国家科技部基础条件平台医药精.docx

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国家科技部基础条件平台医药精

《国家科技部基础条件平台医药

共享网中医药学数据中心》

2007年项目组中期工作总结

中国·新疆

2007.7.30-2007.8.4

一、2007年上半年工作任务完成情况3

（一）中医药期刊文献数据库工作完成情况3

1.各单位标引完成如下3

2.目前存在的主要问题5

（二）中医药学语言系统5

1.加工任务完成情况5

2.语言系统的整理工作6

3.语言系统的发展与应用的研究工作6

4.今后语言系统工作分工6

（三）中医药临床术语集7

1.加工任务完成情况7

2.临床术语集的今后发展8

3.语言系统和临床术语的问题8

（四）突发公卫平台数据库工作进展8

（五）中医疾病基础数据库工作进展9

（六）中药药理数据库9

1．药理库完成情况10

2.新药理实验数据库远程加工界面使用注意事项11

3.几点要求11

（七）中药化学数据库11

1.化学库完成情况11

2.注意事项12

（八）临床疾病数据库12

1.工作任务完成情况12

2．临床库存在的主要问题16

（九）40疾病课题全称“基于信息数据的中医临床优化方案与疗效评价平台研究”课题研究工作17

1．数据补充部分工作17

2．文献检索部分工作17

（十）“评价课题”全称“基于临床文献数据独立评价中医临床效应的方法研究”课题研究情况18

（十一）共建平台网站的建设情况19

1．网站建设19

2．分中心月总结情况20

3．存在问题21

二、下一步工作任务21

（一）实现今年工作目标21

（二）严格质量控制，打造精品数据库25

（三）增加计算机技术支持力度26

（四）培育共享用户，提供多层次的服务27

根据2007年2月28日召开的中医药信息虚拟研究中心会议确定的目标，本年度的工作任务为建立适应国内外传统医学发展需求的中医药科学数据中心，引领国内中医药数字化的发展。

中医药学科学数据管理与利用研究中心主要构建三个体系：

数据发布与共享体系；数据共建与整合体系；基础与支撑体系。

本中心定位：

国家层面：

为国家科技部科学数据共享平台——医药卫生科学数据管理与共享服务网中的4个分中心之一；

行业层面：

以中国中医科学院为牵头，以全国30余个分中心为成员单位的中医药学数据中心。

一、2007年上半年工作任务完成情况

（一）中医药期刊文献数据库工作完成情况

中医药期刊文献数据库的网络标引工作并行完成三年的数据加工，在9个分中心文献标引人员的共同努力下取得了一定的成绩，现将各单位2005、2006、2007三年的文献标引完成的工作量统计如下，并对目前存在的主要问题进行总结。

