单细胞空间转录组培训考核试题.docx

1、单细胞空间转录组培训考核试题单细胞&空间转录组培训考核试题您的姓名： 填空题 *_一、单选题1.百迈客提供10x单细胞转录组测序服务产品数据量有（） 单选题 *A 100GB 200GC 100G，200G(正确答案)D 150G2.空间转录组载玻片上每个捕获区域有多少个spots? 单选题 *A 3000B 5000(正确答案)C 7000D 90003.百迈客提供空间转录组测序数据量? 单选题 *A 60G (正确答案)B 100GC 150GD 200G4.10x genomics单细胞技术中Gel bead上结合的哪个接头序列是用来标记不同细胞的（） 单选题 *A TruSeq Rea

2、d1B 10x Barcode (正确答案)C Unique Molecular Identifier（UMI）D polyd(T)5.10x genomics单细胞转录组比对分析的是什么类型的序列（） 单选题 *A 3 mRNA序列(正确答案)B 5 mRNA序列C 3 mRNA全长序列D 5 mRNA全长序列6.10X genomics平台对于细胞大小的要求范围是多少? 单选题 *A 10um以下B 20um以下C 30um以下D 40um以下(正确答案)7.10X genomics中UMI是什么作用? 单选题 *A 全长Illumina TruSeq Read1测序引物B用于区分细胞C区

3、分同不同的mRNA(正确答案)D 捕获mRNA分子8.10X genomics单细胞转录组细胞聚类分群的依据是什么? 单选题 *A 细胞大小B细胞个数C细胞marker基因表达(正确答案)D 细胞分化轨迹9.百迈客单细胞全长转录组测序提供的数据量是? 单选题 *A 100GB 200GC 300GD 三代200-300G，二代100G(正确答案)10.百迈客单细胞全长转录组是基于什么平台? 单选题 *A 10x genomics+Nonapore+Illumina(正确答案)B 10x genomics+PBC Smart-seq+Nonapore11.单细胞ATAC-seq是基于对对细胞进行

4、分群? 单选题 *A 基因表达B 细胞个数C 染色质开放性特征(正确答案)D 细胞大小12.单细胞转录组拟时序核心分析的目的是? 单选题 *A 探索细胞发育分化轨迹 (正确答案)B 基因表达动态变化C 差异基因在不同cluster表达状况D 寻找marker基因13.细胞周期热图分析的核心目的? 单选题 *A 探索处于高分裂期的细胞cluster可能是病变细胞(正确答案)B 鉴定marker基因C 寻找差异表达基因D 观察细胞分化途径14.空间转录组冷冻组织切片常规厚度一般是? 单选题 *A 1umB 5umC 10um(正确答案)D 20um15.空间转录组中Gel bead上结合的spat

5、ial Barcode序列作用是? 单选题 *A 标记细胞B 捕获mRNA分子C 细胞分群D 标记每个spot进行空间定位(正确答案)16.10x 单细胞免疫组库检测富集扩增区域是? 单选题 *A TCR/BCR CDR3区域序列B TCR/BCR CDR区域序列C TCR/BCR V(D)J全长序列(正确答案)D 所有mRNA全长序列17.目前10x Genomics 空间转录组细胞水平分辨率为（） 单选题 *A 单个细胞B 2-3个细胞C 1-10个细胞(正确答案)D 1-100个细胞18.单细胞和单细胞核的技术原理核心区别是? 单选题 *A 单细胞核需要抽核处理，单细胞转录组需要制备单细

6、胞悬浮液(正确答案)B Gel beadC Chip芯片D 捕获mRNA方式19.单细胞核转录组目前已发表文章篇数数量级别? 单选题 *A 10篇B 100篇 (正确答案)C 1000篇D 10000篇20.10X genomics单细核转录组测序对细胞大小的要求范围是多少? 单选题 *A 10um以下B 20um以下C 30um以下D 40um以下E 没有细胞粒径大小限制(正确答案)二、多选题21.下面哪些细胞类型一般不适合10x 单细胞测序? *A神经元细胞(正确答案)B巨噬细胞 (正确答案)C皮下脂肪细胞(正确答案)D心肌细胞(正确答案)E肾脏细胞(正确答案)F骨骼肌纤维(正确答案)G卵

