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两因素方差分析

两因素方差分析

「、两因素方差分析中的基本概念

1.例1-1(pp1):

四种疗法治疗缺铁性贫血后红细胞增加数

服用A药,则A=2,否则A=1;服用B药,则B=2,否则B=1

疗法

X

总体均数

A

B

疗法1(般疗法)

0.8,0.9,0.7

片1

1

1

疗法2(般疗法+A药)

1.3,1.2,1.1

亠21

2

1

疗法3(般疗法+B药)

0.9,1.1,1.0

亠12

1

2

疗法4(般疗法+A药+B药)

2.1,2.2,2.0

»22

2

2

两因素Stata数据输入格式

 

命令anovaxaba*b

其中a表示A药疗效的主效应,b表示B药疗效的主效应,a*b表

示A药与B药对疗效的交互作用

结果如下

Numberofobs=12R-squared=0.9737

RootMSE=.10AdjR-squared=0.9638

Source|PartialSSdfMSFProb>F

+

Model|2.962499943.9874999898.750.0000

|

a|1.687511.6875168.750.0000

b|.9074999741.90749997490.750.0000

a*b|.3674999671.36749996736.750.0003

|

Residual|.0800000028.01

+

Total|3.0424999411.276590904

结果表明:

对于:

=0.05而言

He:

没有交互作用并且A药和B药疗效的主效应都没有差异H11:

有交互作用或A药主效应有差异或B药主效应有差异FModel=98.75,P值<0.05,因此认为模型是有效的(或有交互作用或有主效应)。

H20:

没有交互作用

H21:

有交互作用

Faxb=36.75,P值=0.0003<0.05,因此A药与B药的疗效有交互作用,并且有统计意义。

H30:

A药没有差异

H31:

A药主效应有差异

Fa=168.75,P值<0.05,A药的主效应有统计意义

H40:

B药没有差异

H41:

B药主效应有差异

Fb=90.75,P值<0.05,B药的主效应也有统计意义。

问题:

模型是什么?

模型:

%」.*a」(Jab

其中Jab是x的总体均数,:

a称为A因素的主效应,-b称为B因素的主效应,(厂)ab称为A因素和B因素对因变量x(观察指标变量)的交互作用。

2.主效应的意义

A主效应

平均

平均二=Tl」21_=亠12■"22_=Tl.」12.」21.」22均.12.22

B主效应」

称r和〉2为a因素的主效应,-1和]2为b因素的主效应。

并且可以验证:

-:

冷+-:

=0(即:

®=—-:

込)以及'1+'2=0(1=—2)若〉1=〉2(即〉1=〉2=0),贝S对应A因素的主效应没有作用。

若:

1=2(即M=-2=0),则对应B因素的主效应没有作用。

3.交互作用的意义

B药A主效应

A药—

未服用服用表示

未服用屯“=丛.+叫+B1+(邙)“片2=4.+°^+32+(邛)仁%二比+牛

B主效应

 

并且根据巧,屯.2,41,山2和生定义,请验证:

 

=>C:

)22=—(-)21=(:

)11=—C:

)12

(:

)12+(:

-)22=0

若G■)11=G-)22=C:

)21=G-)12=0,则称无交互作用。

否则称A因

素和B因素对观察指标构成交互作用。

例如:

若无交互作用

模型:

巴厂卩+/+Pb并称为Reduced模型

(称有交互作用的模型%=卩+叭+%+(川人为饱和模型或全模型)

B药A主效应

A药-

未服用服用表示

未服用

比1=4.+5+01

卩12=4..+Ct1+卩2

巴=4+«1

1...1

服用

亠21=卩..+^2+卩1

卩22=»..+°2+卩2

巴=卩+ao

2...2

B主效应

卩1=卩+优

巴二卩+打

卩2=0.65+0.05服用出=0.7

(0.65+0.05—0.1)(0.65+0.05+0.1)©2=0.05)

平均

^.1=0.55

4.2=0.75卩.=0.65

B主效应

卩1=0.65-0.1

(m=—0.1)

—=0.65+0.1

(2=0.1)

未服用A药时,未服用B药与服用B药均数差值^1—-12—1—2=2j服用A药时,未服用B药与服用B药均数差值为^1—-22=11—12=2「即:

B药的疗效与是否服用A药无关,并且B药的疗效正好为B药的主效应的差异已-卩2=^-駡=2打

未服用B药时,未服用A药与服用A药均数差值^1—-21—1—■2=21服用B药时,未服用A药与服用A药均数差值为^2—122—1—2=21即:

A药的疗效与是否服用B药无关,并且A药的疗效正好为A药的主效应的差异叫-巴尸%-02=25。

有交互作用的情况

B药A主效应

A药—

未服用服用表示

未服用>11=卩..+。

1+卩1+(M)11卩12=卩..+°^1+P2+(aB)12%=»..*“1

B主效应〜「1".2二J.<-2J

未服用A药时,未服用B药与服用B药均数差值:

-11—-12=-1—:

2+C川)11—C川)12=2:

l+2C川)11

服用A药时,未服用B药与服用B药均数差值:

J21—-22='1—'2+(:

川)21—(:

川)22=2:

1—2(:

•川)“,因此C川)11不为0时,未服用B药与服用B药均数差值与是否服用A药有关。

即交互作用。

同理可以验证未服用A药与服用A药均数差值与是否服用B药有关。

即交互作用。

如A药

B药

平均

A主效应表示

未服用

服用

未服用

0.4

(.75-.25-.15-.05)

