黄化突变体文献综述模板文档格式.docx
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EMS将鸟嘌呤的O6位置烷基化，在DNA复制过程中由于烷基化的鸟嘌呤与正常的胸腺嘧啶配对，使得碱基发生替换（赵用亮，1996）。
EMS诱发的另外一个鸟嘌呤位点是N7位点，该位点是最易起反应的位点几乎可以与所有烷化剂起烷化作用，鸟嘌呤N7位点烷基化后，使核苷键发生水解导致断裂，鸟嘌呤从DNA链上脱落，造成DNA链碱基缺缺失，在复制的时候游离的碱基可能发生错配，以致发生碱基颠换即G：
C—A：
T，G：
C—C：
G，G：
C—T：
A；
另外烷基化的鸟嘌呤易离子化，使稳定的酮式变为不稳定的烯醇式，不与胞嘧啶配对而与胸腺嘧啶配对，从而发生G：
T转换。
除此之外，EMS还可能使两个鸟嘌呤N7位点形成共价键，使得DNA双链交联而造成变异甚至死亡。
这些DNA结构上的变化都可能促使不表达的基因或区段被激活，而表现出被掩盖的性状。
另外胸腺嘧啶O4位点也易发生烷基化，其次是鸟嘌呤N3，腺嘌呤N2，腺嘌呤N7和胞嘧啶N3位点，此四个位点发生烷基化后引起碱基置换突变只占烷化作用突变的10%。
1.1.2叶色突变体的分类
由于叶色突变体通常在苗期出现叶色变异,因此,其分类常常根据苗期的叶色表型进行。
目前分类方法较多,如Gustaftsson把叶色突变体分为五种类型：
白化、黃化、浅绿、条纹、斑点。
而Awan等将其分成八种类型：
白化,黄化,浅绿,白翠,绿白,黄绿,绿黄和条纹。
二者的分类中,白化、黄化、浅绿类型相同,Awan将条纹和斑点两种类型按表型的差异又分成了不同的类型[16]。
walles将叶色突变体分成3类:
1、单色突变,指叶片仅表现出浅绿、黄、白三种颜色中的一种;
2、杂色突变,指叶片存在多种颜色,如白黄、白绿、斑等;
3、阶段性失绿,指在植株发育的某个阶段,叶色发生突变,然后再恢复到正常颜色。
然而,简单地以苗期表型为依据来进行分类具有一定的局限性。
植物的表型性状与基因型并非一一对应的关系,一种表型性状可能受多个基因同时突变的共同影响,即使是同一个基因发生突变,损伤的程度不同基因功能也会表现出不同的表型性状。
比如,au和yg一2是番茄的黄叶突变体,其表现型非常相似,而研究表明an突变体的黄叶性状是由编码血红素加氧酶的基因发生突变引起的,yg一2突变体中编码光敏色素生成团合酶基因发生了突变[17]。
另外,还有一些叶色突变性状在苗期时无法识别,如常绿（staygreen）突变体是常见的苗期后才表达的叶色变异[18],此突变性状也存在于拟南芥、菊花等很多物种中,其最明显的特征是生育末期叶片保持绿色甚至出现完全不黄化现象。
植物表型的表达不仅受基因的控制,也受环境因素的影响。
因此,在对叶色突变体进行分类时,应根据不同的表型性状选择并结合多种分类方法对其进行科学的分类。
1.1.3叶色突变体的遗传研究
叶色突变体的来源广泛,种类繁多,种类不同其遗传规律差别也较大。
叶色变异性状可能受细胞核遗传,也可能受细胞质遗传;
可能由单基因控制,也可能由多基因控制;
可能是质量性状,也可能是数量性状。
为了确定叶色突变的遗传方式,在构建F1群体时必须进行正反杂交,并且需要进行测交试验。
如果是细胞质遗传,正反杂交的子代叶色表型不同,总是和母本保持一致且不发生性状分离;
如果是细胞核遗传,正反交的子代叶色相同,在F2和BC1群体中发生叶色分离,并具有一定的性状分离比例,根据分离比便可知叶色变异是受单基因控制还是多对基因控制。
