的再编码:

mRNA以不同的方式翻译,改变原来编码信息,称为RNA

的再编码

94、氨基酸的活化:

是指氨基酸与tRNA相连,形成氨酰-tRNA的过程。

氨基酸

的活化在细胞质中进行。

反应由氨酰-tRNA合成酶(又称氨基酸活化酶)催化。

意义:

(1)使氨基酸本身被活化,利于下一步形成肽键反应。

(2)tRNA可携带

氨基酸到mRNA的指定部位,使氨基酸进入到肽链合适的位置

95、安慰诱导物:

又称义务诱导物:

能高效诱导酶的合成,但不是酶作用底物,

与酶底物结构类似的分子

96、应急反应:

当细菌能源十分缺乏时,几乎所有的生化反应都停止,为生存,

细菌体内可立即产生一种应急应答反应,关闭许多基因表达。

97、反式作用因子:

通过扩散到与其编码基因不在同一个DNA分子上的靶位置,

识别、结合而调节基因表达的分子。

如转录因子、RNA聚合酶

98、顺式作用元件:

通常只在原位影响与其处于同一个DNA分子上的、物理上

紧密相连、被表达的基因序列。

通常不编码蛋白,多位于基因旁侧或内含子中。

如启动子、终止子、增强子、操纵基因、MAR

99、转录后的加工:

是指将各种前体RNA分子加工成成熟RNA的过程。

100、信号序列:

所有靶向输送的蛋白质结构中存在分选信号,主要为N末端特

异氨基酸序列,可引导蛋白质转移到细胞的适当靶部位,这一序列称为信号序

列。

101、分子伴侣:

分子伴侣是细胞一类保守蛋白质,可识别肽链的非天然构象,

促进各功能域和整体蛋白质的正确折叠。

102、应急反应(strigentresponse:

)当细菌能源十分缺乏时,几乎所有的生化反应

都停止,为生存,细菌体内可立即产生一种应急应答反应,关闭许多基因表达。

103、管家基因:

在生物体几乎所有的细胞中始终表达的基因,表达产物大致以

恒定水平始终存在于细胞内,是维持细胞最低限度功能所不可缺少的基因,是

细胞生存所必须的。

这类基因的表达称为组成型表达

104、奢侈基因:

只在特定的细胞类型或细胞生长发育特定时间表达的基因。

类基因的表达称为可调节表达

105、核基质结合区:

30nm染色质纤维以特定的DNA序列结合在核基质上,这

些特定DNA序列称为MAR,它使纤维状的染色质DNA形成数以万计的环状结

构域。

106、绝缘子:

是一类特殊的顺式作用元件,阻止激活或阻遏作用在染色质上的

传递,使染色质活性限定于结构域内

107、座位控制区(LCR):

是一种远距离顺式元件,为相连接的基因提供了一个

可以活化的染色体环境,可能是DNaseI的超敏感位点和许多转录因子结合位点,

可促进基因转录

108、CpG岛:

真核生物基因组中,常见富含的CpG的区域,称为CpG岛,常

位于转录调控区及其附近,其甲基化程度直接影响转录活性。

109、DNA甲基化:

真核生物DNA双螺旋中,胞嘧啶核苷的嘧啶环5位甲基化,

并与其上的鸟嘌呤形成mCpG,是DNA甲基化的唯一形式

110、高速泳动蛋白(HMG):

活性染色质中含有两种高度丰富的小分子非组蛋

白,这些蛋白具有异常高的电荷,在凝胶电泳中移动快,所以称为高速泳动蛋白

(HMG)

111、小卫星DNA序列:

又称可变数目串联重复,重复单位6-40bp,每个拷贝

长度0.1-20Kb(6-100次),分为位于邻近染色体端粒的区域(端粒家族),以及

分散在基因组的多个位置上(高变家族),一般没有转录活性。

112、增强子:

指能使基因转录频率明显增加的DNA远端调控序列。

二、填空题

1、原核生物复制方式:

θ型复制、滚环复制、D环复制

2、真核生物复制方式:

多起点双向复制

3、真核生物基因组组分包括:

核内染色体DNA、核外细胞器DNA(线粒体DNA、

叶绿体DNA)、质粒

4、真核生物DNA序列类型:

单拷贝序列、低度重复序列、中度重复序列、高

度重复序

5、PCR体系:

引物、DNA聚合酶模板dNTPMg2+浓度

6、反式作用因子结构包括:

DNA结合结构域、转录激活结构域、二聚体结构域,

其中,DNA结构域包括:

螺旋-转角-螺旋(HTH)结构基序、锌指(ZF)结构

基序、螺旋-突环-螺旋(HLH)结构基序、亮氨酸拉链(LZ)结构基序

7、DNA的提取的一般步骤

1、准备生物材料2、裂解细胞3、去除杂质4、沉淀DNA5、检测6、

保存

三、简答论述题

1、增强子为什么具有远距离作用呢?

