酵母预备试剂Word文件下载.docx

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3.YPDAAgar培育板(1L)

YPDagar

70g

L-adeninehemisulphate

4.0.9%NaCl(w/v)(科室拿)1ml:

EP管分装

NaCl:

0.9g

milipore水定容到100ml

灭菌121°

,20min

%DMSO从试剂瓶中分装到ep管中,500ul每管,室温保留

6.10×

TE(pH=):

(0.1MTris-HCl,10mMEDTA)

●Tris-HCl1.211g/100ml

●EDTA0.37g/100ml

●调剂pH=,121°

7.10×

LiAc(pH=)

●1MLiAc10.202g/100ml

●用醋酸调剂pH=,121°

灭菌20min

1.×

TE/LiAc

的10×

TE+的10×

LiAc加入灭菌水终为10ml

2.50%PEG3350:

●PEG3350:

50g

●已灭菌的milipore水:

定容到100m

●(可用50°

水浴助溶,PEG易吸水,不可灭菌)

3.PEG/LiAc:

现配现用,在超净台中操作,吸取母液到ep管或50ml离心管中

终浓度10ml

PEG335040%8ml50%PEG3350

TEbuffer1×

1ml10×

TE

LiAc1×

LiAc

4.变性的鲱鱼精DNA(10mg/ml):

100°

5min变性

5.milipore水,70%酒精棉球,50ml离心管4个,ep管一盒,15ml试管架,50ml试管架,ep管架

6..x-a-GAL用DMF(dimethylformamide)20mg/ml,

Prepareandautoclave1Loftheappropriatedroputagarmedium

Coolto55°

CAdd2mlofX-a-Gal(20mg/ml)

Spreadingontopremadeagarplates

DiluteX-a-Galto4mg/mlindimethylformamide

Spread200μlonto15cmplates,or100μlonto10cmplatesusingsterileglassbeads

(二)具体方式:

FreezingMediumconsistsofYPDliquidmedium+25%glycerol

◆A:

酵母感受态制备

1.从平板上或保种管中,挑少量酵母,在YPDA平板上划单克隆(10ul+10ul的DDH20),30°

培育3天左右。

2.从平板上别离挑取单克隆(直径2-3mm)到含有3mlYPDA的玻璃试管中(平行做3管)

3.30°

,200rpm,培育8-12h(留宿)

4.取200ul菌液,测OD600

5.选取OD600值最大的一个试管(即活力最高的一个),吸取5ul转移至50m新鲜的YPDA培育基中(培育基装在250ml三角瓶中)?

剩下的离心制作甘油菌

6.30°

,200rpm,培育16-20h,直至OD600=将培育好的菌液转入2个50ml离心管,室温离心3000g,3min,弃上清,用100ml新鲜的YPDA悬起管底的菌体,并倒入干净的三角瓶中。

7.30°

,200rpm培育直到OD600=(3-5小时)

8.将菌液倒入2个50ml离心管,室温离心,3000g,3min,弃上清,每一个离心管用30ml灭菌水重悬。

9.再次离心,3000g,3min,室温弃上清,每管用×

TE/LiAc重悬。

10.将重悬的菌液转移到2个ep管中,12000rpm,15s

11.弃上清,每管用600ul×

TE/LiAc重悬,将两管重悬菌液并入一管,预备进行转化。

◆B:

酵母质粒转化(pGBKT7。

pGBKT7/n端和c端。

小规模转化大规模转化

1.加入质粒DNA(在预冷的EP管中)100-500ng3-5ug

鲑鱼精DNA(变性的,10mg/ml)5ul20ul

加入感受态细胞,轻弹混匀50ul600ul

2.加入PEG/LiAc,轻弹混匀500ul

水浴,每10-15min轻弹混匀30min45min

4.加入DMSO,轻弹混匀20ul160ul

5.42°

水浴,每5-10min轻弹混匀15min20min

6.离心,弃上清最大转速3000g

15s3min

7.用液体YPDA培育基重悬1ml3ml

8.30°

,230rpm,培育90min90min

9.离心,弃上清最大转速3000g

10.用%NaCl重悬1ml15ml

11.涂板在相应的挑选培育基上。

(三)注意事项:

1.转化效率与很多因素有关,酵母活力是一个重要因素,一样制备酵母感受态的细胞必需是没有通过4°

保留的,活化过的,从培育箱中掏出的新鲜酵母。

2.在制备酵母感受态时,不要超过上述的的OD值,要让酵母一直处在生长最旺盛的时期,专门是最后一次培育,OD600的值不要超过

3.酵母转化进程中,没有抗生素,极易染菌,所有实验都在超净台中进行,超净台需提早一天用70%酒精棉擦拭,将第二天用到的物品(如,试剂,试管,架子等)都放入超净台,灭菌留宿,每次进入超净台操作时,需用70%酒精棉擦手消毒。

4.由于酵母生长周期较长,平板一样在培育箱中要放3天左右,因此在倒板时,不可吹得太干,小板晾干10min左右,大板晾干15min左右即可

5.有些挑选培育基需要加入3-AT,必需是在培育基冷却到55°

一下才可加入。

铺板(铺板3个一路做,转化后生长、自我激活、毒性对照)

试剂预备:

预备SD/-Trp板3*3=9个板9*20=180ml~~~200ml

SDselectionmedium()

ForpGBKT7,useSD/-TrpForpGADT7,useSD/-Leu

2.1/10稀释:

100ul目的载体+900ulYPDA板3*3=9个板9*20=180ml~~~200ml

1/100稀释:

10ul目的载体+990ulYPDA

1/5稀释:

10ul目的载体+40ulYPDA

二、Spread100μlof1/10and1/100dilutionontoa100mmplatecontainingtheappropriateSDselectionmedium

三、Incubateplatesupsidedownat30°

Cuntilcoloniesappear(3–5days).

3-5天后,挑取单菌落,5ml的缺点液体培育基中培育12h(留宿),室温离心,3000g,3min。

甘油菌制备取500ul的(YPD+25%甘油)

菌落自我激活和毒性

一、自我激活

1)已预备好的AH109菌株:

pGBKT7-cav3和N端,

2)阳性对照组:

pGBKT7-53(AH109菌株)和pGADT7-T

3)SD/-Trp/X-a-Galplates

在1L中,Coolto55°

C,add2mlofX-a-Gal(20mg/ml).

4)SD/-Ade/-His/-Trp/X-a-Galplates

C,add2mlofX-a-Gal(20mg/ml)

二、实验进程:

100μlofa1/10dilutionanda1/100dilutionofyourtransformationmixtureontoseparate:

SD/-Trp/X-a-Galplates

SD/-Ade/-His/-Trp/X-a-Galplates

二、Expectedresultsafter3–5days:

毒性-中毒

:

AH109competentcells(Section

SD/-Trpagarplates(AppendixD)

SD/-Trpliquidmedium(AppendixD)

二、Transform100ngofthefollowingvectorsusingthesmall-scaletransformationprotocol(Section

pGBKT7(empty)

pGBKT7+clonedbaitgene

3、Spread100μlof1/10and1/100dilutionsofyourtransformationmixturesontoSD/-Trp.

4、Growat30°

Cfor3–5days:

 

酵母双杂交

一、材料预备、

转化后baitstrain在菌株上长3-5天后

1、EP管,灭菌好的2L烧瓶;

2、Y187-library

3、在SD-Trp板上培育的已经转化入AH109的pGBKT7-cav3/pGBKT7-cav3N端和C端

4、-SD/-Trp液体培育基50ml(250ml烧瓶)+5ml

5、SD培育板

-SD/-Trp4中浓度*3=12个板12*20ml=240Ml~~~~250ml

-SD/-Leu培育板4中浓度*2=8个板8*20ml=160Ml~~~~150ml

-SD/-Leu/-Trp培育板4中浓度*2=8个板8*20ml=160Ml~~~~150ml

------SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp/X-a-Gal培育板

32个板*20ml=640ml~~~~~650ml

6、2xYPDAliquidmedium:

45ml(50ug/mlkan)

7、liquidmedium50ml(50ug/mlkan)+10ml=60ml

8、Kanamycinsulfate(50mg/ml)

9、YPD+25%glycerolliquid(freezing)medium

P18

对如实验

三、一、Prepareaconcentratedovernightcultureofthebaitstrain(AH109[pGBKT7+Bait])asfollows:

1)Inoculateonefresh,large(2–3mm)colonyofyourbaitstraininto50mlofSD/-Trpliquidmedium.