甘蓝型油菜黄化突变体的基因定位
3.1细胞核遗传
对多种突变体的研究表明,叶色突变多是由单隐性核基因控制的[13、19、20、21]。
胡远辉等对甘蓝型油菜叶色突变体Cr3529进行了研究,认为此突变性状受细胞核内1对隐性基因控制[22]。
刘海衡等对芥菜型（召rassicajuneea五.）油菜黄化突变体五“s少进行了研究,该黄化性状受2对隐性核基因控制[23]。
何瑞锋等（2000）研究“斑马叶”叶色突变体,发现由于核基因改变其叶片间断失绿[24]。
吴殿星等对水稻转绿型白化突变系W25进行研究,表明W25不育系的的叶色表型由单隐性核基因控制。
[25]
3.2细胞质遗传
细胞质遗传的叶色突变体与细胞核遗传的相比,数量比较少,且后代性状遗传以母性遗传方式进行。
细胞质控制的叶色突变体最早在大豆中出现,刘友杰利用激光诱变处理早稻品种,获得了褪绿突变体,遗传分析表明该褪绿性状是由细胞质基因突变引起的[26]。
此外,受细胞质遗传的叶色突变体仅在拟南芥[27]、小麦[28]（王保莉等,1996）、烟草[15、29]（Mondeetal.,2000;
Baraketal.,2001）等植物中有报道。
1.1.3.3外部环境对叶色突变体的影响
外部环境如温度、光照,水分等对叶色突变体都有影响,其中温度的影响最大。
陈佳颖等（2010）利用60c。
丫射线辐照处理粳稻品种嘉花1号的种子,得到了1个低温敏感叶色突变体InrZI,在较低温度（<
25.0℃）条件下,该突变体幼苗叶色呈黄色;
随着温度逐渐升高,叶色由黄色转化为绿色,出现转化现象的临界温度约为27,5℃。
[30]
1.1.4叶色突变体的分子机制
叶绿素合成机制的稳定受突变基因直接或间接的影响,任何妨碍叶绿素素代谢稳定性的因素都会引起叶色变异,其分子机制非常复杂。
1.1.4.1叶绿素生物合成途径中的基因突变
叶绿素合成分为厌氧条件和有氧条件下的反应。
的生物合成以谷氨酸与a一酮戊二酸为原料,然后合成厌氧条件下,高等植物叶绿素ALA。
2分子ALA成1分子胆色素原,其具有毗咯环。
4分子胆色素原经脱氨基缩合形成脱水缩合形成1分子尿琳原11，尿叶琳原111的4个乙酸侧链脱梭形成具有4个甲基的粪叶琳原m。
在有氧条件下,粪叶琳原m再脱梭、脱氢、氧化形成原叶琳双,原叶琳IX是形成叶绿素和亚铁血红素的分水岭。
如果与铁结合,就生成亚铁血红素;
与镁结合,则形成Mg-原叶琳仄。
Mg一原叶琳IX的一个梭基被甲基酷化,在原叶琳IX上形成第五个环,接着B环上的一CH=CHZ侧链还原为一CHZ一CH3,即形成原叶绿酸酷。
原叶绿酸酷经光还原变为叶绿酸酷a,然后与叶醇结合形成叶绿素a,叶绿素b是由叶绿素a转化而成的。
叶绿素合成的过程涉及多个酶的参与。
DVR基因最先被鉴别后,参与高等植物叶绿素合成的所有基因逐一被鉴定,拟南芥中从谷氨酞一tRNA到叶绿素b的合成过程中,共有编码15种叶绿素合成酶的27个基因参与困[31]agatactal.,2005）。
叶绿素合成过程中的任何一种酶的合成发生突变均可影响叶绿素的合成进程,进而改变叶绿体中各种色素的含量,引起植株叶色变异。
1.1.4.2血红素代谢途径中的基因突变
叶绿素合成速率受细胞内血红素含量影响。
当血红素的消耗大于合成时,血红素减少就会促进ALA的合成,ALA含量增加促使叶绿素的合成。
当血红素的合成大于消耗时,其浓度升高从而抑制ALA的形成,ALA含量减少便抑制叶绿素的合成。
