单细胞空间转录组培训考核试题.docx

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单细胞空间转录组培训考核试题

单细胞&空间转录组培训考核试题

您的姓名：

[填空题]*

_________________________________

一、单选题

1.百迈客提供10x单细胞转录组测序服务产品数据量有（）[单选题]*

A100G

B200G

C100G，200G（正确答案）

D150G

2.空间转录组载玻片上每个捕获区域有多少个spots?

[单选题]*

A3000

B5000（正确答案）

C7000

D9000

3.百迈客提供空间转录组测序数据量?

[单选题]*

A60G（正确答案）

B100G

C150G

D200G

4.10xgenomics单细胞技术中Gelbead上结合的哪个接头序列是用来标记不同细胞的（）[单选题]*

ATruSeqRead1

B10xBarcode（正确答案）

CUniqueMolecularIdentifier（UMI）

Dpolyd（T）

5.10xgenomics单细胞转录组比对分析的是什么类型的序列（）[单选题]*

A3’mRNA序列（正确答案）

B5’mRNA序列

C3’mRNA全长序列

D5’mRNA全长序列

6.10Xgenomics平台对于细胞大小的要求范围是多少?

[单选题]*

A10um以下

B20um以下

C30um以下

D40um以下（正确答案）

7.10Xgenomics中UMI是什么作用?

[单选题]*

A全长IlluminaTruSeqRead1测序引物

B用于区分细胞

C区分同不同的mRNA（正确答案）

D捕获mRNA分子

8.10Xgenomics单细胞转录组细胞聚类分群的依据是什么?

[单选题]*

A细胞大小

B细胞个数

C细胞marker基因表达（正确答案）

D细胞分化轨迹

9.百迈客单细胞全长转录组测序提供的数据量是?

[单选题]*

A100G

B200G

C300G

D三代200-300G，二代100G（正确答案）

10.百迈客单细胞全长转录组是基于什么平台?

[单选题]*

A10xgenomics+Nonapore+Illumina（正确答案）

B10xgenomics+PB

CSmart-seq+Nonapore

11.单细胞ATAC-seq是基于对对细胞进行分群?

[单选题]*

A基因表达

B细胞个数

C染色质开放性特征（正确答案）

D细胞大小

12.单细胞转录组拟时序核心分析的目的是?

[单选题]*

A探索细胞发育分化轨迹（正确答案）

B基因表达动态变化

C差异基因在不同cluster表达状况

D寻找marker基因

13.细胞周期热图分析的核心目的?

[单选题]*

A探索处于高分裂期的细胞cluster可能是病变细胞（正确答案）

B鉴定marker基因

C寻找差异表达基因

D观察细胞分化途径

14.空间转录组冷冻组织切片常规厚度一般是?

[单选题]*

A1um

B5um

C10um（正确答案）

D20um

15.空间转录组中Gelbead上结合的spatialBarcode序列作用是?

[单选题]*

A标记细胞

B捕获mRNA分子

C细胞分群

D标记每个spot进行空间定位（正确答案）

16.10x单细胞免疫组库检测富集扩增区域是?

[单选题]*

ATCR/BCRCDR3区域序列

BTCR/BCRCDR区域序列

CTCR/BCRV（D）J全长序列（正确答案）

D所有mRNA全长序列

17.目前10xGenomics空间转录组细胞水平分辨率为（）[单选题]*

A单个细胞

B2-3个细胞

C1-10个细胞（正确答案）

D1-100个细胞

18.单细胞和单细胞核的技术原理核心区别是?

[单选题]*

A单细胞核需要抽核处理，单细胞转录组需要制备单细胞悬浮液（正确答案）

BGelbead

CChip芯片

D捕获mRNA方式

19.单细胞核转录组目前已发表文章篇数数量级别?

[单选题]*

A10篇

B100篇（正确答案）

C1000篇

D10000篇

20.10Xgenomics单细核转录组测序对细胞大小的要求范围是多少?

[单选题]*

A10um以下

B20um以下

C30um以下

D40um以下

E没有细胞粒径大小限制（正确答案）

二、多选题

21.下面哪些细胞类型一般不适合10x单细胞测序?

