生化第三版课后习题答案3至13章Word下载.docx
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胱氨酸中的二硫键可用氧化剂或还原剂断裂。
半胱氨酸的SH基在空气中氧化则成二硫键。
这几个反应在氨基酸荷蛋白质化学中占有重要地位。
除甘氨酸外α-氨基酸的α-碳是一个手性碳原子,因此α-氨基酸具有光学活性。
比旋是α-氨基酸的物理常数之一,它是鉴别各种氨基酸的一种根据。
参与蛋白质组成的氨基酸中色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸在紫外区有光吸收,这是紫外吸收法定量蛋白质的依据。
核磁共振波谱技术在氨基酸和蛋白质的化学表征方面起重要作用。
氨基酸分析分离方法主要是基于氨基酸的酸碱性质和极性大小。
常用方法有离子交换柱层析、高效液相层析等。
习题 1.写出下列氨基酸的单字母和三字母的缩写符号:
精氨酸、天冬氨酸、谷氨酰氨、谷氨酸、苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸。
[见表3-1] 表3-1氨基酸的简写符号 名称丙氨酸(alanine)精氨酸(arginine)天冬酰氨(asparagines)天冬氨酸(asparticacid)Asn和/或Asp半胱氨酸(cysteine)谷氨酰氨(glutamine)谷氨酸(glutamicacid)Gln和/或Glu甘氨酸(glycine)组氨酸(histidine)异亮氨酸(isoleucine)++ - 三字母符号AlaArgAsnAspAsxCysGlnGluGlsGlyHisIle单字母符号ARNDBCQEZGHI名称亮氨酸(leucine)赖氨酸(lysine)甲硫氨酸(蛋氨酸)(methionine)苯丙氨酸(phenylalanine)脯氨酸(praline)丝氨酸(serine)苏氨酸(threonine)色氨酸(tryptophan)酪氨酸(tyrosine)缬氨酸(valine)三字母符号LeuLysMetPheProSerThrTrpTyrVal单字母符号LKMFPSTWYV2、计算赖氨酸的εα-NH320%被解离时的溶液PH。
解:
pH=pKa+lg20% pKa=(见表3-3,P133) pH=+lg20%= 3、计算谷氨酸的γ-COOH三分之二被解离时的溶液pH。
pH=pKa+lg2/3% pKa= 1 pH=+= 4、计算下列物质/L溶液的pH:
(a)亮氨酸盐酸盐;
(b)亮氨酸钠盐;
(c)等电亮氨酸。
[(a)约,(b)约,(c)约] 5、根据表3-3中氨基酸的pKa值,计算下列氨基酸的pI值:
丙氨酸、半胱氨酸、谷氨酸和精氨酸。
[pI:
;
] 解:
pI=1/2 pI(Ala)=1/2= pI(Cys)=1/2= pI(Glu)=1/2= pI(Ala)=1/2= 6、向1L1mol/L的处于等电点的甘氨酸溶液加入,问所得溶液的pH是多少?
如果加入NaOH以代替HCl时,pH将是多少?
[pH:
;
] 7、将丙氨酸溶液调节到,然后向该溶液中加入过量的甲醛,当所得溶液用碱反滴定至时,消耗/LNaOH溶液250ml。
问起始溶液中丙氨酸的含量为多少克?
8、计算/L的组氨酸溶液在时各种离子形式的浓度。
[His2+为×
10-4,His+为,His为×
10] 9、说明用含一个结晶水的固体组氨酸盐酸盐和1mol/LKOH配制的/L组氨酸盐缓冲液的方法[取组氨酸盐酸盐(),加入352ml1mol/LKOH,用水稀释至1L] 10、为什么氨基酸的茚三酮反映液能用测压法定量氨基酸?
