化工原理实验教学大纲文档格式.docx
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实验成绩评分办法:
实验技能占40%,实验态度占20%,实验报告占20%,实验室常识占20%。
四、实验项目一览表
生物化学与分子生物学综合实验项目一览表
序号
实验项目名称
实验类型
实验要求
适用专业
学时
1
2
3
4
5
6
7
蛋白质含量测定(考马斯亮蓝G-250法)
蛋白质含量测定(双缩脲法)
蛋白质含量测定(Folin酚试剂法)
蛋白质含量测定(紫外吸收法)
淀粉酶活力测定
质粒DNA的提取
质粒DNA的琼脂糖凝胶电泳分析
聚合酶链式反应(PCR)技术及电泳检测
SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定蛋白质分子量
设计性
设计性
综合性
必做
农科类、植保、工程类
五、实验项目的具体容
实验一蛋白质含量测定(考马斯亮蓝G-250法)
1、本次实验的目的和要求
学习和掌握考马斯亮蓝G-250法测定蛋白质含量的原理和方法。
比较不同方法测定蛋白质含量的异同。
2、实验容或原理
考马斯亮蓝G-250在游离状态下呈棕褐色,当它与(浓度0~100μg/ml)蛋白质结合呈蓝色,颜色随蛋白质浓度的增加而加深,在595nm波长下光吸收和蛋白质浓度成正比。
3、需用的仪器和试剂
试管、离心管、研钵、移液管、离心机、分光光度计、牛血清白蛋白、考马斯亮蓝G-250
4、实验步骤
标准曲线的配制、样品中蛋白质的提取、结果与计算
5、教学方式
学生为主,教师辅助,充分预习,独立完成。
6、考核要求
以出勤、随堂提问、实验报告和预习报告为主要考核容。
7、实验报告要求
实验报告应包括下列各项:
(1)报告的题目(要简明确切);
(2)写报告人及共同测定人员的;
(3)实验目的;
(4)实验原理;
(5)实验仪器和试剂(包括主要仪器的规格、主要试剂的名称);
(6)实验数据记录(包括原始数据记录表格和整理后的数据记录表格);
(7)实验结果。
明确提出本次实验的结论,用公式计算。
(8)分析与讨论,要对实验结果做出估计,分析误差大小及原因,对实验中发现的问题应进行讨论,对实验方法、实验设备有何改进建议也可写入此栏;
(9)回答思考题。
实验二蛋白质含量测定(双缩脲法)
学习和掌握双缩脲法测定蛋白质含量的原理和方法。
碱性溶液中双缩脲(NH2-CO-NH-CO-NH2)能与Cu2+产生紫红色的络合物,这一反应称为“双缩脲反应”。
蛋白质分子中的肽键也能与铜离子发生双缩脲反应,溶液紫红色的深浅与蛋白质含量在一定围符合朗伯-比尔定律,而与蛋白质的氨基酸组成及分子质量无关。
其可测定围为1~10mg蛋白质,适用于精度要求不高的蛋白质含量测定。
Tris,一些氨基酸,EDTA等会干扰该测定。
试管、离心管、研钵、移液管、离心机、分光光度计、牛血清白蛋白、双缩脲试剂、NaOH
实验三蛋白质含量测定(Folin酚试剂法)
掌握Folin-酚法测定蛋白质含量的原理方法,熟悉分光光度计的操作。
Folin-酚法测定蛋白质含量的过程包括两步反应:
第一步是在碱性条件下蛋白质与CuSO4作用生成络合物,第二步是此络合物还原Folin试剂(磷钼酸和磷钨酸试剂),生成深蓝色的化合物,且颜色深浅与蛋白质的含量成正比关系。
该方法灵敏度高于双缩脲法100倍。
分光光度计、水浴锅、试管、具塞试管、小烧杯、漏斗及架、电子天平、吸管、容量瓶、
滤纸、玻棒、研钵、离心机、离心管、Folin-酚试剂
实验四蛋白质含量测定(紫外吸收法)
学习用紫外吸收法测定蛋白质含量。
熟悉分光光度计的操作。
蛋白质分子中的酪氨酸、色氨酸和苯丙氨酸等残基在280nm波长下具有最大的吸收。
由于各种蛋白质中都含有酪氨酸,因此280nm的吸光度是蛋白质的一种普遍性质。
在一定程度上,蛋白质溶液在280nm吸光度与其浓度成正比,故可用作蛋白质定量测定。
紫外分光光度计,离心机,电子天平,研钵,容量瓶,刻度吸管