1.各单位标引完成

（工作量统计截止到2007-8-7）

2007年文献库任务完成表

单位名称

标引任务（条）

已完成

已审校

尚需完成

备注

辽宁中医药大学

10000

9999

完成不好尚需努力

江西中医药高等专科学校

10000

1656

8344

完成不好尚需努力

广州中医药大学

2000

完成不好尚需努力

上海中医药大学科技信息中心

30000

5007

24993

完成不好尚需努力

陕西省中医药研究院

10000

完成不好尚需努力

山东中医药大学图书馆

1000

完成不好尚需努力

长春中医学院

1000

完成不好尚需努力

南京中医药大学

3000

249

2751

完成不好尚需努力

山西中医学院

3000

完成不好尚需努力

总计

70000

6913

6664

63087

2006年文献库任务完成表

单位名称

任务量

已完成

已审校

尚需完成

备注

上海中医药大学

20000

20405

超额完成

辽宁中医药大学

5000

10302

10300

超额完成

陕西中医药研究院

10000

4915

4755

5085

南京中医药大学

5000

877

506

4123

还有82%未完成尚需努力

江西中医高等专科学校

8000

8708

8704

超额完成

广州中医药大学

3000

2482

2313

518

还有18%未完成尚需努力

总计

47689

46983

3311

2005年文献库任务完成表

单位名称

任务量

已完成

已审校

说明

上海中医药大学

24000

24920

超额完成

辽宁中医药大学

5000

5171

超额完成

陕西中医药研究院

10000

11561

超额完成

南京中医药大学

5000

5132

403

江西中医高等专科学校

8000

8500

8497

超额完成

广州中医药大学

3000

3796

超额完成

总计

59080

54348

超额完成

2.目前存在的主要问题

从统计表中可以看出，在分中心标引人员的共同努力下，2005年标引工作己超额完成（超额4080篇），2006年未完成3311篇，占总量的6%，目前2007年只完成6000多篇。

虽然标引人员工作非常努力了，但任务完成的并不理想，总结问题主要有以下几点：

●人员有限兼任工作太多，有的分中心参加课题项目多，每个数据库都承接了任务，超出了本单位的实际能力，人员分配不开，影响了标引任务的完成。

●以突击的形势做标引，这种情况大多数单位都如此，但文献标引工作是一个相对长期持续的工作，因为受到刊时间的限制，不能单纯搞任务突击。

●前段时间受经费不到位的原因，也影响了标引的进度。

文献标引工作是一个相对长期持续的工作，它受到领导重视、标引人员整体素质、培训与否等多方面因素的制约和限制，需要在一个相对长的时间内才能完成对一个合格标引员的培养，所以希望各分中心注意对标引人才的引进和不断培训，加快标引任务的顺利进行。

（二）中医药学语言系统：

1.加工任务完成情况：

截止到2007年7月17日9：

00，语言系统完成情况如下:

单位

任务量

完成情况

加工实例

加工完成百分比

校验实例

审校完成百分比

已加工的类树

备注及存在问题

江西高专

4000

2120

53%

111

希望加快加工速度

上海中医药大学

5000

3985

79.7%

3945

78.9%

加工人员说已经没有可加工的数据，准备分配给新的加工任务

北京中医药大学

4612

陕西中医药研究院

1500

1613

107%

1008

67%

任务完成较好。

注：

其中陕西中医学院是今年的新任务，江西中医药高等专科学校和上海中医药大学是去年的任务未完成；北京中医药大学是对原有的数据进行修改。

2.语言系统的整理工作

首先对语言系统的程序进行了改进，并对数据进行了查重整理。

3.语言系统的发展与应用的研究工作

6月7日在福州组织了语言系统研讨会，会议就语言系统现有的问题和今后的发展应用做了详细的讨论，并按几个基本大类对今后语言系统的工作做了基本的任务分配。

4.今后语言系统工作分工

上海：

中药

江西：

基础、文献、

福建：

方剂、中性词（连接词、量词）

河南：

病、症状、证候

陕西：

生物医学等词表平台维护

山西：

各家学说、古籍

南京：

其他学科词语（环境、地理、人文等自然学科和物理科学）

广州：

治则治法、

诊断、其他疗法（针灸、按摩、康复、气功等）待定加工单位

注：

新的加工任务和加工手册会尽快发给各单位，以便大家尽早展开新的工作。

（三）中医药临床术语集

1.加工任务完成情况

临床术语都是2006年的任务，截止到2007年7月17日9：

00，临床术语共加工实例数据89344条，已初审数据62528条。

各单位加工情况详见下表：

单位

任务量

完成情况

加工实例

加工完成百分比

校验实例

审校完成百分比

已加工的类树

备注及存在问题

陕西中医药研究院

200

219

109%

219

109%

已经加工完

任务已经完成。

福建中医学院

10000

7085

71%

7085

71%

已经加工完

现有的数据已经加工完毕.

