研究进展北京生命科学研究所.docx
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研究进展北京生命科学研究所
序号
所属单位
姓名
模块中文名称
模块英文名称
模块简介
模块教学大纲
参考书
1.
北大
昌增益
蛋白质相互作用及调控
Protein-ProteinInteractionandregulation
将系统介绍和讨论蛋白质相互作用及其调控对于蛋白质发挥功能的重要性和体内外研究方法
1.蛋白质-蛋白质相互作用发生的生物学意义；
2.蛋白质-蛋白质相互作用研究的关键科学问题；
3.蛋白质-蛋白质相互作用的体外研究方法；
4.蛋白质-蛋白质相互作用的体内研究方法。
5.展望。
1.GolemisE（editor）,Protein-ProteinInteractionsAMolecularCloningMannual,2003年，清华大学出版社（英文版）
2.相关的综述性论文。
2.
北大
昌增益
生物衰老和休眠的分子机制
Molecularmechanismofbiologicalaginganddormancy
讨论利用模式生物对衰老和休眠现象开展的研究进展。
1.认识衰老和休眠显现的本质；
2.对衰老和休眠现象所开展的研究工作
3.对研究工作的展望。
基本上以论文为主。
3.
北大
邓宏魁
干细胞生物学
StemcellBiology
Thecoursewillcoverbasicstemcellbiology,anddifferentissuesregardingregenerativemedicinebystemcells.
EssentialsofStemCellBiology,SecondEditionbyRobertLanza,JohnGearhart,BrigidHogan,andDouglasMelton
4.
北大
邓兴旺
植物发育与环境
Plantdevelopmentandenvironment
Selectedtopicsonthreeenvironmentsignalsanditsperceptionandimpactonplantdevelopment
1.Salt
2.Drought
3.Light
Recentreviewsandoriginalpapers
5.
清华
高宁
低温冷冻电镜成像和单颗粒三维重构技术
Cryo-electronMicroscopyandsingle-particlereconstruction
本模块将介绍基于冷冻电镜的结构生物学研究方法。
课程将包括理论和应用，以单颗粒技术为核心，主要讲述冷冻电镜方法解析生物大分子复合物的方法。
1.Introductiontocryo-electronmicroscopyandsingleparticlereconstruction
2.3Dreconstructionmethods（randomconicaltiltreconstruction,commonlinereconstruction,projectionmatchingrefinement）
3.3Dreconstructionofhelicalandicosahedralsamples
4.Hybridmethod（classification,structuremodelingandflexiblefitting）
1.Glaeser,Downing,DeRosier,Chiu,Frank:
"ElectronCrystallographyofBiologicalMacromolecules"
2.Frank:
"ThreeDimensionalElectronMicroscopyofMacromolecularAssemblies"
6.
NIBS
高绍荣
干细胞与克隆的概念2
CONCEPTSINSTEMCELLSANDCLONING2
介绍胚胎干细胞生物学的一些基本概念,分子机制和研究进展。
理解以下干细胞的基本概念，了解研究进展：
Embryonicstemcells
iPS
Directeddifferentiation
Cloning
Etc.
《EssentialsofStemCellBiology》
RobertPaulLanza
ElsevierAcademicpress;
7.
清华
龚海鹏
蛋白质去折叠态的模型研究
Modelingtheunfoldedstatesofproteins
主要讲述近十年来对蛋白质去折叠态的认识，及通过计算建模研究的方法。
8
北大
顾军
先天免疫信号通路的研究进展
Theadvanceofsignalpathwaysininnateimmunity
根据国内外的研究文献，介绍先天免疫信号通路的分子机制以及其生物学和生理学功能
1.先天免疫信号通路的研究历史
2.先天免疫信号通路的机制
3.先天免疫信号通路的生物学和生理学的作用
原始文献
9
北大
郭红卫
植物激素的作用机理及研究方法
Principlesandapproachesforplanthormoneaction
植物激素是一些小分子物质，可以调节植物生长发育的几乎每一个方面。
这些植物激素包括生长素、赤霉素、细胞分裂素、脱落酸、乙烯、茉莉酸、水杨酸和油菜类固醇。
近十年来的遗传学和分子生物学的研究大大提高了我们对植物激素作用机理的认识，尤其在激素受体和信号转导方面取得了重大突破。
本模块将着重讲述该领域一系列激动人心的新发现，新进展，新方法，帮助学生深入理解高等植物在生长、发育、环境适应中独特而奇妙的调控机制。
1.植物激素的生物学功能和研究现状
2.植物激素受体的发现和作用机理
3.植物激素信号转导的分子机制和研究方法
4.植物激素研究中的当前问题和研究展望
1.ChowB,McCourtP.（2006）.GenesDev.20:
1998-2008.
