分子生物学小问题整理.docx
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分子生物学小问题整理
第一章
10.二级结构
a螺旋b折叠helixandsheet
11.疏水相互作用非极性分子远离水分子而互相聚集在一起第二章
1.核酸长的小分子聚合物
2.核苷酸含氮碱基糖三磷酸
3.
一环嘧啶2N
4.
二环嘌呤4N
5.
大小沟majorminor蛋白质大多结合在大沟
7.
8.
变性260nm单链DNA吸收很多光复性了解一下
1.DNA链中的碱基序列可以用来保存生产蛋白质的氨基酸序列信息
10.3.对某些类型的损伤进行修复
11.4.一定的脆弱性第三章
1.原核生物转录
2.起始:
闭合启动子复合体开放启动子复合体取得立足点启动子清空
3.延伸:
局部分幵两条链,RNA聚合酶创造了一个幵口转录泡
4.终止内在型重视和P依赖型终止结合到RNA上形成发夹
6.操纵子:
被协同调控的基因组织起来的结构
包含一个启动子和操纵基因
5.对基因的表达进行调控何时该表达什么蛋白特殊时期特殊表达。
。
operator)
7.
乳糖操纵子:
没有乳糖时乳糖会与lac阻遏蛋白结合别构调控
8.
正调控CAP能感应葡萄糖水平低->激活lac基因的转录不与葡萄糖直接结合
9.
乳糖诱导物诱导了转录
与CAMP这样的小分子结合而发挥作用成反比(CAM繭葡萄糖)
10.色氨酸操纵子trp阻遏蛋白辅阻遏物
11.衰减作用:
确保转录被彻底阻遏
12.边转录边翻译偶联转录-翻译第四章
1.RNA聚合酶IrRNA2.IIItRNA5SrRNAU6RNA
3.IISRNAMRNA
2.TFIID8-10subunits
1.通用转录因子与RNA聚合酶II在启动子位置形成的组合称为RNA前起始复合体
其中一个TATA结合蛋白(TBP)必须作为组织中
看就不是合格的程序员
3.TAFIIsTBP相关因子取名就不能取得有意思一点
可读性极差不是必须的
10.激活蛋白也通过改变基因中DNA勺高级包装情况来促进转录
1.真核生物mRNA勺修饰7-甲基鸟嘌呤核苷
theCTD
第五章
第六章看问题第七章
1.组蛋白尾对组蛋白发挥调控作用是十分重要勺,因为它上面勺一些氨基酸残基可以发生改变乙酰基甲基磷酸等基团可以共价连接上去
2.赖氨酸乙酰化正电->中
3.甲基化激活转录也可阻遏转录
4.染色质重塑蛋白能对组蛋白密码发生相应响应
4.小RNA调控Mrna稳定性RISC的蛋白复合体这一复合体选用小RNA两条链中的
一条并用它来与目标mRNA吉合极度匹配切片不是很匹配干涉翻译
5.miRNa源自于细胞基因转录出的RNA长链中切割出来的问题
1.问题1:
生物学家知道染色体早在他们知道遗传物质是DNA之前就携带了遗传物
质。
你为什么认为花了这么长时间才发现DNA的重要性?
1)。
染色体由DNA和蛋白质组成。
所以结构上DNA和蛋白质组分都可能是遗
传物质;
2)DNA的结构仍然是未知的,因此很难让人们容易地接受DNA作作为遗传物质;
3)人们还没有找到一种好的或适当的方法来验证DNA或蛋白质是否是遗传物质。
什么
2.问题2:
许多生物学家认为,在早期的生命形式中,DNA和蛋白质非常少。
分子可以代替?
为什么这些功能很好的候选人?
答:
RNA可能已经出现了。
因为1)像DNA一羊,RNA可以在早期生活中用作遗
传物质,如病毒;
2)使用RNA还可以使病毒的早期生命直接从遗传物质中制备蛋白质,而不必像
转录一样协调中间步骤。
3)RNA的相对不稳定性在其作为遗传物质的拷贝的作用中非常重要,因为这些
拷贝需要被降解以使细胞具有动态生理学
作用,可以具有远远超出其遗传物质作用的其他功能。
核糖体是制造蛋白质的
4)RNA可折叠成各种复杂的三维形状,与肽类似。
这意味着RNA可以起到酶的
高度结构化复合物,主要由RNA组成。
3.