血红素经一系列的反应最终形成光敏色素生色团,若此途径任何反应受阻,细胞内血红素含量上升,血红素的积累反馈抑制叶绿素合成,突变体由于缺乏叶绿素使得叶色产生变异[17]。
叶绿素合成过程中血红素反馈抑制是关键的调控步骤。
最直接的证据是,在番茄aurea和yenow一green一2突变体中,编码血红素氧化酶（hemeoxygenase）和光敏色素生色团合酶的（PFBs”thase）基因突变,使细胞内积累过量的血红素,其反馈抑制叶绿素前体氨基酮戊酸的合成,致使突变体表现为叶色黄化[17]。
1.1.4.3编码其他叶绿体蛋白的基因突变
叶绿体的结构基础是蛋白质,约占口卜绿体干重的30一40%。
它亦是叶绿体功能的基础,几乎参与叶绿体全部的生命活动,如酶代谢过程中的催化剂、负责翻译的核糖体等,它们的主要成分均为蛋白质。
电子传递链是由蛋白质与细胞色素、质体蓝素等相结合而构成的,对叶色起关键作用的光合色素同样需要与蛋白质结合形成复合体而存在,同时叶绿体内膜系统的主要成分也是蛋白质[32,33]（Kalmangara,1988;
Yaronskaya,2003）。
一些叶绿体蛋白的突变可导致叶绿体内部膜结构发育不完全,进而叶绿素及其他光合色素的合成及稳定性也受到影响,最终使叶绿体中各种色素的含量及比例发生改变[34]（June,1969）。
叶绿体基因和细胞核基因共同编码叶绿体中的蛋白质,其中大约80个叶绿体蛋白质由叶绿体基因组编码,而3000多个蛋白由核基因编码,在细胞质中合成后通过叶绿体外套上的异位子进入叶绿体中[35、36]（sat。
1999;
Gray,2003）。
此外谷氨酞一tRNA还原酶催化叶绿素合成的第一步反应,而叶绿体核糖体的突变直接影响谷氨酞一tRNA还原酶的合成,减少叶绿素的含量[33]（Yaronskaya,2003）。
叶绿体膜转运蛋白的突变可能阻碍叶绿体膜对蛋白及酶的识别、结合和转运,从而使叶绿素合成速率降低[37]。
1.1.5叶色突变体表型与叶绿素含量的关系
叶色突变体的叶绿素含量发生变化，影响植株的光合作用，从而影响植株的多种生理活动。
叶色突变体在植物生理研究中的应用已经很广泛，比如通过叶色突变体研究叶绿素生物合成、叶绿体分化与发育、光合作用和光形态建成等基础研究，尤其是对植物光合作用和光形态建成的研究中，叶色突变体是理想的材料。
叶片是植株进行光合作用的场所，叶色突变往往影响植物光合效率。
郭春爱等利用水稻低叶绿素b突变体研究了低叶绿素b对突变体光系统II热稳定性的影响[15]。
结果表明，低叶绿素b突变体对高温更敏感，PSII捕光色素蛋白复合体（LHCII）中叶绿素b减少可能降低了PSII结构与功能的热稳定性。
光敏色素由生色团和蛋白质两部分组成，是植物光形态建成的光受体。
光敏色素生色团生物合成受阻，其含量降低将反馈抑制叶绿素合成，引起对光不敏感的叶色突变[16]。
生色团含量影响光敏色素活性，其含量降低，光敏色素的活性也随之下降[17]，因此可利用生色团缺失的突变体研究光敏色素在光形态建成中的作用。
叶色突变体除可直接或间接影响叶绿素合成外，亦可影响激素的合成，改变突变体内源激素含量。
比如脱落酸（ABA），其生物合成途径中的基因突变，可直接导致ABA含量的下降，突变体的生长发育便受到一定程度的影响，造成叶色突变[18]；
脱落酸生物合成的起始反应在叶绿体中进行，因此叶绿体的发育状况直接影响其合成是否能顺利进行，叶绿体发育异常可影响脱落酸合成中关键酶的活性，降低突变体的脱落酸含量[19]。
1.1.6叶色突变体的应用价值