2)Incubateshaking(250–270rpm)at30°

CuntiltheOD600reaches(16–20hr).

3)Centrifugetopelletthecells(1,000gfor5min),discardthesupernatant.

4)Resuspendthepellettoacelldensityof>

1x108cellspermlinSD/-Trp(4–5ml).[Thecellscanbecountedusingahemocytometer血细胞计算器.]

二、CombinetheLibraryStrainwiththeBaitStrainasfollows:

1)Thawa1mlaliquotofyourlibrarystraininaroomtemperaturewaterbath.取1ml在室温水浴下解冻。

Remove10μlfortiteringon100mmSD/-Leuagarplates(seeAppendixB,SectionBforlibrarytiteringinstructions).

2)Combinethe1mlofLibraryStrainwiththe5mlBaitStraininasterile2Lflask.

3)Add45mlof2xYPDAliquidmedium(with50μg/mlkanamycin).

4)Rinse冲洗cellsfromthelibraryvial小瓶twicewith1ml2xYPDAandaddtothe2Lflask.

3、Incubateat30°

Cfor20–24hr,slowlyshaking(30–50rpm).

4、After20hr,checkadropofthecultureunderaphasecontrastmicroscope(40X).Ifzygotesarepresent,continuetoStep8,ifnot,allowmatingtocontinue,incubateforanadditional4hr.

Noteote:

Azygotetypicallyhasa3-lobedstructure,thelobesrepresentthetwohaploidparentalcellsandthebuddingdiploidcell.

5.Centrifugetopelletthecells(1,000gfor10min).

6.Meanwhilerinsethe2Lflasktwicewith50ml(with50μg/mlkanamycin),combinetherinsesandusethistoresuspendthepelletedcells.

7.Centrifugetopelletthecells(1,000gfor10min)anddiscardthesupernatant.

8.Resuspendallpelletetedcellsin10mlofKanliquidmedium.Measurethetotalvolumeofcells+medium.

.,10mlmedium+mlcells=ml

10、Fromthematedculturespread100μlof1/10,1/100,1/1,000,1/10,000dilutionsoneachofthefollowing100mmagarplatesandincubateat30°

Cfor3–5days.

SD/-Trp

SD/-Leu

SD/-Leu/-Trp(DDO)

11、Platetheremainderoftheculture,200μlper150mmonSD/-Ade/-His/-Leu/-Trp/X-a-Gal(QDO+X-a-Gal)agarplate(50–55plates).Incubateat30°

Cfor3–8days.或2~4周

Notesotes:

UsingthehigheststringencypossibletodetectactivationofthethreereportersADE2,HIS3andMEL1,resultsinfewerfalsepositives.

Ignoresmallpalecoloniesthatmayappearaftertwodaysbutnevergrowto>

1mmindiameter.TrueAde+,His+coloniesarerobustandcangrowto>

2mm.

12、Calculatethenumberofscreenedclones(diploids)bycountingthecoloniesfromtheSD/-Leu/-Trp(DDO)platesafter3–5days

13、挑取分离良好的菌落划线于QDO/X-Q一GAL平板上,于30℃培育2周,然后仅挑取蓝色菌落再划线于SD/一Trp产Leu(DoubleDropout,DDO)/X一a一GAL平板上,并于30°

C培育1至2周。

从DDO/X-Q-GAL平板挑选蓝色菌落划线于DDO/X-Q-gaL平板上,如此重复3次。

将第三次DDO/X-a-GaL平板分离良好的蓝色菌落划线到QDO/X-a-GaL平板上,并于30℃培育1至2周。

挑取最后一次的QDO/X-a-GaL平板上的蓝色菌落,接种于的SD/-Leu/-Trp培育液,于30℃250Prm摇晃培育2h0。

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