问题3:
JamesWatson和FrancisCrick发现DNA的结构被认为是生物学史上
最重要的发现之一。
你为什么认为这可能是这种情况?
答:
因为1)这意味着DNA分子的结构已被证明
2)它也提示DNA的复制机制,揭示生命的奥秘。
4.
3)它被认为是分子生物学诞生的象征
问题4:
“基因”的概念并不简单,我们才刚刚开始发现基因是或可能是什么。
你目前对什么是基因的理解?
9.
问:
DNA复制如此复杂的一些约束条件是什么?
10.答案:
DNA复制是复杂的,因为没有步骤可以在没有蛋白质帮助的情况下快速或
自发地发生。
一些所需的蛋白质含有内在的限制,例如DNA聚合酶只能在5'-
3'方向合成新的DNADNA聚合酶由10个亚基组成,每个亚基具有独特的功能,
DNA聚合酶也具有校对功能-3'-5'和5'-3'外切酶活性,等等。
11.问题:
真核细胞在DNA复制过程中面临的问题是什么,原核生物不需要处理?
12.答:
1)真核生物基因组比原核生物基因组大得多
14.
3)真核生物复制在细胞的生命周期内是协调的,并且所有的
DNA只在S期复制
13.
2)由于真核生物DNA与组蛋白相关,真核复制叉比原核叉更慢地移动
一次。
20.其次,
如果没有引物合成的引物,DNA聚合酶III不能合成DNA在引导链合成
16.染色体的末端。
17.问题:
滞后股是否比领先股更真实地合成?
为什么或者为什么不?
18.答案是肯定的,滞后股的合成速度比领先股慢得多。
原因如下:
中,除复制起点外很少需要引物。
然而,在滞后链合成中,每个冈崎片段必须以
新引物开始。
因此,首先必须为每个(1-2)kb的滞后链合成(1kb=1000bp)
添加引物。
21.
并且在DNA复制完成之前,RNA引物必须被DNA聚合酶I替换为具有53外切
22.
最后,RNA引物降解和DNA聚合酶
I合成DNA后滞后链中的空位将被连接酶密
核酸酶活性的DNA。
封。
23.
所有这些步骤都需要时间。
24.
问题:
为什么真核基因在它们的调控
DNAX域可能有许多不同的元件是重要的?
25.
答:
这是因为真核生物有更多的基因,
需要更复杂的基因表达调控。
真核生物
启动子包含核心启动子元件,TATA盒,启动子,TFIIB识别元件(BRE和下
游启动子元件(DPE以及上游启动子元件,多种保守序列,包括GC盒和CCAAT
盒。
然而,真核生物启动子几乎从未包含刚刚列出的所有元素。
不同的启动子
包含这些元素的不同组合,从而提供了一种多样性,允许将数以万计的单个基因
彼此清晰地区分开来。
26.
问题:
众所周知,许多增强子可以将数百或数千个碱基对从其正常位置移开并仍
能正常工作。
为什么或者为什么不?
27.
答:
这是因为DNA可以环绕,这使得增强子和附着的特定转录因子与预先起始复
合物接触。
因此,虽然增强子位于远离启动子的位置,但它仍然可以正常工作。
28.
问题:
蛋白质如何识别特定的DNA碱基序列?
你会期望什么样的氨基酸对于识
别和结合最重要?
29.
答:
它依赖于DNA的大沟中的结合,其中A,G,T,C的四个碱基是完全可区分
的。
然而,如果在小沟中结合,G与C无法区分,且A与T不可区分,这导致
蛋白质不能识别特定的DNA碱基序列。
预期可与DNA碱基化学基团相互作用的
蛋白质的氨基酸对于识别和结合最重要。
30.
问题:
您是否期望与RNA结合的蛋白质具有与结合DNA的蛋白质相似的结构?
为什么或者为什么不?