(1)取4ml的豆菜提取液,在紫外分光光度计上,于280nm和260nm波长下分别测其吸光度。
(2)根据公式计算出蛋白质含量:
蛋白质(μg/ml)=(1.45A280-0.74A260)×
稀释倍数
实验五淀粉酶活力测定
学习酶活力测定的一般方法,巩固并熟练分光光度计的使用。
淀粉酶主要包括α-淀粉酶、β-淀粉酶、葡萄糖淀粉酶和R-酶。
α-淀粉酶随机作用于直链淀粉和支链淀粉的直链部分α-1,4糖苷键,单独使用时最终生成寡聚葡萄糖、α-极限糊精和少量葡萄糖。
它比较耐热但不耐酸,pH3·
6以下可使其钝化。
β-淀粉酶从非还原端作用于α-1,4糖苷键,遇到支链淀粉的α-1,6键时停止。
单独作用时产物为麦芽糖和β-极限糊精,70℃保温15min可使其钝化。
通常提取液中α-淀粉酶和β-淀粉酶同时存在。
可以先测定(α+β)淀粉酶总活力,然后在70℃加热15min钝化β-淀粉酶,测出α-淀粉酶活力,用总活力减去α-淀粉酶活力,就可求出β-淀粉酶活力。
淀粉酶活力大小可用其作用于淀粉生成的还原糖与3,5-二硝基水酸的显色反应来测定。
还原糖作用于黄色的3,5-二硝基水酸生成棕红色的3-氨基-5-硝基水酸,生成物颜色的深浅与还原糖的量成正比。
以每克样品在一定时间生成的还原糖(麦芽糖)量表示酶活力大小。
电子天平、研钵、容量瓶、具塞刻度试管、吸管、离心机、恒温水浴、分光光度计
1%淀粉溶液、柠檬酸缓冲液、NaOH、3,5-二硝基水酸、麦芽糖标准液(1mg/ml)
(1)酶液提取
称取2g萌发3天的小麦种子(芽长1cm左右),置研钵中加少量石英砂和2ml左右蒸馏水,研成匀浆,无损地转入100ml容量瓶中,用蒸馏水定容至100ml。
每隔数分钟振荡1次,提取20min。
3000r/min离心10min,转入上清液备用。
(2)标准曲线的制作
取25ml刻度试管7支,编号。
分别加入麦芽糖标准液(1mg/ml)0、0.1、0.3、0.5、
0.7、0.9、1.0ml,然后用吸管向各管加蒸馏水使溶液达1.0ml,再各加3,5-二硝基水酸试剂1.0ml,置沸水煮沸5min。
取出冷却,用蒸馏水稀释至12.5ml。
混匀后用分光光度计再520nm波长下进行比色,记录吸光度。
以吸光度为纵坐标,以麦芽糖含量(mg)为横坐标,绘制标准曲线。
(3)α-淀粉酶活力测定
① 取试管4支,标明2支为对照管,2支为测定管。
② 于每管中各加酶液1ml,在70℃恒温水浴中准确加热15min,钝化β-淀粉酶。
取出后迅速用流水冷却。
③ 在对照管中加入4ml0.4mol/L氢氧化钠。
④ 在4支试管中各加入1mlpH5.6的柠檬酸缓冲液。
⑤ 将4支试管置另一个40℃0.5℃恒温水浴中保温15min,再向各管分别加入40℃下预热的1%淀粉溶液2ml,摇匀,立即放入40℃恒温水浴准确记时保温5min。
取出后向测定管迅速加入4ml0.4mol/L氢氧化钠,终止酶活动,准备测糖。
(4)淀粉酶总活力测定
取4支试管编号,2支为对照,2支为测定管。
然后加入提取的酶液1ml。
在对照管
加入4ml0.4mol/L氢氧化钠。
4支试管中各加1mlpH5.6的柠檬酸缓冲液。
以下步骤重复α-淀粉酶测定第⑸步的操作,同样准备测糖。
(5)样品的测定:
取步骤2,3中酶作用后的各管溶液1ml,分别放入相应的4支25ml具塞刻度试管中,各加入1ml3,5—二硝基水酸试剂。
以下操作同标准曲线制作。
根据样品比色吸光度,从标准曲线查出麦芽糖含量,最后进行结果计算。
实验六质粒DNA的提取
通过该实验使学生掌握质粒培养的方法,条件(包括培养基的配制、灭菌、接种、培养)、以及提取质粒的方法。
从大肠杆菌中提取质粒DNA的方法很多,其中的碱性SDS法提取质粒是基于染色体DNA与质粒DNA的变性与复性存在差异而予以分离的。
在强碱性条件下,染色体DNA和质粒DNA均变性(双链解开)。
由于质粒DNA是共价闭合环状超螺旋结构,变性后两条互补链不会完全分开。
当溶液pH调节到中性时,质粒DNA容易复性并溶解在溶液中,而染色体DNA不容易复性,互相缠绕,在离心时极易和蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来。