吉林中医中药研究院

2000

2663

133%

2663

133%

已经加工完

任务已经完成。

河北医科大学

1000

3337

333%

3337

333%

已经加工完

任务已完成。

广州中医药大学

12000

8993

75%

4112

34.3%

类树已部分加工

工作认真，最近加工速度比较慢，希望加快速度。

河南中医研究院

50000

39846

79.7%

36439

72.9%

类树已加工

上海中医药大学

15000

12580

84%

2282

15.2%

类树已加工

河南仲景医学院

10000

4939

49%

3771

38%

类树已部分加工

1．加工速度缓慢，希望加快速度。

2．以前加工中的错误，请尽快改正。

北京中医药大学

10000

6333

63%

316

类树已加工

几个月没有加工，不知何原因？

？

南京中医药大学

5000

3342

67%

1811

36%

类树已加工

加工速度缓慢，希望加快速度。

2.临床术语集的今后发展

6月7日的福州会议上，刘保延院长对中医药临床术语集的发展指出了发展方向，与会人员进行了详细的讨论。

3.语言系统和临床术语的问题

（1）数据质量问题

语言系统和临床术语的加工量比较大，我们终审人员不可能一一审校，需要各单位加工人员细心，审校人员认真负责。

目前加工的数据存在一定的质量问题，个别加工单位极不负责任，被通知数据错误后，长时间不改正。

（2）加工程序问题

目前语言系统和临床术语的加工程序仍处于不断改进过程中，程序的速度问题及其他加工中的不方便给大家的加工带来了一定的困难。

希望大家能及时和我们沟通，共同改善问题。

（四）突发公卫平台数据库工作进展

福建中医学院今年承担急门诊传染病库任务4000条，目前完成了大部分图片扫描工作，现正在进行编辑加工。

由于福建中医学院图书馆与本课题组长期合作，从数据编辑加工到审校数据库管理有成熟的管理办法。

对于数据库任务完成具有较强的实力，目前完成任务量的情况良好，仍需投入人力进行继续编辑加工并审校。

统计日期7月17日

单位

任务量

实发量

完成量

审校量

图片上传

福建中医药大学

4000

6752

403

835

（五）中医疾病基础数据库工作进展

中医疾病基础数据库是2005年的任务，由南京中医药大学、上海中医文献馆、广州中医药大学三家分中心承担。

由于数据采集等原因，一直延续到2006年才开始建设，2006年底本项工作未完成。

目前南京中医药大学任务已基本完成。

上海中医文献馆:

完成任务情况也较好，但还有少量数据需继续完成和审校。

广州中医药大学还有一部分任务未完成，需合理安排人力尽早完成任务。

上海中医文献馆，继续完成剩余的任务。

中医疾病数据库总任务还有256条需继续完成。

统计日期7月17日

单位名称

任务量

实发任务

完成量

审校量

终审量

总完成量

广州中医药大学

500

336

130

149

南京中医药大学

1000

350

277

347

上海中医文献馆

500

350

114

145

284

总计

244

422

780

（六）中药药理数据库

2007年药理实验数据库进行了大的结构改造，加工界面做了很大的改进，新的加工界面可能会面临的问题与困难：

（1）程序问题：

新程序虽然进行了测试加工，但仍然可能在加工过程中出现新的问题，程序的稳定性有待考验。

（2）加工人员：

我们的加工人员虽然从事过数据库的加工工作，但是对新的中药药理实验数据库还是初次进行培训，这就需要我们共同努力，认真负责地对待。

（3）数据管理人员：

作为数据管理人员，我们的自身学识水平及管理水平都有局限性，这需要我们的共同努力不断提高。

这就要求我们：

（1）数据库加工员：

一定要有一个认真、严谨的工作态度，同时还要不断提高自己，培养独立分析和解决问题的能力，力争把新的中药药理实验数据库建设成功。

（2）数据管理员：

会耐心配合，做好工作，为分中心同仁提供最好的服务。

（3）沟通：

遇到问题请及时与我们沟通。

MSN：

llhong_2008@qq:

