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2012年6月6日
学院意见
院长签字：
2012年6月6日
附4：
毕业论文（设计）任务下达书
学生 李政 （学号 200908010342 ）:
现将毕业论文（设计）任务下达书发给你。
毕业论文（设计）任务下达书内容如下：
一、毕业论文（设计）题目
DNA甲基化及其生物化功能
二、主要内容
1、综述DNA甲基化的研究现状；
2、DNA甲基化在生物学中的应用；
3、对DNA甲基化研究提出新的展望。
三、基本要求
认真阅读相关文献著作，提炼文字信息、理清思路。
四、主要参考文献
[1]杨春,邢秀梅.哺乳动物DNA甲基化研究进展[J].中国畜牧兽医,2012,（8）.
[2]宫时玉,蒋曹德,邓昌彦.DNA甲基化及其生物学功能[J].华中农业大学学报,2005,（6）.
[3]王文文,邱丽华.DNA甲基化在卵巢癌中的研究[J].国际生殖健康/计划生育杂志,2012,（4）.
[4]邱峥艳,郭将,杨春,赵志辉.DNA甲基化在动物遗传育种中的研究[J].中国畜牧兽医,2012,（7）.
[5]孟凡荣,司志飞,刘昊英.植物DNA的甲基化及其生物学功能[J].安徽农业科学,2007,（36）
[6]朱立宁,徐岷,张尤历.DNA甲基化与胰腺癌的研究进展[J].国际消化病杂志,2012,
（2）.
[7]周俊峄,杨劲.DNA修复基因甲基化修饰与肿瘤研究[J].国际检验医学杂志,2012,（8）
五、进程安排
阶段
起止日期
主要内容
1
2013年1月15日－2013年2月15日
阅读参考文献
2
2013年2月16日－2013年3月20日
整理资料、撰写大纲
3
2013年3月20日－2013年4月20日
中期检查
4
2013年4月20日－2013年6月10日
论文撰写及教师修改
六、本毕业设计（论文）任务下达书于2012年06月08日发出。
毕业设计（论文）应于2013年04月30日前完成后交指导教师，由指导教师评阅后提交毕业论文（设计）答辩委员会。
指导教师（签名）：
学 生（签名）：
注：
毕业设计（论文）任务下达书一式两份，一份给学生，一份留学院存档。
附5：
本科毕业论文（设计）文献综述（学生用表）
学 号
200908010342
题 目
DNA甲基化及其生物化功能
DNA甲基化是一种主要的表观遗传修饰，是调节基因表达的重要手段。
本文在介绍了DNA甲基化机制、与DNA甲基化的酶、DNA甲基化特点的基础上，重点论述了DNA甲基化通过与反式因子相互作用或通过改变染色体结构而影响基因的表达，在胚胎发育、X染色体失活、基因组印记等方面所起着重要作用。
并提出了DNA甲基化研究中的展望。
DNA甲基化反应分为两种类型，一种是2条链均未甲基化的DNA被甲基化，称为从头甲基化。
另一种是双链DNA的其中一条链已存在甲基化，另一条未甲基化的链被甲基化，这种类型称为保留甲基化。
DNA甲基化酶分为两类：
维持DNA甲基化转移酶（Dnmt1或维持甲基化酶）和从头甲基化酶。
根据序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化转移酶又分为四类：
