SDSPAGE电泳测定蛋白质相对分子质量Word文档格式.docx
《SDSPAGE电泳测定蛋白质相对分子质量Word文档格式.docx》由会员分享,可在线阅读,更多相关《SDSPAGE电泳测定蛋白质相对分子质量Word文档格式.docx(5页珍藏版)》请在冰豆网上搜索。
式中:
Mr为蛋白质的分子量;
K为常数;
b为斜率;
mR为相对迁移率。
在条件一定时,b和K均为常数。
若将已知分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量的对数作图,可获得一条标准曲线。
未知蛋白质在相同条件下进行电泳,根据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求得分子量。
仪器、原料和试剂
仪器:
垂直板型电泳槽;
直流稳压电源;
50或100μl微量注射器、玻璃板、水浴锅,染色槽;
烧杯;
吸量管;
常头滴管等。
原料:
低分子量标准蛋白质按照每种蛋白0.5~1mg·
ml-1样品溶解液配制。
可配制成单一蛋白质标准液,也可配成混合蛋白质标准液。
试剂:
(1)分离胶缓冲液(Tris-HCl缓冲液PH8.9):
取1mol/L盐酸48mL,Tris36.3g,用无离子水溶解后定容至100mL。
(2)浓缩胶缓冲液(Tris-HCl缓冲液PH6.7):
取1mol/L盐酸48mL,Tris5.98g,用无离子水溶解后定容至100mL。
(3)30%分离胶贮液:
配制方法与连续体系相同,称丙烯酰胺(Acr)30g及N,N’-甲叉双丙烯酰胺(Bis)0.8g,溶于重蒸水中,最后定容至100ml,过滤后置棕色试剂瓶中,4℃保存。
(4)10%浓缩胶贮液:
称Acr10g及Bis0.5g,溶于重蒸水中,最后定容至100mL,过滤后置棕色试剂瓶中,4℃贮存。
(5)10%SDS溶液:
SDS在低温易析出结晶,用前微热,使其完全溶解。
(6)1%TEMED;
(7)10%过硫酸铵(AP):
现用现配。
(8)电泳缓冲液(Tris-甘氨酸缓冲液PH8.3):
称取Tris6.0g,甘氨酸28.8g,SDS1.0g,用无离子水溶解后定容至1L。
(9)样品溶解液:
取SDS100mg,巯基乙醇0.1mL,甘油1mL,溴酚蓝2mg,0.2mol/L,pH7.2磷酸缓冲液0.5mL,加重蒸水至10mL(遇液体样品浓度增加一倍配制)。
用来溶解标准蛋白质及待测固体。
(10)染色液:
0.25g考马斯亮蓝G-250,加入454mL50%甲醇溶液和46mL冰乙酸即可。
(11)脱色液:
75mL冰乙酸,875mL重蒸水与50mL甲醇混匀。
实验步骤
1.安装夹心式垂直板电泳槽:
目前,夹心式垂直板电泳槽有很多型号,虽然设置略有不同,但主要结构相同,且操作简单,不易泄漏。
同学们可根据具体不同型号要求进行操作。
主要注意:
安装前,胶条、玻板、槽子都要洁净干燥;
勿用手接触灌胶面的玻璃。
2.配胶:
根据所测蛋白质分子量范围,选择适宜的分离胶浓度。
本实验采用SDS-PAGE不连续系统,按下表的配制分离胶和浓缩胶。
试剂名称
配制20ml不同浓度分离胶所需各种试剂用量/ml
配制10ml浓缩胶所需试剂用量
5%
7.5%
10%
15%
3%
分离胶贮液
(30%Acr-0.8%Bis)
3.33
5.00
6.66
10.00
-
分离胶缓冲液
(pH8.9Tris-HCl)
2.50
浓缩胶贮液
(10%Acr-0.5%Bis)
3.0
浓缩胶缓冲液
(pH6.7Tris-HCl)
1.25
10%SDS
0.20
0.20
0.10
1%TEMED
2.00
重蒸馏水
11.87