2.BishoppA,etal（2006）.Development133:
1857-1869.
3.Dharmasiri,N.,etal（2005）.Nature435,441-445
4.Ueguchi-Tanaka,etal.（2005）.Nature437,693-698.
5.Chinietal.,（2007）;Nature;498:
666-673
6.Thinesetal.,（2007）;Nature;498:
661-666
7.YooSD,etal（2008）.Nature451,789-95.
8.Li,H.andGuo,H.（2007）.JournalofPlantGrowthRegulation26,106-117.
9.Guo,H.andEcker,J.R.（2003）.Cell115,667-677.
10.Hua,J.andMeyerowitz,E.M.（1998）.Cell94,261-271.
10
清华
郭伟
成体干细胞和癌症
AdultStemCellsandCancer
介绍干细胞概念，多种成体干细胞，以及相关的癌症发生的基本概念
1.干细胞的概念
2.各种成体干细胞
3.干细胞的功能和调控
4.癌症发生
5.癌症与干细胞的关系
6.癌症干细胞的发生和临床治疗
待定
11
NIBS
何万中
细胞电子断层成像技术及其在生物医学中的应用
Cellularelectrontomographyanditsapplicationsinbiomedicalresearch
介绍一门新兴的纳米尺度的电子断层三维成像技术在细胞生物学、发育生物学及医学研究中的应用
1.细胞电子断层成像技术及其进展
2.生物样品的制备技术
3.电镜成像及三维重构技术
4.电子断层成像技术在生物医学的应用
原始文献
12
NIBS
何新建
植物染色质修饰和表观遗传
Chromatinmodificationandepigeneticsinplants
植物染色质特异性不仅决定于DNA的碱基序列，而且受到染色质其它特性的影响。
我们将结合最新研究进展介绍染色质修饰的作用机制和功能。
1．DNA甲基化和组蛋白修饰
2．RNA在染色质修饰过程中的功能
3.植物基因组的甲基化和去甲基化调控
4．染色质修饰的功能
暂无
13
清华
纪家葵
生殖细胞生物学
Germcellbiology
Classeswillfocusondiscussingthesignificanceofgermcells,themechanismofgermcelldifferentiationfromembryonicstemcell,andtheroleofgermcellinreprogramming.
Thefollowingtopicswillbecovered:
1.Significanceofgermcellintransmittingtotipotencyoforganisms.
2.Determinationsofgermcellsandsomaticcells.
3.Theuniquepropertiesofgermcells,includingimprintingerasure,meiosis,andgametogenesis.
4.Theuniquepropertiesofoocyteinreprogrammingspermorsomaticcells.
Mostlyreviewsandpaper,textbookmightberecommendedlater.
14
北大
瞿礼嘉
植物分子遗传与发育
PlantMolecularGeneticsandDevelopment
主要介绍植物分子遗传学的研究方法、进展以及植物发育生物学进展
1.植物分子遗传学的研究方法
2.植物叶片发育的分子调控
3.植物配子体发育的分子调控
4.植物蛋白质泛素化过程的生物学研究
PlantBiology（GarlandScience,2009）
PlantPhysiology4thEdition（SINAUER,2006）
15
清华
雷建林
电镜基础与结构生物学中的电子断层方法
TEMBasicsandElectronTomographyinStructuralBiology
ThecoursegivesabriefintroductiontoTEMandcoverselectrontomographyapproachforthree-dimensionalvisualizationofstructuresinthecell.
1.IntroductiontoTEM,optics,imageformation
2.Fouriertransforms（FT）,contrasttransferfunction（CTF）,cross-correlation
3.Principlesofelectrontomography
4.Samplepreparation
5.Automatedimaging
6.Alignmentofimages
7.Three-dimensionalreconstruction
8.Denoising
9.Cryoelectrontomography
1.JoachimFrank（Editor）.ElectronTomography:
MethodsforThree-DimensionalVisualizationofStructuresintheCell,Springer,2009.