Dnmt1/MET1、Dnmt2、CMT和Dnmt3。
脊椎动物DNA甲基化的模式不同于细菌，在细菌体内胞嘧啶和胸腺嘧啶都可以发生甲基化，而脊椎动物只有5mC一种形式，脊椎动物DNA的甲基化有以下4个特点：
（1）基因组内甲基化多数发生在与鸟嘌呤相连的胞嘧啶上，形成mCpG；
（2）G+C丰富区域的CpG即CpG岛是非甲基化的。
CpG岛位于转录起始点的上游。
如看家基因的启动子都含CpG岛，且保持非甲基化状态；
（3）启动子区的CpG被甲基化时转录受到抑制，基因下游即非岛区的CpG甲基化不抑制基因的转录；
（4）启动子区CpG甲基化的密度与转录的抑制程度有关，弱的启动子能被密度较低的甲基化完全抑制，当启动子被增强子增强时，恢复转录功能；
如果甲基化的密度进一步增加，转录也进一步被完全抑制。
此外，DNA甲基化分布有组织和发育阶段特异性。
DNA甲基化的检测方法报道非常多。
这些方法根据其检测的原理可以分为四大类型：
第一类是以Bisulfite处理DNA为基础的PCR方法。
第二类方法是直接从PCR产物研究DNA甲基化的方法。
第三类是整个基因组的方法。
第四类方法是实验控制活体细胞甲基化状态的方法。
DNA甲基化的生物学功能有以下五个方面。
1.DNA甲基化与基因表达，一般说来，DNA甲基化与基因表达呈负相关，不仅启动子区高甲基化与基因表达呈负相关，基因内部的甲基化与基因表达也存在着弱的负相关，启动子区低甲基化与转录活性正相关。
在体外，已甲基化的序列转入细胞后可抑制表达，相反，许多内源基因在经甲基化抑制剂5-叠氮胞嘧啶处理后被激活。
2.DNA甲基化与哺乳动物发育，基因组的甲基化模式在分化的体细胞中通常是稳定且可以遗传的，但哺乳动物中的生殖细胞发育期和移入前胚胎期，甲基化模式通过大规模的去甲基化和再甲基化形成新的甲基化模式，并产生有发育潜能的细胞。
3.DNA甲基化与基因组印记,基因组印记（genomicimprinting）是一种新发现的非孟德尔遗传现象，指控制某一表型的基因其成对的等位基因依亲缘（父源或母源）的不同而呈现差异性表达。
此种差异性表达，称为亲缘性差异性表达[23]。
来自父方的等位基因（父源等位基因）不表达即无转录活性而处于沉默状态者称为父系印记（paternalimprinting）；
若母源等位基因不表达，则称为母系印记（maternalimprinting）。
呈现上述现象的基因称为印记基因（imprintedgene），它又可分为父系印记基因（父源印记，母源表达）和母系印记基因（母源印记，父源表达）。
4.DNA甲基化与杂种优势,杂种优势现象在生物界广泛存在并早为人们所认识，而且在利用杂种优势的同时，对其产生机理的研究也一直未间断过。
随着分子生物学技术的发展，人们起初试图从基因杂合度出发，研究其与杂种优势的关系。
研究结果随不同材料而异，说明还不能从全基因组的杂合度来解释杂种优势的遗传基础。
近年来，人们从基因差异表达水平研究杂种优势的遗传基础。
目前发现亲子代间基因表达存在差异，那么DNA甲基化是否也参加了杂种优势有关基因表达调控呢?