目前很多农作物如水稻、油菜、小白菜、辣椒等都有关于叶色变异作为标记性状鉴定杂交种字纯度的报道。
水稻中,余新桥等（2000）利用淡绿叶色标记性状的
突变体,培育出带淡绿色叶色标记的不育系:
标一IA,标一IA与中413、明恢63的杂交后代均表现出较强的杂种优势。
曹立勇等（1999）将紫叶标记转育到釉型光温敏核不育系中,通过筛选培育出中紫S。
油菜中,赵云等（2003）利用物理和化学诱变复合处理,获得了幼叶黄化突变性状Cr,将其突变性状和核不育性状同时导入到油菜PolCMS中,成功地选育出了带Cr标记的双低双重不育三系。
1.1.7.2叶色变异可应用于高光能育种的研究
叶绿体是植物进行光合作用的场所,光合作用的效率受叶绿素含量、叶绿体形态、结构和数目变化的共同影响。
叶色突变不仅会影响叶绿素的含量,而且对叶绿体的分化和发育也有影响,因此,叶色突变体是研究光合作用的理想材料。
Gan等（1995）利用转基因技术在烟草中获得了一个常绿突变体,此突变体在生长末期叶片持绿时间较长,衰老过程明显延迟,且能有效的吸收光能,延长光合作用的时间,其生物量增加40%、种子产量增加52%,从而使实现高光效育种变得可能。
光抑制是植物在强光下光合作用受到抑制的现象。
当同时出现其他环境胁迫因素如低温,高温和干旱等时,光抑制会加剧。
一些黄化突变体,虽叶绿素含量减少,但叶黄素含量明显较多,叶黄素在植物体内以紫黄质、环氧玉米黄质和玉米黄质三种状态相互转化,使光系统避免伤害。
如在水稻“249黄”突变体中,虽叶绿素含量减少,但光合结构对强光的耐受性升高,突变体的最大光合速率反而显著上升（龚红兵等,2001）。
1.1.7.3叶色突变体可作为改良作物品质性状的资源
叶色突变体叶绿素含量的改变,对植物的生长一般具有负面的影响。
但少数的叶色突变体使得植物具有特殊优良品质。
安吉白茶的返白现象与温度有较大的关系。
返白和复绿的过程中,叶绿素和类胡萝卜素含量均是由低到高变化,但氨基酸总量的变化却是随白化程度的加深而升高,氨基酸总量高峰值可达5%,有很高的营养价值。
在烟草中,叶片缺少叶绿素也有特殊的利用价值。
烟草叶绿素缺乏变异型分为白肋型、灰黄型、黄绿型等,其中白肋突变体来源于马里兰深色晒烟,叶绿素含量还有一些叶色突变体的颜色比较特殊,可培育成观赏植物。
Oud等（1995）利用转基因植株进行多年相互杂交实验,培育出了橙色的矮牵牛新品种7.4叶色突变体在功能基因组学研究中的应用功能基因组学是指利用结构基因组学研究得到的大量数据与信息评价基因的生化、细胞、发育和适应等功能,其主要方法结合了高通量、大规模统计和计算机分析技术。
目前已有多种分析验证基因功能的方法,其中突变体是最为有效的分析方法。
吴自明等（2007）对水稻叶绿素合成缺陷突变体进行研究,并利用图位克隆方法克隆了该基因（YGLI）。
对其基因功能研究表明,该基因编码叶绿素合成酶,其催化叶绿素a生物合成过程中的最后一步反应。
Jung等（2003）利用T-DNA插入的方法获得水稻黄绿色突变体,经研究发现,T-DNA的插入改变了基因OsCHLH的结构,该基因最大的一个亚基一CHLH亚基C末端缺失,从而导致镁鳌合酶的活性降低,使该突变体叶绿素合成受阻,表现出黄绿色的表型。
刘文真（2006）等利用T-DNA插入法获得了对低温敏感的水稻叶色突变体,对该突变体的研究将更好的了解温敏叶色突变的分子机制。
7.5叶色突变体在植物生理研究中的应用
叶色突变体的叶绿素含量发生变化,影响植株的光合作用,从而影响植株的多种生理活动。
