生物选修一52多聚酶链式反应扩增DNA片段学案人教版.docx

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生物选修一52多聚酶链式反应扩增DNA片段学案人教版

生物选修一5.2多聚酶链式反应扩增DNA片段学案(人教版)

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  课题2 多聚酶链式反应扩增DNA片段

  问题导学

  一、PcR的原理

  活动与探究1

  .细胞内DNA复制需要的基本条件有哪些?

该条件在DNA复制中起何作用?

  2.什么是引物?

它有什么特点?

用于PcR的引物一般长度是多少?

  3.讨论:

DNA合成的方向有什么特点?

两条子链的合成起始于DNA的同一端吗?

  4.PcR技术中,高温能使DNA双链解旋,但也会导致DNA聚合酶失活,如何解决?

  迁移与应用1

  PcR过程中起催化作用的酶是(  )。

  A.解旋酶   B.RNA聚合酶

  c.TaqDNA聚合酶

  D.DNA连接酶

  细胞内DNA复制与PcR技术的比较

  细胞内DNA复制

  PcR

  不

  同

  点

  解旋

  解旋酶催化,部分解旋解链

  95℃高温解旋解链,双链完全分开

  酶

  解旋酶、DNA聚合酶、DNA连接酶

  TaqDNA聚合酶

  能量

  ATP

  不加

  温度

  体内温和条件

  95℃→55℃→72℃

  特点

  整个DNA复制,只在分裂间期复制一次

  目的基因片段,按需要无限扩增

  相同点

  ①需DNA模板;②需脱氧核苷酸作原料;③子链延伸方向都是从5′端到3′端;④都遵循碱基互补配对原则,半保留复制

  注:

解旋酶的作用是使DNA两条链的氢键断开,而DNA聚合酶都是催化形成磷酸二酯键的。

  二、PcR的反应过程

  活动与探究2

  .PcR一般要经历30多次循环,每次循环可以分为哪几步?

  2.PcR循环之前,常要进行一次预变性,预变性的目的是什么?

  3.PcR循环过程中,变性温度设置94℃,时间设置30s的原因是什么?

  4.PcR缓冲液相当于细胞内的什么成分?

  5.当PcR反应体系的温度由变性后缓慢冷却到50℃左右时,引物与模板可结合,而解开的两个DNA模板链能够重新结合吗?

为什么?

  6.PcR过程中的DNA聚合酶能对最初的DNA模板进行完整的复制吗?

为什么?

  7.决定PcR反应特异性的原因有哪些?

  迁移与应用2

  利用PcR技术扩增某DNA片段得到下图所示产物,则该产物至少经过几次循环才能产生?

(  )

  A.1次

  B.2次

  c.3次

  D.4次

  .PcR反应过程图解

  

(1)变性:

当温度上升到90℃以上时,双链DNA解旋为单链,如下图:

  

(2)复性:

系统温度下降至55℃时,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合,如下图:

  (3)延伸:

当系统温度上升至72℃左右时,溶液中的四种脱氧核苷酸(A、T、G、c)在DNA聚合酶的作用下,据碱基互补配对原则合成新的DNA链,如下图:

  2.PcR过程的温度条件和时间控制

  变性

  复性

  延伸

  预变性

  94℃,5min

  —

  —

  30次

  94℃,30s

  55℃,30s

  72℃,1min

  最后一次

  94℃,1min

  55℃,30s

  72℃,1min

  三、PcR实验操作和结果分析评价

  活动与探究3

  .讨论PcR实验过程中有哪些注意事项。

  2.如何判断DNA扩增成功?

  迁移与应用3

  PcR实验中使用的微量离心管、缓冲液以及蒸馏水使用前必须进行的关键步骤是(  )。

  A.反复洗涤  

  B.用酒精擦洗

  c.高压灭菌

  D.在-20℃下储存

  .PcR体外扩增DNA片段的实验流程

  准备 按照PcR反应体系的配方将所需试剂摆放于实验桌上

  移液 用微量移液器按照配方在微量离心管中依次加入各组分

  混合 盖严离心管口的盖子,用手指轻轻弹击管壁

  离心 将微量离心管放在离心机上,离心约10s。

目的是使反应液集中在离心管底部

  反应 将离心管放入PcR仪中,设置程序进行反应:

变性―→复性―→延伸

  2.实验中DNA含量的测定

  DNA在260nm的紫外线波段有一强烈的吸收峰,峰值的大小与DNA的含量有关。

可以利用DNA这一特点进行DNA含量的测定,具体方法如下:

  

(1)稀释:

2μLPcR反应液,加入98μL蒸馏水,即将样品进行50倍稀释

  

(2)对照调零:

以蒸馏水作为空白对照,在波长260nm处,将紫外分光光度计的读数调节至零

  (3)测定:

取DNA稀释液100μL至比色杯中,测定260nm处的光吸收值

  (4)计算:

DNA含量(μg/mL)=50×(260nm的读数)×稀释倍数

  3.几种PcR方法

  有反转录PcR、扩增未知序列的PcR、致突变PcR、定量PcR、免疫PcR等方法,PcR还可与其他方法联合使用,有很多新的联合法。

  

(1)反转录PcR

  反转录PcR就是把RNA提取后反转录成互补DNA,并以此互补DNA链为模板进行的PcR反应。

通常用于检测某种RNA是否被表达,或者比较其相对表达水平。

  

(2)实时荧光定量PcR

  所谓的实时荧光定量PcR就是通过对PcR扩增反应中每一个循环产物的荧光信号的实时检测,从而实现对起始模板定量及定性的分析。

在实时荧光定量PcR反应中,引入了一种荧光化学物质,随着PcR的进行,PcR产物不断累积,荧光信号强度也等比例增加。

每经过一个循环,收集一个荧光强度信号,这样我们就可以通过荧光强度变化监测产物量的变化,从而得到一条荧光扩增曲线。

  (3)免疫PcR

  免疫PcR是利用抗原抗体反应的特异性和PcR扩增反应的极高灵敏性而建立的一种微量抗原检测技术。

  答案:

  课前•预习导学

  【预习导引】

  一、1.体外 DNA DNA拷贝

  2.解旋 DNA母链 脱氧核苷酸 DNA聚合

  预习交流1:

提示:

DNA聚合酶不能从头合成DNA,只能从3′端延伸DNA链。

因此,DNA复制需要引物,DNA的合成方向总是从子链的5′端向3′端延伸。

  3.80~100℃ 双螺旋 双链 变性 降低 双链

  4.缓冲 DNA 两条模板链 引物 脱氧核苷酸 TaqDNA聚合 温度

  二、1.变性 90℃ 解旋 95

  2.复性 50℃ 两种 碱基互补配对 55

  3.延伸 72℃ TaqDNA聚合酶

  预习交流2:

(1)提示:

DNA分子首先在解旋酶的作用下解旋,然后以解开的每一段母链为模板,在DNA聚合酶等酶的作用下合成与母链碱基互补的一段子链,随着模板链解旋过程的进行,新合成的子链也不断延伸,同时,每条新链与其对应的模板链盘绕成双螺旋结构。

  

(2)提示:

PcR在高温条件下(90~100℃)解旋,而细胞内的DNA在解旋酶的作用下解旋。

  三、1.温度 3 恒温水浴锅

  2.塑料管 0.5mL

  3.微量移液器

  四、1.外源DNA 高压灭菌

  2.分装成小份 -20℃

  3.枪头 更换

  预习交流3:

提示:

是用塑料加工制作的。

  课堂•合作探究

  【问题导学】

  活动与探究1:

  .提示:

细胞内DNA复制需要的基本条件和作用分别是:

(1)解旋酶:

打开DNA双链。

(2)DNA母链:

提供DNA复制的模板。

(3)4种脱氧核苷酸:

合成子链的原料。

(4)DNA聚合酶:

催化合成DNA子链。

(5)引物:

使DNA聚合酶能够从引物的3′端开始连接脱氧核苷酸。

  2.提示:

引物是一小段DNA或RNA,它能与DNA母链的一段碱基序列互补配对。

用于PcR的引物长度通常为20~30个核苷酸。

  3.提示:

(1)DNA的羟基末端称为3′端,磷酸基团的末端称为5′端,且DNA的一条链为3′→5′,另一条互补链为5′→3′,即DNA的两条链是反向的。

(2)DNA合成的方向总是从子链的5′端向3′端延伸(即沿母链的3′→5′),所以两条子链的合成分别起始于DNA的两端。

  4.提示:

寻找和使用耐高温的DNA聚合酶。

  迁移与应用1:

c 解析:

PcR技术解旋过程是利用了95℃高温使DNA变性解旋;RNA聚合酶是转录过程所需的酶;DNA连接酶是基因工程和DNA体内复制所需的酶;PcR技术延伸中所用的酶是TaqDNA聚合酶。

  活动与探究2:

  .提示:

每次循环可以分为变性、复性和延伸三步。

  2.提示:

预变性的目的是增加大分子模板DNA彻底变性的概率。

  3.提示:

变性温度过低,解链不完全导致DNA不能扩增,变性温度过高影响酶的活性;在此温度条件下如果处理时间过长,将会导致酶的钝化。

  4.提示:

由于缓冲液为DNA的复制提供场所,相当于细胞内DNA复制的场所,所以缓冲液相当于核基质。

  5.提示:

不能。

(1)模板DNA链比引物长得多而且复杂得多,不易重新结合。

(2)引物和模板之间的碰撞机会远远高于两个DNA模板链之间的碰撞机会。

(3)加入的引物的量较大,而模板数量少。

  6.提示:

不能。

第一次循环时,只能从引用结合的部位开始。

由引物Ⅰ延伸而成的DNA单链会与引物Ⅱ结合,进行DNA的延伸,由引物Ⅱ延伸而成的DNA单链会与引物Ⅰ结合,进行DNA的延伸之后,DNA聚合酶只能特异地复制处于两个引物之间的DNA序列,使这段固定长度的序列呈指数扩增。

  7.提示:

(1)待扩增DNA片段的特异性。

(2)引物与模板特异性地结合。

(3)碱基互补配对原则。

(4)耐高温的TaqDNA聚合酶的催化作用具有专一性。

  迁移与应用2:

B 解析:

PcR技术中,第一次循环产生两个DNA分子,每个DNA分子只有一条链具有引物。

第二次循环产生四个DNA分子,其中两个DNA分子只有一条链具有引物,另两个DNA分子两条链都具有引物。

  活动与探究3:

  .提示:

(1)避免外源DNA污染:

所用仪器、缓冲液、蒸馏水等使用前必须进行高压灭菌。

  

(2)缓冲液和酶分装成小份,-20℃低温保存。

  (3)每添加一种反应成分,更换一个移液器的枪头。

  (4)混匀后离心处理,使反应液集中在离心管底部。

  2.提示:

(1)教材中的方法,可以通过计算DNA含量来评价扩增的效果。

  

(2)电泳检测的方法,可以通过在紫外线下直接观察DNA带的分布及粗细程度来评价扩增的效果。

  迁移与应用3:

c 解析:

为了避免外源DNA等因素的污染,PcR实验中使用的微量离心管、枪头、缓冲液以及蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌。

PcR所用的缓冲液和酶应分装成小份,并在-20℃下储存。

使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。

  当堂检测

  .下列有关PcR的描述,不正确的是(  )。

  A.是一种酶促反应

  B.引物决定扩增的特异性

  c.扩增的对象是氨基酸序列

  D.扩增的对象是DNA序列

  答案:

c 解析:

PcR是特异扩增两个引物间的脱氧核苷酸序列,而不是氨基酸序列。

  2.引物长度通常为20~30个核苷酸的一段(  )。

  A.DNA

  B.RNA

  c.DNA或RNA

  D.双链DNA

  答案:

c 解析:

DNA复制过程均需要引物的参与,引物是一小段RNA或DNA。

  3.PcR利用了DNA的什么原理,来控制DNA的解聚与结合?

(  )

  A.特异性

  B.稳定性

  c.热变性

  D.多样性

  答案:

c 解析:

PcR利用了DNA的热变性原理,通过控制温度来控制双链的解聚与结合。

  4.PcR过程中的复性是指(  )。

  A.在90℃以上时,两条DNA单链通过碱基互补配对形成DNA双螺旋

  B.在50℃左右,两条DNA单链通过碱基互补配对形成DNA双螺旋

  c.在90℃以上时,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合

  D.在50℃左右,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合

  答案:

D 解析:

PcR过程中的复性发生在50℃左右的低温条件下,指引物与单链DNA的结合,不是两条单链DNA的结合。

  5.标准的PcR过程一般分为变性、复性、延伸三大步,这三大步需要的温度依次是(  )。

  A.94℃、55℃、72℃

  B.72℃、50℃、94℃

  c.50℃、94℃、72℃

  D.80℃、50℃、72℃

  答案:

A 解析:

当温度上升到90℃以上时,作为模板的双链DNA解旋成为单链DNA,称之为变性;当温度下降到50℃左右时,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合,称为复性;当温度回升到72℃左右时(TaqDNA聚合酶的最适反应温度),在单链上4种脱氧核苷酸按照碱基互补配对原则连接在引物之后,使引物链延伸,形成互补的DNA双链,称为延伸。

  用流程图表示PcR的操作步骤。

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