有鉴如此，人们开展了DNA甲基化与杂种优势关系的研究。
用甲级化敏感扩增多态性方法（Methylationsensitiveamplifiedpolymorphism，MSAP）研究了亲本与杂种一代的甲基化差异对水稻杂种优势的影响。
结果表明：
总体甲基化程度与杂种优势无关，而特异位点上的甲基化的改变多对杂种优势有显著效应。
而且还发现，不同位点处甲基化减弱时，有的对杂种优势正效应，有的为负效应。
亲子代间存在双亲与F1代相同甲基化、单亲与F1代相同甲基化、F1代甲基化减弱和F1甲基化增强4种类型的差异。
当然，这些研究成果尚不足以阐明DNA甲基化与杂种优势的具体关系，亲子代间甲基化各种差异类型与杂种优势的关系还有待大量的研究。
5.DNA甲基化与X染色体失活,
Mlynarczyk等（2000）发现了染色体失活中心（XIC）并发现了XIST是失活中心的一个候选基因。
通过对失活和有活性的X染色体DNA甲基化状态的研究结果表明：
在失活的X染色体上大部分基因的CpG是甲基化的，而在活化的染色体是非甲基化的。
XIST基因5’端在活化X染色体上是完全甲基化的，而在失活的X染色体上是非甲基化的。
活化染色体与失活染色体甲基化状态的不同代表着甲基化在X染色体失活中的一种晚发现象，它对失活状态的维持具有重要的意义研究结果还发现，450kb的序列具有选择启动和保持X染色体失活的功能等。
虽然人们对DNA甲基化的研究开展了大量的工作，但因为还不完全清楚发育控制的去甲基化、甲基化谱建立和维持的机制及作用方式等问题，还是有很多工作要做。
真核细胞中多种多样后成调节现象的存在表明，不同后成调节的建立绝非单一因素所能控制，必然还要涉及其它许多因子。
对这一领域研究结果的全面了解将有益于加深对基因表达调控机制的研究。
就家畜而言，DNA甲基化的研究多集中在总体甲基化水平与生长发育关系上，到底是哪些基因的甲基化水平发生变化、如何变化，还不太清楚。
单个基因中，特定甲基化区域与基因的表达、生产性能和杂种优势表现的关系尚待深入研究。
不够可加附页
附6：
本科毕业论文（设计）开题报告书（学生用表）
DNA甲基化及其生物学功能
一、选题意义、研究现状及可行性分析
1.选题意义：
DNA甲基化是研究最清楚、也是最重要的表观遗传修饰形式DNA甲基化是正常发育、分化所必需的，具有重要的生物学意义。
DNA甲基化通过模式和数量的改变，对生物遗传信息进行调节，在基因表达调控、发育调节、基因组印迹等方面发挥重要作用。
DNA甲基化已日益成为分子生物学研究的热点之一。
2.研究现状：
在生物中基因组中DNA甲基化是一种重要的修饰方式，也是一种重要的表观遗传学机制[1][2]。
通常甲基化发生在胞嘧啶第5个碳原子上，由DNA甲基化转移酶（DMT）家族催化形成的。
DNA甲基化对于生物的正常发育起着非常重要的作用，并在很大程度上影响着生命重要的生物学进程，主要包括转录成分的沉默、基因失活、染色体的完整性和大部分基因的转录调控作用[3]。
虽然人们对DNA甲基化的研究开展了大量的工作,但因为还不完全清楚发育控制的去甲基化、甲基化谱建立和维持的机制及作用方式等问题,还是有很多工作要做。
[7]真核细胞中多种多样后成调节现象的存在表明,不同后成调节的建立绝非单一因素所能控制,必然还要涉及其它许多因子[4][5][6]。
DNA甲基化的研究多集中在总体甲基化水平与生长发育关系上,到底是哪些基因的甲基化水平发生变化、如何变化,还不太清楚。
单个基因中,特定甲基化区域与基因的表达生产性能和杂种优势表现的关系尚待深入研究[7]。
DNA甲基化与DNA修复、基因组稳定性和染色质结构等的关系，了解DNA甲基化建立和维持的机制，将有助于加深对基因表达调控机制的研究。
[12]越来越多的研究关注DNA甲基化在系统性红斑狼疮、哮喘等免疫疾病发生发展中的作用，为有关理论的完善与临床治疗提供了更多的思路与方法。
关于DNA甲基化与上述疾病发生机制的关系目前尚不清楚，更深入的研究将有助于进一步了解免疫性疾病的调控机制，对临床治疗起推动作用。
[8]
3.可行性分析：
在阅读大量文献与相关理论知识下，在前人工作基础上，结合老师的指导，这项研究可以顺利进行。
二、研究的主要问题和重点、难点
1.研究的主要问题：
2.研究的重点和难点
（1）DNA甲基化的研究现状
（2）DNA甲基化在生物学中的应用
主要参考文献
[2]宫时玉,蒋曹德,邓昌彦.DNA甲基化及其生物学功能[J].华中农业大学学报,2005,（6）.[3]王文文,邱丽华.DNA甲基化在卵巢癌中的研究[J].国际生殖健康/计划生育杂志,2012,（4）.
