生物选修一52多聚酶链式反应扩增DNA片段学案人教版.docx
《生物选修一52多聚酶链式反应扩增DNA片段学案人教版.docx》由会员分享,可在线阅读,更多相关《生物选修一52多聚酶链式反应扩增DNA片段学案人教版.docx(8页珍藏版)》请在冰豆网上搜索。
生物选修一52多聚酶链式反应扩增DNA片段学案人教版
生物选修一5.2多聚酶链式反应扩增DNA片段学案(人教版)
本资料为woRD文档,请点击下载地址下载全文下载地址www.5y
课题2 多聚酶链式反应扩增DNA片段
问题导学
一、PcR的原理
活动与探究1
.细胞内DNA复制需要的基本条件有哪些?
该条件在DNA复制中起何作用?
2.什么是引物?
它有什么特点?
用于PcR的引物一般长度是多少?
3.讨论:
DNA合成的方向有什么特点?
两条子链的合成起始于DNA的同一端吗?
4.PcR技术中,高温能使DNA双链解旋,但也会导致DNA聚合酶失活,如何解决?
迁移与应用1
PcR过程中起催化作用的酶是( )。
A.解旋酶 B.RNA聚合酶
c.TaqDNA聚合酶
D.DNA连接酶
细胞内DNA复制与PcR技术的比较
细胞内DNA复制
PcR
不
同
点
解旋
解旋酶催化,部分解旋解链
95℃高温解旋解链,双链完全分开
酶
解旋酶、DNA聚合酶、DNA连接酶
TaqDNA聚合酶
能量
ATP
不加
温度
体内温和条件
95℃→55℃→72℃
特点
整个DNA复制,只在分裂间期复制一次
目的基因片段,按需要无限扩增
相同点
①需DNA模板;②需脱氧核苷酸作原料;③子链延伸方向都是从5′端到3′端;④都遵循碱基互补配对原则,半保留复制
注:
解旋酶的作用是使DNA两条链的氢键断开,而DNA聚合酶都是催化形成磷酸二酯键的。
二、PcR的反应过程
活动与探究2
.PcR一般要经历30多次循环,每次循环可以分为哪几步?
2.PcR循环之前,常要进行一次预变性,预变性的目的是什么?
3.PcR循环过程中,变性温度设置94℃,时间设置30s的原因是什么?
4.PcR缓冲液相当于细胞内的什么成分?
5.当PcR反应体系的温度由变性后缓慢冷却到50℃左右时,引物与模板可结合,而解开的两个DNA模板链能够重新结合吗?
为什么?
6.PcR过程中的DNA聚合酶能对最初的DNA模板进行完整的复制吗?
为什么?
7.决定PcR反应特异性的原因有哪些?
迁移与应用2
利用PcR技术扩增某DNA片段得到下图所示产物,则该产物至少经过几次循环才能产生?
( )
A.1次
B.2次
c.3次
D.4次
.PcR反应过程图解
(1)变性:
当温度上升到90℃以上时,双链DNA解旋为单链,如下图:
(2)复性:
系统温度下降至55℃时,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合,如下图:
(3)延伸:
当系统温度上升至72℃左右时,溶液中的四种脱氧核苷酸(A、T、G、c)在DNA聚合酶的作用下,据碱基互补配对原则合成新的DNA链,如下图:
2.PcR过程的温度条件和时间控制
变性
复性
延伸
预变性
94℃,5min
—
—
30次
94℃,30s
55℃,30s
72℃,1min
最后一次
94℃,1min
55℃,30s
72℃,1min
三、PcR实验操作和结果分析评价
活动与探究3
.讨论PcR实验过程中有哪些注意事项。
2.如何判断DNA扩增成功?