28499503

中药药理实验数据库2007年任务20000条，目前加工界面修改和标准表挂接都已经完成，任务已经下发至各分中心。

请各分中心在加工过程中遇到问题及时与我中心联系。

1．药理库完成情况（至2007年7月20日下午4点）

单位

任务量

分配量

完成量

初审量

备注

河南中医药研究院

7000

已经开始加工，发现问题及时沟通，加工较认真。

注意：

增词时注意标准词的检索，确实标准词表中没有的再进行增词，最好与我中心msn时时联系增词。

福建中医学院

5000

222

加工进度较好，加工认真，时时沟通增词。

山西中医学院

2000

已经开始加工，加工认真，及时沟通讨论加工问题。

加油！

江西中医药研究院

2000

已经开始加工，加油！

江西中医药高等专科学校

2000

有什么问题请及时跟我们联系吧！

南京中医药大学

1000

除了标引，咱们还有药理库的任务呢！

发现问题请与我们联系！

张仲景国医学院

1000

仲景的老师们，发现问题一定要跟我们联系啊！

qq请加我。

合计

20000

321

药理库加工才开始，问题较多，辛苦大家了！

2.新药理实验数据库远程加工界面使用注意事项

新药理实验数据库加工平台基本搭建完成，在进行数据加工时请注意参考中药药理实验数据库加工手册。

2.1标准表使用问题：

目前药理数据库标准词表挂接的是词雀－辅助词表系统，此表是语言系统与未分类词（以往标准词表）联合查询在词雀系统中的实现。

在线加工字段需选择标准表查询，请参照标准词表使用方法，严格按照标准词表选词加工，无标准词需要添加时，注意添加标准词要认真，不是标准词的不要随意添加。

增词人员最好msn，qq与我及时联系增词以保证大家加工的进度和标准词的准确性。

2.2有些图片没有严格按要求扫描上传，扫描图片中半页、不清楚现象需要加工单位重新下载或扫描上传。

2.3药理数据库的工作量应删除的数据，请及时标明“应删除”通知。

2.4根据文献数据，各字段内容的添加请严格按操作手册要求加工。

2.5药理库进行结构改造之后变动较大，难度增加，辛苦大家克服困难，认真加工，谢谢！

3.几点要求：

3.1分中心药理库进行2007年工作时请严格按加工手册进行编辑加工。

3.2分中心药理库进行加工时请与本地管理人员及时沟通，以利于数据加工的顺利完成。

（七）中药化学数据库

1.化学库完成情况（至2007年7月20日下午4点）

单位

任务量

分配量

完成量

图片量

备注

上海中医药大学

2600

2498

186

160

整体进度尚可，请注意图片上传的质量，加快初审速度。

辛苦啦！

重庆中药研究院

600

461

485（加去年完成的200）

已经全部传完

整体任务完成较好，加工质量较高，图片上传清晰，大小适度。

谢谢啦！

另外请加快初审速度

江西中医药研究院

800

910

165

任务进度尚可，上传图片较清晰，请注意原文图片上传要求整张上传，不能出现半页上传现象。

辛苦啦！

另外请加快初审速度。

合计

4000

3869

816

656

整体进度较稳定

中药化学库的工作是由三个分中心承接，从加工到审校的工作都是连续性的，技术力量较强，工作较熟悉，数据加工情况比较稳定。

2.注意事项（以往存在问题）：

●在线标准表使用问题：

化学数据库在线加工应选择标准表查询，无标准词应及早通知审校人员增加，不能随意填加非标准化的词，加大了终审人员的工作强度，对导入数据库增加困难。

●图片：

有些图片没有严格按照扫描上传图片要求，扫描图片不能只有半页，应全页扫描。

有的图片上传也不够清晰，请认真扫描上传。

●化学数据库的工作量应删除的数据，有的没有及时通知。

●请严格按《化学库编辑注意》编辑，规范加工数据。

●关于主表中“实验对象来源—科属”需要选择标准词，原加工的“柴胡，伞形科，BupleurumchinenseDC”格式不能导入。

请注意从标准词表中选择填写。

●请认真加工，不要出现漏表和字段加工不全现象。

（八）临床疾病数据库

1.工作任务完成情况

2006年前任务完成情况

单位

已完成

已审校

图已传

共完成

05任务量

05年完成

06任务量

06年完成

福建中医学院（05传染病）

5883

6381

5906

4000传染

完成

6000

完成

广州中医药大学

367

5532

5686

5899

2000

完成

4000

1899

河南中医学院（河南1）

5477

5601

5501

500

完成

5000

完成

河南中医药研究院（河南2）

24922