转移出上清液,再用乙醇沉淀出其中的质粒DNA。
以具有质粒pETblue-2的大肠杆菌实验材料,用碱性SDS法可从该菌体中提取到质粒DNA,经琼脂糖凝胶电泳可以检测出。
高压蒸汽灭菌锅、超净工作台、恒温振荡摇床、台式高速离心机、真空干燥器、低温冰箱、恒温水浴、移液器、LB培养基、羧苄青霉素(Carb)、四环素(tet)、TE、溶液Ⅰ、溶液Ⅱ、溶液Ⅲ、无水乙醇、70%乙醇
(1)先在3mLLB液体培养基中加入3uL羧苄青霉素(Carb,终浓度50ug/mL)和7.5uL
四环素(Tet,终浓度12.5ug/mL),然后接入一个含pETBlue-2质粒的大肠杆菌单菌落,37℃190r/min振荡培养过夜。
(2)将过夜培养的菌液加入1.5mL小指管管中,4000r/min离心1分钟,吸去培养液将所有菌体细胞收集在一个小指管中。
(3)加入100μL溶液I于含菌体细胞的小指管中,旋涡振荡将细菌沉淀悬浮,室温放置10分钟。
(4)加入200μL溶液II(新鲜配制),轻轻混匀容物,将小指管置于冰上使菌液裂解变清(不可用旋涡震荡器)。
(5)加入150μL溶液III(冰上预冷),盖紧管口,轻轻混匀数次。
冰上放置15分钟让质粒DNA复性(不可用旋涡震荡器)。
(6)12000r/min离心10分钟,将上清转至另一1.5mL小指管中。
(7)向上清中加入等体积酚:
氯仿:
异戊醇(去蛋白和脂类),旋涡混匀,12000r/min离心5分钟,将上清转移到另一1.5mL小指管中。
(8)向上清中加入等体积氯仿:
异戊醇(去微量酚和脂类),旋涡混匀,12000r/min离心5分钟,将上清转移到另一1.5mL小指管中。
(9)向上清中加入2倍体积无水乙醇,旋涡混匀后,室温放置30分钟。
12000r/min离心10分钟,吸去上清液。
(10)用1mL75%乙醇洗涤质粒DNA沉淀两次(每次12000r/min离心5分钟),吸去上清液,真空抽干或空气中干燥。
(11)加20μLTE,使质粒DNA完全溶解,-20℃保存。
明确提出本次实验的结论
(8)回答思考题。
实验七质粒DNA的琼脂糖凝胶电泳分析
掌握电泳鉴定的基本操作技术,为从事基因工程和分子生物学研究奠定初步基础。
琼脂糖凝胶电泳适于分离鉴定200~20000bp的核酸片段。
在中性pH条件下,核酸带负电荷,在电场中向正极移动,电泳后,核酸在凝胶中的位置通过“染色”来显现。
GoldView是一种可代替溴化乙锭的新型核酸染料,其灵敏度与EB相当,使用方法与之完全相同,当与DNA结合后,在紫外透射光下双链DNA呈现黄色荧光,由于未发现GoldView有致癌作用,且灵敏度与EB相当,将有可能逐渐取代EB而得以广泛应用。
琼脂糖、标准分子质量DNA、上样缓冲液(6×
loadingbuffer)、TAE、GoldView
电泳仪、水平电泳槽、移液器
(1)将有机玻璃槽,洗净,晾干,用橡皮膏将有机玻璃槽的两端边缘封好(一定封严,不能留缝隙)。
(2)将有机玻璃槽放置于水平位置,并放好样品梳子。
(3)将称取0.25g琼脂糖放入三角瓶中,加入25mL1×
TAE,用封瓶膜封住三角瓶的上口,在微波炉中将琼脂糖溶化。
(4)待冷到60℃左右的琼脂糖凝胶液时,加入2μLGoldView核酸染料,轻轻混匀,将混匀的胶液缓缓倒入有机玻璃槽,直至有机玻璃板上形成一层均匀的胶面(注意不要形成气泡)
(5)待胶液凝固后,取下橡皮膏,将机玻璃槽放入电泳槽。
(6)加入电泳缓冲液(1×
TAE)至电泳槽中使缓冲液刚好没过胶平面,轻轻取出梳子。
(7)加样:
DNA样品中按照5:
1的比例添加6×
凝胶加样缓冲液(loading-buffer),混合均匀,用移液枪将DNA样品加入样品孔中。
(记录点样顺序及点样量)。
(8)电泳:
接通电泳槽与电泳仪的电源,恒压80V(注意正负极,DNA片段从负极向正极移动)。
DNA的迁移速度与电压成正比,最高电压不超过5V/cm。