答:

成环模型:

认为增强子通过一些蛋白质因子的介导可与远距离的启动子

结合,使DNA形成了一个环,从而促使远距离的启动子的转录。

成环模型也符

合染色体的侧环模型和核基质的调控理论,也就是说DNA的特殊序列可以和核

基质结合形成侧环,在某些细胞中有些基因通过环的形成让增强子区和启动子区

相互靠近,使这些基因能得以表达。

看来环的形成主要是两种因素:

①某些蛋白

质因子的介导;②和核基质特异的结合

2、病毒基因组的结构特点

答:

a与细菌相比,病毒基因组很小,大小相差较大。

b病毒基因组由DNA组成,也可以由RNA组成,每种病毒颗粒中只含

有一种核酸,核酸结构可以是单链或双链、环状或线状。

c有重叠基因。

d大部分是用来编码蛋白质的,基因间的间隔序列较短。

e功能上相关的基因集中成簇,在基因组的特定的部位,形成一个功能单

位或转录单元,转录产物为多顺反子,之后经过简单加工。

f噬菌体的基因是连续的;而真核细胞病毒的基因是不连续的,具有内

含子。

3、细菌染色体基因组结构的一般特点

答:

☆细菌的染色体基因组通常仅由一条环状双链DNA分子组成,染色

体相对聚

集在一起,形成一个较为致密的区域,称为类核。

☆只有一个复制起点,数个相关的结构基因串联在一起,受同一调控

区调节,合

成多顺反子mRNA。

☆具有操纵子结构。

☆编码蛋白质的基因都是单拷贝,但rRNA基因是多拷贝。

☆和病毒的基因组相似,非编码的DNA部份所占比例比真核细胞基

因组少得多。

☆基因组DNA中具有多种调控区如复制起始区、复制终止区、转录

启动区和终

止区等,还有重复序列,比病毒基因组复杂。

☆具可移动的DNA序列

4、真核生物基因组的特点

答:

☆真核生物的基因组比较庞大,具有多个复制起始点。

☆一个基因组包括多条线状染色体,每条染色体DNA上有多个复制

起始点。

☆真核生物的基因组DNA与蛋白质结合形成染色质的复杂高级结构,

储存于细

胞核内。

☆真核细胞被核膜分隔成细胞核和细胞质,在基因表达中,转录和翻

译在时间和

空间上被分隔,不偶联。

☆真核生物基因组存在着许多重复序列,重复序列单位长度不一,重

复程度各异。

☆真核生物的蛋白质基因一般以少拷贝形式存在,转录产物为单顺反

子。

☆存在着可移动的DNA序列。

☆大多数真核生物基因含内含子,为断裂基因。

5、滚环复制特点:

(1)共价延伸;

(2)模板链和新合成的链分开;

(3)不需RNA引物,在正链3‘-OH上延

(4)只有一个复制叉;

(5)形成多联体;

6、D环复制的特点:

D环复制的特点是:

复制起始点不在双链DNA同一位点,内、外环复制有

时序差别。

7、DNA聚合酶反应特点

☆以4种dNTP作为底物

☆反应需要接受模板指导

☆链延伸需要引物3’-羟基存在

☆新链延伸方向5’→3’

☆产物DNA极性与模板相对

8、DNA聚合酶I的结构

DNA聚合酶I有5个结合位点:

(1)模板结合位点

(2)引物结合位点

(3)底物dNTP结合位点

(4)5‘→3’外切酶结合位点

(5)3'→5'校正位点

9、DNA聚合酶I的主要活性和生理功能

5’→3’聚合活性:

催化条件:

4×dNTP、Mg2+、模板DNA(双链)、

RNA引物;可用与DNA测序

3’→5’外切活性:

无dNTP是外切活性,有dNTP时,校正作用

5’→3’外切活性

内切酶活性

生理功能:

滞后链合成中除去RNA引物并添补其留下的缺口;参与DNA

损伤修复

10、DNA聚合酶II的主要活性

5’→3’聚合活性

3’→5’外切活性

生理功能:

修复中起作用

11、DNA聚合酶III的主要活性

多亚基酶

5’→3’聚合活性

3’→5’外切活性

生理功能:

是体内DNA复制的主要承担者

12、DNA的复制过程

1、复制的起始

DNA解旋、解链,形成复制叉:

拓扑异构酶、解旋酶及单链DNA结合蛋

RNA引物合成:

依赖于单链模版,由引物酶催化合成一小段RNA引物

特点:

原核环形DNA通常只有一个起点,双向复制;真核线性DNA通

常多个起始点,形成多个复制叉

2、复制的延长

子链延长:

引物合成后,由polII催化,在引物3’-OH

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