0.8

(0.75+.25-.15+.05)

%=0.6

已=0.75—0.15(5=—0.15)

服用

0.6

(.75-.25+.15+.05)

1.2

(.75+.25+.15-.05)

匕=0.9

电=0.75+0.15(口2=0.15)

平均

#1=0.5

T.0

卩=0.75

B主效应

^1=0.75-0.25

(打二—0.25)

卩2=0.75+0.25

^2=0.25)

红色的数值为交互效应

如果有交互作用,贝心

两个药都用的均数>A药的均数+B药的均数-两个药都未用的均数

(本例即:

%2^l12+l21—111),则称协同作用。

两个药都用的均数<A药的均数+B药的均数-两个药都未用的均数

(本例即:

J22^l12+l21—111),则称拮抗作用。

在实际统计时,如果检验的结果为有交互作用,只需用相应的样本均数代替总体均数验算一下:

判断协同作用还是拮抗作用。

4.两因素方差分析中的两两比较(简单效应的组间比较

Comparisonofsimpleeffectbygroup):

有许多方法可以进行两两比较,这里介绍的LSD方法进行两两比较。

分两个步骤进行。

一、借用单因素方差分析的方法进行方差齐性检验和统计描述:

以pp1中的例1-1为例:

在该研究中有两个因素,每个因素有2个水平:

用和不用,因此共有4种情况,对应有4组,两因素方差分析的两两比较时,可以转化为4组(各个因素的水平数之和)的单因素方差分析。

仍以上述Stata文件结构:

产生分组变量group

gengroup二a+(b-1)*2

对应的关系为:

A

B

group

1

1

1

2

1

2

1

2

3

2

2

4

onewayxgroup,tsidak

|Summaryofx

group|MeanStd.Dev.

Freq.

+

1|.79999999.09999999

3

2|1.2.09999996

3

3|1.10000002

3

4|2.1.100000023

+

Total|1.275.525919112

AnalysisofVarianee

SourceSSdfMSFProb>F

Betweengroups2.962499943.9874999898.750.0000

Withingroups.0800000028.01

Total3.0424999411.276590904

Bartlett'stestforequalvariances:

chi2(3)=0.0000Prob>chi2=1.000

结果说明:

各组方差齐性

anovaxgroup

Numberofobs=12R-squared=0.9737

RootMSE=.10AdjR-squared=0.9638

Source|

PartialSS

df

MSF

Prob>F

Model|

I

2.96249994

3

.98749998

98.75

0.0000

1

group|

1

2.96249994

3

.98749998

98.75

0.0000

|

Residual|

.080000002

8

.01

+

Total|3.0424999411.276590904

4组的总体均数不全相同regress

x

Coef.

Std.Err.t

P>|t|

[95%Conf.Interval]

_cons

2.1.057735

36.37

0.000

1.966863

2.233137

group

1

-1.3.0816497-

-15.92

0.000-

-1.488284

-1.111716

2

-.9

.0816497-11.02

0.000-

■1.088284-.7117155

3

-1.1.0816497-

-13.47

0.000-

-1.288284

-.9117155

4

(dropped)

Coef.表示第4组均数—其他组的均数的差值,如:

第4组均数—第2组均数的差值=—0.9。

P>|t|表示第4组均数与其他组的均数比较的P值,如第4组均数与

第2组均数比较的P值=0.000。

即:

第4组(用A药且用B药)的红细胞增加数均数大于其他3组的红细胞增加数均数,并且差别有统计学意义。

第1至3组的均数比较的检验操作如下:

第i组与第j组比较:

test_b[group[i]]=_b[group[j]]

H。

4i=»j

检验命令

F值与P值

»1=»2

test_b[group[1]]=_b[group[2]]

F(1,8)=24.00

Prob>F=0.0012

卩1=卩3

test_b[group[1]]=_b[group[3]]

F(1,8)=6.00

Prob>F=0.0400

卩2=卩3

test_b[group[2]]=_b[group[3]]

F(1,8)=6.00

Prob>F=0.0400

结果说明:

第2组(不用B药情况下用A药)的红细胞增加数均数大于第1组(不用B药和A药)和第3组(不用A药情况下用B药)的红细胞增加数均数,差别有统计学意义。

第3组(不用A药情况下用B药)的红细胞增加数均数大于第1组(不用B药和A药)的红细胞增加数均数,差别有统计学意义。

判断何种交互作用

组别

第1组

第4组

第2组

第3组

不用B药

用B药

不用B药

用B药

不用A药

用A药

用A药

不用A药

样本均数

0.8

2.1

1.2

1.0

0.8+2.1=2.9>

2.2=1.2+1.0

结合两因素方差分析的结果说明A药和B药的疗效构成协同作用。

结果小结:

A药和B药均能使红细胞增加数提高。

若仅用一个药的情况下,A药优于B药,但用两个药的疗效已经超过单独使用其中一个药的疗效之和(有协同作用)。

二、两因素方差分析的分析策略小结:

1.先做两因素方差分析确定是否有交互作用

a)如果没有交互作用,看主效应的差别是否有统计学意义:

若有统计学意义,考察相应的样本均数,确定哪种情况的均数高。

b)如果有交互作用,则不能分析主效应。

而化为单因素的方差分

析(组数为各个因素的水平数之和),作两两比较。

2.在有交互作用的情况下,通过计算样本均数确认交互作用为协

同作用还是拮抗作用

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