迁移与应用3
PcR实验中使用的微量离心管、缓冲液以及蒸馏水使用前必须进行的关键步骤是( )。
A.反复洗涤
B.用酒精擦洗
c.高压灭菌
D.在-20℃下储存
.PcR体外扩增DNA片段的实验流程
准备 按照PcR反应体系的配方将所需试剂摆放于实验桌上
移液 用微量移液器按照配方在微量离心管中依次加入各组分
混合 盖严离心管口的盖子,用手指轻轻弹击管壁
离心 将微量离心管放在离心机上,离心约10s。
目的是使反应液集中在离心管底部
反应 将离心管放入PcR仪中,设置程序进行反应:
变性―→复性―→延伸
2.实验中DNA含量的测定
DNA在260nm的紫外线波段有一强烈的吸收峰,峰值的大小与DNA的含量有关。
可以利用DNA这一特点进行DNA含量的测定,具体方法如下:
(1)稀释:
2μLPcR反应液,加入98μL蒸馏水,即将样品进行50倍稀释
(2)对照调零:
以蒸馏水作为空白对照,在波长260nm处,将紫外分光光度计的读数调节至零
(3)测定:
取DNA稀释液100μL至比色杯中,测定260nm处的光吸收值
(4)计算:
DNA含量(μg/mL)=50×(260nm的读数)×稀释倍数
3.几种PcR方法
有反转录PcR、扩增未知序列的PcR、致突变PcR、定量PcR、免疫PcR等方法,PcR还可与其他方法联合使用,有很多新的联合法。
(1)反转录PcR
反转录PcR就是把RNA提取后反转录成互补DNA,并以此互补DNA链为模板进行的PcR反应。
通常用于检测某种RNA是否被表达,或者比较其相对表达水平。
(2)实时荧光定量PcR
所谓的实时荧光定量PcR就是通过对PcR扩增反应中每一个循环产物的荧光信号的实时检测,从而实现对起始模板定量及定性的分析。
在实时荧光定量PcR反应中,引入了一种荧光化学物质,随着PcR的进行,PcR产物不断累积,荧光信号强度也等比例增加。
每经过一个循环,收集一个荧光强度信号,这样我们就可以通过荧光强度变化监测产物量的变化,从而得到一条荧光扩增曲线。
(3)免疫PcR
免疫PcR是利用抗原抗体反应的特异性和PcR扩增反应的极高灵敏性而建立的一种微量抗原检测技术。
答案:
课前•预习导学
【预习导引】
一、1.体外 DNA DNA拷贝
2.解旋 DNA母链 脱氧核苷酸 DNA聚合
预习交流1:
提示:
DNA聚合酶不能从头合成DNA,只能从3′端延伸DNA链。
因此,DNA复制需要引物,DNA的合成方向总是从子链的5′端向3′端延伸。
3.80~100℃ 双螺旋 双链 变性 降低 双链
4.缓冲 DNA 两条模板链 引物 脱氧核苷酸 TaqDNA聚合 温度
二、1.变性 90℃ 解旋 95
2.复性 50℃ 两种 碱基互补配对 55
3.延伸 72℃ TaqDNA聚合酶
预习交流2:
(1)提示:
DNA分子首先在解旋酶的作用下解旋,然后以解开的每一段母链为模板,在DNA聚合酶等酶的作用下合成与母链碱基互补的一段子链,随着模板链解旋过程的进行,新合成的子链也不断延伸,同时,每条新链与其对应的模板链盘绕成双螺旋结构。
(2)提示:
PcR在高温条件下(90~100℃)解旋,而细胞内的DNA在解旋酶的作用下解旋。
三、1.温度 3 恒温水浴锅
2.塑料管 0.5mL
3.微量移液器
四、1.外源DNA 高压灭菌
2.分装成小份 -20℃
3.枪头 更换
预习交流3:
提示:
是用塑料加工制作的。
课堂•合作探究
【问题导学】
活动与探究1:
.提示:
细胞内DNA复制需要的基本条件和作用分别是:
(1)解旋酶:
打开DNA双链。
(2)DNA母链:
提供DNA复制的模板。
(3)4种脱氧核苷酸:
合成子链的原料。
(4)DNA聚合酶:
催化合成DNA子链。
(5)引物:
使DNA聚合酶能够从引物的3′端开始连接脱氧核苷酸。
2.提示:
引物是一小段DNA或RNA,它能与DNA母链的一段碱基序列互补配对。
用于PcR的引物长度通常为20~30个核苷酸。
3.提示:
(1)DNA的羟基末端称为3′端,磷酸基团的末端称为5′端,且DNA的一条链为3′→5′,另一条互补链为5′→3′,即DNA的两条链是反向的。
(2)DNA合成的方向总是从子链的5′端向3′端延伸(即沿母链的3′→5′),所以两条子链的合成分别起始于DNA的两端。
4.提示:
寻找和使用耐高温的DNA聚合酶。
迁移与应用1:
c 解析:
PcR技术解旋过程是利用了95℃高温使DNA变性解旋;RNA聚合酶是转录过程所需的酶;DNA连接酶是基因工程和DNA体内复制所需的酶;PcR技术延伸中所用的酶是TaqDNA聚合酶。