叶色突变体在植物生理研究中的应用已经很广泛,比如通过叶色突变体研究叶绿素生物合成、叶绿体分化与发育、光合作用和光形态建成等基础研究,尤其是对植物光合作用和光形态建成的研究中,叶色突变体是理想的材料。
叶片是植株进行光合作用的场所,叶色突变往往影响植物光合效率。
郭春爱等（2007）利用水稻低叶绿素b突变体研究了低叶绿素b对突变体光系统11热稳定性的影响。
结果表明,低叶绿素b突变体对高温更敏感,PSll捕光色素蛋白复合体（LHCn）中叶绿素b减少可能降低了PsH结构与功能的热稳定性。
光敏色素由生色团和蛋白质两部分组成,是植物光形态建成的光受体。
光敏色素生色团生物合成受阻,其含量降低将反馈抑制叶绿素合成,引起对光不敏感的叶色突变（Terryetal.,华中农业大学2011届硕士研究生学位论文1999）。
生色团含量影响光敏色素活性,其含量降低,光敏色素的活性也随之下降,（welleretal.,1997）,因此可利用生色团缺失的突变体研究光敏色素在光形态建成中的作用。
叶色突变体除可直接或间接影响叶绿素合成外,亦可影响激素的合成,改变突变体内源激素含量。
比如脱落酸（ABA）,其生物合成途径中的基因突变,可直接导致ABA含量的下降,突变体的生长发育便受到一定程度的影响,造成叶色突变（Agrawaletal.,2001）;
脱落酸生物合成的起始反应在叶绿体中进行,因此叶绿体的发育状况直接影响其合成是否能顺利进行,叶绿体发育异常可影响脱落酸合成中关键酶的活性,降低突变体的脱落酸含量（Fambrinietal.,2004）。
1.2叶色性状基因定位方法
1.2.1质量性状基因定位方法
质量性状指能观察而不能测量的性状,即属性性状,它表现出质的中断性变化。
因此在相对性状间呈现非连续变异,其遗传上由一个或少数几个效应大的基因（或称主基因）决定,受环境影响较小,因而能对群体内的个体进行明确的分类。
对多种突变体的研究表明，叶色突变多是由单基因控制的。
胡远辉（2004）等对甘蓝型油菜叶色突变体Cr3529进行了研究，认为此突变性状受细胞核内1对隐性基因控制[20]。
刘海衡等对芥菜型油菜黄化突变体L638-y进行了研究，该黄化性状受2对隐性核基因控制[21]。
何瑞锋等研究“斑马叶"
叶色突变体，发现由于核基因改变其叶片间断失绿[22]。
吴殿星等对水稻转绿型白化突变系W25进行研究，表明W25不育系的的叶色表型由单隐性核基因控制[23]。
1.2.2数量性状基因定位方法
常用的数量性状基因定位方法有单标记分析法、区间作图法、复合区间作图法、多重区间作图法等。
（1）单标记法（singlemarkeranalysis）包括标记分析方法（marker-basedanalysis）和性状分析方法（trait-basedanalysis）两种，前者利用每个标记位点不同基因型和性状存在的差异，通过传统的单因素方差分析法，检测数量性状在标记基因型间的差异是否显著，并进行F测验，若结果显著，则说明该标记位点可能与一个或多个QTL（quantitativetraitlocus）连锁。
这种方法简单且符合QTL定位的基本统计原理，同时不需要完整的分子标记连锁图。
性状分析方法的原理是假设由于选择的结果使数量性状的高、低表型间等位基因增减频率改变，当QTL等位基因与某一标记基因连锁时，由于其相互关联，导致高、低表型个体间标记基因频率的差异。