7、细胞(正确答案)22.10X genomics单细胞转录组分析内容的核心是什么? *A 划分细胞群体(正确答案)B细胞群间基因表达差异检测(正确答案)C鉴定marker基因(正确答案)D鉴定细胞类型(正确答案)E 细胞轨迹分析(正确答案)F GO/KEGG富集分析23.百迈客目前10x单细胞转录组适用原则（） *A 对于人、鼠样本可以提供组织解离单细胞悬浮液制备(正确答案)B其他动物样本需要上门进行预实验进行解离和单细胞悬液制备(正确答案)C植物样本需要老师提供原生质体悬浮液，现场制备单细胞悬浮液(正确答案)D 冷冻组织和细胞也可以适用于单细胞转录组测序24.10x单细胞转录组测序对细胞悬浮液

8、的要求（） *A 细胞数量50万以上(正确答案)B 细胞活性高于90%(正确答案)C 细胞粒径小于40m(正确答案)D 细胞浓度:7001200cell/l;细胞体积:100微升(正确答案)E 细胞不能成团，少碎片，不存在逆转录抑制剂和非细胞的核酸分子(正确答案)25.单细胞转录组测序数据量推荐正确的是? *A 原代细胞、细胞系可推荐3000-5000个左右细胞(正确答案)B 肿瘤推荐3000-8000个细胞(正确答案)C 血液细胞或干细胞发育推荐1万个左右(正确答案)D 每个细胞测5-10万条reads(正确答案)E 每个样本可推荐100G或200G数据量(正确答案)26.单核转录组测序更适

9、合哪种类型样本? *A 冻存样本(正确答案)B脑、心、肾脏等复杂组织;(正确答案)C 难以解离组织样本;(正确答案)D 酶解离有偏好性样本;(正确答案)27.10x 单细胞核转录组技术的优势有（） *A 减少解离偏差(正确答案)B 与冷冻样本兼容(正确答案)C 消除解离诱导的转录应激反应(正确答案)D 无惧细胞活性和细胞粒径大小(正确答案)28.单细胞核测序mRNA相对单细胞较少说法正确的是? *A捕获到的基因总数减少了约20-40%，UMI总数减少了约20-60%，而较大一部分是线粒体基因。(正确答案)B不影响细胞分群，且标志物的表达得以维持。(正确答案)C样本类型不一样，检测灵敏度不一样。

10、(正确答案)D外周血PBMC和单核细胞类型比例相似，单细胞核检测转录组数据可与细胞的读数相当。(正确答案)29.单细胞核转录组样本运输要求? *A 组织样本液氮冷冻干冰运输;(正确答案)B 细胞样本经 4（10min），-20(30min)，-80（16-18h）梯度冻存直至液氮槽冷冻(正确答案)C 全血直接分离PBMC，PBMC冻存后干冰寄送(正确答案)30.细胞核悬液质检标准? *A 核总数一般不低于5*105个(正确答案)B要求核浓度为700-1200 nucleus/ul，体积大于200uL，(正确答案)C结团率低于10%，细胞核膜完整，染色均一，无较大杂质(正确答案)D提核后活性低于

11、5%(正确答案)31.目前10x Genomics空间转录组的不适合样品类型有? *A FFPE(正确答案)B 人鼠心脏组织C 骨骼组织(正确答案)D 皮肤组织(正确答案)E 植物幼嫩组织F 肝脏组织32.10x Genomics空间转录组的优势? *A 全组织解析(正确答案)B 高分辨率(正确答案)C 操作简单(正确答案)D 多维度分析(正确答案)E 完善数据分析(正确答案)F 经验丰富(正确答案)33.10x genomics 空间转录组测序送样要求 *A 每块组织样本不宜过大（长宽高约0.8 cm）(正确答案)B客户需要同时制作多份样本（至少2份，建议3份）(正确答案)C置于干冰环境寄送