[4]邱峥艳,郭将,杨春,赵志辉.DNA甲基化在动物遗传育种中的研究[J].中国畜牧兽医,2012,（7）.
[7]周俊峄,杨劲.DNA修复基因甲基化修饰与肿瘤研究[J].国际检验医学杂志,2012,（8）.
[8]郭广平,袁金玲,吴晓丽,顾小平.DNA甲基化在植物研究中的应用现状与前景[J].植物遗传资源学报,2011,（3）.
写作进度安排
2012年8月-2012年9月查阅文献，撰写开题报告
2012年9月-2012年10月查阅文献，拟写提纲
2012年10月-2013年4月继续阅读文献为实验准备材料，相继开展实验
2013年4月-2013年5月整理实验数据，拟写论文
2013年5月-2013年6月修改论文准备答辩
李政同学通过对DNA甲基化及其生物化功能相关文献的阅读，对相关领域的研究情况有比较全面、深入的了解，为毕业论文的撰写奠定了较为坚实的基础。
为顺利完成论文的写作，应该对参考文献进行更加详细的参阅，更好地把握资料掌握的进程，可以得到较好的总结和展望。
指导教师：
2012年9月10日
开题小组意见
李政同学所选题建立在大量研究资料的基础上确立，并能对相关领域的研究情况有比较全面和深入的了解，同时本综述可以为DNA甲基化的研究提供理论依据，可行性比较强，同意开题。
开题小组组长：
2012年9月12日
学院意见
本毕业论文设计具有一定的创新性，可行性比较强，同意开题小组意见。
院长：
2012年9月16日
注：
各学院可根据专业特点对开题报告格式进行适当调整。
附7：
本科毕业论文（设计）选题变更审批表（教师用表）
学号
变更前题目
变更后题目
选题变更原因及论文工作计划、进度安排
2012年9月20日
2012年10月1日
附8：
毕业论文（设计）选题落实情况统计表
专业：
填表时间：
2012年6月16日
序号
题目名称
选题性质
指导教师
学生
成果形式
论文地点
姓名
职称
学号
说明：
1.本表由学生所在学院教务人员负责填写，一式两份，教务处、学院各一份；
2.选题来源：
是指导师推荐、学生自选、其它。
3.选题性质：
是指理论研究、应用研究、其它。
4.外聘教师姓名后加符号“*”
附9：
本科毕业论文（设计）中期检查及指导记录表（指导教师用表）
题目
是否按计划完成工作任务
是□基本按计划要求□否□
是否有能力独立按期完成毕业论文（设计）
目前进展情况（学生论文写作进展、资料搜集和利用情况、教师指导情况等）
学生：
到目前为止，论文选题、开题工作已经完成。
毕业设计整体写作思路已经整理出来，论文概要已经完成。
对指导教师建议文献基本都查阅并认真进行了研读，对相关领域的研究情况有更为全面、深入的了解。
教师指导情况：
在查阅参考资料、文献方面：
提供了此研究方向的最新研究进展情况，相关的权威刊物、书籍以及查找资料的建议和注意事项；
在策略方面：
建议多方面查找相关资料以便选取行之有效的研究方法；
建议不要忽略细节，从总体入手按部就班的将论文撰写完整。
对此后论文（设计）工作的建议，包括应注意的问题及采取的措施
下一步就是论文准备及论文的写作、修改、答辩。
要保证论文的可行性；
保证论文的创新性。
写论文之前充分了解各类文献，保证论文的可靠性，不会造成论文失误。
此后的论文写作中，在论文的撰写方面：
要认真研读所查文献。