2.LudwigReimer,andHelmutKohl,TransmissionElectronMicroscopy:
PhysicsofImageFormation,Springer-Verlag,2008.
16
清华
李蓬
细胞代谢
CellularMetabolism
主要介绍细胞代谢的调控机制，最新进展以及与代谢性疾病发生和发展的关系
细胞代谢的概况介绍；
脂肪和肝脏细胞的糖脂代谢调控，细胞代谢的主要调控因子如Leptin，AMPK，SREBP,PPAR等的作用机制，
细胞代谢和肥胖，糖尿病，心血管疾病的关系（全部以英文教学）
无
17
NIBS
李文辉
病毒学基础与病毒入侵研究
BasicconceptsofVirologyandprinciplesofviralinvasion
本课程以病毒与细胞相互作用的分子细胞生物学为基础；以病毒学研究中的一些共同问题为主要内容;以部分病毒为例介绍相关重要科学发现的过程；讨论病毒入侵和疾病防治的相关研究进展。
1.Structuralelementsofvirions
2.Viralreplicationincells
3.Viralpathogenesisandanti-viralimmunity
4.Viralinvasion:
cellularreceptorsandendocytosis
5.Cross-speciesofviralinfectionandzoonoticviruses
6.Methodsandtechniquesinvirology
7.Vaccinesandantiviraltherapy
8.Paperdiscussion
FlintSJ,EnquistLW,RacanielloVRandSkalkaAM:
PrinciplesofVirology.ThirdEdition,ASMPress,2009
18
NIBS
李夏璐
基因组非稳性的因与果
Genomeinstability:
itscausesandconsequences.
本课程为面向生命科学研究生的专业研讨课。
通过文献讨论的方式，介绍基因组稳性维护机制研究领域的最新进展。
1.DNA复制与基因组非稳性
2.转录与基因组非稳性
3.RNA加工与基因组非稳性
4.基因组非稳性与人类疾病
AgingoftheGenome---ThedualroleofDNAinlifeanddeath，Vijg,Jan,BuckInstituteforAgeResearch,Novato,California,USA，2007
Genomeinstabilityincancerdevelopment,Nigg,ErichA.（Ed.）,AdvancesinExperimentalmedicineandbiology,vol.570,2005
19
NIBS
李夏璐
真核细胞中的mRNA加工
mRNAprocessinginmammaliancells
本课程为生命科学研究生而设立的基础课程。
内容以介绍真核基因表达过程中特有的mRNA加工过程及其调控机制和生物学功能为主。
1.真核基因mRNA加工过程简介。
2.mRNA加工过程与真核基因表达调控
3.mRNA选择性剪接的调控与生物学功能。
4.mRNA加工与其他生物学过程的偶联机制及其生物学意义
TheRNAworld,first,second,thirdedition（1993,1999,2006）
20
北大
刘东
动物发育生物学进展
Progressindevelopmentalbiology
本课程主要针对脊椎动物发育研究的最新进展，特别就研究历史，新方法、理论、工具进行系统研讨。
主要CNS杂志，Gilbert的发育生物学
21
清华
刘进元
蛋白质组学原理
Principlesofproteomics
蛋白质组学不仅是当前生命科学研究的前沿，也是生物技术与生物产业发展的重要源泉与支撑。
本模块将重点学习蛋白质组学研究的基本方法与原理，掌握蛋白质组学的研究策略，为运用蛋白质组学技术解析生命科学中自己感兴趣的重要生物学问题打下理论和技术的基础。
第一章从基因组到蛋白质组；第二章蛋白质组学研究的基本方法与原理；第三章比较蛋白质组学研究的案例分析；第四章全基因组尺度蛋白质组学研究的案例分析；第五章磷酸化蛋白质组学研究的案例分析；第六章相互作用蛋白质组学研究的案例分析。
1.Principlesofproteomics
2.ProteomicsinDrugResearch
22
清华
罗弘
果蝇的发育
Drosophiladevelopment
将介绍果蝇发育研究的常用方法、眼和翅的发育及其研究进展
1.果蝇的研究方法；
2.果蝇眼发育的机制；
3.果蝇翅的发育。
研究论文、综述文章
23
NIBS
罗敏敏
化学感觉系统
Thechemosensorysystem