*

A神经元细胞（正确答案）

B巨噬细胞（正确答案）

C皮下脂肪细胞（正确答案）

D心肌细胞（正确答案）

E肾脏细胞（正确答案）

F骨骼肌纤维（正确答案）

G卵细胞（正确答案）

22.10Xgenomics单细胞转录组分析内容的核心是什么?

*

A划分细胞群体（正确答案）

B细胞群间基因表达差异检测（正确答案）

C鉴定marker基因（正确答案）

D鉴定细胞类型（正确答案）

E细胞轨迹分析（正确答案）

FGO/KEGG富集分析

23.百迈客目前10x单细胞转录组适用原则（）*

A对于人、鼠样本可以提供组织解离单细胞悬浮液制备（正确答案）

B其他动物样本需要上门进行预实验进行解离和单细胞悬液制备（正确答案）

C植物样本需要老师提供原生质体悬浮液，现场制备单细胞悬浮液（正确答案）

D冷冻组织和细胞也可以适用于单细胞转录组测序

24.10x单细胞转录组测序对细胞悬浮液的要求（）*

A细胞数量50万以上（正确答案）

B细胞活性高于90%（正确答案）

C细胞粒径小于40μm（正确答案）

D细胞浓度:

700~1200cell/μl;细胞体积:

>100微升（正确答案）

E细胞不能成团，少碎片，不存在逆转录抑制剂和非细胞的核酸分子（正确答案）

25.单细胞转录组测序数据量推荐正确的是?

*

A原代细胞、细胞系可推荐3000-5000个左右细胞（正确答案）

B肿瘤推荐3000-8000个细胞（正确答案）

C血液细胞或干细胞发育推荐1万个左右（正确答案）

D每个细胞测5-10万条reads（正确答案）

E每个样本可推荐100G或200G数据量（正确答案）

26.单核转录组测序更适合哪种类型样本?

*

A冻存样本（正确答案）

B脑、心、肾脏等复杂组织;（正确答案）

C难以解离组织样本;（正确答案）

D酶解离有偏好性样本;（正确答案）

27.10x单细胞核转录组技术的优势有（）*

A减少解离偏差（正确答案）

B与冷冻样本兼容（正确答案）

C消除解离诱导的转录应激反应（正确答案）

D无惧细胞活性和细胞粒径大小（正确答案）

28.单细胞核测序mRNA相对单细胞较少说法正确的是?

*

A捕获到的基因总数减少了约20-40%，UMI总数减少了约20-60%，而较大一部分是线粒体基因。

（正确答案）

B不影响细胞分群，且标志物的表达得以维持。

（正确答案）

C样本类型不一样，检测灵敏度不一样。

（正确答案）

D外周血PBMC和单核细胞类型比例相似，单细胞核检测转录组数据可与细胞的读数相当。

（正确答案）

29.单细胞核转录组样本运输要求?

*

A组织样本液氮冷冻干冰运输;（正确答案）

B细胞样本经4℃（10min），-20℃（30min），-80℃（16-18h）梯度冻存直至液氮槽冷冻（正确答案）

C全血直接分离PBMC，PBMC冻存后干冰寄送（正确答案）

30.细胞核悬液质检标准?

*

A核总数一般不低于5*105个（正确答案）

B要求核浓度为700-1200nucleus/ul，体积大于200uL，（正确答案）

C结团率低于10%，细胞核膜完整，染色均一，无较大杂质（正确答案）

D提核后活性低于5%（正确答案）

31.目前10xGenomics空间转录组的不适合样品类型有?

*

AFFPE（正确答案）

B人鼠心脏组织

C骨骼组织（正确答案）

D皮肤组织（正确答案）

E植物幼嫩组织

F肝脏组织

32.10xGenomics空间转录组的优势?