当溴酚蓝指示剂移动到距凝胶前沿1~2cm处,停止电泳。
(9)254nm紫外灯下观察DNA条带的完整性及亮度。
明确提出本次实验的结论;
实验八聚合酶链式反应(PCR)技术及电泳检测
了解PCR实验原理及操作技术,讲授引物设计的原则,观看PCR课件
PCR是一种在体外扩增的DNA的技术,其基本原理是通过高温使双链DNA解旋成单链,然后退火,使特征引物与互补序列配对,最后在TaqDNA聚合酶的作用下合成DNA片段,经多次循环,直至产生足够的DNA片段。
Khorana等早在1971年就提出PCR概念,但直到1988年Saiki等从真细菌ThurmasaquticusrT1中开发出热稳定的TaqDNA聚合酶并实现PCR技术的完全自动化后,PCR才在生命科学研究领域被广泛用来扩增DNA片段。
PCR技术可在一个酶促反应中产生大量已知序列的DNA片段,简化了克隆、鉴定、修饰核酸等程序。
正是因为具有如此快速、简便、经济、高效的特点,使得PCR技术成为分子生物学研究强有力的技术工具。
酶:
来源TaqDNA聚合酶最适温度90多度,但那时其半衰期短不足以支持30个循环。
所以选择72℃作为延伸温度足以支持30个循环。
DNA片段快速扩增的方法:
即通过引物在DNA聚合酶的作用下,延伸核酸某个区域而引起的双向DNA合成。
反应物含有:
(1)模板:
阳性对照
(2)Taq酶:
(3)引物1
(4)引物2
(5)dNTPs(dATP、dCTP、dGTP、dTTP)
(6)电极缓冲液TAE:
Tris-乙酸
(7)buffer缓冲液含有:
20-24个核苷酸,40%-50%的鸟苷酸、胞苷酸,以及反应所需的MgCl2。
反应的过程:
变性、扩增、复性、延伸
PCR仪、水平电泳槽、恒压电泳仪、加样器、封口膜、PCR管、台式高速离心机、紫外检测仪、10×
PCR反应液、、中性dNTP、引物1、引物2、DNA模板、Taq酶(2.5U/μl)、电泳缓冲液(1×
TAE)、琼脂糖、Goldview、DNAMarkers(标准DNA)
PCR扩增目的基因(碱性磷酸酶AKP)
(1)在0.2mLPCR管配制50μL反应体系
2.5mmol/LdNTPMixture4uL
10xPCRbuffer5uL
10umol/mLsense2uL
10umol/mLanti-sense2uL
模板DNA1uL
Ex-Taq1uL(1U)
ddH2O35uL
(2)按下述程序进行扩增
1)94℃预变性5分钟
2)94℃变性1分钟
3)55℃退火1分钟
4)72℃延伸2分钟
5)重复步骤2)一4)30次
6)72℃延伸10分钟。
(3)琼脂糖凝胶电泳分析PCR结果。
配制0.8%琼脂糖凝胶30mL(1×
TAE),加1.5ulGoldView。
50μLPCR扩增产物+6uL10×
loading-buffer+6uLSYBR核酸染料,混匀,全部上样电泳,恒压80V。
明确提出本次实验的结论。
实验九SDS--聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定蛋白质分子量
学习和掌握SDS—聚丙烯酰胺凝胶电泳的原理、方法、并应用该方法测定蛋白质分子量。
如果在聚丙烯酰胺凝胶中加入一定浓度的十二烷基硫酸钠(SDS),由于SDS带有大量的负电荷,且这种阴离子表面活性剂能使蛋白质变性,特别是强还原剂如巯基乙醇存在下,蛋白质分子的二硫键被还原,肽键完全伸展,使蛋白质分子与SDS充分结合,形成带负电性的蛋白质-SDS复合物;
此时蛋白质分子上所带的负电荷量远远超过蛋白质分子原有的电荷量,掩盖了不同蛋白质间所带电荷的差异。
蛋白质分子量愈大,所带的负电荷愈多,在电场中移动得越快;
反之越慢。
在聚丙烯酰胺凝胶电泳中,蛋白质的迁移速率取决于它所带的电荷的多少、分子的大小和形状。
如果用还原剂(如巯基乙醇或二硫糖醇等)和十二烷基硫酸钠(SDS)加热处理蛋白质样品,蛋白质分子中的二硫键将被还原,并且1g蛋白质可定量结合1.4gSDS,亚基的结构呈长椭圆棒状。
由于与蛋白质结合的SDS呈解离状态