最新猪常见病PCR检测程序Word文档格式.docx

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最新猪常见病PCR检测程序Word文档格式.docx

1、阳性对照RNA的提取

材料冻干猪瘟兔化弱毒疫苗、检测用病毒RNA提取试剂盒(天跟公司产品)。

方法将1瓶猪瘟兔化弱毒冻干疫苗用1.5ml蒸馏水或PBS液稀释,用1mlRNase-free管分装,每管500µ

l,-20℃保存。

取出冻存的猪瘟病毒,解冻后离心,取上清用于RNA的提取。

RNA提取按试剂盒说明进行,最后用50µ

lRNAase-free水溶解RNA,得到RNA溶液。

2、疑似病料RNA的提取

样品采集采集病死或扑杀的猪,取血清、扁桃体、淋巴结(包括肺门、腹股沟和肠系膜淋巴结)、肺脏、脾脏、肾脏、流产胎儿等组织病变与健康部交界处组织;

待检活猪,用注射器取血5ml,4℃保存,送检(病料要新鲜,严禁反复冻融病料)。

附:

通常木乃伊胎不能作为检测样品。

对于新鲜流产的胎儿,可作为检测样品。

对于流产日龄较早的胎儿,可取整个胎儿保存;

如果是晚期流产的胎儿,最好根据上述步骤,摘取相应组织,保存送检。

胎儿的保存方法同上。

组织样品处理称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5mlPBS(PH7.2)继续研磨制成1:

3的组织匀浆液,转至1.5ml灭菌离心管中,8000r/min离心2min,取上清液用于RNA的提取;

全血样品处理:

待血凝后取血清用于RNA的提取。

RNA提取待检样品RNA的提取按试剂盒说明进行,最后用50µ

二、RT-PCR反应

1、材料RT试剂盒(东洋纺产品)、PCR试剂盒(天跟公司产品)。

引物序列:

F:

5’-GACCTGGATGCGACTGACC-3’,19bp,TM为61.88。

R:

5’-GCGGCGAGTTGTTCTGTTAG-3’,20bp,TM为59.85。

扩增的目的片段为133bp。

2、RT体系及反应程序:

名称

弱毒疫苗阳性对照

检测病料

RNase-Free水

l

特异性下游引物

模板RNA

11µ

Total

12µ

置于PCR仪上65℃10min,立即冰浴5min。

然后加入以下试剂:

变性后的RNA溶液

RTbuffer

dNTPmixture

RNaseInhibitor

ReverTraACE

20µ

按以下程序反转录:

1、42℃,45min

2、99℃,5min

将cDNA-20℃保存。

3、PCR反应体系及程序

ddH2O

7.5µ

cDNA

上游引物

下游引物

Mastermix

12.5µ

25µ

反应程序:

1、94℃,3min

2、95℃,30sec

3、56℃,30sec×

35cycles

4、72℃,1min

5、72℃,10min

三、电泳

用TAE电泳缓冲液配制1.8%的琼脂糖凝胶,100ml加入5µ

l染色液。

80V/70Ma电泳40min观察结果,在阳性对照出现133bp条带、阴性对照无条带的情况下,检测样品如出现133bp的条带,判定为猪瘟病毒阳性。

猪繁殖与呼吸综合症RT-PCR检测程序

材料冻干PRRS弱毒疫苗、检测用病毒RNA提取试剂盒(天跟公司产品)。

方法将1瓶PRRS弱毒冻干疫苗用2ml生理盐水或PBS液稀释,用1mlRNAase-free管分装,每管200µ

取出冻存的病毒,解冻后用于RNA的提取。

样品采集病死或扑杀猪,取病死或扑杀猪,取血清、淋巴结(包括肺门和腹股沟淋巴结)、肺脏、脾脏、流产胎儿等病变明显部位与正常组织交替处组织(检测蓝耳病必须包括淋巴结和肺脏样本);

组织样品处理称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5mlPBS(pH7.2)继续研磨制成1:

1、材料RT试剂盒(日本东洋纺产品)、PCR试剂盒(天跟公司产品)。

5’-CAACGCCAGCAACGACAG-3’,18bp,TM为59.58。

5’-ACGGAACCATCAAGCACAAC-3’,20bp,TM为57.8。

扩增的目的片段为468bp。

三、电泳

用TAE电泳缓冲液配制1.2%的琼脂糖凝胶,100ml加入5µ

80V/70Ma电泳50min观察结果,在阳性对照出现468bp条带,阴性对照无条带出现的情况下,检测样品如出现468bp的条带,判定为PRRS病毒阳性。

高致病性猪繁殖与呼吸综合症RT-PCR检测程序

材料阳性对照病料为该病的活疫苗、检测用病毒RNA提取试剂盒(天跟公司产品)。

方法RNA提取按试剂盒说明进行,最后用50µ

样品采集病死或扑杀猪,取血清、淋巴结(包括肺门和腹股沟淋巴结)、肺脏、脾脏、流产胎儿等病变明显部位与正常组织交替处组织(检测蓝耳病必须包括淋巴结和肺脏样本);

组织样品处理称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5mlPBS继续研磨,匀浆后转至1.5ml灭菌离心管中,8000r/min离心5min,取上清液用于RNA的提取;

5’-TGATGGGCGACAATGTCC-3’,18bp,TM为55.56。

5’-CGCAGGCAAATCCAGAGG-3’,18bp,TM为61.11。

扩增的目的片段为230bp。

1、PCR反应体系及程序

3、52℃,30sec×

用TAE电泳缓冲液配制1.5%的琼脂糖凝胶,100ml加入5µ

80V/70Ma电泳40min观察结果,在阳性对照出现230bp条带,阴性对照无条带出现的情况下,检测样品如出现230bp的条带,判定为高致病性PRRS病毒阳性。

猪流行性乙型脑炎RT-PCR检测程序

材料阳性对照病料为该病的弱毒疫苗、检测用病毒RNA提取试剂盒(天跟公司产品)。

lRNase-free水溶解RNA,得到RNA溶液。

样品采集采集病死或扑杀的猪,取血液、腹股沟淋巴结、脑脊髓液、死产胎儿的脑组织、分泌物、脾、肿胀的睾丸等组织病变与健康部交界处组织;

组织样品处理称取病变组织0.5g于研磨器中研磨,加入1.5ml生理盐水继续研磨,匀浆后-20℃反复冻融3次,转至1.5ml灭菌离心管中,8000r/min离心2min,取上清液用于RNA的提取;

三、RT-PCR反应

5’-GCTTGTTGGACGGCAGAG-3’,18bp,TM为59.58。

R:

5’-AGCCACATGATTGAGCCTTC-3’,20bp,TM为57.8。

扩增的目的片段为238bp。

1、RT体系及反应程序:

弱毒疫苗

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