*

A全组织解析（正确答案）

B高分辨率（正确答案）

C操作简单（正确答案）

D多维度分析（正确答案）

E完善数据分析（正确答案）

F经验丰富（正确答案）

33.10xgenomics空间转录组测序送样要求*

A每块组织样本不宜过大（长宽高约0.8cm）（正确答案）

B客户需要同时制作多份样本（至少2份，建议3份）（正确答案）

C置于干冰环境寄送（推荐用量约5kg/日），-80°C冰箱保存。

（正确答案）

D样本需要进行异戊烷冻存和OCT包埋预处理（正确答案）

34.10Xgenomics目前应用比较多的产品类型有哪些?

*

A单细胞转录组测序（正确答案）

B单细胞免疫组库（正确答案）

C单细胞ATAC-seq（正确答案）

D单细胞表面蛋白检测

35.10Xgenomics单细胞转录组测序后验证实验有哪些?

*

AqPCR验证marker基因表达（bulk&分选的亚群）;（正确答案）

B免疫荧光定位验证时空分布;（正确答案）

C流式分选特定亚群KO/OE细胞验证功能;（正确答案）

Dsmart-seq2单细胞转录组小细胞量验证表达;（正确答案）

Emarker基因临床相关性分析，比如预后（正确答案）

36.10Xgenomics单细胞转录组测序关于生物学重复说法对的?

*

A需要生物学重复，尤其是个体差异性大的临床样本;（正确答案）

B根据目前发表的文献，很少不做重复的;（正确答案）

C多个生物学重复也会增加最终获得的有效单细胞数据个数;（正确答案）

D不需要生物重复

37.百迈客10x单细胞转录组测序产品优势?

*

A经验丰富:

累计制备100余种组织类型、3000+例的单细胞样本;（正确答案）

B成功案例:

目前具有一篇高分成功案例（正确答案）

C单细胞产品全面:

10x单细胞转录组、单细胞免疫组库、单细胞核转录组、空间转录组、单细胞全长转录组、单细胞ATAC-seq;（正确答案）

D强大生信分析:

强大的生信团队不仅提供基本分析，还提供细胞分化轨迹分析等多种高级分析;（正确答案）

E全套服务:

提供单细胞分离捕获、反转录建库、测序、标准分析和高级分析全套单细胞转录组测序服务，满足个性化分析。

（正确答案）

F优质售后:

单细胞产品图表免费服务到文章发表（项目金额10万元以上，需要开发流程的分析单独评估收费）（正确答案）

G可以提供上门组织解离、单细胞悬液制备服务（正确答案）

38.组织样本单细胞悬液制备方法有哪些?

*

A机械法:

网搓法、研磨法（正确答案）

B酶解法:

胰蛋白酶类、胶原酶、溶菌酶、弹性蛋白酶（正确答案）

C化学处理方法:

0.2%EDTA-酶,将组织细胞间起粘连作用的钙镁离子置换出来，从而使细胞分散开来;（正确答案）

39.单细胞全长转录组测序技术优势有哪些?

*

A细胞获取通量高:

理论上一张芯片可混上万个cell;（正确答案）

B长度长:

可精准鉴定可变剪接、融合基因、基因家族、SNV等基因变异;（正确答案）

C获取数据量多:

50Mreads/prometgION芯片，获取reads数多，同时进行单细胞转录本3’端测序和全长转录组测序，获得超高数据量100G（二代）+200-300G（三代）;（正确答案）

D性价比高:

一次测序，两套数据，可挖掘细胞类型特异性Isoforms和细胞类型间Isoforms比较。

（正确答案）

40.相较于传统免疫组库检测方法，单细胞免疫组库技术上有哪些优势?

*

A富集V（D）J区域全长序列，检测信息更全;（正确答案）

B精准匹配两个BCR/TCR链对（正确答案）

CTCR/BCR同时检测（正确答案）

D一次分析上千个单细胞TCRα/β和BCR重链和轻链信息和基因表达（正确答案）

E同时获得单细胞免疫组库和5’转录组表达信息（正确答案）

41.空间转录组使用异戊烷的作用*

A防止组织样本在液氮中迅速冻结，形成冰晶;（正确答案）

B防止RNA降解（正确答案）

C防止组织形态受损（正确答案）