12、（推荐用量约5 kg/日），-80C冰箱保存。(正确答案)D 样本需要进行异戊烷冻存和OCT包埋预处理(正确答案)34.10X genomics目前应用比较多的产品类型有哪些? *A 单细胞转录组测序(正确答案)B 单细胞免疫组库(正确答案)C 单细胞ATAC-seq(正确答案)D 单细胞表面蛋白检测35.10X genomics单细胞转录组测序后验证实验有哪些? *A qPCR验证marker基因表达（bulk&分选的亚群）;(正确答案)B 免疫荧光定位验证时空分布;(正确答案)C 流式分选特定亚群KO/OE细胞验证功能;(正确答案)D smart-seq2单细胞转录组小细胞量验证表达;(正

13、确答案)E marker基因临床相关性分析，比如预后(正确答案)36.10X genomics单细胞转录组测序关于生物学重复说法对的? *A需要生物学重复，尤其是个体差异性大的临床样本;(正确答案)B根据目前发表的文献，很少不做重复的;(正确答案)C多个生物学重复也会增加最终获得的有效单细胞数据个数;(正确答案)D不需要生物重复37.百迈客10x单细胞转录组测序产品优势? *A经验丰富:累计制备100余种组织类型、3000+例的单细胞样本;(正确答案)B成功案例:目前具有一篇高分成功案例(正确答案)C单细胞产品全面:10x 单细胞转录组、单细胞免疫组库、单细胞核转录组、空间转录组、单细胞全长转

14、录组、单细胞ATAC-seq;(正确答案)D强大生信分析:强大的生信团队不仅提供基本分析，还提供细胞分化轨迹分析等多种高级分析;(正确答案)E全套服务:提供单细胞分离捕获、反转录建库、测序、标准分析和高级分析全套单细胞转录组测序服务，满足个性化分析。(正确答案)F优质售后:单细胞产品图表免费服务到文章发表（项目金额10万元以上，需要开发流程的分析单独评估收费）(正确答案)G 可以提供上门组织解离、单细胞悬液制备服务(正确答案)38.组织样本单细胞悬液制备方法有哪些? *A 机械法:网搓法、研磨法(正确答案)B 酶解法:胰蛋白酶类、胶原酶、溶菌酶、弹性蛋白酶(正确答案)C 化学处理方法:0.2%

15、EDTA-酶,将组织细胞间起粘连作用的钙镁离子置换出来，从而使细胞分散开来;(正确答案)39.单细胞全长转录组测序技术优势有哪些? *A 细胞获取通量高:理论上一张芯片可混上万个cell;(正确答案)B长度长:可精准鉴定可变剪接、融合基因、基因家族、SNV等基因变异;(正确答案)C获取数据量多:50 M reads/prometgION芯片，获取reads数多，同时进行单细胞转录本3端测序和全长转录组测序，获得超高数据量100G(二代)+200-300G(三代);(正确答案)D性价比高:一次测序，两套数据，可挖掘细胞类型特异性Isoforms和细胞类型间Isoforms比较。(正确答案)40.相较于传统免疫组库检测方法，单细胞免疫组库技术上有哪些优势? *A富集V(D)J 区域全长序列，检测信息更全;(正确答案)B 精准匹配两个BCR/TCR链对(正确答案)C TCR/BCR同时检测(正确答案)D 一次分析上千个单细胞TCR/和BCR重链和轻链信息和基因表达(正确答案)E 同时获得单细胞免疫组库和5转录组表达信息(正确答案)41.空间转录组使用异戊烷的作用 *A 防止组织样本在液氮中迅速冻结，形成冰晶;(正确答案)B 防止RNA降解 (正确答案)C 防止组织形态受损(正确答案)