31.
答:
不,我不认为结合RNA的蛋白质具有与结合DNA的蛋白质相似的结构。
这是
因为与DNA的单一双链结构不同,即使在分子内,RNA也具有双链和单链结构。
事实上,RNA结合蛋白通过识别它们的序列和结构而显示出对其靶
RNA的高度特
异性识别。
到目前为止,包括RNA识别基序,双链RNA吉合基序,锌指基序在内
的三类RNA结合结构域被广泛研究和记录。
然而,所有这三类RNA结合结构域
都与那些与DNA吉合的结构不同。
RR雇75-85个氨基酸的小蛋白质结构域,
其形成针对两个a-螺旋的四链P-折叠。
dsRBM是通过a-螺旋和P1-32环结
合dsRNA的70-75个氨基酸结构域。
锌指基序不是与DNA结合的CCCH型结构
域,而是通过分子间氢键和Watson-CrickRNA边缘之间的相互作用与单链RNA
结合的CCHH型结构域。
32.
问题:
修复DNA损伤的一个重要部分是识别损伤的存在,特别是它是什么样的损
伤。
细胞用于识别各种损伤的一些机制是什么?
33.
答:
对于每种类型的DNA损伤,细胞已经发展出修复损伤或消除破坏性化合物的
特定方法。
酶光解酶通过破坏它们之间的共价键特异性识别和修复嘧啶二聚体。
06-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶从DNA结构上的鸟嘌呤碱基裂解甲基和乙基加合
物。
MMF酶能够将新合成的链识别为具有未甲基化的GATC序列的链。
大肠杆
菌中的NER开始当蛋白质UvrA和UvrB在损伤部位与DNA吉合时。
BER幵始时,
称为DNA糖基化酶的蛋白质结合受损的碱基,并通过切断与脱氧核糖连接的键
将其去除。
在NHEJ中,蛋白质Ku和DNA-PK识别并结合到DNA的每个断裂末
端。
34.问题:
你认为细胞总是转录DNA损伤修复基因吗?
你认为这些基因在某些条件
下表达更强烈吗?
为什么或者为什么不?
35.答:
是的,我认为细胞总是转录DNA损伤修复基因,以确保DNA损伤可以及时修
复。
否则,生活会陷入困境。
虽然小的突变率驱动进化,但高的突变率使得不
38.答:
有两种DNA损伤对细胞来说是最难检测和修复的,
例如易位和转位特别不可
种突变也是灾难性的。
件下的DNA损伤率高于正常条件下的DNA损伤率,因此需要更多的蛋白质来修
复它,尤其是那些仅适用于一次修复的蛋白质。
37.问题:
对于细胞来说,哪种DNA损伤最难检测和修复?
能逆转
39.问:
错配修复和核苷酸切除修复有什么区别?
40.答:
错配修复和核苷酸切除修复有三个区别。
首先,NER和MMR识别不同类型
的错误并使用不同的蛋白质来修复它们。
其次,虽然MM主要在复制期间发生,
但NER在整个细胞周期中普遍存在。
最后,MMF存在于原核生物和真核生物中,
而NER机制在真核生物和原核生物中不完全相同。
41.
你为什么认为在真核生物中对RNA进行了很多修饰?
含有内含子必须被小心切除snRNPs
46.
除了编码蛋白质之外,您还能从多少个实例中了解哪些
RNA具有功能?
加帽提高mRNA勺稳定性
Rbp1亚基的C末端区域中RNA三磷酸酶鸟苷酸转移酶甲基转移酶capping
开始引导前剪切反应
可变剪切选择不同外显子产生不同的蛋白果蝇的Dscam基因
mRNA又叫信使RNA作用是携带转录后的遗传信息到核糖体上参与合成蛋白质;
rRNA,又叫核糖体RNA是最多的一类RNA也是3类RN(tRNA,mRNA,rRNA中相对分
子质量最大的一类RNA它与蛋白质结合而形成核糖体,是组成核糖体的重要原料;
tRNA,是具有携带并转运氨基酸功能的一类小分子核糖核酸,作用是携带氨基酸参与
翻译合