论文修改时，要严格按照学校的论文写作要求来进行论文修改，注意字号，字数，装帧等一系列规范。
修改完后，积极同老师探讨，找出不足，继续修改。
（不少于150字）
指导教师签章：
2013年3月6日
院长签章：
2013年3月8日
附10：
毕业论文（设计）书面成绩评分参考标准（指导教师用表）
一级指标
二级指标
具体要求
分值
学术水平
立题水平
符合培养目标和教学基本要求，深度、难度、广度适当，能达到科研实践训练的要求
6
实验（调查）方法
能正确设计实验（调查）方案，实验（调查）方法先进合理，实验（调查）结果达到预期目标
结论合理性
结论符合理论法则和基本原则；
图纸质量高，工艺可行；
建模正确，设计合理
创新水平
有创新意识、创新点，对前人工作有改进或突破，或有独到见解。
7
应用价值
推广前景
推广前景好，推广后可以创造一定的经济价值或社会价值
5
适用面
论文研究的内容适应范围较广泛，并在较长的时间内可以适用
论文写作能力
格式
符号统一，编号齐全，图表完备、整洁、准确，符合论文格式规范及要求；
论文各构件齐全、格式正确
结构
布局合理，段落规范，层次清楚，结构严谨
文字
文字通顺、规范，语言准确、简洁、严密，表达能力强
逻辑性
思路清晰，条理清楚，逻辑严密，主分论一致，富有说服力
综合应用能力
综合应用文献资料能力
查阅文献有一定广泛性；
能独立查阅文献和搜集资料，并且收集的资料翔实、充分，能恰切地说明问题
学科间理论综合应用能力
综合分析正确、合理；
设计、计算准确；
方案论证充分；
能综合多学科、多层面的理论或技术并能熟练应用
综合应用技术、工具能力
设计或论文中综合应用了较多技术或工具，并能独立完成
解决问题能力
分析问题能力
有清晰的思路、恰当的方法，能全面地分析出问题及原因
10
能根据分析的结果提出完整的解决方案
遵守纪律情况
遵守纪律、工作量、工作态度
按期圆满完成规定的任务，工作量饱满，难度较大；
工作努力，遵守纪律；
工作作风严谨务实
各学院可根据专业特点对指标、要求进行适当调整。
附11：
毕业论文（设计）指导教师评分表
2013年5月8日
论文题目
指 导 教 师 评 语
李政同学对DNA甲基化及其生物化功能研究进展进行了综述，毕业论文选题新颖，立题符合教学目标和教学的基本要求，具有一定的深度与广度，通过查资料能达到提高其科研实践训练的要求。
文献综述逻辑性较好，对毕业论文相关领域的研究情况有比较全面和深入的了解，为毕业论文的撰写奠定了较为坚实的基础。
该生查阅大量文献资料，能全面收集研究的相关资料，写作过程中能综合运用相关基础知识和专业技术知识，综合运用知识能力强。
论文格式较为规范、统一，层次清楚，文字通顺、语言简练、条理清楚，结果分析恰当。
该生能独立查阅参考文献，收集资料比较翔实，阅读较为广泛，能说明有关本研究的现状以及研究进展，能够根据文献资料撰写论文。
平时学习态度认真、学风严谨，专业基础和专业功底较为扎实，实验技能较为熟练。
在论文写作过程中，严格保证了科研时间并能够按任务书中规定的进度开展各项工作，各阶段任务完成较好。
同意提交答辩。
是否同意提交答辩
同意提交答辩□ 不同意提交答辩□
评定成绩（百分制）
指导教师签字
职 称
附12：
毕业论文（设计）书面成绩评分参考标准（评阅人用表）
论文各构件齐全、格式正确
附13：
毕业论文（设计）评阅人评分表
2013年5月8日
D
升级会员 