解:
茚三酮在弱酸性溶液中与α-氨基酸共热,引起氨基酸氧化脱氨脱羧反映,,其中,定量释放的CO2可用测压法测量,从而计算出参加反应的氨基酸量。
11、L-亮氨酸溶液在20cm旋光管中测得的旋光度为+。
计算L-亮氨酸在6mol/LHCl中的比旋。
[[a]=+] 12、标出异亮氨酸的4个光学异构体的构型名称。
[参考图3-15] 13、甘氨酸在溶剂A中的溶解度为在溶剂B中的4倍,苯丙氨酸在溶剂A中的溶解度为溶剂B中的两倍。
利用在溶剂A和B之间的逆流分溶方法将甘氨酸和苯丙氨酸分开。
在起始溶液中甘氨酸含量为100mg,苯丙氨酸为81mg,试回答下列问题:
(1)利用4个分溶管组成的逆流分溶系统时,甘氨酸和苯丙氨酸各在哪一号分溶管中含量最高?
在这样的管中每种氨基酸各为多少毫克?
[第4管和第3管;
Gly+24mgPhe和+36mgPhe] 解:
根据逆流分溶原理,可得:
对于Gly:
Kd=CA/CB=4=q(动相)/pp+q=1=(1/5+4/5) 4个分溶管分溶3次:
=1/125+2/125+48/125+64/125对于Phe:
Kd=CA/CB=2=q(动相)/pp+q=1=(1/3+2/3) 4个分溶管分溶3次:
3=1/27+6/27+12/27+8/27 故利用4个分溶管组成的分溶系统中,甘氨酸和苯丙氨酸各在4管和第3管中含量最高,其中:
2 3 0 -4 第4管:
Gly:
64/125×
100=mgPhe:
8/27×
81=24mg第3管:
48/125×
12/27×
81=36mg 14、指出在正丁醇:
醋酸:
水的系统中进行纸层析时,下列混合物中氨基酸的相对迁移率:
(1)Ile,Lys;
(2)Phe,Ser(3)Ala,Val,Leu;
(4)Pro,Val(5)Glu,Asp;
(6)Tyr,Ala,Ser,His.[Ile>
lys;
Phe,>
Ser;
Leu>
Val>
Ala,;
Val>
Pro;
Glu>
Asp;
Tyr>
Ala>
Ser≌His]解:
根据P151图3-25可得结果。
15.将含有天冬氨酸(pI=)、甘氨酸(pI=)、亮氨酸(pI=)和赖氨酸(pI=)的柠檬酸缓冲液,加到预先同样缓冲液平衡过的强阳离交换树脂中,随后用爱缓冲液析脱此柱,并分别收集洗出液,这5种氨基酸将按什么次序洗脱下来?
[Asp,Thr,Gly,Leu,Lys]解:
在pH3左右,氨基酸与阳离子交换树脂之间的静电吸引的大小次序是减刑氨基酸(A2+)>
中性氨基酸(A+)>
酸性氨基酸(A0)。
因此氨基酸的洗出顺序大体上是酸性氨基酸、中性氨基酸,最后是碱性氨基酸,于氨基酸和树脂之间还存在疏水相互作用,所以其洗脱顺序为:
Asp,Thr,Gly,Leu,Lys。
第四章蛋白质的共价结构提要 蛋白质分子是一条或多条肽链构成的生物大分子。
多肽链是氨基酸通过肽键共价连接而成的,各种多肽链都有自己特定的氨基酸序列。
蛋白质的相对分子质量介于6000到1000000或更高。
蛋白质分为两大类:
单纯蛋白质和缀合蛋白质。
根据分子形状可分为纤维状蛋白质、球状蛋白质和膜蛋白质。
此外还可按蛋白质的生物学功能分类。
为了表示蛋白质结构的不同组织层次,经常使用一级结构、二级结构、三级结构和四级结构这样一些专门术语。
一级结构就是共价主链的氨基酸序列,有时也称化学结构。
二、三和四级结构又称空间结构或高级结构。