1561

26888

26483

15000

完成

15000

11483

黑龙江中医药大学

953

1050

969

500

完成

500

469

吉林中医药研究院

500

2996

3022

3496

3000

完成

辽宁中药大学

253

760

1013

500

完成

500

完成

山西中医学院

112

6034

6148

6146

2000

完成

4000

完成

陕西中医药研究院

885

3369

4629

4254

2000

完成

1000

完成

上海中医药大学

155

15278

12213

15433

10000

完成

5000

完成

重庆中药研究院（重庆药）

606

396

1011

1002

500

完成

500

完成

重庆中医研究院（重庆医）

210

502

601

712

500

完成

500

212

浙江中医药研究院

711

733

200

完成

500

完成

湖南中医药研究院

2698

2866

2766

1000

完成

1000

完成

仲景国医学院

6932

7384

6964

3000

完成

5000

3964

河北医科大学中医学院

210

1499

1721

1709

1000

完成

500

完成

江西（05年）

5442

2843

9074

8285

10000

差1715

江西中医药高专（江西专）

3402

633

5817

4035

6000

4032

江西中医药研究院（江西研）

493

512

500

完成

安徽中医学院

2046

2723

5276

4769

5000

完成

2007年任务完成情况

单位

已完成

已审校

图已传

07完成

07任务

备注

云南中医学院（云南）

1000

新加入单位，不知何故培训后一直没有加工

福建中医学院（福建）

512

186

517

4000

加工速度与质量良好

广州中医药大学（广州）

1000

2006年数据仍未完成，加工速度过于缓慢

河南中医学院（河南1）

3567

6000

几乎没有进行2007年数据的加工工作

河南中医药研究院（河南2）

2052

1716

2052

10000

2006年数据仍未完成，希望加快速度

黑龙江中医药大学（黑龙江）

290

327

305

1000

加工速度与态度比较好

吉林中医药研究院（吉林）

1681

1705

1687

2000

工作完成情况良好

辽宁中药大学（辽宁）

476

478

476

1000

工作完成情况良好

南京中医药大学（南京）

150

151

3000

2007年数据加工速度缓慢，望加快速度

山西中医学院（山西）

278

4000

2007年数据加工速度较慢，希望加快速度

陕西中医药研究院（陕西）

387

2000

2007年数据加工速度较慢，希望加快速度

陕西中医学院图书馆（陕西1）

115

101

1000

今年新加入单位，加工速度良好，但是对于加工中的某些概念含糊不清，像疗效观察表中收录的应该是经治疗后变化了的，有意义的指标，而不是只有简单的变化日期

上海中医药大学（上海）

293

1069

1314

1362

5000

加工速度与质量良好

重庆中药研究院（重庆药）

391

500

2007年数据几乎没有开始加工

重庆中医研究院（重庆医）

500

2006年加工工作仍未完成，今年任务完全没有开始

浙江中医药研究院（浙江）

202

203

500

加工速度与质量良好

浙江中医药大学（浙江1）

1000

今年新加入单位，未参加培训

湖南中医药研究院（湖南）

2799

2939

849

1000

加工速度、质量、态度良好

张仲景国医学院（仲景）

152

258

237

3000

2007年加工速度较慢，希望加快速度

河北医科大学中医学院（河北）

441

595

517

2000

加工速度较快，但请注意加工人员人手一帐号，加工完成后请不要签中文名字

江西中医药高专（江西专）

1878

2890

1913

3000

在努力完成2006年加工任务，态度与质量均良好

江西中医药研究院（江西研）

1000

2007年已过半，仍未进行数据加工，不知何故

安徽中医学院（安徽）

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