主要介绍动物的化学感觉系统。
包括哺乳动物及昆虫的嗅觉及味觉系统的组织原则，信号转导通路，神经通路，及特殊化学感觉系统。
1.嗅觉受体及信号转导通路
2.哺乳动物及昆虫的嗅觉系统神经环路
3.辅助嗅觉系统及信息素的检查
4.特殊嗅觉系统
5.味觉受体及信号转导通路
6.哺乳动物及昆虫的味觉系统神经环路
《Neuroscience》DalePurves
4thEdition,SinauerPress
24
NIBS
罗敏敏
生物医学研究中的现代光学技术
AdvancedopticaltechniquesforBiomedicalResearches
给生物医学研究的研究生介绍主要的光学技术，包括光学显微镜，荧光探针，钙成像，FRET，光刺激
1.光学显微镜基本原理，共聚焦显微镜
2.双光子显微镜及纳米级别光学成像
3.荧光探针，GFP及其它荧光蛋白
4.钙成像，FRET
5.光刺激，光遗传学
6.高通量筛选
《FundamentalsofLightMicroscopyandElectronicImaging》
DouglasMurphy
2edition
Wiley;
25
北大
罗述金
种群和保护遗传学
PopulationandConservationGenetics
介绍种群遗传学的基本概念和经典原理，以及遗传学在野生动物种群研究和保护中的应用。
1.自然种群中的遗传和性状多样性；
2.种群遗传学基本概念：
Hardy-Weinberg原则、有效种群、遗传漂变、自然选择等；
3.种群间的基因交流，片断化、种群结构分析；
4.Inbreedingdepression、杂交物种、保护繁育、重引进、入侵物种等问题解析；
5.遗传学在种群保护中的应用：
司法鉴定，保护单元定义、行为生态学的遗传学分析等
ConservationandtheGeneticsofPopulations（AllendorfandLuikart2006）
2.APrimerofPopulationGenetics（Hartl2000）
26
清华
孟安明
胚胎图式形成
EmbryonicPatterning
主要介绍动物胚胎体轴的建立、胚层的诱导及胚层分化的分子机理
1.体轴的建立
2.中内胚层的诱导和分化
3.神经外胚层的诱导和分化
ScottF.Gilbert《DevelopmentalBiology》，9thEdition.
27
NIBS
邵峰
先天性免疫中一个新概念:
炎症小体
Anewconceptininnateimmunity:
Inflammasome
炎症小体是当前先天性免疫研究中的一个重要的新热点，本模块将和学生一起讨论最近几年有关炎症小体的比较重要的原始文献（大约20篇）。
通过讨论，让学生了解炎症小体的基本概念和目前相对研究较多的三个炎症小体的功能机制。
更为重要的是，通过该模块的讨论，期望能够让学生了解这个新兴领域目前急需解决的重要科学难题和刺激学生在这方面的兴趣思考。
1.简略介绍先天性免疫的概念框架和并讨论炎症小体概念的提出；
2.重点介绍Nalp3,Ipaf,AIM2炎症小体的遗传和功能实验；
3.介绍炎症小体在拮抗病原微生物感染中的重要作用；
4.当前炎症小体研究中的尚未解决的重要问题和面临的瓶颈难题。
无参考书目，将提供一系列原始文献。
28
清华
沈沁
神经干细胞研究进展
AdvanceinNeuralStemCellResearch
Toprovideanoverviewofcurrentunderstandinginneuralstemcellbiology
1.Originandderivationofneuralstemcells
1.1neuralstemcellsinthebrain
1.2neuralstemcellsderivedfrompluripotentstemcells
2.lineageandcellfatedeterminationofneuralstemcells
3.controlofself-renewalanddifferentiation
4.adultneurogenesis
“Developmentofthenervoussystem”
“NeuralDevelopmentandStemCells”
Andlatestreviews
29
清华
沈沁
神经系统发育生物学
NeuralDevelopment
Thelectureswillcoverbasicsindevelopmentalbiologyofthenervoussystem.
1.Neuralinduction
2.Regionalpatterningandspecification
3.Histogenesisduringcorticaldevelopm
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