蛋白质的生物功能决定于它的高级结构,高级结构是一级结构即氨基酸序列决定的,二氨基酸序列是遗传物质DNA的核苷酸序列规定的。
肽键是连接多肽链主链中氨基酸残缺的共价键,二硫键是使多肽链之间交联或使多肽链成环的共价键。
多肽链或蛋白质当发生部分水解时,可形成长短不一的肽段。
除部分水解可以产生小肽之外,生物界还存在许多游离的小肽,如谷胱甘肽等。
小肽晶体的熔点都很高,这说明短肽的晶体是离子晶格、在水溶液中也是以偶极离子存在的。
测定蛋白质一级结构的策略是:
测定蛋白质分子中多肽链数目;
拆分蛋白质分子的多肽链;
断开多肽链内的二硫桥;
分析每一多肽链的氨基酸组成;
鉴定多肽链的N-末端和C-末端残基;
断裂多肽链成较小的肽段,并将它们分离开来;
测定各肽段的氨基酸序列;
利用重叠肽重建完整多肽链的一级结构;
确定半胱氨酸残基形成的S-S交联桥的位置。
序列分析中的重要方法和技术有:
测定N-末端基的苯异硫氰酸酯法,分析C-末端基的羧肽酶法,用于多肽链局部断裂的酶裂解和CNBr化学裂解,断裂二硫桥的巯基乙醇处理,测定肽段氨基酸序列的Edman化学降解和电喷射串联质谱技术,重建多肽链一级序列的重叠肽拼凑法以及用于二硫桥定位的对角线电泳等。
在不同生物体中行使相同或相似功能的蛋白质称同源蛋白质。
同源蛋白质具有明显的序列相似性(称序列同源),两个物种的同源蛋白质,其序列间的氨基酸差异数目与这些物种间的系统发生差异是成比例的。
并根据同源蛋白质的氨基酸序列资料建立起进化树。
同源蛋白质具有共同的进化起源。
在生物体内有些蛋白质常以前体形试合成,只有按一定方式裂解除去部分肽链之后才出现生物活性,这一现象称蛋白质的激活。
血液凝固是涉及氨基酸序列断裂的一系列酶原被激活的结果,酶促激活的级联放大,使血凝块迅速形成成为可能。
凝血酶原和血清蛋白原是两个最重要的血凝因子。
血纤蛋白蛋白原在凝血酶的作用下转变为血清蛋白凝块。
我国在20世纪60年代首次在世界上人工合成了蛋白质——结晶牛胰岛素。
近二、三十年发展起来的 3 固相肽合成是控制合成技术上的一个巨大进步,它对分子生物学和基因工程也就具有重要影响和意义。
至今利用Merrifield固相肽合成仪已成功地合成了许多肽和蛋白质。
习题 1.如果一个相对分子质量为12000的蛋白质,含10种氨基酸,并假设每种氨基酸在该蛋白质分子中的数目相等,问这种蛋白质有多少种可能的排列顺序?
[10100] 12000/120100 解:
10=10 2、有一个A肽,经酸解分析得知为Lys、His、Asp、Glu2、Ala以及Val、Tyr忽然两个NH3分子组成。
当A肽与FDNB试剂反应后得DNP-Asp;
当用羧肽酶处理后得游离缬氨酸。
如果我们在实验中将A肽用胰蛋白酶降解时,得到两种肽,其中一种在时,净电荷为零,另一种可给除DNP-His,在时,带正电荷。
此外,A肽用糜蛋白酶降解时,也得到两种肽,其中一种在时全中性,另一种在时带正电荷。
问A肽的氨基酸序列如何?
[Asn-Ala-Tyr-Glu-Lys-His-Gln-Val]解:
1、N-末端分析:
FDNB法得:
Asp-;
2、C-末端分析:
羧肽酶法得:
-Val;
3、胰蛋白酶只断裂赖氨酸或精氨酸残基的羧基形成的肽键,得到的是以Arg和Lys为C-末端残基的肽断。
酸水解使Asn→Asp+NH4+,已知条件可得:
Asn-()-()-()-L