（2）区间作图法（Intervalmapping,IM）是由Lander和Botstein、Jensen和Knapp等提出的，其原理是利用饱和连锁图谱，通过极大似然函数和线性回归模型对目标性状进行全基因组扫描，判断是否存在任意相邻标记位点和位点间任一位置上具有对该性状有效应的位点[64-66]。
各个位点对性状的效应大小通过似然值（LOD值）来衡量，根据似然值绘制的曲线图可以确定QTL在染色体上可能的位置。
（3）复合区间作图法（Compositeintervalmapping,CIM）由Zeng提出等，是在区间作图的基础上发展起来的,该方法的原理是：
检测某一特定标记区间时，将与其它QTL连锁的标记也包括在模型中以控制背景遗传效应，实现了同时利用多个遗传标记信息对基因组的多个区间进行多个QTL的同步检测，是目前应用最为广泛的方法之一[67]。
复合区间作图法的主要优点是：
保留了区间作图法的优点，利用QTL似然图来显示QTL的可能位置及显著程度；
一次只检验一个区间；
若不存在上位性和环境互作的影响，其位置和效应的估计是接近无偏的；
利用了整个基因组的标记信息；
以所选择的多个标记为条件，控制了背景遗传效应，提高了作图的精度和效率。
复合区间作图法存在的主要问题有：
若存在上位性及QTL与环境互作等复杂的遗传学问题则结果会出现偏离；
需要从大量的标记中筛选出部分有用的标记，而筛选时采用的显著性水平以及筛选的方法均会影响定位结果；
由于拟合在模型中的标记会吸收其附近的QTL效应，复合区间作图法需要为检验的区间开辟一个窗口，窗口内的标记不能包括在模型中，但适合的窗口大小不易确定[68]。
（4）混合线性模型方法由朱军提出，该方法把群体均值、QTL的各项遗传主效应作为固定效应，而把环境效应、QTL与环境互作效应、分子标记效应及其与环境的互作效应以及残差作为随机效应，将效应估计和定位分析结合起来，进行多环境下的联合QTL定位分析，提高了作图的精度和效率[69]。
Yang和Zhu开发了可以分析包括加性和加×
加上位性的各项遗传主效应及其与环境互作效应的计算机软件,这种模型可以无偏地分析QTL与环境的互作效应，并可以扩展到分析具有加×
加、加×
显、显×
显上位性的各项遗传主效应及其与环境互作效应的QTL[70]。
1.3分子标记技术
1.3分子标记技术
基因定位主要是通过分子标记来定位性状位点，通过寻找与目标性状连锁的分子标记，再计算分子标记与位点间的重组率，最终将基因定位在染色体的具体位置，分子标记技术有很多种，包括传统的分子标记技术和新兴的分子标记技术。
1.3.1传统的分子标记技术
遗传标记，从形态标记、细胞标记、生化标记，逐步发展到分子标记，其中传统的分子标记技术包括：
RFLP标记技术、RAPD标记技术、AFLP标记技术和SSR标记技术，其中又以SSR标记技术应用最为广泛。
简单重复序列（SimpleSequenceRepeat，SSR）标记又称微卫星（Microsatellite）标记，是第二代分子标记，一般以1~6个核苷酸为单位，经过多次串联重复而形成的DNA序列。
当重复单位发生不同次数的重复或不完全重复时，会影响扩增片段大小，导致该位点具有多态性。
以基因组中某一特定微卫星两侧的保守序列为依据，设计引物，经PCR扩增及凝胶电泳分离，扩增产物长度上的变化即可揭示SSR位点的多态性[71]。
相关研究表明SSR广泛分布于植物整个基因组，包括其编码区和非编码区，平均23.3Kb就有一个SSR[72]，SSR序列在不同植物基因组中的分
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