10.20
8.54
5.20
4.60
混匀后,置真空干燥器中,抽气10min
10%AP
0.10
0.05
3.制备凝胶板:
(1)分离胶制备:
按表配制20ml10%分离胶,混匀后用细长头滴管将凝胶液加至长、短玻璃板间的缝隙内,约8cm高,用1ml注射器取少许蒸馏水,沿长玻璃板板壁缓慢注入,约3—4mm高,以进行水封。
约30min后,凝胶与水封层间出现折射率不同的界线,则表示凝胶完全聚合。
倾去水封层的蒸馏水,再用滤纸条吸去多余水分。
(2)浓缩胶的制备:
按表配制10ml3%浓缩胶,混匀后用细长头滴管将浓缩胶加到已聚合的分离胶上方,直至距离短玻璃板上缘约0.5cm处,轻轻将样品槽模板插入浓缩胶内,避免带入气泡。
约30min后凝胶聚合,再放置20—30min。
待凝胶凝固,小心拔去样品槽模板,用窄条滤纸吸去样品凹槽中多余的水分,将pH8.3Tris-甘氨酸缓冲液倒入上、下贮槽中,应没过短板约0.5cm以上,即可准备加样。
4.样品处理及加样
各标准蛋白及待测蛋白都用样品溶解液溶解,使浓度为0.5~1mg/mL,沸水浴加热3分钟,冷却至室温备用。
处理好的样品液如经长期存放,使用前应在沸水浴中加热1分钟,以消除亚稳态聚合。
一般加样体积为10-15μL(即2-10μg蛋白质)。
如样品较稀,可增加加样体积。
用微量注射器小心将样品通过缓冲液加到凝胶凹形样品槽底部,待所有凹形样品槽内都加了样品,即可开始电泳。
5.电泳
将直流稳压电泳仪开关打开,开始时将电流调至10mA。
待样品进入分离较时,将电流调至20-30mA。
当蓝色染料迁移至底部时,将电流调回到零,关闭电源。
拔掉固定板,取出玻璃板,用刀片轻轻将一块玻璃撬开移去,在胶板一端切除一角作为标记,将胶板移至大培养皿中染色。
6.染色及脱色
将染色液倒入培养皿中,染色1h左右,用蒸馏水漂洗数次,再用脱色液脱色,直到蛋白区带清晰,即用直尺分别量取各条带与凝胶顶端的距离。
计算
1.相对迁移率mR=样品迁移距离(cm)/染料迁移距离(cm)
2.以标准蛋白质分子量的对数对相对迁移率作图,得到标准曲线,根据待测样品相对迁移率,从标准曲线上查出其分子量。
注意事项
1.
不是所有的蛋白质都能用SDS-凝胶电泳法测定其分子量,已发现有些蛋白质用这种方法测出的分子量是不可靠的。
包括:
电荷异常或构象异常的蛋白质,带有较大辅基的蛋白质(如某些糖蛋白)以及一些结构蛋白如胶原蛋白等。
例如组蛋白F1,它本身带有大量正电荷,因此,尽管结合了正常比例的SDS,仍不能完全掩盖其原有正电荷的影响,它的分子量是21,000,但SDS-凝胶电泳测定的结果却是35,000。
因此,最好至少用两种方法来测定未知样品的分子量,互相验证。
2.有许多蛋白质,是由亚基(如血红蛋白)或两条以上肽链(如α-胰凝乳蛋白酶)组成的,它们在SDS和巯基乙醇的作用下,解离成亚基或单条肽链。
因此,对于这一类蛋白质,SDS-凝胶电泳测定的只是它们的亚基或单条肽链的分子量,而不是完整分子的分子量。
为了得到更全面的资料,还必须用其它方法测定其分子量及分子中肽链的数目等,与SDS-凝胶电泳的结果互相参照。
思考题
1.SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳与聚丙烯酰胺凝胶电泳原理上有何不同?
2.
用SDS-凝胶电泳法测定蛋白质分子量时为什么要用巯基乙醇?
3.用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳测定蛋白质的分子量,为什么有时和凝胶层析法所得结果有所不同?
是否所有的蛋白质都能用SDS-凝胶电泳法测定其分子量?
为什么?