活动与探究2:
.提示:
每次循环可以分为变性、复性和延伸三步。
2.提示:
预变性的目的是增加大分子模板DNA彻底变性的概率。
3.提示:
变性温度过低,解链不完全导致DNA不能扩增,变性温度过高影响酶的活性;在此温度条件下如果处理时间过长,将会导致酶的钝化。
4.提示:
由于缓冲液为DNA的复制提供场所,相当于细胞内DNA复制的场所,所以缓冲液相当于核基质。
5.提示:
不能。
(1)模板DNA链比引物长得多而且复杂得多,不易重新结合。
(2)引物和模板之间的碰撞机会远远高于两个DNA模板链之间的碰撞机会。
(3)加入的引物的量较大,而模板数量少。
6.提示:
不能。
第一次循环时,只能从引用结合的部位开始。
由引物Ⅰ延伸而成的DNA单链会与引物Ⅱ结合,进行DNA的延伸,由引物Ⅱ延伸而成的DNA单链会与引物Ⅰ结合,进行DNA的延伸之后,DNA聚合酶只能特异地复制处于两个引物之间的DNA序列,使这段固定长度的序列呈指数扩增。
7.提示:
(1)待扩增DNA片段的特异性。
(2)引物与模板特异性地结合。
(3)碱基互补配对原则。
(4)耐高温的TaqDNA聚合酶的催化作用具有专一性。
迁移与应用2:
B 解析:
PcR技术中,第一次循环产生两个DNA分子,每个DNA分子只有一条链具有引物。
第二次循环产生四个DNA分子,其中两个DNA分子只有一条链具有引物,另两个DNA分子两条链都具有引物。
活动与探究3:
.提示:
(1)避免外源DNA污染:
所用仪器、缓冲液、蒸馏水等使用前必须进行高压灭菌。
(2)缓冲液和酶分装成小份,-20℃低温保存。
(3)每添加一种反应成分,更换一个移液器的枪头。
(4)混匀后离心处理,使反应液集中在离心管底部。
2.提示:
(1)教材中的方法,可以通过计算DNA含量来评价扩增的效果。
(2)电泳检测的方法,可以通过在紫外线下直接观察DNA带的分布及粗细程度来评价扩增的效果。
迁移与应用3:
c 解析:
为了避免外源DNA等因素的污染,PcR实验中使用的微量离心管、枪头、缓冲液以及蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌。
PcR所用的缓冲液和酶应分装成小份,并在-20℃下储存。
使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。
当堂检测
.下列有关PcR的描述,不正确的是( )。
A.是一种酶促反应
B.引物决定扩增的特异性
c.扩增的对象是氨基酸序列
D.扩增的对象是DNA序列
答案:
c 解析:
PcR是特异扩增两个引物间的脱氧核苷酸序列,而不是氨基酸序列。
2.引物长度通常为20~30个核苷酸的一段( )。
A.DNA
B.RNA
c.DNA或RNA
D.双链DNA
答案:
c 解析:
DNA复制过程均需要引物的参与,引物是一小段RNA或DNA。
3.PcR利用了DNA的什么原理,来控制DNA的解聚与结合?
( )
A.特异性
B.稳定性
c.热变性
D.多样性
答案:
c 解析:
PcR利用了DNA的热变性原理,通过控制温度来控制双链的解聚与结合。
4.PcR过程中的复性是指( )。
A.在90℃以上时,两条DNA单链通过碱基互补配对形成DNA双螺旋
B.在50℃左右,两条DNA单链通过碱基互补配对形成DNA双螺旋
c.在90℃以上时,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合
D.在50℃左右,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合
答案:
D 解析:
PcR过程中的复性发生在50℃左右的低温条件下,指引物与单链DNA的结合,不是两条单链DNA的结合。
5.标准的PcR过程一般分为变性、复性、延伸三大步,这三大步需要的温度依次是( )。
A.94℃、55℃、72℃
B.72℃、50℃、94℃
c.50℃、94℃、72℃
D.80℃、50℃、72℃
答案:
A 解析:
当温度上升到90℃以上时,作为模板的双链DNA解旋成为单链DNA,称之为变性;当温度下降到50℃左右时,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合,称为复性;当温度回升到72℃左右时(TaqDNA聚合酶的最适反应温度),在单链上4种脱氧核苷酸按照碱基互补配对原则连接在引物之后,使引物链延伸,形成互补的DNA双链,称为延伸。
用流程图表示PcR的操作步骤。
www.5y